學院都市是將東京西部隔離出來建造而成的高科技城市，整體給人平坦整潔的未來都市印象，但是有些事情與有些地方卻和外面的世界依舊沒什麼兩樣。
比如現在，在學園都市深夜的某條小巷中，不斷傳出怒吼聲、尖叫聲、哀號聲、以及東西被砸毀的聲音。
這是一條細長的直線巷道，兩側皆被水泥牆所阻隔，兩邊的建築物應該都是學生宿舍吧，小巷內有七個少年正在不住喘氣。
再往下看，地面上還倒著三個人，身上血流如注，而還保有戰斗力的七個少年手上各自拿著大型摺疊刀、警棍、催淚瓦斯等物品，雖然破壞力強大，但拿在這些少年手中卻顯得不順手，給人一種才剛從塑膠包裝盒里拿出來的感覺。
然而就算不順手，凶器畢竟是凶器，不，或許正因為是拿在不知輕重的門外漢手中，才更顯得特別危險。&}.{}
七個少年包圍著一個少年，每個人的眼楮都充滿了血絲，但是被包圍住的那名少年，卻沒有任何舉動。
手持凶器圍在四周的七人似乎不存在于少年的視線中，他只是抬頭仰望著被切割成長條形的夜空，若有所思地站著。少年似乎才剛從便利商店回來，手上提了個印著店名的塑膠袋。塑膠袋搖搖晃晃，里面塞滿了十罐以上的物體，似乎是罐裝咖啡，把塑膠袋撐得鼓鼓的。
少年給人的印象就是白,然而更讓人印象深刻的，是他身為學園都市最強等級5超能力者的頭餃。
名為一方通行的少年，漫不經心地在腦中茫然地思考著，自己與那些御阪人偶的戰斗，到底具有怎樣的意義?
「喝啊！」
怒吼聲從背後傳來，圍著一方通行的凶惡少年之一，拿著刀子朝一方通行的背部捅去。但是一方通行沒有回頭，甚至連看都沒看一眼。凶惡少年將全身的體重施加于刀鋒尖端，朝一方通行那毫無防備，看來極為柔弱的背部刺來。
而此刻，一方通行依舊在思索著什麼，毫無防備。
利用兩萬名‘妹妹’讓自己進化至等級6絕對能力者的實驗，最後竟落得那種下場，這場敗北，讓世界產生了什麼樣的變化?
被一群克隆人擊敗的一方通行似乎從那時候起，就不再是‘學園都市最強’了，他是學園都市內僅七人的等級5超能力者之一，擁有‘可以自由變換接觸到皮膚的動能、熱能、電能等各種能量方向’的能力，這些明明就沒有改變。
但有些事情卻還是發生了變化。
啪！骨頭碎裂的聲音從一方通行的背後響起。
當然，這個毀滅的聲音並非發自一方通行的身體，拿著刀子刺向他的背部的凶惡少年，手腕已經斷了，施加于刀子上的全部重量遭到反射，握著刀子的縴細手腕，在強度上根本無法承受那樣的力量。
「啊啊啊啊！」
又是一聲凶惡少年的慘叫，凶惡少年壓著手腕在污穢的地面上翻滾，那副模樣著實可笑。
同伴的慘叫聲似乎反成了導火線，剩下的六名少年一起沖了上來，但是這里頭有幾個人，真正認為自己能贏?他們的眼楮內布滿血絲，但那似乎是過度的緊張、不安、恐懼與焦躁所造成的。
自從那一戰之後，一方通行便不分晝夜地遭到來自各方的襲擊，‘學園都市最強’的神話已經被打破了，襲擊他的人如此深信著。
在怒吼聲中，刀子、警棍各自揮出。但一方通行對這些根本視而不見，他的雙手懶散地下垂著，什麼都不用做，只要等敵人自滅就行了，凶惡少年們所發出的任何攻擊，所有能量方向都會遭到反射，集中在復雜而脆弱的手腕骨頭上。
而這些人毫無例外地察覺到一件事，就在他們發出第一擊並失敗之後，他們察覺到學園都市最強的神話依然健在，但是一方通行遇襲的次數並沒有減少，不管擊垮敵人幾次，不管證明自己的能力幾次，都無法撕掉這些笨蛋貼在自己身上的標簽。
凶惡少年們斷筋碎骨的聲音此起彼落，他們發出慘叫並在地上翻滾，而一方通行依然對他們視若無睹。
他依舊在思考，在那場戰斗之後，一方通行這個人產生了何種變化?
一方通行到底是變弱了，還是變強了?
「嗯?」
一方通行突然，原本包圍著自己的喧鬧聲已經完全消失，此時他才終于將眺望著小巷內長條形天空的視線往下移，往四周看了看，任性地圍住了一方通行的凶惡少年們全都任性地自滅，躺在污穢的地面上安靜地睡著。
以飛濺在周圍的血跡來看，睡著這樣的字眼或許有點太過含蓄，但至少沒有任何人送命，與一方通行正面對決還能夠留下一口氣，已經可以算是奇跡了。
回頭一看，路上倒著大約十名的凶惡少年，但是一方通行根本什麼也沒做，甚至不算戰斗，對他而言，現在的狀況只是他在深夜到便利商店買了罐裝咖啡，正要走路回家——這件事對他來說不過如此而已。
他也不打算對這些倒在路上的家伙下最後一擊，今天能殺的人也能殺，能殺的人一年後也能殺，跟這些人認真根本只是件蠢事。這種戰斗跟那場實驗不同，就算再怎麼盡心盡力也無法抵達終點，沒有終點的游泳，跟溺水又有何不同?
「唉……不對，依我原本的個性，可不會這麼輕易就放過向我挑釁的人。我真的變了。但是，到底是哪里變了?現在是什麼狀況?到底是怎麼回事?」
一方通行歪著腦袋沉思著。嘗過有贏有輸的戰斗滋味後，單方面壓倒性勝利的行為就再也無法讓自己滿足——這樣的結論想必是太過美化了。如果有人能夠笑著回想自己吃癟的經驗，那這家伙一定是個被虐狂。
「嗯?」
一方通行將雙手在胸前交叉，袋子里的罐裝咖啡不斷晃動，咖啡總共有十罐以上，而且全都是同一個牌子，每次中意的咖啡品牌，一方通行總是每天不斷地喝，接著不到一個星期便喝膩，然後又去找其他品牌的咖啡，重復這樣的循環。
「這到底是怎麼回事?為什麼我會這麼提不起勁?」
他再次望向長條形的夜空。
而就在一方通行正在思考人生的時候，學院都市中那座沒有窗戶的大樓內迎來了一位黑發的客人。