這一邊，跟隨這不良少年的御阪美琴看到一出好戲，一個身穿研究員或是醫生專用白大褂的少女僅僅是用言語和演技以及一點麻醉藥就將幾個不良完全制服。
「呀，真是讓我看到十分精彩的東西啦，原本還想要是有個萬一我就出手的。」
而少女只是看著御阪美琴︰「你就是•••素體吧。」
「想必你也有所耳聞吧。」少女沒有管御阪美琴的驚愕，只是自己說自己的。
御阪美琴想起了有關自己克隆人的傳聞，但是，對此她是不相信的，除了幼年時交出去的一份DNA圖譜，她可沒有給其他任何人她的DNA信息。
「還以為你要說什麼呢，想不到長點上機學院也有好八卦的人啊。于是，你對那些傳聞知道些什•••」
踫，少女直接拿手中的包砸了御阪美琴一下。「你是初中生，而我是高中生，好好遵循長幼之序。InBrief，禁止使用簡語。」
「關于那一則傳聞請問您是否知曉些什麼？」御阪美琴不得不低頭，畢竟少女說的是事實。
「知道的比你多，不過比起我在的時候，現在的實驗目的及內容好像已經截然不同了。」
「啊？」
「知道了也只是徒增苦惱，因為憑你的能力什麼都做不到。我能做到的也微乎其微，發放儲蓄卡也只是其中一個環節——滅掉學院都市的死角。通過發放儲蓄卡，讓人們注意到監視器無法監視到的小路小巷，如此做，或許能阻止本應該在那些地方發生的實驗。But，連我本人都被目擊到，還被尾隨至此，實屬大意。」少女轉過身，從抽屜里掏出一個文件，「這東西要是被人看見了，可能會變得麻煩起來，看來不能用這些會留下痕跡的東西啊。」說著，從口袋里掏出了打火機，將手中的文件點燃。
「你這都在說些什麼，你到底又知道•••」御阪美琴急迫上前，卻使得燃燒的文件掉落在地上，即將引起一場不小的火災。
「總之，先把他們帶出去。」說著，御阪美琴開始拖動幾個倒地的不良少年，而少女則是迅速地披上白大褂，離開了。
御阪美琴也想追上去，但這些不良少年可能會被燒死，善良的御阪美琴還無法視人命于無物。
離開這個地方後，御阪美琴始終無法相信自己克隆人的存在，但是那股心中的不安讓她決定查一查那個少女，而就是這個決定讓她徹底滑向深淵。
在路邊公用電話亭內，御阪美琴用自己的能力直接入侵書庫查看長點上機學院的學生信息，很快找到了那個少女的信息。
「布束砥信，高中三年級學生，十七歲，幼年時便在生物精神醫學領域鋒芒畢露，在山下大學附屬醫院以及口制藥•第七醫藥學研究中心•••」看到這里，御阪美琴已經有些相信布束砥信的話語了，當初御阪美琴交出DNA圖譜的時候，就是在山下大學附屬醫院。
看完布束砥信信息後，御阪美琴下定決心潛入口制藥•第七醫藥學研究中心探查。
在一處商店買好便裝之後，御阪美琴隨意找了一家酒店，換好衣服後來到了口制藥•第七醫藥學研究中心，然後利用自己的能力潛入了最機密區域，發現了這樣一份報告。
「超電磁炮量產計劃︰Sisters最終報告書。」
看完之後，御阪美琴頓時感到一陣輕松，自己的克隆實驗確實存在沒錯，而且當初自己的DNA一開始就是被騙去做克隆實驗的，但是，經過樹狀圖設計者的計算這項計劃有致命缺陷，已經終止並永久凍結了。
「什麼嘛，到頭來還是沒有我的克隆體嘛，一定是這個瘋狂的計劃泄漏出來的時候就不完整，傳聞不脛而走罷了。」御阪美琴像是放下了包袱了一樣輕松地離開了，卻是沒有想到，僅僅在她離開後不久，一個和她長得一樣的人就走了過來，將關于Sisters的檔案完全刪除。
而少女自稱御阪。
另一邊，佐天淚子來到了屬于暗部Protect的基地，在這里，她見到了之前听過的春上衿衣的老師木山春生，有固法美偉的男友也是曾經大蜘蛛首領的黑妻綿流，自己的同居者，也是學院都市Level5心理掌握的食蜂操祈，還有一位不認識的美少女。
然後，在這群人之後，是自己的男友，亦是學院都市Level5的白井月。
「淚子，我現在要和你說的是關于存在于這個世界的真實，這個學院都市的真正面目，還有我的真正面目。」白井月頓了一下，接著說著。「听完我說完後，你再好好決定是否真的要到‘這邊’來。」
「這個世界分成四個部分︰其中普通人的世界是一部分，他們沒有任何異常的能力，只是生活在這個世界上；第二部分是科學側，沒錯，就是以學院都市為代表的超能力者以及以科學為名的武裝集團；第三部分則是魔法側。」
「魔法？真的有那種東西？」
「有的，既然超能力存在那麼為什麼魔法不存在？而且魔法的勢力遠遠比超能力更加龐大，有著二十億信徒的十字教就是最大的一部分。這個世界魔法側主要分三個勢力，羅馬正教、俄羅斯成教和英國清教。而且，魔法側和科學側是對立的。」
「對立？為什麼？」
「十字教是建立在神與耶穌存在的基礎上的，但是科學否定神的存在，相當于否定了魔法存在的意義。所以二者的矛盾基本上不可調和。」
停了一下，給佐天淚子一點消化的時間，白井月繼續說著︰「這個世界的第四部分勢力是天朝的修真側。他們是中立的勢力，至于具體修真側是什麼意思，就不用太在意了。」
佐天淚子細細地想著剛剛所听到的話語，她第一次接觸到這樣的現實，實際上，暗部Protect的其他人也是第一次听到這些信息。食蜂操祈或許有些了解，但沒有這樣細致的分類。
「但是，月你還是沒有和我說清楚御阪同學的事情。」佐天淚子沒有忘記自己的最初目的。
「別急，關于這個學院都市，還有不少要和你說呢。」