在遙遠的神話時代，天空的宙斯、海界的波塞冬、冥界的哈迪斯無一不在覬覦人類賴以生存的大地。為了保護弱小的人們，愛好和平的女神雅典娜站出來，與邪惡的神展開連番戰爭。與此同時，人類中一些驍勇善戰、正義善良的少年圍繞在女神身邊和她並肩作戰，他們一掌可以劈開天空，一腳能夠踩裂大地，這群不用武器，完全憑藉赤手空拳戰斗的少年被稱作「雅典娜的聖斗士」！從神話時代開始，雅典娜和她的聖斗士們就與邪神展開無數次的聖戰。
到了現代，星矢、紫龍、冰河、瞬、一輝等五個青銅聖斗士在戰爭中不斷成長起來，他們打敗了陰謀篡位的教皇、意欲淹沒大地的海皇波塞冬，對抗企圖帶來永久黑暗的冥王哈迪斯。為了大地和人類，雅典娜和聖斗士們一次次挺身而出……
然而，一個不應該屬於這個世界的人物突然造訪，他自幼開始接受特訓，在一個與時隔絕的地方潛心修煉。後來成為了守護世界和女神雅典娜的聖斗士。對，這是一個穿越者的故事，一個知道所有未來一切事情之人。超越常人的訓練方式，天賦和吸收能力遠遠凌駕于人類。是不是因為自己是穿越者才能得到的優勢，這連他自己也不清楚。在十年的修煉中，就獲得了完全超越人類境界的強大力量，同時也是個熱愛這個世界和相信人類的男孩，認為他們即使有錯也要保護他們。對，人是值得去守護的存在。也許他自己明白所謂「人」到底是什麼才會變得今天這麼強也說不定。人是讓神也能畏懼的存在，他們有著眾神所沒有的東西，神之所以要毀滅人類這個原因就是在本能上明白人類的可怕！可是，本身卻什麼都被察覺到。只是認為人類是愚蠢又下等的生物而已。而企圖讓世界陷入危機的無論是不是神，他都會為了守護而去反抗，守護所愛之人和這個世界！而在某一年，他領悟了，大自然界的幾大元素，當他明白的時候他獲得了可以守護一切的力量。生存在這個世界，人類和神都無法踏進的地方，只有被選中的人類才能獲得的偉大力量。在那之後，他屢次創造了奇跡，其睿智的頭腦讓他明白真正的究極小宇宙。人類史上的第一個！他戰斗的技能更是前所未有，就像是魔法師一樣有著多彩多樣技能和如忍者般體術的人類。其強大的程度從人類誕生以來也絕對無人能及的力量。
這個少年已經十四歲，名字叫做游星，自由在一個荒山中長大。他本是名門之後，只因家中不知何種原因，所有人暴斃而死。只剩下他和在山中居住多年的祖父。一歲的時候，他爺爺將他抱走，走進了深山中，過著與世無爭的生活。日子和一般鄉下民一樣，既簡單又樸實。游星他是個穿越者，二十一世紀的一個靈魂來到了這個少年的身體內，當時他只有一歲，附身在了本應該死去的小孩子的上。在他兩歲的時候就听到他祖父所說的希臘神話的故事，和小宇宙之類的東西，立刻明白這是聖斗士的世界。至於自己為什麼會來到這里他是一點也不清楚。從那個時候起，他自己就下定決心，要當一名聖斗士，保護世界和平。因此在他四歲那年，覺醒了小宇宙。便在荒山中修煉，不知不覺就過了十年。
這個荒山極大，可只有他爺孫在這里。因此，沒有人打擾，游星要當聖斗士也告訴了他的祖父，他的祖父異常的高興，模著他的頭夸獎他。連游星都不知道，這個山中有一個巨大的結界，外邊的人無法進入這里，這是與世隔絕的地方。無論你的小宇宙如何燃燒，外邊的人也無法感應到。不知這件事的他靜心修煉，他的爺爺也是個懂得小宇宙的人，年紀雖老邁，據說年輕時曾經以聖斗士作為目標，可惜後來失敗。剛起手的時候游星經常問他，跨越了一步又一步，他那聰明的頭腦讓人都無法聯想到是人類。短短兩年間。也就是他六歲的時候，小宇宙的真髓第七感已經完全覺醒。游星本就是個天生的戰斗者，有著極強的戰斗潛能，他此刻年紀雖幼，卻已經到達聖斗士最高級別的水準。
一年過一年，他的祖父不時對他產生了畏懼之心，只因游星的強大已經不是人類所能企及。不單是小宇宙而已，他創出的每一個絕招都威力巨大，即使手臂輕輕一揮，也能施展超人一等的力量。和其他聖斗士不同，他修煉的方法完全走上了另一條道路。雖然這麼說也不是簡單就能做到，這些年也受了不少苦，曾幾次感覺到自己快不行，不知流了多少血汗。可一想到今後要和星矢那些人一起維護世界和平，保護雅典娜。這份信念使他不斷努力堅持向上，到十三歲那年，他已經不是人，游星的力量已經踏入神之領域。他祖父告訴他今後要將真正的力量封印在體內，只能用人類級別的水準戰斗，不到危險關頭，絕不解放那股力量。游星也答應下來，這一年，他爺爺因年紀老邁去世。他變成了孤兒！
要成為聖斗士，游星這十幾年來有一個月左右的時間去了外面，跟他爺爺去見一個老朋友。那是在他八歲的時候，他萬萬想不到這一次竟然是和那個人的相遇。兩個老人見面，雙方都有年紀相仿的孫子孫女，游星和她一起玩，一開始覺得這女孩甚是任性驕縱，但一看到他那張臉孔自己也氣不上來。最先幾天那女孩對他不是很好，她從小到大什麼都有，什麼都能得到。游星經常陪她，她的任性偶爾不听在耳里，若不是過分的事，他則是順從她的要求。兩人隨著日子的增加，感情日深，游星對她抱著尊敬的態度，那女孩也漸漸對他越來越好，游星每天牽著她的手去外面玩一些小孩子的事情，他只是掛起笑容，卻顯得很成熟。過一個月不到的時間，最終分離。而這個小女孩，正是城戶沙織，年幼時的雅典娜。他的祖父城戶光政和他祖父是舊相識，在數年前認識。
世上的事經常都是很巧，沙織比游星小了一歲，這個時候星矢他們全部才剛剛去了世界各地，為了要成為聖斗士。游星和沙織的相遇，讓他感到這絕對不是踫巧，這是所謂的命運。讓他們二人在今後的戰斗中能夠同甘共苦，游星心下也發誓決不讓眼前這女孩在未來不斷承受坎坷的命運，決定要好好守護她。那個時候的離別，盡管雙方都不願意，沙織甚至是哭了，游星只跟她說了一句話，那就是︰「我們今後一定會再見面的，到時我一定會保護你！」
然而時間是會沖淡人的感情，在翌年，城戶光政去世，沙織傷痛不已。決心要好好繼承家業，也就是古拉杜財團。為了今後聖斗士們的歸來而做準備，爭奪黃金聖衣為主。忙碌的日子，使得沙織漸漸淡忘了小時候和游星的事！當然，不是全都忘記，而是不怎麼去想。這已經成為她心中的一個回憶。而且，那個時候的她不過是個七歲的孩子，又懂得什麼。小孩子家的事不去想自然很快就忘記，而游星身體是小孩，頭腦卻是個大人。他穿越前是一個17歲的男生。懂得東西自然比沙織多！她的一切，都仿佛存在他的心中，一刻都沒忘懷。
不知不覺六年過去，兩人均長大，游星變成一個俊俏的男孩，個子既不是很高，也不是很矮。大概跟紫龍一樣，身材也差不多。只是游星的頭發不屬於長發，而是短發。跟星矢差不多接近，卻沒他那麼茂盛。發型前後完全不同。凌亂帥氣。長大的游星不知不覺多了幾分高傲的氣質。卻從不驕傲自滿，視人為低賤生物他從未有過，就和星矢等人一樣。
日本——
此時，在古拉杜競技場，正進行著一場聖斗士的戰斗。就是所謂的銀河戰爭，台上在相斗的是獨角座的邪武和幼師座的蠻。兩人你來我往的拳頭向對方身上打去，聖斗士的戰斗使得台上的觀眾們很是興奮。坐在最高位置上的正是古拉杜財團的總帥，代替死去的城戶光政，她正是長大後的城戶沙織。一身白衣，頭上和脖子上掛著金冠和項鏈。都是價值連城的東西。長大後的沙織一頭長長的紫色頭發，藍色雙瞳的眼楮，相貌美得如同天女一般，不愧是女神雅典娜。美貌果然冠絕世界！難怪那個獨角座的邪武被她迷得神魂顛倒。
沙織坐在台上觀看，暗道︰「爺爺，你期待已久的聖斗士黃金聖衣爭奪戰，銀河戰爭開始了，沙織代替爺爺你作為主辦人，請你在天國那里觀賞吧！星矢，你為什麼還慢吞吞的，快點帶著天馬座的青銅聖衣從希臘回來吧！」
希臘——
原本的主角星矢正在一個斗技場里，四周圍站滿了許多人，一個帶面罩的男人站在高處上說道︰「你們到今天為止，已經打敗了九位選手贏到這里，在一千零二十四名戰士中只剩下你們兩個人。那麼，你們兩人去戰斗吧！勝者將給與榮譽的雅典娜聖斗士的證明，給與這件天馬星座的聖衣！」原主人公星矢，穿著一件黃色的衣服，個子不高，黑色的短發，皮膚稍黑，長得一般般。卻是一臉熱血的樣子。他在台下說道︰「那就是天馬座的聖衣嗎？我就是為了那件聖衣從老遠的地方來到希臘的！」他旁邊站著一個大漢，樣貌極為丑陋，趁星矢不注意，打了他一下，又把他握在手中舉了起來，笑道︰「星矢，我不會把聖衣給你的，它是屬於希臘人我卡西歐士大人的！」一個女人在群集中響起聲音︰「卡西歐士，你這樣偷襲太卑鄙了！」又一個綠色頭發的女人說道︰「魔玲，在戰斗前被對手看到破綻是他自己愚蠢，去吧，我的卡西歐士！」
香港——
在一個荒山中，游星穿著一條黑色褲子，白色短衫，手上拿著一束鮮花，走到一個墳前，蹲下去之後，把鮮花放在墓碑前面，雙手張開合住，閉上眼楮，道︰「爺爺，我就要去日本了，為了和沙織重逢，成為雅典娜的聖斗士，消滅世上的邪惡勢力，你對我的教誨我絕對不會忘記，會照你所說的守護雅典娜，游星今後會回來看你的！」說完站了起來，向前走去。
希臘——
星矢劈下了卡西歐士的一只耳朵，而這場決斗也星矢完全佔了上風，將卡西歐士這粗漢打得片體鱗傷。星矢道︰「你的身上只掌握了聖斗士表面的破壞力而已，你有在身體中感覺到宇宙的存在嗎？」。卡西歐士道︰「你說宇宙？」星矢點了點頭，想起了三年前魔玲給他說過得話︰「听好，石頭是由原子組成的，我和你的身體也是由原子所組成，在這個世界上的任何東西都一樣！就連天山那閃耀的星星也是，明白嗎？所謂破壞的根本，就是要將原子粉碎，星矢，集中所有力量。將來體內的全部的精神集中集中在一起，把要破壞的東西集中在那一點上，用那拳……」明白後的星矢果然一拳把大石頭擊碎，魔玲又道︰「星矢，宇宙是在一百五十多億年前在一次大爆炸中誕生的，換言之，你的也是由於爆炸而誕生的小宇宙之一！」星矢奇道︰「小宇宙？」魔玲道︰「真正的聖斗士憑藉著爆發自己體內的小宇宙而產生超人的力量，然後把大地分開，把星星粉碎。星矢，你也嘗試爆發自己的小宇宙吧，把自己的拳化成流星一般，像流星……」星矢道︰「流星？」魔玲指著天空，道︰「你的守護星就是天馬座！」
星矢在斗技場上說道︰「卡西歐士，我再說一次，是你輸了！」卡西歐士道︰「笨蛋，如果真的能在你的身體內看到宇宙的話就把聖衣給你！」這個時候星矢手不斷揮動，那淺綠色頭發女人驚道︰「天馬？星矢的拳在劃出天馬座十三顆星的軌跡！」卡西歐士道︰「可惡，這種騙小孩的東西！」立刻沖了上去。那女的喊道︰「等等，卡西歐士，別接近星矢！」可為時已晚，星矢沖了上去，一拳揮出，喊道︰「天馬流星拳！」一拳揮出，體內的小宇宙爆發，許許多多的白色流星飛去，正中卡西歐士的身體，八十多拳打在他身上，讓他口中吐出鮮血，身上的也負了相當大的傷害。倒地不起！