由于監獄被劫，這無疑是向學園都市宣戰。警衛員開始全面出動尋找犯人，根據那名逃出來的獄警描述，犯人正是無能力集團的首領︰蛇谷次雄。可是自從上次鎮壓無能力集團後，蛇谷次雄就已經銷聲匿跡了，沒有人知道他在哪里。警衛員再次趕到曾經的大本營時，已經是空空如也。因此調查陷入僵局。還有就是尋找那名失蹤的人，也一樣沒有留下任何線索，正當尋找還在繼續時，新的事情又發生了，又有將近三十人無故失蹤了，一點失蹤的痕跡也沒有留下。而且接下來幾天也是接二連三地發生同樣的事情，雖然警衛員已經加大了監察和尋找力度，但失蹤人數依舊在不斷增加。
由于警衛員人數來不及，所以風紀委也是參與進來。黑子和初春每天都忙地不可開交。美琴倒還比較空閑，于是像老樣子打算去便利店看免費的漫畫雜志。美琴慢慢地走在路上，她發現，路邊的行人談話的主題差不多都是最近發生的人口失蹤事件以及之前的監獄事件。美琴雖然也很在意，但卻是故意裝作毫不在意的樣子。
「呱呱呱」美琴口袋里的電話響起了，撥通電話，那頭傳來了冥土追魂的聲音︰「那個，你要是有空來一下我這里，研究有結果了。」美琴掛掉電話，直奔冥土追魂所在的醫院里。
「砰」醫務室的房門被粗魯的打開了，美琴喘著粗氣看著正坐在凳子上的冥土追魂。冥土見美琴這麼快就趕來了，也是微微一笑︰「看來你對這件事情真的是很關心在乎啊。」美琴緩了口氣，問︰「醫生，研究結果怎麼樣？」冥土看了看美琴，嘆了口氣，說︰「結果是有了，可是具體的原因還是不清楚呢。」
美琴被冥土的話愣住了，什麼叫有結果卻還是不知道具體原因？正當美琴打算繼續問時，冥土先開口了︰「你知道染色體嗎？」。美琴一愣，初中的她雖然听說過染色體，但卻沒有真正認識染色體，所以只能搖搖頭。冥土慢慢說道︰「所謂的染色體，就是指細胞核中載有遺傳信息（基因）染色體的物質，在顯微鏡下呈圓柱狀或桿狀，主要由月兌氧核糖核酸和蛋白質組成，在細胞發生有絲分裂時期容易被堿性染料（例如龍膽紫和醋酸洋紅）著色，因此而得名。它是遺傳物質—基因的載體，控制人類形態、生理和生化等特征的結構基因呈直線排列在染色體上。簡單說就是能決定人大部分的機能。當然包括無能力者和肌肉萎縮癥等。」
美琴思維轉得很快，趕忙說道︰「那醫生你的意思是那塊石頭中能改變染色體的能力？」冥土點點頭，︰「確實是這樣，我通過研究發現石頭中有一種神奇的能量，這種能量能夠補齊或者改造染色體中所含的一切東西，就像修理坑坑窪窪的馬路一樣，重新平坦。」「那就是說以後這樣的絕癥都能醫治了？」美琴欣喜地問。
可是，冥土卻又搖搖頭︰「很可惜，雖然我知道有這麼一種能量，卻不能制造出相同的東西，因為我從來沒有發現過這種能量，應該是沒有人發現也不可能會被發現的一種能量。因為從科學上講，這種能量不可能會存在于這個世界。」美琴不禁奇怪，問道︰「那這到底是一種什麼樣的能量呢？」
冥土看了看她，說︰「生命是由很多的元素加上大量的連科學都無法探清反應後，才產生了生命這種東西。但是我所說的這種能量，只要將它注入到任何一種東西，記住，是任何一種，連石頭，機器都行。只要注入，那麼那樣東西就會擁有生命，變成一個只有外形不一樣的生物。簡單說，就是被賦予了生命，變成了一個活物，而且如果這樣東西原本就有生命，再被注入這種能量，那麼這種能量將覆蓋在原本的生命上，形成一個完全不一樣的新的生命。」
美琴被冥土的話給震驚了，一時間竟然呆住了。冥土看著美琴的反應，也是無奈地笑了笑︰「覺得不可思議是嗎？其實當時我也是被震驚了，很難接受這個事實。但慢慢地，我接受了，並且給這樣的能量起了一個名字︰生。」
「生」這個字在美琴腦海中炸開。她回想起曾經听到過的不知道是誰說的話︰「可惡，要不是擔心索菲亞發現，哪會讓你們這麼輕松就把「生」給搶回去，不過算了，反正計劃已經開始了，就讓「生」再瀟灑一段時間吧，給我記住，「生」是我們的東西，我們會奪回她的。」
「到底是怎麼回事？」琴心中非常混亂︰「所謂的生到底是什麼？那時我們只是救了雪米妮，那些人的目標也是雪米妮，淚子又說雪米妮是和索菲亞一起逃出來的？難道…」一個驚恐的答案在美琴腦海中爆炸︰「雪米妮就是生，那股能量是從雪米妮身上得來的！」
美琴身體不住地顫抖著。冥土奇怪地看著美琴，問道︰「沒關系吧？」美琴被冥土叫醒了。忍不住深深地吸了口氣，說︰「沒關系。」
冥土也是松了口氣，但接著似乎又想到什麼，說道︰「但是研究還不只這一點。」美琴立刻盯著冥土，追問道︰「還有什麼發現？」
「經過研究，我發現石頭里不是只有「生」這一種能量，還有一種也是說不出的能量，這種能量似乎沒有什麼特效，但它卻能控制「生」這種能量，或者說囚禁「生」，讓「生」這種能量听它使喚。」
美琴瞳孔猛然緊縮，大聲問道︰「具體是怎麼回事？」冥土先是被嚇了一跳，但很快冷靜下來，慢慢說道︰「簡單說，就是能控制一切有生命的東西，控制他們的機能，新陳代謝，甚至是思維。如果說「生」是部下，那這種能量就是司令，統帥一切屬于他的部下。」
美琴的瞳孔都縮至針眼大小了︰如果是這樣，那麼向許願石許願的人們體內都有這兩種能量。那麼如果說「生」是雪米妮的能量，那麼另外這種能量難道也和「生」一樣是某個人的能量。那麼既然這種能量可以操控「生」，也就是說它同樣也可以靠這樣來操控這些向許願石許願的人，那麼那些失蹤的人難道…
想到這里，美琴趕緊撥通了初春的電話︰「初春，幫我查看下失蹤的人是不是大部分曾經都是無能力者或者低能力者，然後忽然之間變成能力者的？」初春被美琴著急的通話給嚇了一跳，然後趕忙打開電腦查找︰「卻實是和御阪學姐說的一樣，失蹤的人大部分都是這樣的……」
還沒等初春通話完，一名護士著急地跑了進來︰「不好了冥土醫生，街上有很多人倒下並且失去意識了。」「什麼！」冥土大吃一驚，趕緊跑了出去，美琴也是跟了出去。
果然，在大街上到處都躺著失去意識的人。警衛員和醫生正在抓緊時間搶救。美琴也是幫忙。忽然，她發現地上躺在一名像是打工仔的人，身上有一股淡淡的咖啡香味。美琴走進一看，居然是那天看到的那名在咖啡館打工的人。「這人本來是肌肉萎縮癥患者，可是通過許願石，他康復了……慢著，許願石！」
美琴忽然想到了這個，然後又猛然想到什麼，飛快的跑走了，美琴跑去的方向，正是佐天淚子和初春飾利所居住的宿舍的方向。
……
在淚子居住的房間里，淚子昏倒在地上，茶水撒了一地，看樣子是剛好在端茶。一旁的雪米妮正流著眼淚拼命地搖著淚子︰「淚子姐姐！淚子姐姐！」就在剛才，淚子忽然就倒在了地上，並且失去知覺。
……
……
一道黑影站在一根充滿綠色液體的柱子前，看著液體中間的黑色小石頭緩緩變大，忍不住大笑起來︰「哈哈哈，計劃開始咯。」