「完蛋了」馬格納加魯魯獸看到煙霧升起，抱著腦袋痛苦地大叫。
「成功了。」顯示器後面的軍隊高聲歡呼道。
「這麼多的能量，足夠實行我的計劃了。」倉田在基茲獸的保護下，在恐怖的爆炸中毫發無傷。
「現在我們怎麼辦？」知情者們著急地團團轉。
「啊，啊，啊」煙霧中傳來憤怒的咆哮神，濃煙被吹散，展示爆炸後的狼藉。
海面上，只剩下三三兩兩的數碼寶貝。其中究極體的存在只是臉色發黑，完全體數碼寶貝卻有了不小的傷亡。最弱小的成熟期數碼寶貝，只剩下幾只。不過對于數碼寶貝來說，死亡並不是什麼太大不了的事情，所有死亡的數碼寶貝，都變成一枚數碼蛋。現在只要將數碼蛋送回數碼寶貝世界重新孵化就可以了。
見到數碼寶貝們眼中的畏懼，梅爾瓦獸舉起權杖，說道︰「孩子們，世界樹已經向我們傳達了他的意志。人類接連入侵數碼寶貝世界，不知悔改，不但殺戮了許多數碼寶貝，甚至對數碼寶貝世界也造成了傷害。人類必須為自己犯下的錯誤付出代價。」
阿波羅獸站出來，大聲說道︰「今天，我們要向人類世界發動戰爭，消滅所有人類，用人類的世界來修補數碼寶貝世界的傷口。」
阿波羅獸並不是向人類宣戰，也不是向幸存的數碼寶貝喊話，而是向整個數碼寶貝世界發出自己的聲音。听到阿波羅獸的話，每一個渴望生存的數碼寶貝，每一只憧憬未來的數碼寶貝，都將站出來為數碼寶貝世界付出自己的力量。
「這是正義的戰爭嗎？」。托馬喃喃自語道。人類的戰爭，從來都是上層追求利益的衍生品，從來都沒有正義的。可是數碼寶貝在人類世界沒有任何利益可言，如果不是人類自己作死，威脅到數碼寶貝的生存，數碼寶貝絕對不會向人類發起戰爭。不過戰爭似乎不可避免，受到攻擊的人類，同樣會為了守護家園的正義戰爭付出一切吧。
「數碼寶貝世界將要重建，秩序重新建立。」阿波羅獸的聲音已經傳遞到整個地球。面對這樣的強者，似乎輿論控制已經沒有意義了。「世界樹將會重建數碼寶貝世界，重建黃道聖斗士，重建生肖守護神，重建群星監測者，重建虛空衛士，重建海洋執法者，重建陸地守護者，重建調停者，重建，」阿波羅獸頓了頓才說道︰「奧林匹斯。」
「戰死的數碼寶貝，將會在世界樹下重生，將有機會進化到究極體，守護新世界的秩序。但是首先，我們要建立新的世界。」阿波羅獸說完，手中扔出一枚能量彈，將目前人類最高的建築物，新東京塔打成碎片。
「看來數碼寶貝的氣勢已經達到最高點了。這個時候如果給他們來一下狠的，應該有意想不到的成果。」倉田嘿嘿一笑，指揮基茲獸XT們沖了上去。
奧林匹斯的神明們已經放下了一切負擔，基茲獸XT的數量雖然多，但是面對五只全力戰斗的究極體數碼寶貝還是有些不夠看。可是基茲獸XT也沒有擴大戰果的想法，只是分出一部分基茲獸XT來拖延，而剩下的基茲獸群體沖到海面上，一槍一個強數碼寶貝死後留下的數碼蛋打碎，然後基茲獸XT手中深處一枚管子，將數碼寶貝的能量收集起來。
在倉田的計劃里，基茲獸XT本來就是消耗品。生產基茲獸XT消耗大量資源，但是這些資源都是人類世界所擁有的。而數碼寶貝的本源能量是人類世界難以獲取的。在被阿波羅獸他們消滅了九成九的基茲獸XT之後，倉田也心滿意足地抱著收集滿能量的儲存罐，向自己最隱秘的基地出發。戰場上卻只剩下五大究極體數碼寶貝，之前那些在爆炸中幸存下來的成熟期，完全體數碼寶貝已經全部戰死了。
「啊，啊。」阿波羅獸看著空空蕩蕩的海面，發出不甘的怒吼。然後一抹黑色從阿波羅獸的耳後浮現，迅速佔據了阿波羅獸全身。「從現在開始，我是月光復仇者，吳剛獸。」
佔領世界，和殺光人類是兩碼事。這個世界目前被稱為人類世界，是因為人類是這個世界的文明的主導。而數碼寶貝們並不想要主導這個世界，而是打碎這個世界。那麼在這一過程中，人類的存在其實無關緊要，因為人類沒有能力參與世界的根源處的戰斗。不過世界破碎後，幸存的人類會就是上個世界的遺民，會擁有不可思議的力量，假如在世界融合的過程中進入到數碼寶貝世界，可能會引起新的問題。所以數碼寶貝世界派出軍隊來消滅所有人類。不過現在軍隊已經消失了，究極體數碼寶貝們自然不會做這種掉分的事情。除了吳剛獸。
吳剛獸自稱月光復仇者，心中對人類的仇恨可想而知。在這一立場上，只要能殺戮人類的事情，吳剛獸不會有任何遲疑。不過也正因為這種心態，各國的聯軍付出極大的代價將吳剛獸引到了非洲。總算讓這一強大的數碼寶貝停下腳步。
全世界都在尋找倉田。有些人希望能用倉田換來數碼寶貝與人類的和平，有些人希望倉田能帶領人類戰勝數碼寶貝。當然還有一些奇葩希望能將倉田抓起來，榨干倉田的價值，而人類世界的發展卻不再這些奇葩的考慮中。但是倉田究竟在什麼地方，卻沒有人知道。
「快了，最多七天，鄭凡就能從石像里出來。」古樂獸繞著鄭凡化成的石巨人飛了一圈。告訴大家一個還算可以的消息。
「不行啊，根據計算，在不損傷數碼寶貝世界的情況下，最多四天時間就能打開大型的空間通道。」野口博士沉聲說道。
「我們必須用同歸于盡的辦法才能和數碼寶貝世界平等對話。」薩摩撫模著管狐獸，提出種種陽謀。
「我和拓也可以各自對抗一只究極體數碼寶貝，剩下的三只究極體數碼寶貝怎麼辦？」輝二了解自己超武裝進化後擁有的力量，所以相當悲觀。
輝二作為斗士精神的代表參加會議，而拓也則跑去訓練自己。作為野生的斗士，拓也他們的戰斗力全部來自數碼武裝。在大門大的介紹下，準備用科學的方法提升自己的戰斗能力。
仿佛天生的武學奇才，才兩天的時間，拓也他們的實力已經提高了一個檔次。現在大家進行人形武裝進化後的實力已經不比過去用獸性武裝進化的實力差了。一起提升的還有大門大。三天前大門大可以和拓也的人形武裝進化火神獸打平，三天後依然是平手。
就在眾人焦頭爛額之際，會議室的大門被強勢打開，守門人被打飛。托馬•H•諾史丁領著兩只數碼寶貝走了進來。
「生化數碼寶貝。」輝二第一時間就確定了對方的身份，但也強行控制住自己的厭惡。
「托馬，你還有臉回來。」淑乃上前，一個巴掌打過去。托馬挺直了身子，不閃不避。
「各位，托馬其實是受我的委托而加入倉田實驗室的。要怪，就怪我吧。」湯島沖上前，抓住淑乃的手掌。
「不是的，後面的事情都是因為我自作主張。我感覺，倉田的研究會對我妹妹的病情有所幫助，所以才會發生後面這些事情的。」托馬臉色慘白，恐怕萌發了死志。
「切。」生化忘憂花獸根本不理會身後的弱者，眼中只剩下輝二，利用斗士精神來進行武裝進化的強大存在。輝二卻只是中學生，很快就害羞地敗下陣來。
「我也是究極體，大概能拖住一只究極體數碼寶貝。不過我還帶來了倉田的研究資料，能夠把人類改造成強大的數碼寶貝哦。」此刻，奈奈美已經解除了進化，用人類形態加入談話。
「不可能的，那些數碼寶貝完全無法掌控自己的力量，沒有任何意義。」薩摩反駁道。
「誰說的，這里不是有也有人能進化成數碼寶貝，而且力量控制地非常完美。」奈奈美瞥了一眼輝二。
沒有哪個世界的選召的孩子，像斗士們一樣有明確的目的了。消滅邪惡，這是古代數碼寶貝留下自己的武裝時一起留下的精神。而繼承了斗士精神的孩子們，也是在履行這一責任的過程中成長起來的。
生化數碼寶貝就是邪惡的。用邪惡的方法，邪惡的過程制造的邪惡數碼寶貝。雖然如此，但是斗士們的行動時只會淨化其中的邪惡能量，卻不會做邪惡的事情。
而奈奈美卻是對輝二這些代表正統的，如貴族一般的斗士有說不清的痛恨。他們一出現，就否定了自己所做的一切努力，他們一動手，就毀掉自己的幸勤勞動的成果。那種痛恨，比斗士對邪惡的痛恨強烈一百倍。
托馬回到這里，是為了參與到戰爭里。而奈奈美來到這里，是為了毀掉斗士們，為此不惜犧牲自己。而且，奈奈美已經有了新的計劃。