在以亞基利獸為代表的黑暗數碼寶貝的計劃下，黑暗之塔出現在地球的各個角落。由此而引起的空間混亂以及數碼寶貝暴走給人類造成了巨大的損失。
為了清理這些混亂，眾人不得不鎖定數碼寶貝世界的大門，調整大門權限。然後從人類世界清理每一只陷入狂亂狀態的數碼寶貝。
即便以數碼寶貝的力量與速度，做完這些事情也已經過去了好幾天時間。這還是因為有數碼寶貝世界零時選召出來的孩子幫忙。地球實在是太大了。
「太好了，終于又可以吃到媽媽做的飯了。」臨江的公路上，扶著護欄的女孩子歡呼著。
「嗯，我宣布，這次的作戰完美勝利。我們又一次擊退了敵人的陰謀。」太一揮著拳頭，很有氣勢地說道。周圍的眾人一同舉手，響應太一。除了太一的妹妹。
「嘉兒，你怎麼了，有什麼不對嗎？」。阿武擔心地問道。
「沒什麼，我只是在想，敵人一定還有別的計劃。這些在地球上搗亂的數碼寶貝，不會有什麼大作為的。我們的敵人也一定知道這一點。」嘉兒用力地抓著護欄，眉宇間透露出深深的擔憂。
成熟期數碼寶貝可以破城，完全體數碼寶貝可以滅國。但要做到這種程度，必須要有時間和計劃。可是那些闖入人類世界的數碼寶貝全部都是狂亂的。或許他們能在最初的階段制造巨大的災難，但是只要人類緩過神來，對付這些智商欠費的家伙還是很輕松的。
「這也許是敵人的調虎離山之計，也有可能是疲兵之計。所以我們要做的，就是回家去好好休息，隨時應對接下來可能發生的事情。」大浦突然說道。結果所有人都將目光投了過去。
「你們，為什麼這麼看著我啊？」大浦一臉的呆萌向，問得大家一頭冷汗。太一結結巴巴地回答道︰「真是，我只是沒想打，大浦能說出這麼有，有，有道理的東西來。」說完，太一趕緊擦擦頭上滲出來的汗珠。而其他人都哈哈大笑起來。
听到太一的話，大浦這才發現，自己剛才所說的話，竟然與自己平常的風格完全不同。看著其他人哈哈大笑的樣子，有些惱羞成怒地說道︰「什麼嘛，不準再笑了。」
嘻嘻哈哈地打鬧後，一乘寺賢第一個向大家道別。再接著，大家各自分散離去了。
太一和光子郎還有嘉兒是一條路的。半路上，太一突然說道︰「光子郎，你很在意一乘寺賢的狀態。」
「嗯，沒錯，那家伙太努力了，這樣的努力，反而讓我有一種不好的預感。」光子郎不無意外地回答道。
「你是指，大浦所說的疲兵之計嗎？這樣想起來，這次的事情，帝皇龍甲獸的消耗是最大的。」太一沉吟片刻，在腦海中編織事情的頭尾。
「我們的戰斗，從頭到尾都像是在玩鬧。只是打破幾座黑暗之塔，甚至找不到敵人的觸手，更別說發現敵人的本體。」嘉兒有些低沉地說道。
「真正的敵人一直隱藏在黑暗中，在進行我們還沒有察覺到的陰謀。」光子郎說道。
「不，是陽謀。」太一突然大聲說道︰「黑暗之塔的力量可以改變世界的環境。如果我們放任黑暗之塔，敵人根本不需要做其他事情，靜靜等待就可以了。如果我們將注意力放在黑暗之塔上，敵人也可以按暗地里悄悄行動。」
「嘉兒，我想，是因為你們之前的動作太激烈了，已經影響到敵人的行動。所以他們才會在人類世界進行報復性的破壞行動。我想，這是敵人的調虎離山之計。」光子郎也說道。
「其實敵人的觸角還是有的。亞基利獸他們就是。我們應該想個辦法，抓住那兩個家伙。」迪路獸也說道。
「哥哥，大家不用安慰我。這些事情我都知道的。」嘉兒輕聲回答，心中因太一等人的安慰而感覺溫暖。
「我只是在擔心，如果我們的行動繼續深入，敵人在人類世界的破壞會不會變本加厲。如果真的發生那種事情，我們又應該怎麼辦呢。」嘉兒擔憂地說道。
「主動權。我們沒有主動權。」太一緊握著拳頭，不甘心地說道。
「想這些事情是沒有意義的，如果因為這樣的原因而放棄對抗，才是最大的笑話。如果敵人要報復，我們能做的就是十倍，一百倍地報復回去。將事情從根源上消滅掉。這才是對受害者最好的答復。」曾經在吸血魔獸手下謀生的迪路獸如此說道。
「沒錯，就像迪路獸說道一樣，其實敵人的動作越大，說明我們的優勢越強。如果因為這樣那樣的原因放棄我們原本的優勢，那才是真正的傻瓜。」光子郎補充道。
而回家的路上，太一再也沒有發出聲音。
正如大家所預料的那樣。敵人又有了新的動靜。這一次，似乎是真正的敵人。
一只海魔獸傍著一艘游輪，得意洋洋地看著潛鯊獸。只要潛鯊獸有所異動，一船游客頃刻間變回葬身大海。
「可惡，誰能告訴我現在該怎麼辦。」伊織不甘心地說道。也就在這是，原本波濤洶涌的大海變得安靜了。
一只巨龜悄然浮出水面。而作為水生數碼寶貝，海魔獸與潛鯊獸沒有察覺到半點動靜。只見那巨龜的龜殼月兌離身體，飄到海魔獸頭頂上，猛然砸了下去。
直到最後，海魔獸才察覺到危機。此刻的海魔獸已經沒有半點反抗或者逃生的可能了，于是猛然拋棄求生的念頭，拼著最後的力氣，朝游輪吐出一口漆黑的墨汁︰「罪孽黑毒」
「大海無量」戰斗經驗豐富的龜丞相自然在防備海魔獸做出同歸的舉動，當場操縱海水，形成一層巨浪，將海魔獸的舍命一擊擋住。保護了游船上的游客。
「阿丈學長，謝謝你。」伊織和潛鯊獸來到龜丞相身邊，龜丞相身上，站著一個意氣風發的少年。
「沒什麼，伊織，多虧你在前面吸引了海魔獸的注意力。我和龜丞相才能偷襲成功的。」阿丈沒有半點驕傲地說道。
「不好，阿丈，我們中計了。」龜丞相突然說道。
「怎麼了？」阿丈和伊織連忙問道。
「海魔獸本來就是炮灰。那家伙的罪孽黑毒里還有別的東西。在完全消解以前我不能離開這里，不然這附近的所有海水將受到不可逆轉的污染。」龜丞相沉聲說道。
龜丞相是這個世界過去從來沒有出現過的數碼寶貝，是海獅獸走出自己的道路進化成為龜丞相的。古代種數碼寶貝是真正的天之驕子，就算是完全體的等級，也足以匹敵究極體數碼寶貝。犧牲一只完全體的海魔獸困住龜丞相，這筆生意還是很劃算的。
「可惡，沒想到是這樣。伊織，我們快點通知其他人，讓大家小心陷阱。」既然龜丞相會遭遇這樣的陷阱，幕後黑手怎麼可能放過其他人。現在只希望敵人的計劃還沒能啟動。
果不其然，太一的通訊已經無法接通了。而阿和那邊，卻是遭到******獸的襲擊。鋼鐵加魯魯獸追殺******獸到了火山。結果******獸毅然自爆。鋼鐵加魯魯獸不得不全力鎮壓火山爆發。幸好，素娜沒有遭到敵人的狙擊。而其他人只是完全體級別的戰斗力，被相應的對手拖在戰場上，隨時可以月兌身。
「超大角炮。」超比多獸一擊打中魔龍獸後背，魔龍獸慘叫一聲，當場灰飛煙滅。
「嘉兒，天女獸，需不需要幫忙？」眼見天女獸和女惡魔獸還在糾纏，光子郎上前問了一句。只是腦海中猛然回想起當年的事情。
「不需要。」「天女獸加油。」
果然。光子郎有些尷尬地扭過頭，不再關注天空中的戰斗，然後給其他人傳遞消息。
「啊」超比多獸猛地發出一聲慘叫。所有人看向那邊，發現超比多獸身上的甲殼凹陷，卻沒有發現敵人的蹤影。
敵人，在什麼地方？疑惑間，阿武和神聖天使獸從遠處飛了過來。
「大家小心，敵人是喪尸撒旦獸。」神聖天使獸搜尋敵人，阿武則為大家示警。
「喪尸撒旦獸。」光子郎等人的神情當即變得凝重。喪尸撒旦獸是以技巧和經驗著稱的近戰數碼寶貝。這種家伙說強不強說弱不弱，但是眼下在城市當中，大威力大範圍的絕招不能用，恐怕沒有人是喪尸撒旦獸的對手。
「哥哥不在嗎？」。阿武觀望四周，沒有看到獸人加魯魯或者鋼鐵加魯魯。
「阿和學長不在。敵人引爆了火山，鋼鐵加魯魯被拖住了。太一學長也聯系不上。」小京將情報告訴阿武。正說話間，亞古拉獸發出一聲悲鳴，被打飛嵌在牆壁上。
「喪尸撒旦獸，別跑。」神聖天使獸一直都在追蹤喪尸撒旦獸，突然搞出這麼大的動靜，自然無法逃過神聖天使獸的眼楮。
「敵人就交給我們好了。」喪尸撒旦獸的逃竄路線上，猛地鑽出一只大家伙，將道路封死。大家活頭上，大浦和小賢露出得意的笑容。