在得到了總統的最高許可之後，很多盟軍機密級的作戰兵器都可以建造了。盟軍的超時空傳送儀和質子撞擊炮就是這種類型的超級作戰兵器。年輕的愛因斯坦在一次演講之中發生了意外，沒能繼續她的科學研究事業。但是他的助手在查閱愛因斯坦遺留下來的手稿時發現，這位天才的科學家在他「光電效應」的研究之後更近了一步，發現原子之中可能有超強的能量。盟軍的科學家很快接手了這方面的研究，他們發現用高速（接近光速）的質子團直接撞擊原子，放出多余的質子和巨大的能量。而這種撞擊還會產生一些連鎖反應，連鎖反應是因為放出的多余質子撞擊其他原子造成的。在能量達到一定大小時質子轟擊其他原子，破壞原子內部作用力，將質量轉化為能量，這與核彈原理類似。但是因為質子帶電，靠近其他原子會被排斥因此會有損耗，所以這一反應會停止，所以這個武器沒有直接毀滅地球，卻有足夠殺傷力。
對于傳說之中的質子撞擊炮，太子殿下已經眼饞很久了。帝國近些年來的軍事實力一直都在騰飛，但是底蘊還是補足。雖然海陸空三軍很強，但是還是沒有自己的超級武器。太子殿下希望硫娜可以趁機從其他國家的超級武器之中借鑒一些東西。正海譚雅提出要使用質子撞擊炮，硫娜就悄悄地派遣出了帝國的忍者前去探听虛實。作為帝國的間諜部隊，忍者有些時候甚至比盟軍自己的間諜還要好用。帝國人有時候戲稱盟軍的間諜是用錢戰斗的，事實上盟軍的間諜可以在支付一些金錢的情況之下直接策反敵方的部隊——這一點和Y倒有幾分相似。
娜塔莎也貢獻出了蘇聯的真空內爆彈。這是蘇聯終極武器，是俄軍科學家發明的。他們將倫理道德拋到一邊，經過反復實驗、測試最後發明了這種駭人听聞的彈頭。其有效範圍要比盟軍的質子撞擊炮的攻擊範圍小一些（指對單位的有效範圍，對建築的有效範圍其實三者一樣），但對活動單位威力比它們強，其強大之處是能將有效範圍一切活動單位（包括空中單位和潛水單位）吸到空中繞其攻擊中心旋轉並將其爆破摧毀，「真空內爆彈」中的「內爆」從這里體現。因此可以考慮著重攻擊單位密集區域。相對而言，真空內爆彈對于軍隊的殺傷力更大，它並不適合拆建築。硫娜也嘗試著盜取了真空內爆彈，但是太子看了之後卻大失所望。原來這需要蘇聯特有的超級反應堆技術才能實現，而帝國地域狹小，並不適合建造佔地面積極大而又很危險的超級反應堆。
在主基地正在建造超級武器的時候，被困在Y的領地附近的硫娜等人也沒有閑著。她們分成兩個小組去解決蘇聯的超級反應堆。
硫娜這一邊首先面對的是磁暴線圈的集群。硫娜作為肉盾頂在了最前方——在這次任務之前，太子將應用于「將軍劊子手」的超強反特斯拉裝置編寫到了硫娜身體之中的納米機器人之中，雖然做不到被特斯拉攻擊回血，但是硫娜還是可以成功地扛著七八個特斯拉線圈的攻擊談笑風生。有了硫娜這個MT的存在，百合子輕而易舉地將一座座磁暴線圈拔了起來。只有兩個人的小隊四舍五入之後就像是一個億，輕而易舉地就突破了敵人嚴密的防線。雖然敵方的抵抗很頑強，派出了茫茫多的海嘯坦克洪流前來堵截，怎奈硫娜這一邊有著盟軍的戰場監視（SurveillanceSweep），就和開圖了沒什麼兩樣。再加上硫娜和百合子人數少目標小，所以地方根本抓不住她們。反倒是為了維持鐵幕裝置的正常運作，Y的超級反應堆太多，防御塔拉扯出來的戰線太長，反倒是被硫娜逐個擊破。Y的很多超級反應堆都被摧毀了。
硫娜和百合子在人群之中開了無雙，而譚雅和娜塔莎也大鬧了一場。譚雅精準的手槍火力壓制可以殲滅所有的步兵單位，而娜塔莎則是用她出眾的狙擊天賦可以透過敵人的載具直接狙殺其中的駕駛員。很快，大地上多出了數量多得數不清的無主海嘯坦克、天狗機甲、鐵錘坦克、V4、天啟坦克和牛蛙載具。和百合子與硫娜類似，娜塔莎和譚雅也是極好的組合。他們也成功地破壞了Y的電力。由于電力大幅下降，所以Y無力維持所有的鐵幕裝置，對于Y的基地的無敵保護時間有了空隙。但是，這個空隙其實很小，大概一天之中只有半個小時主基地才不是無敵的。
這個時候盟軍的質子踫撞炮已經造好了，真空內爆彈也已經準備就緒。這時候，硫娜也得到了一個好消息。由帝國忍者部隊竊取的質子踫撞炮已經成功通過MCV之中的納米核心送到了太子那邊。帝國的科學家在連夜研究之後，終于破解出了其中的一些關鍵信息，並且即將成功創造出帝國自己的超級武器︰「納米蟲巢」。
「我們什麼時候才能得到納米蟲巢？」硫娜問道。
「短期內的使用時不可能的了。」太子解釋道，「納米蟲巢的技術還不是很成熟，我們還沒有切實實踐過。而且其中還有一個很有意思的現象——我們的科學家模擬之後發現，如果在盟軍的質子踫撞炮之後使用納米蟲巢的話，質子踫撞炮會有多米諾骨牌效應，威力將會稱幾何級數地上升。可能是因為我們納米蟲巢的科技借鑒了質子踫撞炮的創意，但是這件事情我們實在不想讓盟軍知道。所以在這次任務之中我們也最好不要使用納米蟲巢。」
「其實我覺得也不需要，實際上我覺得連質子踫撞炮也不需要。」硫娜微微一笑，「如果我沒猜錯的話。」
「我不知道你發現了什麼，但是希望你可以盡快完成任務。」太子說道，「這次你竊取盟軍的科技，做的很好。作為獎勵，你回來之後淺川博士會對你進行進一步的加強。」
「好的。」
硫娜掛斷了太子的通訊。
「對我進行加強……真是不太好听的說法呢……」
「怎麼？被你的上司欺負了麼？」譚雅壞笑著說道。現在幾個人已經匯合到了一起，她們正在等待著超級武器的準備時間。這些昂貴的大家伙（質子踫撞炮造價5000萬元）做起事來總是慢吞吞的。
「你說起話來怎麼像個色老頭一樣……」硫娜聳了聳肩，丟掉了心事，「我想問你，如果你使用你的那條腰帶，就能回到過去麼？」
「你說得沒錯，小女孩。」譚雅撩起了外衣，露出了她引以為豪的時空腰帶，「只要摁下這個小小的按鈕，我就會變得更加年輕……是不是很羨慕呢？」
「那你的記憶呢？」硫娜問道，「你還回記得按下按鈕之前的那段時間的事情麼？」
「不記得了，不過那又有什麼？」譚雅毫不在乎地聳了聳肩，「我丟失掉的也就是幾分鐘時間的記憶，那和我漫長的人生比起來算不上什麼。再者說這條腰帶救了我好幾命，活著科比什麼都好。」
「可是你在回到過去吃掉的東西，射進身體里的子彈之類的東西都去了哪里？」
「誰知道呢？可能是外太空吧，或者是什麼時間間隙之類的。」譚雅無聊地擺了擺手，「那些穿著白大褂的科學家曾經和我說過這方面的事情，但是我按了一下腰上的按鈕之後就全忘光了。放過我吧，讓我听那些東西就是就是在折磨我。我只會用到殺人，太復雜的事情我可玩不轉。」
「這樣啊……」硫娜若有所思地點了點頭。
「你們別聊了，從主基地那邊傳來了一個不好的消息。」娜塔莎說道，「好像是我們用過頭了，我們的戰場監視（SurveillanceSweep）被對方的科學家嚴加防範，他們嘗試著破解了我們盟軍的間諜衛星。雖然我們發現的及時，重新或許了衛星的掌控權，但是他們在最後關頭竟然破壞了衛星上所有的數據。這樣有好一段時間我們都沒法使用衛星了。」
「所以說呢？」
「所以說我們就看不到Y的主基地了，我們也就沒法往那個地方投放超級武器。」娜塔莎聳了聳肩，「就這麼簡單。我們需要親自走到那里，為我們的超級武器定位。」
「喂喂，饒了我吧，我可不想去。」硫娜連忙搖頭，「去了之後不會被一起炸上天麼？」
「理論來講不會，因為超級武器從定位到投放有兩分鐘的時間，我們可以跑出去。」娜塔莎解釋道，「不過或許會被余波掀上天……不過以你的體重的話，這是不可能的吧。」
「……」硫娜翻了翻白眼。
「講道理的話，我建議我們之中的一個人去。如果派其他人去有可能會被Y控制。」譚雅建議道，「我們都是身經百戰的戰士，你們兩個人都不算是人類，所以沒關系。」
「你既然這麼說，那就你去好了啊。」硫娜說道。
「好啊，那就我吧。」譚雅認真地說道。
「喂，那可是相當地危險啊。」硫娜本來也只是隨口一說，沒想到譚雅竟然直接答應了下來。
「你放心吧，她有她的寶貝腰帶，死不掉的。」娜塔莎說道，「像她那樣沒心沒肺的人，總是能活得比一般人久一點。」