自從我們在你和嘉兒身上發現人類徽章對于數碼寶貝促進後，我們就著手開始分析你們的數據。我們本來因為能量的不足而擔心，但是你們的身上擁有巨大的能量。我們假意答應千年獸的要求，一邊加緊分析你們的數據希望可以找出原因。這樣就可以不必依靠千年獸了。畢竟我們對千年獸從來不信任，而千年獸對我們也是如此。當初我們和千年獸之間的交易，說實話誰都沒有真的相信對方會真的履行。
但是我們在分析了你們的數據後發現你們有一個獨特的數據。這段特殊的數據我們無法理解，經過分析我們也不明白這段數據為什麼可以擁有巨大的力量可以促進數碼寶貝的進化。無奈我們回收了那個暴龍獸但是在回收的過程中，千年獸插手了他利用火牆的一個漏洞將暴龍獸搶走了。我們雖然及時的補上了這個漏洞但是卻晚了一步暴龍獸還是被千年獸帶走了。
千年獸利用鋼之帝國留下的技術將那只暴龍獸改造成了機械暴龍獸，在千年獸給機械暴龍獸灌注了黑暗的能量後再次改造成了機械邪龍獸，從而誕生了第一由進化而來的究極體，在此之前究極體的數碼寶貝只能用無窮的能量來催化比如十三皇家騎士和黑暗七魔王。但是機械邪龍獸的出現打破了這一個常識。從而讓數碼寶貝世界擁有了自然進化究極體這一個概念，從而讓數碼寶貝擁有了自然進化為究極體的可能。
我們于是想到了將人類世界的孩子們帶到數碼寶貝世界並且給他們相匹配的數碼寶貝搭檔，從而讓他們可以催化數碼寶貝，增添我們的戰斗力。我們掃描了當時在場的孩子們將他們的心紋制作成了可以放大他們心紋和提高心紋力量傳送給數碼寶貝的利用率。但是我們擔心在你們以後是否還可以擁有這個品質，或者在有了數碼寶貝後會用他們做一些不好的事情，于是我們在徽章上加入了密碼，只有在檢測到你們有這個品質時才可以發揮徽章的功能。
我們和代理者將全部的精力都投入到了制作神聖計劃和徽章的工作里，但是數碼寶貝世界也不能沒有管理者。于是我們選擇了五只神聖的數碼寶貝將他們的力量用聖石提升到了究極體，並且將聖石所掌管的法制給了他們希望他們可以代替我們管理數碼寶貝世界。在做好了這些後我們就開始了工作，希望可以在與千年獸決戰的最後時刻讓這些數碼寶貝轉化為助力。
但是在這個時間里鎮座數碼世界中央掌管「大地(世界)」的皇帝數碼獸黃龍獸是數碼寶貝世界的第一只數據種數碼寶貝被在遙遠古代降臨的一只天使數碼獸封印于地下深深的黑暗中。因此失去統治的四聖獸開始爭奪霸權。雖然黃龍獸陷入了封印但是他卻是第一只數據種的數碼寶貝從此數碼寶貝世界有了數據種的數碼寶貝。
掌握著數碼寶貝世界的規則守護東方操縱雷之力量的青龍「青龍獸」守護北方操縱水之力量的玄武「玄武獸」守護南方操縱火之力量的朱雀「朱雀獸」守護西方操縱鋼之力量的白虎「白虎獸」。和手下的十二帝厲魔毘羯羅獸(亥)，宮毘羅獸(子)，伐折羅獸(丑)，迷企羅獸(寅)，安底羅獸(卯)，頞羅獸(辰)，珊底羅獸(巳)，因達羅獸(午)，波夷羅獸(未)，摩虎羅獸(申)，真達羅獸(酉)，招杜羅獸(戌)開始了互相討伐，在這場本不用的戰爭里無數的數碼寶貝卷入其中。
四聖獸他們的職責是維護數碼寶貝世界的平衡和平穩的運行。但是他們爭權奪利的行為將數碼寶貝世界帶入了戰亂之中，在這場戰爭中無數無辜的數碼寶貝死亡，他們的怨念在數碼寶貝世界中不斷的飄蕩不願散去。來自人類的負面思考、被這場戰爭影響進化不了而滅亡的數碼寶貝們的怨念。數碼獸即使在進化的過程中不幸消失了，仍然能做為別的數碼獸在創始村築構重新復活。但是對自己消失的怨念、思想等仍會殘留。
由大量進化中消失的數碼寶貝的怨念和人消極的思考加上來自黑暗之海的數據成為了一個恐怖的結合體—極惡魔王強大的力量足以毀滅平行世界。與「恆常性」是完全相反的兩派，其巨大的身體里充滿了留戀不已的數碼寶貝們各種各樣的怨念，以及所有黑暗系數碼寶貝的進化、必殺技、通常技之類的情報……
極惡魔王想用體內預先準備的大爆炸將世界重置，之後自己創造新世界的規則，也就是成為「神」。將進化、成長、運動、所有反復無常的事物（也就是「進化」的概念）都否定掉，正如他本身的概念一般，成為停滯又死寂的新世界之神。開始與四聖獸爭奪數碼寶貝世界的控制權。四聖獸停止了戰爭，開始站在統一戰線與極惡魔王斗爭。但是他們之間的戰爭讓數碼寶貝世界再次開始了動蕩。
最後四聖獸借助數碼寶貝世界的力量封印了極惡魔王將其封印在了火牆外面。但是這場戰爭讓數碼寶貝世界的平衡消失了。火牆也開始變得不是那麼的緊密可以防御黑暗區域的侵蝕，黑暗區域開始不斷的侵蝕數碼寶貝世界。
在這個時候千年獸利用這個時機開始沖擊封印，我們只能留下代理者繼續制作神聖計劃和徽章，好在已經差不多完成了。我們則去黑暗之海監視千年獸的行動。
就在這時候千年獸利用極惡魔王留下的後手發動了，小丑皇帶領著機械邪龍獸襲擊了我們制作神聖計劃的地方。代理者們的戰斗力並不強大，沒能抵擋小丑皇他們的進攻他們奪走了徽章，而一個代理者—現在的玄內帶走了數碼蛋和神聖計劃。
四聖獸得知後趕緊去阻止但是千年獸另外又催生了木偶獸、改造成了鋼鐵海龍獸與四聖獸他們對抗。我們與千年獸再次展開了戰斗，無暇顧及數碼寶貝世界的變化。等到我們還不容易將千年獸再次鎮壓起來時，四聖獸他們已經被黑暗四天王所壓制。我們本來想要幫助四聖獸但是卻發現這不是我們可以插手的因為黑暗四天王這時候表面上還是極惡魔王的棋子。而極惡魔王是從數碼寶貝世界出生的雖然他不是正常的數碼蛋但是也是屬于數碼寶貝世界的。我們的職責是維護數碼寶貝世界。等到我們明白這是千年獸的陰謀時，已經晚了一切已經是定局了我們也被千年獸所牽制。
黑暗四天王他們開始封印四聖獸，于是我們準備利用這個機會，快速的實現數碼寶貝世界的升級。數碼寶貝世界從人類世界而來，所以復制人類世界的規則是最快捷方便的，所以數碼寶貝世界有那麼多奇奇怪怪的東西。
千年獸與我們約定都不可以干擾數碼寶貝世界雖然誰都沒有把這個約定放在心上。但是我們還有更深的考慮，人類本身擁有光和暗兩個方面，如果讓人類來統領數碼寶貝世界，那麼數碼寶貝世界升級的能量就可以從兩個方面獲得了，而且從人類世界復制的規則如果有人類來使用那麼就可以更快的融入數碼寶貝世界了。
所有我們將你們召喚到數碼寶貝世界以後，就將我們手上所有關于鋼之帝國的資料留在了鋼鐵工廠，只要你到以後就會顯示出來，我們希望你可以盡快的成長起來，抵擋黑暗四天王。