一股巨大的黑暗能量從黑暗龍卷山的山下涌上來將整座黑暗龍卷山染成了黑色。
突然孩子們所在的位置出現了一個大洞將孩子們吞了下去。
「啊——啊——」孩子們驚叫這掉了下去。
「怎麼了？」獅子獸他們趕緊跑過去，但是那里已經恢復了原狀。
他們掉下去的洞里充滿了黑暗色彩和扭曲的光線，宛如無底洞一般。
「太一。」
「阿和。」
「素娜。」
「阿助。」
「光子郎。」
「美美。」
「阿武。」
「嘉兒。」
孩子們的數碼寶貝緊跟著孩子們落下來想要接住孩子們，但是孩子們卻在掉到了一個地方時停了下來。懸在空中。四周望去好像宇宙空間一樣<。
「太一，阿和你們沒事吧。」奧米加獸落了下來關心的問道。其他的數碼寶貝也跟著陸續的落下來。
「嗯。」太一回答道，看向四周的場景。
「這里到底是什麼地方啊？」光子郎四處張望著。
「嘀——嘀——嘀——」光子郎的電腦響了起來。
光子郎從背上拿出電腦打開後出現了玄內的頭像原來是玄內傳來的咨詢。
「說不定這片黑暗根本沒有結束的時候。」玄內的頭像不斷的閃動著。
「玄內老人這到底是怎麼回事啊？」光子郎迫不及待的想要知道原因。
「你不是叫我們打倒黑暗天王嗎？」。阿和有些不解，畢竟剛剛打倒小丑皇還沒來得及慶祝就被丟到這個地方心情自然不會多好。
「因為生出這些邪惡的根源還沒有被打倒，所以你們的任務還沒有完成呢？」玄內解釋道。
「啊。」孩子們听到回答驚訝不已。
「就是從火牆那邊來的黑暗根源。」
「你說火牆？」阿助不理解這個詞是什麼意思。
「上古時期邪惡的根源被封印到了數碼寶貝世界之外的異空間，火牆是數碼寶貝世界的防御機制將那股邪惡的根源擋在了數碼寶貝世界之外。但是在這之後數碼寶貝世界有出現了一個邪惡的意識體，他匯聚了大量進化中消失的數碼寶貝的怨念和人類消極的思考加上來自黑暗之海的數據成為了一個恐怖的結合體我們稱它為極惡魔王。這個結合體妄圖控制整個數碼寶貝世界因為極惡魔王還吸收了人類的人消極的思考所以僅僅依靠數碼寶貝的力量還不足以挽回這個可怕的危機，所以我們只能提前挑選了人類世界的孩子們來幫這個忙。」
「這麼說在我們之前還有另外的孩子了？」阿助驚訝的說。
「沒錯，但是當時神聖計劃還沒有制作起來所以雖然四聖獸聯合當時被宣召的孩子們打敗了極惡魔王卻無法徹底的消滅他，最後只能將其封印到了火牆外的異空間里面。希望等到神聖計劃制作完畢後在徹底的消滅他。」
「所以選中我們來這里是為了對付這個從火牆外出來的極惡魔王了嗎？他才是最後的敵人嗎？」。素娜反問玄內。
「不過要注意啊，孩子們。他雖然有實體可是還是要用心來戰斗啊。」正說著玄內消失在光子郎電腦的屏幕上。留下一群大眼瞪小眼的孩子們在消化玄內帶來的消息。
太一沒有去湊熱鬧，玄內的話只是騙騙他們罷了。現在太一有更重要的事情要去做。
離開那群圍著一台電腦的孩子們，太一打開了數碼眼鏡聯系分子獸按了一下數碼眼鏡的按鈕，分子獸的身影出現在鏡片上︰「怎麼樣了，完成沒有？」
「太一大王，現在九台格式儀都已經安放完畢了。只要將最後的數碼寶貝世界的本源去來就可以實行‘開天闢地’了。」
「‘方舟計劃’怎麼樣了？」
「已經全部準備完畢了隨時可以實行。」
「好，‘方舟計劃’實行。」
隨著太一的話音落下，放置在數碼寶貝世界的九台格式儀放出了無數由1和0組成的數據流席卷數碼寶貝世界。無數的數碼寶貝被數據流擊中身體在數據流中消散了，不論是成熟期還是完全體的數碼寶貝身體都被擊散。只是一會的功夫整個數碼寶貝世界變的靜悄悄的，在數據流經過一個地方時一個巨大的護罩豎立起來將一座巨大的城市保護起來。數據流被護罩擋住繞開了這座城市繼續前進。
透過巨大的護罩可以看到里面是很多的機械數碼寶貝在街道上維護秩序，在一座座的高樓大廈里面是無數的數碼蛋並且隨著數據流的擴大數碼蛋也不斷的增加著。
視線回到孩子們的這邊玄內消失了，留下一堆听的不是很懂的話。
「他說的話實在讓人搞不懂。」
「這到底是怎麼回事啊，難道我們打了這麼久的數碼寶貝還不是我們真正的敵人？」阿助有些抓狂。
光子郎合上電腦︰「說不定玄內老人所說的只是他們在根本上有所不同而已。」
「可以贏得。」阿和斬鐵截釘的說道︰「因為以前也有像我們這樣的孩子被宣召來打敗同樣的數碼寶貝啊，而且他們並沒有神聖計劃啊。」
「可是他們有四聖獸的幫忙啊，我們只有自己而已。」美美擔憂的說道。
「我們不是只有自己，不是還有數碼寶貝嗎？我們打敗了那麼多的敵人，這一次我們也一定可以贏得。」太一走過來說道。
「對呀，美美你還有我啊。」花仙獸飛到飼主的面前。
美美一把抱住了花仙獸用臉不斷的蹭著邊蹭還一邊說︰「花仙獸你還是這麼可愛啊。」本來臉上的擔憂瞬間變成了享受。
「」
「呃——啊——」四面八方傳來這種惡心的聲音。
「什麼聲音啊，听起來好可怕。」美美抱緊了搭檔花仙獸害怕的說道。孩子們四周看著想找出聲音的來源。
「這邊跟那邊都有一樣的聲音傳過來。」天女獸警惕的說道。
「他好像在說什麼？」阿和仔細的听後說道。
「沒錯，我就是有冤屈不得申訴的怨恨集合體。」一個陰慘慘的聲音傳來。
「你有冤屈？」素娜有些疑惑。
「你是誰？」阿助四處張望著想找出聲音的主人。
孩子們的面前出現一個不規則的多面體並且從里面傳來心跳的聲音。
光子郎咽了一口口水︰「這個就是從火牆的那邊過來的數碼寶貝嗎？」。
多面體的幾個面開始伸長，伸長的頂部打開來伸出幾個由雙螺旋結構連接的爪子。最上面的一個面伸長露出了一個被黑袍包裹的身影，黑袍向後去露出了里面的身影。他的被幾根線連接在多面體上，渾身漆黑。背後的披風里面是紅色外面是黑色的，身體下部與下面的多面體融為一體。
「這個家伙到底是什麼啊？」阿和有些不敢置信眼前看到的東西。
而這個時候從人類的世界天空可以看到空中出現的這一大片的黑暗和極惡魔王的身影。
「那是什麼？」地面上的人類被下了一跳。
這個時候孩子們和他們的數碼寶貝出現在極惡魔王的身前。
「素娜。」
「美美。」孩子們的家人認出了他們。
「哈，哈，哈。你們覺得我長得很丑吧。」
「嗯？」極惡魔王的話讓孩子們模不著頭腦。
「沒錯，你們一定是這麼想的。」極惡魔王沒有管孩子們不回答他的話只是繼續說道︰「因為我們在進化的過程中受到來自外界的干擾。」
「你說進化的過程？」光子郎問道。
極惡魔王沒有理會光子郎抬起雙手繼續說道︰「所有的數碼寶貝都必須要長期的不斷的反復進化，你們知道有些數碼寶貝在進化的過程當中就消失了嗎？」。
光子郎分辨道︰「他們自己不夠強壯，所以在進化的過程當中消失我們也沒有辦法。誰叫他們的適應能力那麼差。」
「給我閉嘴。」極惡魔王似乎被抓到了痛腳一揮手聲音高了起來眼神變得凶惡︰「說什麼沒有辦法，你以為這樣一句話就什麼事都沒有了嗎？我們只是想要好好的生活而已為什麼要被卷入那場不需要的戰爭。他們自己要爭權奪利為什麼要犧牲我們。」
「那只是你們自己不夠強壯罷了，如果你們可以擁有四聖獸他們的實力，你們就不會被戰爭所影響了，說到底還是你們自身的問題怨不得別人。弱肉強食不是數碼寶貝世界的法則嗎？你們難道沒有殺過別的數碼寶貝嗎？」。太一站出來說道。
「你說什麼？難道四聖獸他們發動戰爭是對的嗎？那是他們自己內部的事情為什麼要拉上我們？」極惡魔王露出瘋狂的眼神。
「你到底想要說什麼？」阿和有些煩了。
極惡魔王伸出一只手指指著孩子們「是你們掌握了生殺大權決定我們能不能生存下來的吧。」
「不，我絕對沒有。」光子郎分辨道。