第一章末日挽歌
赤黑色的天空污濁的雨水。
在一片殘垣斷壁中勉強看出曾經繁華的城市輪廓，
而城市中的民眾早就逃得無影無蹤，
一場災難席卷了這個城市。
但是在普通人看來這只是破壞性極強的台風地震等自然現象罷了。
所有人一開始還能有序的遵守統治者的領導有序的逃難，
但隨著死亡像瘟疫一樣瘋狂的擴散，
漸漸有人察覺到不對勁，
如同有什麼看不見的病毒能讓人瞬間致命一般，
就連正常行走的民眾都會莫名其妙的倒下。，
源自未知的恐懼，秩序在瞬間當然無存。
但這種未知的「病毒」蔓延的速度遠遠超過人類逃難的速度，
很快瀧原市附近的風見原、中森，岩手市相繼陷落，
人群中甚至出現如同舉行邪教儀式的自殺者集團。
從高空上看「病毒」如同陰影一樣以遠超人類反映的速度散開，
不僅整個日本，相鄰的韓國、朝鮮、俄羅斯、甚至連遠在大洋彼岸的美國都被開始陰影籠罩。
死亡的盛宴，末日降臨了……
正當人類一片混亂的時候，一切的災難的根源——瀧原市市中心︰
在連一片立足之地都沒有的瓦礫上——
三個少女如同被遺棄的孩子，孤零零的留在這座「死城」
確切的說是兩個害怕的渾身發抖的少女和一個曾經名為少女的尸體……
「魔女之夜」
最強的魔女，永恆的夢魘，最可怕的災難
只要一出現，就會把人類的文明攪得天翻地覆，最為暴虐凶殘的魔女
簡直就像是把世界當作舞台，以人類的哀嚎做背景樂，唱響了文明的終焉。
可偏偏人類無論如何都看不到她，一直以為是超自然的災難
只能一次次徒勞無功的抵抗著苟延殘喘，
終于這次她玩膩了麼？
「……那麼，我要上了！」
一個嚴肅的聲音響了起來——
粉頭發的少女咬緊牙關，悲傷中帶著決絕的目光望向「魔女之夜」
「不行，不行的，連麻美學姐都死了……」
「正因為這樣所以才要去的啊，因為能阻止魔女之夜的人，就只剩下我一人了啊」
「不要去啊！一個人怎麼可能打得過那種東西，鹿目圓同學你會死的啊！」
黑發少女悲戚的叫道
「即使是這樣，我也必須保護大家」
望著粉發少女溫柔的眼神，黑發少女眼淚奪眶而出
「一起逃吧，逃的越遠越好，她太強了，沒人是對手，逃走的話沒人會怪鹿目圓同學的……」
黑發少女沖上前去緊緊抓住粉發少女的右手懇求著
「焰醬，我啊」
在黑發少女絕望的目光中，粉發少女微笑著掙月兌了對方的手
「……和你成為朋友真的是太高興了」
黑發少女一時語塞
「現在想想，能在你被魔女襲擊的時候救下你真是……太幸運了！如果不是成為魔法少女，我也不會有你這樣的朋友，所以成為魔法少女真是太好了，直到現在我也這麼想」
「——可，可這樣的我」
「再見了，焰醬，保重！」
「鹿目圓——！！！」
暫停的瞬間，粉發少女的胸前靈魂寶石閃耀著能容下全世界的光，毅然沖向天空
粉色的光幕籠罩下，面對來勢洶洶的魔女之夜，舉起長弓對準了蒼穹……
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笨蛋笨蛋笨蛋笨蛋
我真是個笨蛋，為什麼偏偏是我這樣沒用的人能活下來……
……這個世界是在開玩笑嗎？
「鹿目圓同學，小圓……」
黑發少女噙著淚緊緊抱著懷里殘破瘦小的身軀。
燒焦的學校制服包裹著滿是傷痕留有余熱的身體，
粉色的頭發因為失去了緞帶亂糟糟的散落，
稚氣未月兌還帶著稍許嬰兒肥的臉蛋卻保存完好，
就好像僅僅只是睡著了，隨時都會醒來一樣，
……如同一位美麗的睡公主。
「為什麼明知道會死還要去……比起拯救我這樣的人……我更希望你能活下來啊！」
不能接受，怎樣都無法接受這樣的結局，
無法原諒，永遠也無法原諒這樣的自己，
你的微笑，你的溫暖是我留在這個世界的意義。
除此之外，即使是活下來還有什麼意義？
兩眼全是淚花的黑發少女眼神漸漸失去了焦距……
「如果這是你的願望的話，我可以幫你實現哦！」
這個聲音是——
黑發少女猛然抬頭
純白的生物，搖晃著巨大尾巴，垂下的耳朵上掛著金環，透露著詭異粉紅的雙眼
「丘比……你……」
蹲坐在黑發少女面前的生物
是一個不用開口就能說話，能實現少女們願望的不可思議的存在
——Incubator
艱難的放下鹿目圓的遺體，黑發少女帶著某種憧憬的激動望向白色生物
「你是說……我可以讓鹿目圓同學她……你說的……願望真的……能實現嗎？」。
面對黑發少女的質疑，白色生物好整以暇的搖晃著尾巴反問道︰
「那麼曉美焰，你願意為此賭上自己的靈魂嗎？」。
還是那樣和這個世界格格不入的悠閑口吻
偏偏在這個時候出現，提出這樣的建議
平時听起來賣萌的口氣卻讓人有種冷徹骨髓的感覺
「如果你有不惜接受戰斗的宿命也要實現的願望——我可以給你力量。」
「只要和你締結契約，不管什麼願望都能實現嗎？」。
帶著顫抖的聲線，黑發少女雙眼閃爍的希望的光芒
「那當然了，看起來，你似乎有這樣的資格呢，告訴我吧，你將用什麼來點亮你的靈魂寶石呢？」
「我……」
黑發少女沉默了一會，摘下眼楮擦干眼淚重新戴好，
然後對上丘比那看不出感情的目光，用充滿堅定的語氣說道；
「我想要重新與鹿目圓同學邂逅一次，不再做一個一味被保護的我，而是能成為保護她的我」
那一瞬間的剎那永恆——
錐心的痛苦幾乎要將身體貫穿，卻又慢慢匯聚，閃耀著柔和的光芒化成力量流淌進手心
黑發少女胸前，一塊閃爍著紫色火焰的寶石熠熠閃光
——靈魂寶石
「契約成立，你的願望超越了「熵」，來釋放出來把，你嶄新的力量。」
隨著白色生物的聲音，紫色的光芒把世界照的發白
黑發少女顫抖著雙手伸向紫色寶石——然後緊緊握住
耳邊響起水滴的聲音和齒輪的滾動
在一片五彩斑斕的光芒中，黑發少女失去意識，漸漸消失。
原地僅僅剩下一堆殘余的螢火飄散，仿佛證明著黑發少女的存在過的痕跡。
「呀咧呀咧，居然成功了，難以置信，果然我們的計算是正確的，試驗已經成功了一半！」
原地，望著地上粉色少女的遺體，白色生物自言自語
「所需的能量指標遠遠未達到，而新生成能量卻跟不上急劇的消耗，只能進行種種突破性試驗了，只是不知道這次能做到哪種程度呢？」
白色生物如同貓科動物一樣繃緊前肢伸了個懶腰，繼續自言自語道
只是這次語氣透露著隱隱的興奮
「撒~恐怕其它平行世界的我們都不知道這個計劃呢，畢竟太過瘋狂不是我們的作風，雖然經過兆次的演算只有萬分之一的概率，但第一步的達成足足將成功率提升到十分之一，值得一賭呢！」
帶著某種階段性勝利的白色生物準備轉身離去的時候，
異變陡生——