在和四天王希巴的一戰中，阿鵬認識到了自己實力的不足，自己離四天王還有很大一段距離。可接下來就是個鍛煉實力的好機會，就是對付超古代神奇寶貝！
阿鵬等人走到一個山谷，這時已經是中午了，小瑩和小霞開始忙活午飯，阿鵬把神奇寶貝都放了出來︰哈克龍（子），噴火龍，暴蠑螈，化石翼龍，鬼斯通，尼多王。果然，小瑩也放出了神奇寶貝︰尼多後，水箭龜，比比鳥。不過小瑩的目的還是尼多後，尼多王一見到尼多後，兩只神奇寶貝開始親熱起來，互相用角摩擦著。
「阿鵬，離午飯還有一會，現在來對戰吧！」小瑩說著，阿鵬很樂意，接著便叫出哈克龍來，小瑩叫出水箭龜。兩只神奇寶貝互相對峙著，戰斗一觸即發。
小瑩先喊道︰「水箭龜，使出祈雨！」阿鵬听了後在心里贊美小瑩已經不是當初那個害怕對戰的女孩了，用祈雨提升水系技能的威力就是最好的證明。水箭龜向上吼了幾聲，接著烏雲密布，空中滴著雨滴。好在午飯是在帳篷底下做的，不然就吃冷飯了。
「好，使出水之波動！」小瑩下令道，水箭龜打出一個藍色水球，顯然是被祈雨提升威力了，阿鵬下令道︰「用龍之怒！」哈克龍也打出一個大火球，接著水之波動和龍之怒相踫，兩者抵消了。
「這次到我們了，哈克龍，使出龍卷風！」阿鵬喊道，哈克龍脖子下的寶珠發出亮光，接著產生了一個龍卷風，向水箭龜襲來。
「用水炮！」水箭龜從雙管中打出強力的水柱，把龍卷風擊破了。此時，哈克龍一個水之波動打了過來，「水箭龜，避開！」小瑩下令。
水箭龜避開了攻擊，水之波動擊中了水箭龜後方的一塊岩石，接著岩石崩開。
「這是？」小霞看到了一個石板，阿鵬明白了自己已經到達了目的地。接著阿鵬走上前去，翻開石塊，果然，一個戴著黃色花紋，兩邊是圓錐，中間是圓柱的奇怪東西，旁邊還有一個同樣顏色的勺子。
阿鵬剛拿到手上，接著就消失了。「這個是不會錯了」一個女生的聲音響起，阿鵬回頭一看，果然是懷特，正拿著放大鏡觀察著，和旁邊的團長說著。
「那個，是我們發現它的，你們是誰？」阿鵬假裝問道。
「哦，是這樣啊，我叫懷特！」懷特說道，接著又端詳起了那個奇怪的東西。
接著，懷特邀請阿鵬他們到帳篷去，阿鵬等人就跟著去了，似乎還沒發現自己的飯已經糊了
「誒，古代人居然連可達鴨也崇拜？」小霞很不解，誰讓他有一只那樣的可達鴨呢。
「他們把神奇寶貝當成超自然的力量加以崇拜，而在這座山上挖掘的東西也證明了這一點。」說完，懷特拿起那塊石板為阿鵬翻譯著︰毀滅世界的兩股力量，黑色的黑暗染黑了天空，金色的眼眸然亂了氣,把世界一分為二的爭端，使得人們束手無策，天空開啟了異界之門，這時候，把一切都平息的力量，化作了圓球到地平線以下。
阿鵬笑了，心里想到︰這可不一定哦！接著就跑到後山，想也知道干什麼。
「各位，接下來我要借助你們的力量！你們這次的對手不是普通的神奇寶貝，是巨大的古代神奇寶貝，所以這次一定要小心！」阿鵬對面前的六只神奇寶貝說著。「還有就是，大家盡可能用遠程攻擊，不然會被吞噬掉的！」阿鵬又補充著說，畢竟在動漫里阿鵬已經見識到了，接觸身體的話會被吞噬進去，所以阿鵬這次格外小心。
帶阿鵬部署好了，便趕回去等著劇情的發展。沒過多久，胖子團長便跑了過來。
「博士！博士！」胖子團長不安的喊道。
「怎麼了，團長！」懷特問道。
「我們在外面發現了黑色的東西，因為您說那東西可能會有危險，所以我們沒有踫它，現在請您去看看吧。」胖子團長氣喘吁吁地說。
阿鵬他們跑到遺跡那里去，果然有一個像啞鈴一樣的黑色東西。果然是巨大耿鬼的容器，阿鵬心里想到，已經做好戰斗的準備。
「團長，多帶幾層手套把它帶進來吧。」懷特說著，遞給了胖子團長3雙手套。
「額，這就是你們所謂的防護措施？」阿鵬心想。
果然和劇情一樣，胖子團長帶著三雙手套去模，但還是化作一陣紅光被吸了進去。接著阿鵬看到黑容器中除了胖子團長，還有火箭隊︰亞瑪多和小三郎，旁邊還有一只穿山王。阿鵬想著，他們的確比武藏他們聰明，在白天挖洞很容易就辦到了。
接著所有的工作人員都被石化功控制住了，接著化作一團紅光被吸了進去。阿鵬他們往後退，這時，那個黑球化作了一個巨大耿鬼，出現在眾人面前。
「黑色的黑暗，染黑了天空，是指這個麼？」懷特喃喃地說。
就在這時，裝有金色之眼的車子炸開。在空中，金色湯匙開啟了金色之眼。接著，一只滿是花紋的胡地出現在阿鵬眼中。
「這兩只真的是神奇寶貝嗎？」。小瑩喃喃地說道，掏出了神奇寶貝圖鑒，只听圖鑒開始解說道︰「胡地，念力神奇寶貝，它的頭腦性能凌駕超級電腦，據推測智商高達5000，擅長使用超能力。」「耿鬼，影子神奇寶貝，可以附在人的影子上，突然感到發冷害怕時，耿鬼肯定就在附近。」
「真的是神奇寶貝啊，不過怎麼這麼大！」小霞說道。
耿鬼本來正準備下山，見到胡地後，便轉向，準備和胡地大打出手。
胡地揮動著勺子，撒出了一個個能量彈，被耿鬼使出影子球紛紛接下。
「接下來阻止他們吧，去吧，我的勇士們！」阿鵬說著，拋出了神奇寶貝球，暴蠑螈，噴火龍，哈克龍（子），尼多王，化石翼龍，鬼斯通出現。
對面兩只超古代神奇寶貝也是發現什麼，接著巨大耿鬼打出黑夜詛咒，巨大胡地打出精神干擾！
「各位，你們自己去戰斗吧，別忘了該怎麼攻擊！」阿鵬喊著，六只神奇寶貝就沖了過去。
只見暴蠑螈和化石翼龍同時打出破壞死光，黑夜詛咒和精神干擾和兩道破壞死光激烈沖突，發生了爆炸，而這個時候，鬼斯通它們也沒閑著，噴火龍噴出熊熊火焰，尼多王打出一道藍色曲折的光線，哈克龍打出一個大火球，鬼斯通從眼中發出黑色的光線，目標都是胡地。胡地立刻使出精神干擾，不過還是沒法擋下四個神奇寶貝的同時進攻，被炸的站不穩。巨大耿鬼忽然一個催眠術，四只神奇寶貝都露出了困意。
暴蠑螈和化石翼龍趕來支援，龍之波動和原始之力打向巨大耿鬼。這時一發能量球打了過來，擋住了龍之波動和原始之力。巨大胡地支援後被噴火龍和哈克龍兩發龍之怒打中，不過巨大胡地好像沒受什麼傷害一樣，接著打出精神干擾，噴火龍和哈克龍被擊中，倒了下來。
「可惡，還是沒辦法阻止嗎？」。阿鵬咬著牙說道。忽然，巨大耿鬼又使出了影子球。化石翼龍又是一發破壞死光抵消掉了，雖然化石翼龍不受技能的副作用，可連續使用還是有些吃不消。
這時，巨大胡地一個瞬間移動出現在化石翼龍的後方，一個氣合彈打中了化石翼龍，化石翼龍被擊中，墜落了下來。「各位，不要輸啊！加油！」阿鵬喊著。
這時鬼斯通的身體忽然發出白光，接著進化為了耿鬼。出乎所有人的意料。阿鵬是最吃驚的，因為他幾乎沒讓鬼斯通打過比賽，那麼這些經驗值是~
看來是鬼斯通強迫自己進化的，阿鵬看了看表情嚴肅的耿鬼，心里想到。接著耿鬼的雙眼發出紅光，兩只超古代神奇寶貝受到干擾，被分散了注意力，然後，三道破壞死光和兩個龍之怒分別擊中了巨大耿鬼和胡地，然後阿鵬的耿鬼的眼中發著強烈紅光，巨大胡地和巨大耿鬼的眼楮慢慢合了起來.