在回京師的路上，王銳思慮再三，最終還是將有人在神翼上暗中動了手腳之事密報給了朱由校。因為此事畢竟是非同小可，能在禁軍的嚴密守護下神不知鬼不覺地就做了手腳，想來這幕後的黑手亦不簡單，若是不查個水落石出又怎能令人放心？
朱由校聞報大怒，立刻將魏忠賢喚到駕前，嚴令他一回京師就即刻查明事情的真相，看看究竟是何人竟如此大膽，居然將黑手伸向了皇上，此事已與謀逆無異！
魏忠賢得知情況後亦是惶恐不已，立刻明白了事情的重要性。他也很想知道是何方神聖有這麼大的膽子和能耐，所以當即派出了飛騎先行返回京師傳喻鈞命，東廠和錦衣衛得令後立時傾巢而出行動起來。
只可惜他們終究仍是晚了一步，當聖駕終于回宮時，得到的消息是皇上的貼身太監王煒不知何故突然服毒身亡。同時離奇死去的還有兩個小黃門，二人的尸體是在宮後苑的荷花塘中被發現，身上沒有發現任何的傷痕。
事情很顯然與這三人有關，隨之而來昨夜守護欽安殿的親軍首領譚超的證詞也印證了這一點。可是繼續查察的線索已然中斷，朱由校怒不可遏，但除了將三人夷滅九族泄憤外也沒有別的辦法。倒霉的還有譚超，他與手下全部被拿入東廠的大獄嚴刑拷問。可他們確實是毫不知情，就算受遍了諸般酷刑也說不出個所以然來。
無奈之下此事只有暫時不了了之，王銳卻留上了心，暗想這幕後的主使之人可說是神通廣大，以他的所知除了魏忠賢外再想不出第二個人來。但從種種情況來看，此事顯然非魏忠賢所為。這就不能不讓人心生警惕了，看來朝廷這潭水確是太深太渾，遠比想象的還要復雜得多。自己千萬不能因暫時的得利而放松，「階級斗爭」的這根弦還是要時刻緊繃著才是！
雖然有這不愉快的小小插曲，但仍然不掩試飛大典的巨大成功。盡管這不是什麼朝政與民生大事，可實現了自古以來人們就有的飛天之夢仍可說是驚世駭俗的事情，更何況這份功績里還有著皇帝的一半？因此接下來百官朝賀萬民歡慶，乃至于進行祭天祭祖都是順理成章之事。
既然有這麼大的功績，自然少不了論功行賞。可是如何封賞既不宜皇帝一個人說了就算，也不宜交到朝堂上去由百官討論，而是由皇帝和內閣輔臣們一起商量出個章程為宜。這是朝政要事的正規流程，只有照此辦理才能減少很多不必要的麻煩，皇權與文臣集團的對抗性也正在于此。
第二日，朱由校就將信王、顧秉謙和黃立極等幾位閣臣，還有魏忠賢、李永貞，王銳等召來，為的就是商討封賞事宜。
朱由校一上來就開門見山地說道︰「昨日的試飛大典諸公俱已參與，此事可稱是開創了前人未有之偉業，朕心甚慰，對有功者自是不吝封賞，今日召諸公前來為的也正是這件事。呵呵，若論功勞，除朕之外自以王卿居首！諸公不妨說說，朕應該如何封賞為好呢？」
王銳見皇帝提到自己的名字，急忙起身恭敬侍立謙遜道︰「神翼之事全賴皇上聖明與諸位大人的共同努力，銳萬萬不敢貪功！」
朱由校將手一揮笑道︰「王卿不必謙虛，朕早已說過，僅憑敢第一個飛天之壯舉，卿就堪稱我大明第一勇士！朕雖非堯舜，但亦不是商紂無道昏君，如此之功豈有不賞之理？你且安心坐在一旁听著就是！」
王銳聞言暗嘆一聲，心說這個白痴皇帝其實本質也還不壞，只可惜從小就被耽誤了，登基後又被魏忠賢和客氏蒙騙玩弄于股掌之上。若是自己穿越的時間能早個10年20年，他也未必就不是個可造之才。
他原本只將皇帝當作了接近接近信王的一個跳板，此刻見朱由校也算是有情有義，不由得微感歉意。當下不再多言，應諾一聲退到一旁，默默地想著自己的心事。
顧秉謙作為首輔，此時自然應該第一個發表意見。他輕咳了兩聲欠身說道︰「皇上所言極是，飛天一事既開創了前人未有之偉業，又大顯了我大明之威風，當可令萬民歸心，四海臣服！王公子此一番功勞非小，正該重重封賞。以臣之見，可賜其進士出身，入翰林院編修，不知皇上以為如何？」
翰林院掌制誥、史冊、文翰之事，考議制度，詳正文書，備皇帝顧問，主官為翰林學士，下有侍讀學士、侍講學士、修撰、編修、檢討等官。明代規定一甲進士三人直接入翰林之制，狀元授修撰（從六品），榜眼、探花授編修（正七品）。別看翰林院只是個五品的衙門，翰林官品秩甚低，卻被視為清貴之選。自明代以後，大學士均出自翰林，「非翰林不入內閣」，翰林院已經成為培育高級文官的搖籃和涵養高層次學者的場所。
眼下顧秉謙提議讓王銳入翰林院編修，那已是榜眼、探花的待遇，以他目前只是秀才的出身來看，絕對是屬于破格提拔。若非見皇上似乎對這年輕人頗為喜愛，大有重用之意，顧秉謙也斷不會如此說。其他幾位閣臣听後也紛紛點頭，對顧秉謙的提議表示贊同。
顧秉謙滿以為自己的提議肯定會得到皇帝的贊許，卻沒想到朱由校眉頭一皺不悅道︰「一個小小的翰林院編修也算是重重的封賞麼？閣老是想讓天下人恥笑朕的小氣還是我大明無官？」
顧秉謙嚇了一跳，連忙起身跪地說道︰「微臣萬萬不敢！既然皇上認為翰林院編修的封賞太輕，那麼讓王公子入都察院，授右僉都御史如何？臣觀王公子滿面正氣，敢為敢言，定能擔負起其職！」
好家伙，左右僉都御史是正四品，顧秉謙眨眼之間就讓王銳連升了數級。其他幾位閣臣聞言不由得微微皺眉，心中暗暗鄙夷這顧秉謙太會見風使舵奉迎聖意。不過皇上顯然是一心想要重用這個王公子，正四品就正四品吧，反正對自己的利益也無任何影響。幾人全都不願意去觸皇帝的霉頭，所以並無人出言反對。
哪料到朱由校仍一搖頭說道︰「人都說宰相肚里能撐船，但像你等這樣的小家子氣卻當真令人齒冷！算了，還是由朕拿個主意，公等商量一下看看如何？」
幾位閣臣互相看了一眼，同時躬身齊聲道︰「臣等恭听聖意！」
朱由校終于露出了笑容，點點頭說道︰「以朕之見，可賜王銳進士出身，入都察院，授左都御史！眾卿以為如何？」
此言一出，包括王銳在內的所有人都露出了難以置信的神色。幾位閣臣更是險些一頭栽倒在地，明顯都有中風或心髒病發作的跡象。要知道左都御史可就是都察院的頭兒了，乃是正二品的大員，差不多相當于今天的總檢察長一職。區區一個布衣一下就坐到這個位置上，此等奇事恐怕是亙古未有，也難怪幾個老家伙的心髒都有些承受不了。
不等眾人開口，王銳已搶先幾步跪地叩首道︰「承蒙皇上垂愛，銳感激不盡萬死難報！但懇請皇上收回承命，銳即死亦萬萬不敢領受左都御史一職！」
朱由校聞言面露詫色道︰「王卿何出此言，莫非你仍嫌左都御史的官小不成？」
王銳連忙應道︰「銳萬萬不敢，恰恰相反，臣非是嫌官小，而是覺得皇上的封賞太重矣！銳只是區區一介書生，才疏學淺且無任何為官經驗，若貿然擔此重任，一來定會耽誤朝廷大事，二來也容易讓奸佞小人生出投機取巧之心，竊以為只要蒙邀聖寵即可一步登天，于皇上的聲名亦有所不利。因此臣才懇請皇上收回承命，萬死不敢奉詔！此乃銳之真心實言，天日可表，還望皇上明察！」
他說的確實是真心話，因為在他的計劃中，根本沒想過讓朱由校升他的官。別說是左都御史了，就算是朱由校馬上讓其入文淵閣成為內閣輔臣王銳都不稀罕。道理很簡單，因為王銳一旦當了外官，那麼再與信王結交就是一種大忌。如此一來眼下的官當得再大又有什麼意義？他要的是天長地久而不是曾經擁有，若想實現自己的大計，他就必須力辭掉朱由校的這個封賞！
朱由校面露喜色，顯然對王銳的這番真心話頗為贊賞，他哈哈一笑說道︰「王卿此言令朕甚慰，朕果然沒有看錯你！沒有當過官也沒什麼要緊，朕不也是第一次當皇帝，這不也當得好好的麼？」
這回輪到王銳兩眼一黑，險些當場一口鮮血就噴將出來，心說就你這皇帝還敢大言不慚地說當得好好的？倒是木匠當得確實還不錯！若非你和你爺爺倆人將祖宗留下的基業折騰得支離破碎，你那可憐的弟弟又何至于落得那麼悲慘的結局？
這些他當然只敢想想而不敢說出來，反倒順手一個馬屁拍過去道︰「皇上乃天縱奇才，銳如何敢比？」