相較于左右兩路官軍的進展，唯有丁啟睿走中路長江逆流而上這支人馬，卻在出九江之後，進展很不順利，刑天軍水軍都統楊昆山此時已經親自趕到了鄂州坐鎮，兩個戰船營也加強了力量，分別陳駐于黃州和鄂州長江兩岸，死死的扼守住了長江，在丁啟睿揮師開始逆江而上的時候，大批官府戰船剛出九江府，便開始在長江上遭遇到了刑天軍水營的阻擊。
刑天軍水營雖然戰船不如官軍水師多，也沒有官軍水師的船只堅固，但是貴在這些水營兵將們都很驍勇，兩軍在長江上一交手，官軍便開始連吃敗仗，半個月時間便損失戰船數十條，兵將數千人之多，而刑天軍這邊雖然也損失了不少船只兵力，但是卻遠比官軍那邊的要少許多，使得官軍水軍始終無法突破鄂州和黃州一帶的江面直抵武昌府。
丁啟睿其實也預料到了這種情況，在三月下旬的時候，親自調派了數百條戰船逆流而上，試圖一舉蕩平長江上面的刑天軍水寇，于是楊昆山便立即親率兩個戰船營迎戰，雙方于是便在蘄州一帶的江面上展開了一場廝殺。
這一仗兩軍便打了一整天的時間，雙方可以說都使出了渾身解數，撞船、開炮、發火箭……等等戰法都拿了出來，江面上更是火光沖天，喊殺聲和慘叫聲一天都沒有停止過，最終官軍在付出了慘重代價之後，卻還是沒有能滅掉刑天軍的水營，一些兵將駕船便開始掉頭逃竄，引發了官軍水軍的崩潰，大批官軍戰船紛紛掉頭順流逃走，結果這一戰刑天軍獲得了大勝。
說是一場大勝，其實也只能說是一場慘勝，這一戰下來，楊昆山身先士卒，坐船更是高掛帥旗居中指揮，使得他的坐船成了官軍圍攻的目標，大戰之中，他的坐船負炮不知幾何，船上兵卒更是幾乎人人帶傷，楊昆山一天下來負傷多次，但是還是死戰不退，下午的時候楊昆山自知傷重難以支持，于是便將指揮權下令轉交給了長江水營副都統劉江代他指揮，而他自己則在不久之後，坐船被官軍一條戰船用炮集中，之後又中了大批火箭和火油罐的打擊，燒成了一團火球，楊昆山于船上的部下全體戰亡，無一生還，而楊昆山也成為了刑天軍自成軍之後，損失的級別最高的將領。
也幸好是楊昆山死之前移交了指揮權，劉江及時的在他的坐船上升起了帥旗，繼續指揮船隊和官軍死戰，否則的話這一場仗下來，恐怕是刑天軍水營就要以失敗告終了。
官軍也正是看到刑天軍始終都沒有失去指揮，而且似乎是越戰越勇，一條條刑天軍的戰船著火之後，船上的水卒們非但不棄船跳水逃生，反倒是奮勇駕船沖向官軍船隊，用鐵鉤鉤掛住官軍船只，與之同焚，如此之下，官軍在兵力船只佔優的情況下，卻始終沒有能掌握住江面上的主動權，最終敗逃回了九江府。
不過官軍水師敗退之後，劉江這邊也已經沒力氣再揮兵掩殺了，他們兩個戰船營一天激戰下來，船只受損超過了六成，兵將更是傷亡過半，刑天軍的在陸地上的優勢，在江面上卻無法發揮出來，之所以能打勝這一仗，可以說全是憑借水軍的兵將們拿命換來的，除了楊昆山這個水營都統陣亡之外，兩個水營還有一正一副兩位營將陣亡，損失可謂是極大，故此在官軍水師敗退之後，刑天軍這邊也早已無力再戰了，劉江只能下令收兵，撤回鄂州趕修船只，以備再戰。
而這個時候丁啟睿氣的是暴跳如雷，請出了尚方寶劍，將幾個臨陣月兌逃的水師軍將給斬了，要繼續發兵攻打鄂州，可是在這個時候，從北面傳來了肖刑天在陽谷縣大敗官軍的消息，並且生擒督師孫傳庭、陣斬遼東總兵吳三桂。
丁啟睿聞之頓時便大驚失色，在九江府的大營之中頓足大哭了起來，他沒有想到北面官軍敗的會這麼快，在他看來，孫傳庭也算是能臣了，現如今朝廷調入關內數萬精兵，這麼多人馬怎麼也夠孫傳庭對付刑天賊了，不敢說孫傳庭一定可以在北方擊敗刑天賊，起碼以他的兵力拖住刑天賊是沒有問題的，這樣一來便可以給他爭取相當的時間來克復武昌府了！
可是沒成想這才多長時間呀！孫傳庭便落得了一個兵敗被俘的下場，麾下數萬大軍瞬間便灰飛湮滅，接下來肖刑天要怎麼做，丁啟睿便猜不出了。
從丁啟睿的角度出發，現如今孫傳庭和大批遼東的官軍已經被刑天軍所滅，那麼接下來如果刑天軍想要覆滅大明的話，北方官軍數量已經不足以扛住刑天軍大軍的進攻，肖刑天完全可以集結重兵北上，直接打京師，只要京師一克，那麼大明也就基本上可以說完結了。
但是肖刑天會這麼做嗎？他還有一個選擇，那就是在解決掉了北方官軍的威脅之後，繼續按照以前的既定計劃攻打南直隸，待取下南直隸之後，再北上攻打京師，如此一來，將會更徹底的將大明給覆滅掉。
丁啟睿分析過之後，最終在沒有足夠的信息支持之下，也無法判定肖刑天接下來會怎麼做，于是將心一橫，派人告知黃得功，令其務必要盡快攻克黃州，同時令左翼軍也盡快攻打鄂州，先打通長江之後，發兵武昌府，不管怎麼說，他都要先拿下武昌府之後再說，一旦打下武昌府的話，最起碼也能打擊一下刑天賊的氣勢。
于是在三月底的時候，官軍便開始對黃州和大冶縣發動了猛攻，黃得功率領右翼軍的近兩萬兵馬，在三月二十七的時候進至了黃州城外，將黃州城給半包圍了起來，開始對黃州城發動了猛攻，而左翼軍在總兵方國安的率領下急攻大冶縣，至此最為凶險的戰事也就在黃州和大冶一帶展開了。
在羅汝才的調遣之下，坐鎮黃州的乃是老回回，老回回先前受命之後，率領了一個乙種營和兩個丙種營入駐黃州，兵力不過四千不到，面對的卻是黃得功等兩萬余官軍的圍攻，在黃得功率部抵達黃州之後，老回回便立即先是率兵出城對黃得功發動了一次逆襲，黃得功沒有想到刑天軍居然在兵力不足的情況下還敢出城逆戰，所以不防之下，先是大敗了一場，在得知鎮守黃州的乃是老對手老回回馬守應之後，更是氣不打一處來，立即便調遣兵馬開始攻城。
而老回回則在黃州城臨時招募了大批周邊民壯助戰，把整個黃州城外面提前挖的是溝壑縱橫，並且在黃州城內外布置了不少的先前繳獲官軍的大炮，日夜對攻城的官軍轟擊不停，並且反復不斷的派出麾下的兵將進行逆襲抑或是夜襲，戰事打的非常慘烈，老回回手中的三個戰兵營裝備的火銃數量不多，但是戰意卻很是盎然，三千多兵將輪番鎮守和出擊，愣是在黃州城頂住了黃得功所部近十天時間的猛攻，黃得功在黃州城外始終不得寸進，雙方傷亡都非常大，到了第十天的時候，老回回手下僅剩下了不到兩千可戰之兵，其余的則只有數千助戰民壯了，于是老回回將黃州城的青壯也武裝了起來，據城死守，使得黃得功好不容易攻到城下，卻還是不能攻克黃州。
與此同時丁啟睿派出了五千援軍，走陸路趕至黃州城助戰，黃得功在得到援軍的增援之後，更是攻城猛烈，老回回則親自登城指揮防御，幾處城牆激戰之下數度易手，但是最終都被老回回率部給堵了回去。
在四月初八的時候，羅汝才從武昌府派出了兩個營的人馬乘船趕至了黃州，這才擋住了官軍對于黃州的猛攻，黃得功見黃州城難以取下，這才不得不下令撤兵回到麻城休整，至此黃州之危才得以解除。
但是在大冶縣那邊的戰況同樣也十分凶險，鎮守大冶縣的乃是羅立麾下的部將賀國方，而且賀國方還只是一個普通的營將，麾下率領的也只是一個乙種營，在方國安率兵攻向大冶縣的時候，羅汝才又給賀國方增派了兩個丙種營，這才堪堪讓賀國方有能力守住大冶縣。
要知道大冶縣肖天健是相當重視的，這里出產鐵礦，在年前的時候肖天健便下令調集了大批工匠來大冶縣籌建一個大型的匠作營，在這里打造器甲，為下一步攻打南直隸提供裝備上的支持，所以年後大冶匠作營便已經開始運作，大批工匠已經在這里初步的開始打造起了器甲，一旦大冶縣被破的話，刑天軍無疑會損失很大，物資上的損失倒是還可以承受，一旦這麼多工匠落在官軍手中的話，可是短時間之內無法彌補的。
賀國方別看職位不高，但是卻深知大冶縣的重要性，在得知寧州被官軍所破之後，立即便開始在大冶縣一帶做起了御敵的準備，他下令周邊民壯皆要歸他調派，調集了大批民壯在大冶縣一帶開挖溝壕，布置鹿砦、拒馬等物，將整個大冶縣都包了起來，剛剛做足了準備之後，方國安便率軍抵達了大冶縣。
（特別鳴謝feng41501、一醉人二位弟兄的打賞！多謝了！同時也在這個五一節之中對諸位書友們致以最崇高的問候，向那些還要堅持在工作崗位上的朋友，致以最高的敬意！）@