听吳漢生講完了濟南城中農民暴動的經過之後，穆陵軍的眾將們也都覺得有些不敢相信。在當初商毅提出，可以借助城里被俘的百姓力量，發起暴動，從內部攻克濟南府，其實絕大多數人都不信，這些農民怎麼有膽子敢反抗清軍。這也包括被派進濟南城，執行這項任務的吳漢生在內。只是出于一直以來，對商毅的信心，才沒有反對。但現在的事情再一次證明，商毅又對了。
不過商毅當然清楚農民的力量有多麼強大，因為在另一個時空的三百年後，在共和國建立的過程中，這種事情可是屢見不鮮的。說白了，共和國就是一支農民軍隊打下來。共和國的太祖就曾時確是指出過，中國的問題其實很簡單，就是兩點︰農民問題和土地問題，誰抓住了這兩個問題，並且把這兩個問題解決得好，誰就能夠擁有全中國。這個理論在三百年後有效，在三百年之前，也同樣有效。因此在戰後的總結會上，商毅著重總結的，並不是在歷城縣與清軍的野戰，而是這一次濟南府內農民暴動的發展經過。不過這次會議沒請錦衣衛參加。
因為到了現在這個階段，商毅的手下以經不在是十幾個人，七八條槍的草台班子。現在穆陵軍以經初俱規模，而且在未來還是繼續發展壯大，也不可能只守著青州的這一畝三分地的鄉土觀念，全軍的思想教育和為何而戰的信念必須盡快確定下來了。這次攻取濟南府，正是一個對全軍進行一次思想教育的好機會。
因此等吳漢生說完了經過之後，商毅道︰「大家來說一說，你們听完之後，有什麼想法？」
這也是穆陵軍成軍以來的一個優良傳統，盡管眾人都不敢質疑商毅的戰略、戰術計劃安排，但無論是在事前事後，都敢暢所欲言的提出自己的意見和問題。
這時濟南暴動的當事吳漢生首先發言道︰「大人，在這之前，我確實沒有想到過，這群老實巴交，一巴掌都打不出一個屁來的農民，最後竟能夠發揮出這麼大的力量來，當時別說城里只有一千韃子，就是有個五六千韃子，也照樣擋不住這幫農民。」
商毅點了點頭，道︰「這就是農民的力量，在歷史上有多少王朝都是被農民起義的力量推翻的，就是大明的開國太祖，當初也同樣是靠農民起義才起的家。因此農民的力量才是天下最強大的力量，誰要是敢小看了這股力量，誰要是敢輕視農民的力量，就絕對沒有好結果。」
嚴格來說，商毅的這段話有打擦邊球的嫌疑，如果被人扣其中的文字，也能安一個對朝廷大不敬的罪名。不過一來商毅並沒有明確的指示當今的朝廷，二來現在的大明朝廷對全國的控制力度也大大下降了。而且再場的人，都是跟著商毅一起開始創建穆陵軍的人，多數人都沒讀過什麼書，因此誰都不覺得商毅的話有什麼不妥之處。
周少桓還有些不解，道︰「大人，我只是不明白，這些農民既然現在能夠在濟南城里並發出這麼大的力量，那麼為什麼在先前清軍抓他們的時候不反抗，就這麼心甘情願的被清軍抓起來呢？如果當時就反抗，韃孑那能夠這麼輕松的就打到山東來。」
商毅點點頭，道︰「這個問題問得很好，少桓說得很對，在平時，絕大多數的農民都很老實、也很軟弱，受人欺負大多數也都只能忍了，因此他們才往往被人輕視。才覺得他們好欺負。但你們想過沒有，我們穆陵軍的士兵，在最初的時候，還不是和他們一樣的農民嗎？為什麼我們現在是一支強大得可以和韃子抗衡的軍隊？」
听了商毅的話之後，眾將也都不禁開始沉思起來，商毅說得並沒有錯，就在幾個月之前，穆陵軍的人馬實際上就是一群農民，和其他的農民並沒有兩樣，但現在卻是一支連清軍都不能輕視的軍隊了。現在回想起來，這反差也太大了。
這時楊武丞道︰「這是因為我們軍隊有大人，有大人教我們練兵，教我們怎樣打仗，教我們怎樣殺韃子，如果沒有大人，就根本沒有我們商家軍的存在。」
這是穆陵軍的將領首次承認自己就是商家軍，不過商毅並沒有加以糾正，只是順著他的話道︰「武丞所說的，就是關建的地方，農民需要有人來組織，才能夠發揮出他們的力量。就像這一次在城里，如果沒有漢生他們在城里組織發動那些百姓，恐怕他們現在還被韃子關押著。而我們也無法這麼順利的就攻入濟南府。大家想一想，是不是這個道理。」
眾人听了，也都頻頻點頭，吳漢生忽然道︰「我明白了，大人的意思是，想要打敗韃子，就必須把農民組織起來才行。」
商毅也笑了，總算有人能理解自己的意思，道︰「對，你們想一想，我們大明的人口是韃子的百倍，如果能把所有的農民全都組織起來，那怕只有一半，甚致是一成，我們還用怕韃子嗎？」
其他人也都興奮了不少，道︰「當然不用怕了。」
商毅接著又道︰「但你們再想一想，如果是像今天青州的人馬那樣的軍隊，他們能夠組織得好農民嗎？農民肯為他們拼命戰斗嗎？」
眾人听了，也都一起搖頭。
商毅這才進入到今天的最終目地，道︰「這就是為什麼我在建軍的一開始，就強調加強軍紀，不允許士兵們搔擾農民，甚致以保護農民、保護鄉親為目標的原因。我們穆陵軍能夠達到今天這一步，靠得並不是有火銃火炮，其他的軍隊也有火銃火炮，也不是我商毅善于用軍，在韃子之中，也有善于用兵的大將。而且因為我們得到了穆陵關一帶農民的支持，正因為如此，他們才會加入我們的軍隊，才會在戰場上奮勇作戰。如果我們也像青州兵一樣，軍紀敗壞，只會欺壓百姓，還會有人加入我們的軍隊嗎？他們在戰場上會拼命殺敵嗎？」
到了這時眾將才終于明白商毅的意思，也頻頻點頭，周少桓這才道︰「大人放心，我們全都明白了，回去之後一定會約束手下的士將，嚴守軍紀，絕不擾民。也絕不會變得和青州兵一樣。」
商毅也點點頭，道︰「約束手下的士將自然是應該，但你們回去之後，更重要的是，一定要把‘嚴守軍紀，絕不擾民’的道理向士兵們講明白，讓他們也包括你們，永遠都不要忘記，我們的軍隊，就是由一群農民組建起來的，我們的軍隊存在的目地，就是保衛自己的家園，保衛自己的親人、鄉親。永遠都不要忘記這一點。」
這才是商毅的最終目地，因為僅僅靠嚴格的軍紀約束士兵是不夠的，一來以後軍隊還會不斷的發展壯大，在場的眾將恐怕都會有獨當一面的時候，商毅不可能管得了一支軍隊的軍紀，二來如果在場的眾將，或者是在老兵中真的有人觸犯了軍紀，就算是依律處罰了他們，但受損失的還是穆陵軍。
因此莫過于不斷加強眾將以及士兵們的思想教育，讓他們一個人都從思想上自發的認識到，嚴守軍紀，絕不擾民的必要性，遠比用嚴律酷刑來約束軍隊要好得多。在這一點上，後世共和國建立的過程中，太祖和他的同志們就做得非常好。是一份極為寶貴難得的經驗，盡管提前了近三百年，但也完全值得商毅認真的學習。
這時吳漢生又向商毅報告，在被解救的百姓中，有一些人曾經充當過清軍爪牙，借著清軍的勢力，狐假虎威干了不少壞事，雖然在暴動時被百姓們打死一些，但還是有一些人隱藏在百姓中間。
商毅一听，馬上下令吳漢生，立刻到百姓中去調查，把這一些人從百姓群中搜找出來，一個也不能放過。對于像工匠、婦女那樣，由于迫不得己，不得不為清軍做一些事情的人，到是可以原諒。但對這種主動投靠而且為虎作倀，幫著敵人欺壓自己人的漢奸，商毅由其深惡痛絕，對這種人必須嚴懲不貸。絕不留情。
就這樣經過了吳漢生等人的調查，同時也由百姓們進行指認，又從百姓們中間抓出了七十三名曾經做過清軍的爪牙，引起很大民貧的人。
見諸事都準備齊全了，商毅這才下令，招集全體百姓、軍隊招開一次審判大會。就在大會上，將一百二十七青州兵的官兵，還有七十三名做過清軍爪牙的人全部處死，一率當場執行槍決。
盡管這些人听到審判之後痛哭流涕，磕頭求饒不止。但商毅絲毫也不為所動，因為在這個時候不能留情，亂世用重典，必須使用鐵腕手段，殺一敬百，恩威並施，不僅贏得了人心，而且在短期內能夠迅速恢復濟南的秩序。對此沈揚等錦衣衛的人員也有十分驚異，原來商毅也是個狠角色，下手之狠，絲毫也不遜色于錦衣衛，但也並沒有勸阻。
一排排槍聲響過，受刑的人一排排倒地。在場觀看執行的另外一千八百多青州兵，一個個都嚇得面無人色，有不少人都嚇得尿了褲子。而百姓們雖然也有些害怕，但更多的卻是大快人心。
後來不知是誰帶頭喊了一句︰「天大老爺。」隨後所有的百姓都跟著一齊喊了起來。