在第一次進攻蘇州失敗之後，叛軍又向蘇州加了大量兵力，全軍總數達到了五萬余人，但上一次的失敗也讓馬進忠心有余悸，如果再失敗一次，進攻蘇州的計劃也就將徹底破滅了，因此馬進忠雖然擴大的人馬，但也不敢輕易向蘇州發動進攻。
而就在這時，馬進忠也接到了消息，知道商家軍趁虛進取杭州，要他立刻領軍回援，馬進忠也不敢怠慢，而且正好可以借梯下牆，立刻收拾人馬，撤離了蘇州，向杭州進發。
蘇州杭州之間，相隔還不到兩百里的路程，大隊人馬行進，最多也就兩三天的時間，但南京離杭州同樣也不遠，而且商家軍又比叛軍早了一天的時間出發，而且五萬多大軍，也不是說走就能走的，拔營起寨，整裝出發，還需要不少時間，因此馬進忠首先派自己手下的部將盧軍，率先五千人馬先行，搶先趕回杭州駐防，自己帶領著大軍隨後而行。
直到第二天，馬進忠的大軍才開始出發，一路向南，走了一天，在傍晚時分，進入湖州地界，大軍又安營下寨休息，準備明天再趕回杭州。而就在當天晚上，馬進忠收到消息，盧軍的前部人馬在武康縣東北地方遭到了商家軍的伏擊，以經全軍覆沒了。
馬進忠得知以後，也不由大吃一驚，他就是縱橫明末的農民軍首領之一，綽號混十萬，也征殺了十余年，雖然不敢說是精通用兵之道，但至少也是身經百戰了。立刻想到，商家軍這會不會是用圍城打援之計呢？
其實還真叫馬進忠猜對了，商毅用的，就是圍城打援。其實早在制定進攻杭州的戰術計劃時，商毅的目地就不單純是要收復杭州，而是要借機將叛軍的主力人馬也一舉消滅。
因為如果只是要收復杭州，根本就不需要這麼復雜，只用把大軍開到杭州城下，用紅夷大炮轟開城門就行了。但商毅知道，這樣做僅僅只能奪下一座杭州城，如果叛軍不被打滅，就會在整個浙江四處流竄，危險城外的村鄉鎮縣，破壞性極大。又重現自己在湖廣與張獻忠交戰的結果，雖然最後把張獻忠打得全軍覆沒了，但整個湖廣也被張獻忠破壞了大半。商毅一定要避免這樣的結局又在浙江出現。
于是商毅一開始用韜晦之計，引誘叛軍從杭州傾巢出動，全力進攻蘇州，而自己突然從南京出兵，進攻杭州，這一來叛軍必然會立刻起回來救援杭州，而自已正好可以施用圍城打援，首先消滅回援的叛軍，將叛軍的主力徹底打殘，然後再收復杭州，就可以立刻平定浙江的叛亂了。整個計劃其實一環扣一環，不僅周密詳細，而且構思巧妙，除了商毅之外，誰都無法看這整個戰術布局。
事實上商毅得知了蘇州的叛軍撤軍回援杭州之後，根本就沒有到杭州城下，而是將人馬駐扎在武康和清兩縣之間，準備先打援軍。
雖然這個時候馬進忠雖然以經想到了商毅是在用圍城打援之計，但也為時以睌，伏擊叛軍回援的前部人馬，僅僅只是這整個戰術布局的一部份，就在當天晚上，商毅以經布置好了一張大網，向馬進忠的大軍網了下來。
日暮降臨之後，商家軍出動了六營的兵力，分為三路，以經消消的潛伏到馬進忠的大營附近。
商毅也親自帶隊，在遠外用望遠鏡觀察叛軍的營寨，叛軍的軍紀本來就十分松馳，再加上又是臨時扎營，因此只扎下了供士兵休息的帳蓬，而在大營周圍，即沒有豎起木柵牆，也沒有用戰車圍廓，更不可能像商家軍那樣，挖戰壕，總之只沒有修建任何保護工事，而且守夜的士兵也不多，稀稀疏疏，三三兩兩，整個大營，可以說是完全不設防。
看了一會兒，商毅以經楚，這一戰是贏定了，于是放下望遠鏡，道︰「發射信號，開始進攻。」
隨著他的令下，只听「嗖嗖嗖」三聲，三顆橙紅色的信號彈直沖上天，在十七世紀沒有工業污染的晴朗天空里，看得得十分楚。而士兵們也馬上點燃了早就以經準備好了霹靂火箭的引線。
「嗖——嗖——嗖——嗖——」
一支又支拖著橘色火光的火箭帶出銳利的破空聲音，正不斷的從商家軍的陣地飛起，飛上了天空，然後又成排成群的向著叛軍的寨中落下。
這是在叛軍的營中，有不少士兵都被驚覺起來，紛紛出帳觀來，只見天空中的火光也愈來愈密集，猶如一場的火雨正降下一樣，向營中落了下來，絕大部份人都不知道這是什麼東西，還覺得十分有趣。還有人大叫著「放焰火了？」
只見這一團火光從空中掠過，一頭撞在一個帳蓬的頂上，一聲劇烈的爆炸聲隨即傳來，火光四射，那頂帳蓬瞬間就立刻全部燃燒了起來。叛軍的士兵們無不驚駭，這才知道，這個不是好玩的東西，而是殺人的利器。隨著火箭不斷的落丌，原本只有少數燈火的營寨，此時不斷的升騰起巨大的火光和爆炸聲。一團團的火焰在漆黑的夜空下不時升起，有的地方顯然已經完全燃燒了起來。
第一波火箭帶著嘶嘶聲不斷的射入叛軍的營寨之中，整個大營中頓時大亂起來，一時間士兵們在營中四處亂竄，到處有人在喊︰「走水了」「走水了」。
這時馬進忠也從自己的帳蓬里鑽了出東，只見營寨里以是四處火起，人馬已然是亂作一團了。而正在他驚恐之間，只听空中又傳來破空的聲音，從遠處的地方又不斷有無數火箭發射出來，一時間火箭如雨而下，落到營中不是燃起火焰，就是發出悶雷般的爆炸蘆，也使叛軍的整個營寨完全陷入了混亂之中，士兵們再也顧不得救火，紛紛躲避。
馬進忠也不由愈看愈心驚，雖然他也知道明軍有種叫「火箭」的武器，過去和官軍作戰時也見過，但也沒覺得有什麼出奇利害的地方，沒有想到的是，在商家軍這里運用起來，會如此可怕，仿佛什麼火器一但到了商家軍的手里，就會立刻厲害了十倍一樣。
但現在營寨里以經到處都是火光，別說集合人馬準備廝殺，就是想躲藏也沒有個地方。不少士兵見勢不妙，都紛紛逃離了大營。不過這時在營外等待的商家軍的士兵，也從三個方面包抄圍攻了上來。
因為是夜襲，又是火攻，商家軍的火槍兵不敢攜帶火藥，只能把火槍上好刺刀當長矛來使，但畢竟是不如真正的長槍好使，因此反到是是長槍兵開始呈威，而兩個新兵營也還沒有配備火槍，全當長槍兵使。他們接受商家軍的訓練最短的也超過了一個月。而且都是咬牙堅持到了現在，終于成為商家軍的正式一員，這可是他們第一次以商家軍的身份作戰，因此也攢足了一口氣，一定要努力表現。
現在叛軍亂作一團，根本就無心抵抗，而且大部份人都是從睡夢中驚醒過來，慌急火急的就逃離了營寨，現在別說盔甲武器，就連衣服鞋都來不及穿，就是有心想和商家軍作戰，也是心有余而力不足，整個戰局，完全呈顯了一邊倒的局面。
但這樣的局面對商毅來說，卻是求之不得，因為出戰的有兩個營的新兵，作戰經驗不足，打這種順風戰，正好有利于他們的發揮，加作戰經驗和信心。
這時叛軍以經全面潰敗，在滿是火勢的營寨中紛紛亂跑，尋找逃離的出口，而遇到商家軍的圍追堵劫，有人沖出了圍堵，但也有相當一部份人被逼得退了回來，結果人馬互相來回擁擠推搡，沖撞踐踏，也傷死了不少。
而家軍卻在逐漸縮小包圍圈子，慢慢圍隴了上來，將叛軍的活動範圍也逼得越來越小，許多沖不出包圍圈的叛軍們見大勢己去，又無路可走了，也只能棄械投降。所抓的俘虜也不在少數。
當然商家軍畢竟人數不多，因此還是有不少叛軍趁著混亂，殺出了重圍，四散逃開。基中就包括主將馬進忠，他的身邊有幾十名玄皇教眾，都是武功好手，再加上又見機得快，在他們的保護之下，又趁著商家軍的包圍還沒有形成，終于逃脫了出去。然後又收隴了一些敗兵，向杭州逃竄。
不過殺出了重圍，也並不意味著就逃月兌了，因為商毅以經打定了主意，必須徹底擊潰叛軍的主力，因此也安排下第二批堵截的人馬，就是騎兵營。
這時天色以經漸亮，正好可以讓騎兵施展。因為叛軍是四散而逃，因此楊武丞也把騎兵分散，以連為單位，各自為戰追擊叛軍。而逃月兌出來的叛軍折騰了一夜，早就是累得精疲力竭，那里還有精力迎戰，而且叛軍幾乎全是步兵，根本無發抵擋騎兵的沖擊，基本是一沖就散。
馬進忠雖然收隴了近三千多殘兵敗將，但也正因為他聚隴的人多，目標也由為顯著，被三個騎兵連盯上，連挨了幾輪騎兵的沖鋒，好不容易聚隴的人馬，又被沖得四分五裂了。