順治三年，正月二十六日。商毅收到了杭州來的消息，明朝已經又有人被推立為監國，而且這回居然一下子推出了兩位監國，一是潞王朱常芳，在徽州被推立為監國，另一位是魯王朱以海，是在處州出任監國。
其實不僅僅是史可法和吳甡想到要推立新君，以號令南方抗擊清軍，有不少朝的官員為想到了這一點，在南京城破之後，還有一批官員既沒有投降清軍，也沒有依附商家軍，但依然趁著當天的混亂逃出南京，聚集到徽州，因為許多官員都知道，潞王朱常淓就被安置在徽州。
而在十多天之後，南京城破，朱由崧身亡的消息也得到了確認，並且傳遍了整個南方。而且又有許多的官員也都陸續聚集到了徽州，其中大部份都是東林一系的官員，包括黃宗羲、黃震周等一些比較知名的人士,還有朱大典、袁宏勛、張秉貞、何綸等地方派勢人。因為朱常淓本來就是東林黨推崇的皇帝人選，現在朱崧己死，那麼再擁立朱常淓，也就是順理成章的事情了。
于是眾人商議決定，擁立朱常淓為監，號令南方，另外還有原明總兵方國安和佷兒方元科，手下約有一萬多兵馬,也來到徽州,擁立朱常淓。
結果等史可法一行到達徽州的時侯，己經晚了一步，就在前一天，朱常淓己經正式出任了監國，並任命張秉貞為兵部尚、朱大典為吏部尚、黃宗羲為禮部尚、袁宏勛為戶部尚，方國安為左督都，總理軍務。
不過史可法等人到來，還是受到朱常淓的歡迎，因為現在史可法的名望不小，而且朱常淓也知道，在史可法的背後，還有商毅的支持，現在誰都知道，整個南方，只有商毅的商家軍，才能夠抵抗清軍。由其是史可法還帶來了一個令他們震驚的消息，原來南京竟然還沒有完全失守，商毅依然還在南京城里與清軍對持，堅守著南京，而且還在南京周邊地區多次打敗清軍。
這個消息確實讓徽州的眾官員都振奮不己，也包括朱常淓在內。因為朱常淓出任監國本來就十分免強，他當然知道在這個時侯出任監國，甚致是稱帝，可不是天下掉下的餡餅，而是被架到火上烤，一但清軍殺到，恐怕就會先拿自己開刀。而現在看來，南京居然還守得住，只要南京不失，清軍就無瑕南下，而自已也就能夠保住現在的位置，另外商毅也明確表示，支持自已監國，當然也舒心了不少。
而其他官員也都有差不多的想法，因此盡管黃宗羲、黃鎮周等人曾在南京和史可法斗得不亦樂乎，但在這個時候，也都對史可法等人表示了歡迎的態度，眾人相見之後，先是互相大哭一場，悲痛朱由崧架崩，史可法也知道，現在不是翻舊悵的時侯，眾人團結一致，抵抗軍比什麼都重要，因此雙方都非常有默契的沒有提在南京順逆之爭的那些事情。並且都表示一定會齊心協力，共同抵抗清軍。
但表面文章雖然是做得十足，一涉及到實際問題的時候，這些官員們就立刻舊病復，當史可法向眾人提議，請朱常淓立刻到杭州去坐鎮，朱大典、袁宏勛、張秉貞、黃宗羲、黃鎮周等人馬上都顧左右而談他，並不做正面的答復。
因為生存的危機得到了緩解之後，各人立刻都開始打各人的小算盤，杭州可是商毅的地盤，而且史可法這一行人顯然都己經和商毅結成一伙，一但朱常淓到了杭州，肯定成為商毅的傀儡，而史可法、吳甡等人，也一定會成為新朝廷的內閣重臣，那麼那里還有自己的位置呢，但這個理由是沒法說出口的，因此也都紛紛找借口推辭，只說事關重大，應當從長計議。史可法也就不好再說什麼了。
而在私下里，有不少官員都向朱常淓進言，千萬不要去杭州，因為商毅為人飛揚跋扈，桀驁不馴，而且又手握重兵，素有野心，決不可信任，一但去了杭州，就會被商毅架空成傀儡。
朱常淓其實到是很想去杭州，一來杭州是個大地方，肯定出徵州要舒服，二來直接在商家軍的保護之下，也更安全一些，致于成為商毅的傀儡，朱常淓到並不太在意，因為現在朱常淓手里也沒有什麼實權，都是由張秉貞、黃宗羲、朱大典等人說了算。而且朱常淓也沒有多少政治野心，如果一定是要當傀儡的話，那麼寧可給一個實力強的地方勢力當傀儡，起碼也能過得舒心一些。但去不去杭州，並不是由朱常淓說了算，因此他也無可奈何。
就在第二天，黃鎮周上奏，稱弘光架崩之後，國不可一日無君，因此建議朱常淓立刻在徽州稱帝，也好名正言順，使群臣百官有所瞻依。
這個建議也得到眾官員的一致贊同，當然大家彼此都是心照不宣，一但朱常淓在徽州稱帝，正好可以借此為由，暫時不去杭州，而稱帝的儀式雖然單簡，但前前後後至少也要一個月的時間，也可以拖上一個月，至于一個月以後怎麼辦，到時候再想辦法。
史可法多少也了解一些眾人的想法，心里當然也非常不痛快，這都是什麼時候了，居然還有心爭權奪利。但這話也不好直說，而且他到也不反對朱常淓稱帝，因此也借機建議，請朱常淓到杭州稱帝。
就在這時，史可法收到從杭州來的消息，魯王朱以海，在張國維、方逢年、錢肅樂、張名振、張煌言等人的擁立下，在處州出任監國。
原來南京被攻破的消息傳開之後，在浙江處州府定居的明朝原兵部尚張國維匯同一批聚集在浙江的官員們商議，認為急需迎立一位明朝宗室出任監國，然後號招南方抗擊清軍。而因為當時消息不通，朱常淓剛剛出任監國還沒幾天，內部的事情都還沒有理順，也沒有來得通告各地，因此只能在浙江一帶選擇，被安置在溫州平陽的魯王朱以海，也就成為他們擁立的惟一人選,被接到了處州龍泉縣。
雖然朱以海被擁立為監國，但實際上現在他手下只有十幾名大臣，數百士兵，完全是一個地道的草台班子。而擁有的地方也就是一個縣城，處州本來是商家軍的管轄地區，官員和百姓對魯監國並不感冒，沒有商毅的命令，誰鄀不敢去搭理他們，處州知府雖然接到了來的公文，但也裝不知道。
因此在朱以海被擁立為監國之後，立刻派張煌言為使，趕到杭州，來見商毅，通告此事，當然是希望得到商毅的支持。畢竟他們也知道，現在整個南方，只有商家軍靠得住。
不過等張煌言趕到了杭州之後才知道，現在商毅並不在杭州，而是在南京堅守，繼續和軍作戰，接待他的是王夫之。而留守杭州的葉瑤瑱也以此為借口，對是否支持魯王監國也不置可否，推說要請示商毅，才能做決定。張煌言也沒有別的辦法，只好先留在杭州等著。
而留在杭州的吳甡也嚇了一大跳，如果讓朱以海搶了先，那可就麻煩了，這不是又弄出來一個馬士英第二嗎？因此也趕快派人給史可法送信，讓他快把朱常淓接到杭州來，免得夜長夢多。
這個消息立刻在徽州引起了一陣喧嘩，因為在徽州的這些官員看來，自己擁立的朱常淓當然是代表著正統，而朱以海算什麼，憑什麼也能被立為監國，從血緣上來說，朱常淓也比朱以海佔優。因此有不少人都上言，應該派人立刻去溫州，要求朱以海取消監國的稱號，還有人主張兵去打朱以海。
這時史可法又再次建議，朱常淓應該立刻趕去杭州繼位，因為只要朱常淓到了杭州，商毅也就可以名正言順的拒絕朱以海的要求，同時朱常淓還可以借助商毅的兵勢，迫使朱以海取消監國。
在這個時候，這當然是最好的選擇，畢竟在這個時侯，血緣優勢，己經起不了多大作用了，實力才能決定一切，誰能夠得到商毅的全力支持，誰就能在這場爭奪中佔優，但這個正確的建議顯然是不能被徽州的官員所接受，相反到成為阻止朱常淓去杭州的最好借口。
張秉貞先上奏，建議朱常淓就在徽州立刻稱帝，這樣一來，就可以搶在朱以海前面稱帝，在大名份上可以壓倒朱以海一頭，並且請史可法為代表，去溫州責問朱以海。目地是像朱以海表明，商毅是支持朱常淓的。這個建議當然也得到了其他官員們的一致同意。
可惜他們的如意算盤打得雖好，但卻引起了史可法的極大不滿，當場就拒絕了代表朱常淓去責問朱以海的要求，同時也表示，自己第二天就返回杭州。
徽州的官員對此也不敢強求，史可法走了也好，免得老是勸朱常淓去杭州。不過他們也擔心商毅真的倒向朱以海一方，因此最後還是商議決定，派黃宗羲為代表，跟史可法去杭州，策封商毅也越國公，以此籠絡商毅，同時又以黃道周為使，去溫州責問朱以海。