孫元起盡管很忙，但在1899年的聖誕節前，還是努力抽空拜訪了丁韙良大人和康格公使。
丁韙良是一如既往的和藹，也是一如既往的嘮叨。見了孫元起，就抱怨他那麼久不來探望自己，又對京師大學堂的管理發一通牢騷。在抱怨和牢騷中，孫元起感受到這位老人的慈祥和善良。老人極力挽留孫元起和他共進午餐。在告別時，還叮囑以後一定要經常來。
至于康格公使，見面就是一個擁抱。康格太太在握手後，笑著說︰「我們收到了Tomy來信，他在信中極力稱贊你做出的突出成績呢。」
康格先生拍著孫元起的肩膀︰「這一年多以來，你一直過著隱士般的生活，所以才能取得這麼優秀的成績。你要知道，在你出名之後，很多人都在打探YorkJohnson是誰，這是外交官們樂此不疲的話題。盡管沒有誰比我們還知道答案，但我們一直保持緘默。保守秘密是我的操守，無論作為軍人，還是外交官。」
孫元起連番感謝。
在農歷新年快要到來的時候，孫元起的論文終于攢好，論文名字就叫做《論動體的電動力學以及質量與能量的關系》。論文共分為三個部分︰
第一部分是運動學部分，先把相對性原理和光速不變原理共同作為基本公設和出發點。從兩個基本原理出發，推導出了著名的洛倫茲變換方程。同時，還導出了運動剛體的「長度收縮」、運動時鐘的「時間膨脹」效應和速度的「加法定理」，把空間、時間同物質運動密切聯系起來，揭示了空間和時間的相對性。
第二部分是把導出的洛倫茲變換方程組應用于電動力學，認為電磁場方程在不同的慣性系中具有相同的形式。因此，「只有作為電力和磁力的載體的光以太的觀念不再適合于這里提出的理論」，即以太不存在。文中，還解決了把經典麥克斯韋方程應用于法拉第電磁感應實驗所引起的不對稱問題，探討了多普勒原理和光行差的理論等。
第三部分則是推導出了赫赫有名的質能方程E=mc2，把質量守恆定律與能量轉化和守恆定理統一起來。這就是導致原子彈、氫彈等核武器的理論依據。文中，設計了用鐳—溴化物微粒發出的β射線進行證明的實驗方案。
雖然說起來很簡單，真正落到紙面上的時候，需要嚴密的推導和嚴格的證明。所以論文很冗長，所幸沒有超過之前的《光電效應︰從現象到本質》。在春節到來之前，把它作為新春禮物，寄給了《science》。如今，後世牛氣哄哄的《science》已成為孫元起的後花園，幾乎是想什麼時候發文就什麼時候發。
然後，春節就來了。
春節是中國人最重視的節日，所以學堂里面的學生都已經放假。顧之麟、陳驥德、劉斌都是是直隸人，回去最早。韓蘧、周宗武、張純家在北京城，臘月二十八還相約跑來孫元起的院子里轉了一圈。至于小學堂中，佟景仁、佟景智、佟景聖以及「孫家五少」則是「各回各家，各找各媽」。院子里頓時空閑不少。
老佟儼然以管家自居，指揮著老趙、老鄭兩家忙東忙西。孫元起這一年的薪水攢下不少，足夠過個肥年。或許是過年、或者得意的緣故，老佟吆喝得是眉飛色舞。
大年初一一大早，老佟就領著另外兩家人到孫元起住處拜年，大大小小的跪了一地。孫元起趕緊讓大家起來，人人都有壓歲錢。看著五六個孩子都能認識幾個字，心里的憂郁也減輕些︰我來到這里，畢竟是改變了一些人的命運！
過了大年初一，開始挨家挨戶地拜年。孫元起來大清已經一年有半，因為一直閉門著書，也不認識幾個人，想來就是孫家鼐老大人、丁韙良大人、康格公使三家，其他的沒了。葉*子悠*悠兩個洋人，走走過場就行；孫家鼐老大人那里，年前拜訪過一次，如今再去，恐怕拜客盈門，到正月十五都輪不上自己呢！
大年初二，老佟回去了，估計是去他哥哥那里。老鄭一家也出去串門了。老趙一家是逃荒過來的，在京城沒有親朋好友。這樣，老趙家的帶著趙景惠、宋景堯在準備午飯。老趙，還有趙景行、趙景範兩個小子，陪著孫元起有一句沒一句的聊天。
這時候，門外傳來一陣鞭炮聲。老趙趕忙起身，出去看看究竟是怎麼回事。還沒走到門口，就看見韓蘧、周宗武他們領著一群人進了門。他們也不和老趙客氣，打了招呼便往院子里走，一點兒都不生分。
孫元起閑著沒什麼事兒，看著老趙出去，自己也起身跟在後面，恰好看到那群學生闖進院子。這群學生，孫元起都認識，除了韓蘧、張純、周宗武，剩下那六七個學生都是崇實中學三年級的學生，韓蘧他們的學弟。怪不得能一塊來。
學生們見了孫元起，都連忙走快幾步，撩起棉袍，就跪倒一片。幸好過年這幾天沒有雨雪，老趙年前也打掃得干淨，不然，這麼多件新整的衣服就遭踐了。
孫元起連忙讓他們起來︰「都起來吧！大過年的，我們不講那些虛禮！」
韓蘧、張純、周宗武他們仨倒是起來了，其他人還跪著不動。
孫元起奇道︰「怎麼，還要壓歲錢麼？」
韓蘧笑嘻嘻地來到孫元起身邊，看著那些師弟，說道︰「先生，他們可不像我們仨光是拜年！」
「那還干什麼？」孫元起掃射一眼這群跪地不起的少年。
「拜師唄！」周宗武、張純在一旁擠眉弄眼，齊聲說道。
「拜師？」孫元起明白了，他們是沖著「物理傳習所」來的，怪不得兩撥人一起呢。「你們不是還沒畢業嘛？著什麼急啊？都趕緊起來！」
張純說︰「先生，你要不答應，他們可不起來的。」
幾個跪著的學生也參差地說︰「要是不答應，就不起來！」
孫元起只好答應︰「那好，你們起來吧！」
那幾個學生歡呼一聲，磕了個頭，都跳起來。其中一個孫元起認識，叫潘咸，沖著身邊的同學說道︰「剛才可是我最先跪倒的，我是大師兄！」
韓蘧頓時不樂意了︰「咸菜！你是大師兄，那我是什麼？」
那潘咸頓時躬下腰，一溜煙地跑到韓蘧面前︰「您是我們的大師兄，我是他們的大師兄……」
周宗武就在旁邊︰「扯淡！告訴你，韓蘧，大師兄。我，二師兄，張純，三師兄。你？」
潘咸接口道︰「那我是四師兄？」
「球！你是那白龍馬！」張純沒好氣地說。
院子里面一陣笑聲。
又過了五六日，老佟帶著他的三個佷孫回來了——不，是兩個佷孫，一個孫子。據老佟說，他哥哥已經答應把最小的孫子佟景聖過繼給他，如今，他不再是「孤家寡人」。也就是說，院子里，孤家寡人就只有孫元起一個。老佟好幾次隱晦地暗示孫元起，是時候給家里找個「主母」了。這個問題，孫元起不是沒想過，可是一來在大清人生地不熟，根本就沒遇到幾個女性。這個時代的少女，都躲在各式的深閨淺閨中了。像趙景惠、宋景堯、鄭景懿這種能和男孩子一塊兒坐到教室里听課的，大清國中幾乎沒有。二來孫元起在孫家鼐大人的府上，見過幾次所謂的大家閨秀，一個個腳丫子裹得像個錐子，走路都在搖擺，看得孫元起心中發毛︰難道自己要娶個這樣的媳婦？別說能不能交流溝通，這完全就是生理畸形嘛！于是，孫元起徹底打消了這個念頭。(看小說就到葉子•悠~悠)
老佟正跟孫元起匯報這幾日衣錦還鄉的歷程呢，好久不見的胡勛、左功先、曾廣錫、李國秉四兄弟領著兩個陌生人前來拜年。
相互見禮拜年之後，胡勛向孫元起介紹道︰「這二位，是上海商務印書館的石先生和殷先生。先生給學生的幾本著述，就是拜托他們印制的。」說著，就從隨身的包裹中取出一大摞書，呈遞給孫元起。
孫元起接過來，大致翻閱了一下，最先是《教育學大綱》、《心理學大綱》、《教學方法論》，接著是《中等物理教科書》、《中等化學教科書》、《中等數學教科書》，最下面卻是《初等物理教科書》六冊。這六冊書，本來是京師大學堂刊印作學生教材的，孫元起給崇實中學新一級學生上課都沒有辦法，只好從京師大學堂要了兩套，分給學生傳抄。現在看時，卻是從京師大學堂刊印本翻印的，也不知道侵權不侵權。然後，說道︰「印得很是不錯。子實、執中、厚臣、君衡，辛苦你們了！石先生、殷先生，你們的工作很好！」
六個人都躬身說道︰「不敢當！」
那個姓石的中年人笑容可掬地說︰「在孫先生面前，我們可當不起‘先生’這個稱呼！」
同行姓殷的則是為青年人，現在面上還有一絲驚訝︰「沒見到孫先生之前，我們拜讀先生的幾種講義和教科書，以為孫先生著述等身，定然是位皓首窮經的長者。沒想到，孫先生居然這麼年青，真真是沒想到！」
李國秉斜覷了那位姓殷的一眼︰「我們孫先生雖然年青，學問確實極好的，不要說在大清了，就是——」
「就是以後見了洋人的教材，也定然不及孫先生寫得好！」左功先突然攔過李國秉的話頭，接著說下去。說的時候，還給了李國秉一眼鏢。
李國秉不滿地哼了一聲，端起茶碗喝茶。
石先生從袖子中掏出一沓紙，放在孫元起面前的桌子上︰「孫先生，敝館從您的幾個高足看到大著，就覺得先生定然學識淵博，所以決意將之印行。因為本館能力有限，至年前才陸續印出。但就最先印出的幾種圖書，在滬上和江浙一帶都反應極好，不少學校都致函本館，要求預訂先生的那幾種大著作為教科書。能夠印行先生的著述，敝館上下都覺得與有榮焉。這是前期的稿酬，微薄之至，不成敬意，還望笑納。」
孫元起很吃驚，在清末印書也有稿酬麼？粗略掃了一眼，是一百兩一張的銀票，估計有十多張。便問道︰「編教科書，還有稿酬麼？」
那六個人一齊點頭，答道︰「有的！」
「哦！能有這麼多麼？你們不會在騙我吧？」孫元起一臉狐疑。
李國秉看著孫元起那種驚奇的表情，覺得這時候的孫先生，才像是和自己一般年齡的青年人。而且，看上去，他對于這些東西確實是一竅不通。于是心想︰原來也有你不知道的東西！
左功先看了孫元起的表情也想笑，卻不敢笑出來，強忍著說道︰「先生，他們沒有騙你的！」
「真的麼？」孫元起依然有些半信半疑，看了看銀票，又詢問似地看著石、殷兩位。
姓殷的點點頭。姓石的也說︰「孫先生，沒錯的。」
「真的呀！」這是孫元起來到清朝之後最大的一筆收入了。
姓石的中年人非常肯定的點點頭，然後說︰「對了，孫先生，听您的幾位高足說，你還編有幾種小學教科書？」
「是啊，你們要看看麼？」孫元起看著他。
「是所願也，不敢請耳！如果能讓我們拜讀一下，那是最好不過啦！」商務印書館的兩位站起來，向孫元起拱拱手。
「那你們跟我來吧。」最先，小學堂的教科書都是孫元起用鋼筆寫的，說實在的，只能算得上工整。後來有了學生，就讓學生幫自己抄了一遍——這就是有學生的好處。孫元起一個人寫東西的時候，呆在自己的書房；而和學生們編寫什麼的時候，則在掛著「物理傳習所」牌子的房屋里，如今，幾種教材就放在那兒。從會客廳到物理傳習所還有個幾十米，所以最好一塊兒過去。
孫元起帶著他們走進物理傳習所，絲毫沒有注意到最後面的四個學生在「物理傳習所」匾額前含有深意的對視了一眼。
從去年秋天到現在，孫元起和六位學生又編了《中等物理教科書》、《中等化學教科書》、《中等數學教科書》的第二冊；小學堂的語文、數學、自然、英文已經編到了三年級下學期，嗯，還有一本《思想品德》，教學生如何五講四美三熱愛的。
商務印書館的兩位先生饒有興趣地在翻看各種教科書。姓殷的小伙子指著小學語文課本問孫元起︰「和（h）——烏（u）——阿（a）——花（hua），花（hua）……孫先生，這就是你編的漢語拼音吧？」
「是啊，你怎麼知道的？」孫元起很奇怪，居然他也知道漢語拼音。
姓殷的指了指那四個圍在一塊兒翻看字典的學生，孫元起明白了。
那本字典，只收錄了三四千個最常用的漢字，注釋也盡可能用白話翻譯《康熙字典》中的注釋，再加上拼音，就這麼編成了。字典取名為《中小學常用字字典》。這個字典用的是音序排字，那幾個學生都是學過英文的，所以翻起來得心應手。
殷先生問道︰「孫先生編的漢語拼音，對于學生識字，端的是妙用無窮。只是鄙人不明白，為什麼這四聲不是平、上、去、入，而是陰平、陽平、上聲、去聲呢？這樣一來，就有數點不便︰一是不利于其他方言地區的學生學習和使用，二是不利于查字，尤其在不利于吟詩作對寫文章時。」
那四個學生也端著字典過來，看來他們也很在意這個問題。孫元起以前對編字典的幾個學生說過緣由，現在復述出來︰「隨著交通和通訊的發展，在全國推廣和普及官話勢在必行，這是歷史趨勢。現在，中國都在使用漢字，只是讀音不同，這也是方言區學生學習官話的障礙。有了漢語拼音，就有了官話讀音的標準，便于各地學生學習標準的官話。所以，編寫《小學語文教科書》使用了官話中的四聲，並且輔之這本字典，對于官話學習，應該大有裨益。」
「哦？這就是你們前一段時間編的字典？」石先生也放下手中的書冊，走過來，從四個學生手中接過字典，先看封面，念道︰「中小學常用字字典？」
孫元起解釋道︰「有了這本字典，使得學生在學習一段時間漢語拼音之後，可以自學漢字。這樣，對于普及文化、消除文盲具有一定作用。——文盲，就是不識字的人。」
「孫先生真是有心人！」石先生贊了一句，又往後翻看了幾頁，抬頭問道︰「這本字典的字按什麼排序啊？是韻部麼？卻又不是……」
孫元起心想︰看來這位石先生是不懂英文的。
曾廣錫剛才看了個大概，知道一些，便代為回答︰「孫先生的這本字典，是按照英語的字母序來的……哦，應該說是漢語拼音序，然後同一拼音的按照音調，同一讀音的則按照筆畫數。」
孫元起點點頭︰「厚臣說得對！」
因為不懂漢語拼音，只能順手翻翻，然後放下字典，朝孫元起拱拱手︰「鄙人今日前來，主要是代表商務印書館拜訪您，見識一下大名鼎鼎、博學多識的百熙先生。此外，還有一件事懇請百熙先生俯允！」
「請講！」孫元起也拱拱手，示意不敢當。
「敝館想獨家印行百熙先生編寫的各種教科書和講義！」說罷，石先生和殷先生都俯首躬身，以示誠意。
放在二十一世界，商務印書館請求印刷你的書稿，這還不夠你臭屁的！所以，孫元起很爽快地就答應了︰「行！……不過呢，我有幾個問題。」
石先生先是一喜，听到孫元起提條件，又有些吃驚，連忙說︰「百熙先生請講！不過，敝館在稿酬方面，一定不會讓您失望的！」
「倒不是稿酬了。」雖然銀子是多多益善，不過這不是孫元起首先考慮的問題，「第一個問題，獨家問題。其他科目的教材都沒問題，只是物理的不太好辦。因為我是京師大學堂的物理老師，編寫的物理教材自然需要交給京師大學堂印行，然後供學生使用。所以，獨家就……」
那石先生擺擺手︰「這不算問題。京師大學堂印書，向來只供本校學生使用，畢竟這也是百熙先生的學生在用嘛！所以說，我們商務印書館還是獨家的。那第二呢？」
「第二，我編的小學教科書，尤其是語文，你們印行，不會有問題麼？」孫元起擔心的是漢語拼音不容易在南方推廣。而且，按照北京中小學堂的數目，恐怕也賣不出幾本來。如果印行，商務印書館怕是要虧本。
石先生再次擺擺手︰「敝館的技術，百熙先生還是要放心。可以這麼說，在上海，我們印書館不敢稱第一，但絕對是前三！所以，這也不是問題。那麼，第三呢？」
「……」看來自己說話，他沒听懂。只好接著解釋︰「石先生，我是擔心這些教材銷路不好，你們吃虧……」
「哦，這個不用擔心。百熙先生編寫的教科書，現在是大有名氣，很多學校來函征訂呢！近一兩個月，敝館一直在加班加點的印行，還供不應求。所以銷路問題，百熙先生就不用考慮啦！」石先生笑著解釋道，「謝謝百熙先生對敝館的關愛。那第三呢？」
「第三……第三，你們印行的時候，能不能給我幾套？我教學生也要用呢。」孫元起道。
石先生哈哈大笑︰「哈哈哈，百熙先生，這就更沒問題了！那第四呢？」
「第四……沒第四了。」孫元起的第三點都是臨時想起來的，自然沒有第四點了。
「好！百熙先生真是學者風範！」石先生沖孫元起抱抱拳，然後說，「至于稿酬問題，鄙人現在不能給先生一個確數，不過先生放心，敝館絕不會虧欠先生的！」
孫元起擺擺手，示意自己信得過他們。于是，石、殷兩位先生開始收拾桌子上的各種教科書都好，打算一口氣抱走。
等出門的時候，孫元起偶爾一瞥，就看見最厚的那本字典，吃驚地說︰「怎麼，你們還拿了字典？」
「字典，不能拿麼？」石先生看見孫元起吃驚的表情，有些惶恐。
「不是不是！」孫元起連忙解釋︰「關鍵是你們拿字典沒用啊！」
「小學語文教科書有拼音。可光有拼音，沒有字典，拼音也沒用啊！」姓殷的小伙兒說。
孫元起一想，也是這個理兒。就任由他們拿走，只是囑咐他們盡快拿回來，畢竟這是「海內孤本」，全世界只此一家，別無分店！好看的小說盡在,告訴您的朋友