在恭送女媧娘娘和華胥聖母之後，長老們請伏羲，女媧（以後稱人族女媧為女媧，聖人女媧為女媧娘娘或聖母）回華胥部落為首領。伏羲身兼人族眾望也不推月兌，當即與女媧隨長老返回部落。
遠遠的伏羲等人就發現前方稀稀疏疏的有幾間茅草屋，不成規矩，四周連柵欄也沒有。走近伏羲發現大部分族人，都身披樹葉，只有少數人身披獸皮，沒經過裁剪，直接披在身上，只有幾個人，像身邊的幾個長老有些法術傍身，用法術變化衣服穿在身上。族人們有在打磨著石器的，有在樹上摘鮮果的，有在鑽木取火的，沒有一人無所事事。看到長老們回來，也只是點頭打個招呼，就繼續忙自己的去了。長老想把族人們聚起來，向族人們宣布伏羲的事情，被伏羲制止了，「晚上好了，大家忙完休息的時侯。」伏羲如此說道。隨後伏羲來到長老的茅草屋，將自己關了進去，細細思考部落的發展之路。
傍晚，部落的族人聚在一起，圍坐在火堆周圍，看著祭祀祈禱明天的好天氣。這時長老們圍著伏羲來到火堆旁，對族人說道︰「十幾年前，我們部落出了個杰出首領，帶領我們來到這個水畔，開荒田，止洪水，斬邪妖，令我們扎根在此，並且讓我們的部落日漸強盛。今天我們又迎來一位杰出的首領，他不光是我們部落首領，更是女媧娘娘親封的人族共主，也是我們上一代首領的兒子——伏羲。」
伏羲站在族人中間，說道︰「今日我為首領，理當為部落鞠躬盡瘁，」伏羲環視了一下，接著道「今天我看到了大家的能力，也看到了部落的未來，我們必將成為最強盛的部落。」發現族人在聚精會神的听，伏羲繼續道「而現在我們缺乏的是凝聚力，和榮譽感，所以我妻女媧為我們部落制作了一個圖騰，」說著女媧將獸皮展開，「我們的聖母女媧娘娘為人首蛇身，我之前世為人首龍身，所以圖騰為人首龍身。」伏羲指指獸皮上的畫，又說道「我將這個圖騰名為道，是人族之道，願天下蒼生，人人如龍，為我伏羲之道。」說著伏羲，女媧聯手在部落四周的石壁上畫下一個個大大的圖騰，使圖騰首尾相連形成小型陣法，維護部落。
其後女媧手持紅繡球，對族人說道︰「今我定陰陽，男為陽，女為陰，陰陽相合為婚。」
以後的日子里伏羲女媧開始了部落發展大計。雖然伏羲還未恢復記憶，但是後世的一些習慣任影響著他。伏羲愛潔淨，特設立專門的方便場所，更利用糞土做肥料，養地產糧；伏羲愛吃魚，發明了漁網，解決了族人的一大口糧問題；伏羲發現族人還在用結繩記事，便教族人利用圖畫記事。
經過伏羲女媧的努力，華胥部落漸漸成為整個流域最強盛的部落，不少部落前來學習，伏羲身為人族共主的事也漸漸被眾多部落接受。又一個好的豐收日，祭祀圍著火堆，表達對上天的感謝。伏羲忽然一句「好舞豈能無樂？」便命人找來馬尾和木塊，當即做了一把瑟，伴著祭祀彈奏了一曲《駕辨》。
忽然听得有人贊道︰「好曲！」只見一位道風仙骨的老人自然的站在伏羲對面，「果然好慧根。貧道乃人教教主太上老君，你即為人族共主，當為人教中人。你我當有師徒之緣，現收你為徒，你可願否？」華胥部落的人听道聖人要收首領為徒，都十分興奮，興沖沖的看著首領，等著伏羲的回應。而伏羲現在卻一臉的糾結，不知為什麼，從心的底部傳來一個聲音，「不要答應他」好像只要答應了之後，就會失去重要的東西一樣，雖然不知會失去什麼。但是伏羲決定順從自己的想法，再三斟酌後，婉轉的拒絕道︰「多謝聖人垂愛，伏羲不敢當，我為人族共主，當可為人教中人。但聖人之徒，伏羲不敢當，雖伏羲尚未恢復記憶，但伏羲已知自己是上古妖神轉世，戴罪之身，當不起聖人垂愛。再這我雖已為人族，但畢竟是女媧娘娘兄長轉世，女媧娘娘更為人族之母，不經娘娘法旨，我不敢拜聖人師。」老君細細看著眼前之人，忽然大笑「看來你我師徒之緣淺薄，應當如此。吾當送你一般造化。」說完從伏羲身上抽出一道清氣，高歌而去。而伏羲被抽走一道清氣，當即痛苦的大叫起來，女媧急忙來到伏羲身邊，不斷用法術治療，可是什麼效果也沒有。女媧無奈只得打昏伏羲。
伏羲的靈魂來到真靈處，發現紫氣慢慢吸收走信仰之力，一份記憶噴涌而出。伏羲在完全接受了記憶後終于了解了事情原委。
小靈魂來自地球，那里有不少關于這里的神話。老君和女媧娘娘的私自行動，導致天道紊亂，小靈魂穿越時空而來，又介入天道和鴻鈞的爭斗，得到了些有用的知識，在靈魂崩潰之際，被輪回隧道吸引，又被伏羲靈魂融合。而太上老君一開始就在伏羲的靈魂里加入了一道太清玄氣，為阻礙伏羲妖魂的覺醒，沒想到卻成全了小靈魂。現在太清玄氣離開，妖魂覺醒，卻又被鴻蒙紫氣煉化，成為鴻蒙紫氣的養料。老君一開始就算計人族的氣運，人族共主的氣運。如果伏羲拜老君為師，前有老君的再生之情，後有師徒之義，老君即可分走人族半數氣運，又和女媧娘娘了結因果，老君便是貨真價實的人教教主，連天道都不能罷免。如果伏羲不拜師，不管是妖魂與人魂誰吞噬誰，伏羲都不能再算純粹的人族了，而老君就可以廢除伏羲的共主地位，另立他人。而現在，老君的借口沒有了，伏羲又從記憶里得到真正的聖皇之道。伏羲終于跳出了棋局。
伏羲找來女媧，推薦女媧為華胥部落首領，自己牽上青牛踏上漫漫尋道之路。