從理論講，第31艦隊的第二波攻擊，依然沒有太大的威脅。
根據中國海軍的作戰記錄，當時只有七架bd「無畏」式突破了戰斗機的攔截，成功逼近了第一戰斗艦隊。
七架俯沖轟炸機有多大的威脅？
要知道，在這一次攻擊中，總共有十三架bd突破了攔截線，結果卻一無所獲。
只是，這次的情況截然不同。
這批美軍戰機在進入戰場之前，已經與返航的戰機會合，掌握了第一戰斗艦隊的大體情況，知道「秦始皇」號航母在艦隊最前方，也最容易遭到攻擊。更重要的是，在遭到防空戰斗機攔截的時候，有部分bd提前投掉了炸彈，並且在規避的時候俯沖到了低空，但是沒有立即返航。
七架bd中，就有三架在低空飛行，而且朝「秦始皇」號飛去。
結果就是，這三架bd幾乎吸引了「秦始皇」號、以及為其提供直接防空掩護的「南京」號的全部防空炮火。此外，還吸引了近十架在「秦始皇」號附近活動的「海鷹」戰斗機前來攔截。
爭分奪秒的戰斗中，高射炮手根本不可能看清楚幾公里外的敵機。
事實，在高射炮手的眼里，敵機只是一個快速移動的小黑點，他們需要做的就是用瞄準環套住這個小黑點，然後猛烈開火。
也就是說，當時戰艦的高射炮手都不知道敵機的性質。
如果知道那只是三架拋掉了炸彈的俯沖轟炸機，顯然不會有任何高射炮手會在這三架戰機身浪費炮彈。
當然，浪費的最為寶貴的是時間。
防空作戰中，防空戰艦首先對付魚雷攻擊機，有一個非常重要的原因，即魚雷攻擊機在發起攻擊的時候更加笨重，而且在超低空的火控範圍非常有限，因此也就更容易被高射炮擊落。
問題是，這三架bd不是魚雷攻擊機。
戰斗中，炮手肯定不會看表，也就不知道攔截這三架敵機花了多少時間。
更要命的是，bd在拋掉炸彈之後，機動性能並不算差，美軍甚至考慮過把這種戰機用于防空作戰。
結果就是，為了擊落這三架bd，兩艘戰艦浪費了極為寶貴的時間。
趁此機會，四架掛著炸彈的bd從高空逼近了「秦始皇」號。
雖然在俯沖之前，就有兩架bd被及時趕到的「海鷹」擊落，還有一架在轉入俯沖後就被高射炮擊落，但是仍然有一架bd順利開始俯沖，而且在被高射炮擊中之前投下了掛在機月復的炸彈。
最終，駕駛這架bd的飛行員托馬斯尉、與導航員林德克士僥幸生還。
可以說，這是第31艦隊出動了百架戰機，發起兩波攻擊中，唯一一次對「秦始皇」號構成了直接威脅的攻擊。
也就是這唯一一次，中了大滿貫。
當時，「秦始皇」號正在向右轉向，主要是「南京」號在其左側，而且離得很近，而在右側的「北京」號正在向右轉向，準備避開航母，因此在規避轟炸的時候，「秦始皇」號只能向左轉向，向右轉向則會撞「南京」號。
踫巧的是，托馬斯尉在投彈的那一刻，bd的右翼被一枚二十毫米、或者是四十毫米炮彈擊中，導致俯沖線路向右偏了幾度。結果就是，托馬斯尉投下的炸彈砸向了「秦始皇」號的右側。
如果當時「秦始皇」號在直線航行，這枚炸彈就會落到其右側的海面。
問題是，在規模轟炸的時候，航母肯定不會直線航行，因為這會成為轟炸機與攻擊機的理想靶標。i
當時，「秦始皇」號的很多官兵，特別是露天甲板官兵都看到了那枚炸彈。
最後關頭，艦長下達了左滿舵的命令。
可惜的是，這個時候再向左轉向，已經來不及了。
顧祝同等人在密閉的指揮中心里面，根本看不到外面的情況，也就不知道航母將在什麼時候被炸彈擊中。
只是，在此之前，顧祝同已經坐到了司令官的位置，系好了安全帶。
田黛芳與卓宇凡等人沒有座椅，也就只能用安全帶把自己系在艙壁的安全護欄。
戰斗中，直接被炸彈炸死的官兵並不多，大部分傷亡官兵都是因為沒有做好安全防護準備，在爆炸的時候被震死或者震傷的。在已經戰沉的「光武帝」號航母，就有百名官兵被猛烈的爆炸震死。結果就是，中國海軍加強了安全防護教育，並且在戰艦人員集中的地方增設了一些安全防護設備。比如在指揮中心里面，靠大門右側的艙壁就有一排安全防護欄，面有數十根安全帶。在遭到攻擊的時候，官兵可以把安全帶系在腰間，把自己固定在安全防護欄，避免在炸彈爆炸的時候被震飛。此外，在一些小細節，中國海軍也做足了功夫。比如在大戰爆發的時候，戰艦供軍官使用的都是餐具與杯具都是瓷器，結果在海戰中，這些瓷器成為了殺人利器。到一九四一年下半年，戰艦配備的就全是塑料制成的餐具與杯具了。
這些防護措施，讓顧祝同等人安然無恙。
只是，「秦始皇」號航母就沒有這麼幸運了。
炸彈就落在艦島左側，在機庫下面的軍官住艙里面爆炸，直接炸毀了軍官住艙、以及相鄰的技術士官住艙、面的軍官餐廳，並且導致通往軍官餐廳的一根高溫高壓蒸汽管道破損斷裂。當時，這些受損的艙室里都沒有人，只有軍官餐廳里有幾名炊事兵，而傷亡的官兵中有很大一部分與泄露的高溫蒸汽有關。
最嚴重的損傷，還是爆炸產生的後效應。
雖然爆炸點在機庫下面，爆炸釋放的能量在向傳遞的時候，已經在機庫里面分散，但是仍然沖開了飛行甲板，導致飛行甲板中部出現了一道寬度在三十厘米以的裂痕，並且使得飛行甲板中部翹。
事實，「秦始皇」級的飛行甲板本來就不夠堅固。
可以說，這也是「秦始皇」級最大的缺陷之一。
「光武帝」號戰沉後，中國海軍就想過加強「秦始皇」級的水平防護，比如把木制飛行甲板換成裝甲板。可惜的是，到最後還是放棄了。原因也很簡單，「秦始皇」的重心本來就偏高，在加裝了數十門小口徑高射炮之後，穩定性變得更加糟糕，如果換裝甲甲板，恐怕就無法出海了。
當然，顧祝同、以及「秦始皇」號的所有官兵都應該感到慶幸。
bd投下的是一枚五百磅級航空炸彈，而不是威力更大的一千磅級航空炸彈。如果換成一千磅級航空炸彈，那麼爆炸點就應該在軍官住艙下面，也就是航空燃油庫的右前方與航空彈藥庫的正方。
結果如何，可想而知。
事實，當時bd完全有能力掛在一千磅級航空炸彈。
雖然最初的時候，bd不具備掛在一千磅級航空炸彈的能力，但是一九四二年初，隨著bd-3型服役，其載彈能力大幅度提高，已經能夠掛一千磅級航空炸彈從艦隊航母起飛了。
可惜的是，這架bd不是來自艦隊航母，而是來自小型航母。
受飛行甲板長度限制，bd從小型航母起飛的時候，要麼降低載彈量、要麼減少載油量，得把起飛重量減少三百公斤左右。
顯然，托馬斯尉選擇了減少載彈量。
戰後，很多人都認為，托馬斯尉錯過了改寫歷史的機會。如果他當時選擇的是減少載油量，那麼他就有可能一舉干掉在這場大戰中表現最出色，貢獻也是最大的中國海軍將領顧祝同。
托馬斯在戰後出版的回憶錄中提到，他做了一個錯誤的選擇，讓美國輸掉了這場戰爭。
顯然，這麼說有點言過其實了。
要知道，即便擊中「秦始皇」號的是一枚一千磅級航空炸彈，炸死顧祝同的可能性也不會大到哪里去。主要就是，在「光武帝」號戰沉之後，中國海軍就把航母的作戰指揮中心改為全封閉式，而且增加了一層厚度在三十毫米的防破片裝甲，為艦隊司令部的官兵提供了最好的保護。此外，作戰指揮中心在艦島的下面，面有好幾層甲板，被炸彈直接擊中的可能性非常渺茫。
當然，有一點可以肯定，如果當時擊中「秦始皇」號的是一枚一千磅級炸彈，那麼「秦始皇」號就很有可能步「光武帝」號的後塵，成為中國海軍在這場大戰中損失的第二艘艦隊航母。
事實，炸沉「光武帝」號的，也只是一枚炸彈而已。
航母不是戰列艦，自身防護能力並不強，只要命中了關鍵部位，一枚炸彈就能干掉一艘艦隊航母。
顧祝同來到飛行甲板的時候，美軍的攻擊行動已經結束。
此時，「秦始皇」號的官兵正在拼命滅火，艦長則在與附近的「漢高祖」號聯系，讓其接收返航的艦載機。
顧祝同沒有在「秦始皇」號呆多久，十點半不到，他乘水飛機了「漢武帝」號。
戰斗還沒結束，他必須留在司令官的崗位指揮戰斗，而當時也只有「漢武帝」號有全套的艦隊指揮設施。
十一點左右，「漢武帝」號升起了艦隊司令旗。
這個時候，攻擊第31艦隊的戰斗也打響了。