賢者之晶:天神西魯菲所制造的超越賢者之石（《鋼之煉金術士》中以大量人命煉成的奇跡之石）的存在，「永恆絕對之惡」的集合，超越「此世之惡——安利馬尤（AngraMainyu）」數倍的存在，擁有接近于無限的力量（本文中最最最大的BUG）。在諸神黃昏中西魯菲為救朱雀羽辰將賢者之晶消耗殆盡，世間僅余下千羽胸前所帶的一片不完整的賢者之晶。
暗世界︰與普通人生活的表世界相對，屬于異能者、魔術師、魔導士的世界，有幾大異能勢力共同統治。
機關︰世界上最大的自由性異能組織，幾乎除了其他幾個大型暗世界組織成員外所有的異能者都受它管轄。
時空管理局︰擁有時空轉移技術的大型暗世界組織，在許多時空都有勢力分布，主要負責各個時空的穩定，成員統一使用擁有人工智能系統魔導器為武器，自稱為魔導士。
魔術協會︰自稱是鑽研魔術者所組成的自衛團體。負責魔術的管理與隱蔽，目標是希望重現魔法奇跡。成立初期分為三個部門︰倫敦的「時鐘塔」、埃及的「巨人之秘窖」（即專攻煉金術的阿特拉斯學院）、以及勢力遍布北歐的復合協會「彷徨海」。後來「時鐘塔」成為了總部，三方亦老死不相往來。因為中東一帶的魔術根基是中國的思想魔術，與魔術協會互不相容，因此雙方都在防範對方入侵。
聖堂教會︰具有」普遍」意義的基督教會的內部，以」狩獵異端」為名而建立的巨大部門的組織.絕不認同與其教義相悖之物。雖然在表面上他們把‘異端’當作並不存在來處理，但其中也存在著一些狂熱的異端排斥者。他們將在主的教義中不存在的事物予以物質性的排除。首要敵人是教會名單中所列出的死徒二十七祖，並懷疑主角千羽是其中的第三祖已成就完美之軀的朱月之布倫史塔德。
外界宿︰提供暗世界成員交換情報、休息、吃飯、住宿的地方，世界上最強大的情報組織。
魔術師︰這里的魔術師延用《Fate》中的設定，其實就是我們平常所經常說的魔法師。但是現今世界只有五個魔法，那都是連通神秘之根源的極大之法，是奇跡的代名詞。而一個魔法只傳承給一個魔法使。其他的就只能稱為魔術。
魔導士︰時空管理局成員的的獨有稱謂，原自稱魔法師，但魔術協會和教會對此十分不滿，認為他們的稱謂褻瀆了奇跡，故改稱魔導士。將魔力凝聚成的「念動之核」的能量作為等級測定標準，使用魔力與科技結合的人工智能魔導器為武器相當于暗世界警察的一群人。
可能有些設定與原著不符，沒辦法誰讓這是綜漫呢，總該加點自己的東西o(∩_∩)o哈哈~~~~~~~