上回說到西方教兩位教主為了興盛西方教，欲紊亂天數掩蓋天機，先于元始天尊下手將第三任人皇收入門下。奈何天數運轉，冥冥之中自有天理，卻被老子和元始二人看破，隨即運轉法力查探天機，尋找出下一任人皇。準提聞知此消息甚為遺憾，卻被接引道人明悟天機，知曉下一任人皇卻是沒有天定，自由兩者奪之，勝者即為人皇，于是引發了一場人間大戰，這是後話且不提。
卻說神農氏自伏羲證道傳下人皇之位後，為了人族的興盛，日夜勞累，多番辛苦。人族漸漸大興，部落里的人口也越來越多，又經神農推廣五谷耕種，人族又時常狩獵與山野，是以尚沒有出現饑荒之災。人族之勢建大，果然是受天道庇佑，妖族經過第二番劫難分散各地，倒也不會出來霍亂人族。至于巫族，劫難過後自歸洪荒西南，見人族之勢，多有羨慕，奈何受剩余的幾個大巫制轄，不得出來與人族相爭。卻多有族人不滿，巫族長老告于族內留守巫族的大巫風伯與雨伯二人，二人聞言大驚，要說他們乃是上古大巫，自然知曉人族和巫族的因果，也知曉人族興盛乃是上天所定之事，可是現在族人竟然又生與人相爭之心，甚為擔憂，只得駕雲來到巫族祖巫大殿求見刑天和相柳等人。要說這刑天和相柳等人乃是當年經過巫妖大戰的大巫，自劫難過後被玄冥祖巫帶著族人來到這里不再過問洪荒之事，忽聞風伯與雨伯求見，兩大巫相視一眼甚是奇怪，相見之後听說風伯與雨伯來意之後，即便是刑天這樣的大巫也是嚇了一跳，要知道如果巫族這麼做的話，不說天道懲罰，就是洪荒上那六個聖人肯定會出手的，巫族只有一個聖人平心娘娘，到時候怕是巫族滅亡之際。事關重大，大巫刑天等四人只得駕雲前往地府求見玄冥祖巫，告知巫族之事。玄冥祖巫聞言亦是大驚，帶著刑天等人來見平心娘娘。
「你們不在巫族，來地府所為何事？！」平心娘娘坐于幽冥殿內，看著地下拜著的四位大巫問道。
「娘娘不知，此來地府乃是事關巫族危亡大事，我等大巫不知如何是好，只得前來地府求見娘娘！」刑天拜伏在地說道。
「何事如此嚴重？！」平心娘娘聞言甚是奇怪，最近天數紊亂，自己也無法探知天數，見玄冥祖巫帶著刑天等人來求見就知曉定是與巫族有關，可是乍听竟然事關巫族危亡，頓時大驚。
「近來人族經人皇治世，興盛至極，我族內族人心生羨慕，知曉巫族昔日亦是洪荒大陸之大勢，所以心生與人相爭之意。風伯與雨伯聞之甚為恐慌，是以特來告知我等。可是我等直覺此間必有緣故，特來求教娘娘！」刑天躬身答道。
「人族大興乃是天道注定的，人族有三皇治世，五帝興人。此乃是天數，巫族怎的升起與人相爭之心？！」平心娘娘奇怪地說道，「難道此間有別人作祟，意欲滅亡巫族？！可是這間因果甚大，前番逍遙前輩曾言巫族尚有大興一時，應該不會有人敢這般算計。可是巫族興盛之時亦不在此間啊！」
「難道娘娘也不能知曉期間緣故？！」相柳大驚道。
「最近天數紊亂，天機不明。定是有人施法亂了天數，我雖是聖人可也無法從中查探天數！」平心娘娘嘆聲說道。
「不若求教與蓬萊逍遙前輩如何？！」玄冥出聲問道。
「如此，玄冥且親去一番！」平心娘娘說道，「我不能出這地府，你乃是巫族祖巫，卻是有得緣分前去求教的！」
「既如此，你等在此好生等待！我去去就來！」玄冥聞言吩咐四大巫後便施展法力，往東海飛去。
「大鵬，你且去外面將玄冥祖巫迎將進來！」閉上雙眼的吳傳道忽然睜開眼楮對著地下裝模作樣的大鵬鳥說道。
「是，老師！」大鵬鳥應聲，接著起身飛出殿外。
「伏羲，你此番疑惑卻給老師我惹了一番麻煩！」吳傳道看著地下閉幕修煉的伏羲說道，「此番大鵬心生魔障，日後怕是要阻攔佛法東傳的！」
「老師不是告訓過他嗎？！」伏羲聞言大驚。
「唉，此乃是天數。不只是大鵬，連六耳獼猴也與他們扯上因果。日後我們蓬萊一門卻是要與西方教接下兩段因果，日後只怕要插手那番劫難了！」吳傳道嘆息一聲。
「如此，弟子之過！」伏羲躬身說道。
「無妨，到時候便讓楊眉出手吧，我卻是不能隨便出手的，不然會引出很多的事！」吳傳道說道。
「弟子慚愧！」伏羲嘆聲說道。
「對了，還有一事你需小心！」吳傳道說道，「下一場量劫，我蓬萊門下怕是會深陷其中，你到時後不要過于在意他們，順應天數，切莫違反天道法則！」
「弟子謹遵老師法旨！」伏羲答道。
「你該回你的洞府了！」吳傳道說道，「如今墨明等人順應你的請求已經鎮守五方，楊眉已經听從我的旨意回到方丈，孔宣正在洪荒上求找他的機緣，三霄帶著六耳獼猴在三仙島上，此處只留大鵬跟我修煉，你既已證道，天定的道場在火雲洞，你就回去吧！」
「是，老師！」伏羲躬身施禮罷，便起身走出問道殿駕雲飛往火雲洞不提。且說大鵬鳥飛出蓬萊島接住玄冥，引入問道殿內。玄冥拜見吳傳道後，坐于蒲團之上，將來意詳說與吳傳道，只求吳傳道能夠指點巫族該如何行事。
「此乃是天數，無妨，無妨！」吳傳道聞言大笑，「人族興盛乃是大勢，只是此番第三任人皇引起兩教相爭，天道運轉卻是你們巫族此時要出世爭一番機緣！」
「卻不知是何機緣？！」玄冥聞言大喜。
「只是這機緣不是那麼好得的！」吳傳道說道，「此番乃是順應天數，合該第十三個祖巫轉世，與第三任人皇相爭。若成，則你巫族能夠興盛一時，只是日後逃不了滅亡之劫；若敗，則你巫族日後興盛數年，卻得人族氣運相佑，保得巫族不落滅族之難。只是你們切莫插手，不然天數大亂，巫族之劫！」
「如此，我們不讓第十三祖巫出世不就行了？！」玄冥說道。
「不可，此乃是天數如此，莫要違背天意！」吳傳道說道，「那番征戰，你巫族大巫除卻風伯與雨伯，其他切莫參與其中，否則因果無窮！」
「如此多謝前輩指點！」玄冥謝禮道。
「你既已知曉此間原理，就回去吧！」吳傳道說道。
「晚輩告退！」玄冥聞言躬身道別，走出問道殿駕雲回到洞府不提。吳傳道看著底下的大鵬鳥眉頭微微一皺，伸出右手一點，便見一道光芒困住大鵬。
「老師？！」大鵬鳥頓時大驚。
「你且好生修煉，早日月兌離此厄！」吳傳道不理會底下掙扎的大鵬鳥，閉目養神去了。
卻說洪荒上人族雖然免收饑餓之災，奈何人族群集，多發病疾，此災難無時無刻不在威脅著人族的生存。神農氏得知族人們不斷的被病痛侵擾，甚為困惱。忽覺天數明晰，想來必是自己證道之機緣已至，于是神農決定親自前去尋找使人月兌離此災之法，救命之方。
神農將部落之事安排好之後便出門向大山深處行去，忽見天空閃來一道青光，落于神農面前，卻是一根藤鞭，神農面向八景宮之處拜了三拜，口稱︰「多謝老師！」遂起身繼續向深山走去，一路之上但凡見到以前未曾見過的草木便用神鞭鞭打一下，看其有毒無毒，並將他們記錄下來，等到晚上的時候便將那些毒草服下，檢驗其毒性的強烈，慢慢的神農發現各種毒藥都有都有五行屬性，有些厲害的毒藥更是混含了數種五行之力，所以才毒性劇烈，神農察其寒、溫、平、熱之性，辨其君、臣、佐、使之義，慢慢的便可以用之解毒，還可以治病。
忽有一日，神農在石縫中找到一支開小黃花的藤狀植物，其邊散發寒氣，少見生物，神農大奇之，遂用青鞭鞭打一下發現其中蘊含劇毒，想了片刻之後神農便把花和睫吃到肚子里以後，沒有多久就感到肚子鑽心地痛，好像腸子斷裂了一樣。神農大驚，立即查看周邊是否有與之相克之草藥，良久未得，此植物毒性甚重，周邊難有克之之物。神農嘆息一聲，只道是天數如此，想及人族之災尚未解決，自己卻要身死如此，甚為嘆息。忽見東方飛來一只青鳥餃一枚閃閃發光的藥丸，落于神農口內，順水而化入月復，將那草的毒性消散。片刻過後神農方才清醒過來，只覺神清氣爽，低頭看了一下自己的月復部，卻見透明如清，此番卻是神農研百草治病奪生死造化，該有一劫難。卻是機緣深厚，得老子此以丹藥，煉得萬毒不侵之身，以便更好的嘗之百草，以救萬民。神農看著手中的那棵黃花草，心想這種草吃下去肚子鑽心地痛，如同腸子斷裂了一樣，且記之曰斷腸草。
渡過斷腸之劫後，神農繼續嘗百草，將洪荒常見之物，不常見之物一一寫進書中。神農在人族治病多年，研究無數尸體寫下人體經脈穴道全圖，在研究經脈穴位之時而且還把人體研究個透徹，也一並寫在書上留于後人學習。神農寫完藥經後，開始研究藥理為人族治病，由此神農一邊為人族看病，一邊研究治病之法寫在藥經之上。
神農在位研究醫理花去百多年,終是寫成一書，名為《神農百草經》，藥經出世的那一天，本來平靜的洪荒世界突顯異象。洪荒世界所有花草樹木，突然間充滿了生機而蓬勃向上，洪荒天地間的靈氣突然變得非常的濃郁。普通人族沐浴在這濃郁的靈氣中，有傷病迅速恢復過來，沒傷病的身體精力也都變得非常旺盛，而修道之人這是瘋狂的吸收這濃郁的靈氣用以增加修為，而仙人們則是感悟著天道突然的變化，許多大神通者，皆是心有所感，一起看向了陳都方向。
這時神農雙手捧著兩本書，舉過頭頂看著上天說道︰「洪荒人族听令！吾乃共主神農氏！今著《神農本草經》，乃是吾十幾年流歷洪荒各地，嘗遍百草之心得，可為人族治療傷病，今借上蒼之力傳播于世，爾等當牢記，永傳後世！」一時間天降功德金光籠罩神農，本草經內所著之草生植物接在金光中展現出來，接著金光散去，神農手上卻只剩一本書，下半部卻被天道收了去，只因神農所著本草經下半部有奪生死造化之能，不該現于世上，是故天道收去。神農見此只得長嘆一聲，將這藥經上半部傳授給人族，讓人們知道萬物的藥性與作用。人族之內的一些人在神農那里學到不少醫理，便開始學神農在人族四方走動，為人治病。至此人族疾病之災便得解月兌，神農氏因此修為直入準聖初期。證道之機不久便要來臨，卻是需要尋找下一任共主了•••