胡飛當上了保安公會軍政部副部長，取得了軍事實權。這是胡飛進入政壇的一個轉折點，也讓胡飛不得不面對更多的政治問題。
自從成立保安公會後，首先擺在趙爾巽面前的是藍天蔚的兵權，這個藍天蔚成了一個心月復大患。胡飛也經過一番了解，知道此時的革命黨人正是在藍天蔚的領導下，企圖迫使東北三省獨立。胡飛調查了藍天蔚的過程中了解到︰
藍天蔚，字秀豪，1878年生于湖北黃陂。1902年入日本陸軍士官學校。1904年加入中國同盟會。1906年任同盟會遼東支部負責人。1910年任東北第二混成協協統（旅長），是個堅定的革命黨人。此次會議本來是藍天蔚等發起，目的是推舉藍天蔚為關外都督。但不承想功敗垂成。
在保安公會結束的當天，藍天蔚回到自己軍營，氣得大罵趙爾巽和胡飛兩個人狼狽為奸。並召集手下的第二混成旅營管帶（營長）以上官員，召開特別軍事會議，準備對東三省總督趙爾巽進行兵諫，以當時第二混成旅的實力要想兵諫確實很難，這個第二混成旅一共才二千多人的新兵，不僅如此，清朝政府本身就對他們不放心，所以，根本就沒怎麼給第二混成旅配備槍支，平時這些官兵手里的武器都是一些大刀和長矛，有些官兵手里有些槍支，但彈藥都控制在胡飛的手中。
胡飛剛進奉天時，就給趙爾巽出了一個主意，就是把第二混成旅的彈藥槍支嚴格的控制起來。趙爾巽立即給軍需處下達了手令，以後第二混成旅的後勤物資沒有趙爾巽的手令不得供應。這一下子就把第二混成旅完全的給控制了起來，藍天蔚手下的一些將領，都不是傻子，干革命有利可圖，大家都擁戴你。但干革命沒有一點好處，還要做這種無謂的犧牲，有很多將領就出現了倒戈；悄悄地跑到胡飛那里密報藍天蔚的計劃。
藍天蔚把手下招到一些也沒有研究出什麼好辦法，最後不得不，不了了之。但正是藍天蔚的所謂的計劃，逼著趙爾巽對他痛下殺手。趙爾巽得到胡飛的密報後，也相當的緊張。在成立成立保安公會的第二天，即1911年11月13日，向袁大帥發了一封密電︰「此軍即令聶汝清暫兼協統，並留奉防，可保目前治安。」
這實際上是在請示袁大帥，第二混成協的協統由原任該協標統（團長）的聶汝清擔任了。這個聶汝清是個頑固守舊的軍人，堅決反對革命，是趙爾巽最放心的忠于趙爾巽的奴才。趙爾巽把第二協的兵權交給了聶汝清。
袁大帥看到趙爾巽的密電後，立即紛紛趙爾巽做好周密安排，恐生其他事端。趙爾巽得到袁大帥的準許後，馬上把胡飛招進總督府；兩個人一番商議後，最後，決定讓胡飛在第二混成旅外安排人手，一旦有變，絕不留情。
緊接著第二天，即1911年11月14日，趙爾巽派胡飛親自去把藍天蔚召到奉天總督府，當藍天蔚到總督府，趙爾巽就以考察的名義，把藍天蔚派到了關內。趙爾巽給藍天蔚下了一個札令︰「查有第二混成協藍統領天蔚，志趣遠大，識見明敏，堪以派赴東南各省考察此次戰事之實情、公眾之意見，並傳布奉省保安會宗旨，以謀國民之幸福。為此，札委札到該協統，即便遵照，克日前往妥辦，隨時報告。」
當藍天蔚看到胡飛遞過來的總督手令後，氣得只發抖。舉起手令就準備向外仍出去，胡飛和藍天蔚也就一步之遙，胡飛一直觀察著藍天蔚的變化，發現藍天蔚的變化後，胡飛抬起一腳就把藍天蔚踢翻在地，舉起槍就對準了藍天蔚，口中罵道︰「媽的！你別不知道好歹，信不信老子斃了你！」
在外面站著的藍天蔚的護衛一看到，藍天蔚受到胡飛的威脅，想上前制止，這一邊的張是非等人，一擁而上，把那幾個藍天蔚的護衛身上的槍支就給下了。張是非等人就準備上前把藍天蔚的槍支也給下了，這時，趙爾巽看差不多了，趙爾巽也不想得罪革命黨人太狠，以後的事情趙爾巽也說不清，所以趙爾巽這時上前充當和事老，制止了張是非等人的粗暴行為。
這時，藍天蔚也知道好漢不吃眼前虧，趕緊站起來，表態立即按照總督大人的指示辦事。這時，胡飛給張是非使了一個眼色，藍天蔚從總督府出去後，就被張是非等人押著，不得不離開奉天地界；可憐的藍天蔚最後連回家準備的機會都沒有，就被人活生生的趕出了奉天。
藍天蔚一走，胡飛立即拿著趙爾巽的手令，宣布第二混成旅現在由聶汝清代為管理，為了防止聶汝清無法控制局面，胡飛建議由孫列臣任付協統，也就是付旅長輔助聶汝清管理第二混成旅。孫列臣在胡飛的陪同下，對第二混成旅進行了全面整頓；提出不問政事，強身強體富兵政策。一段時間之後，整個第二混成旅一點點打上了胡飛的印記。
就這樣，趙爾巽不費吹灰之力，輕而易舉地就把藍天蔚擠走了。但在外界看來，好像是給藍天蔚委以重任似的。但在革命黨人看來，把擬任關外都督的人選攆到了關內，使關外的革命沒有了領袖，趙爾巽的這一著是夠狠毒的了。讓整個革命黨出現了混亂，也出現了一些火拼現象。
就在革命黨出現混亂的時候，一個叫張榕的革命人及時的站了出來，秘密的組織了一個革命激進會，推舉張榕為會長，柳大年等為副會長，密謀武裝起義。他們派人到遼陽、海城、海龍、興京各地，運動軍警，組織民軍，參加民軍的有一萬多人，連當地的官吏也不敢干涉，形成了一股聲勢浩大的革命勢頭。胡飛接到消息這伙革命黨人正準備在奉天率先發起兵諫……