當神農看向尹國時，由于尹國已經找到了自己的道，整個人的氣質完全改變了……以前神農感覺中的尹國是莫測高深，如同巨人一樣高高在上，而現在的尹國給神農的感覺完全不同了，尹國整個人變得飄渺玄妙起來，覺得變得平凡了，但是仔細一看依舊看不透。神農暗自震驚知道尹國肯定悟到了什麼，不然不會有如此大的改變。
尹國找到自己的道完全是靠神農的幫助才找到的，因此對神農很是感激，見到神農震驚的看著自己，好奇的問道︰「共主？你怎麼了？」神農回過神來，看著尹國說道︰「聖師，我今天證道之後，對于世間的一切都有了新的認識，以前見到聖師時，只是感覺聖師神秘莫測，而我傳播《神農本草經》後，再看聖師，聖師給我的感覺完全變了，變得朦朧起來，不過有一點沒變，依舊讓人看不透。聖師是不是剛才悟到了什麼？」
尹國一愣，感慨起來︰「人皇道果果然不同反響，要是以前，共主你根本就不可能察覺到這些，但是如今一證道，就能準確分析出我的不同了。」感慨一陣後，才向神農解釋道︰「共主，我們修道之人和人皇道果不同，人皇道果那是上天注定，即使不修煉，只要悟到了，就能一躍沖天，修為和道行都達到極高的程度！而我們修道之人則是一步一步修煉下去，要遇到一個又一個的瓶頸，我在伏羲證道之後就再也沒有什麼進步了，直到你剛才證道，我才突破瓶頸找到了自己的道！所以才會有此變化！」
神農恍然大悟，听到尹國找到了自己的道頓時大喜，向尹國祝賀︰「恭喜聖師！恭喜聖師！」尹國連忙還禮︰「多虧了共主，我才能找到自己的道，我要感謝你才是。」兩人互相恭賀一番後，相視大笑。
這時，天地異象已經完全消失，洪荒世界恢復原樣。祭台周圍叩拜的人被尹國和神農的大笑驚醒。看著祭台上的兩人，所有人歡呼了起來，高喊神農之名。尹國和神農看著下方涌動的人群，尹國朝神農笑了下，然後瞬間消失不見，對于尹國突然消失，下方的人群只驚訝了一下，然後接著歡呼，因為今天的主角是神農不是尹國。神農無奈，他可沒辦法像尹國來說消失就消失，苦笑了一下，然後緩緩走下祭台，迎向歡呼的人群。
神農證道後幾天，再次找尹國請教，不是教化人族之事，而是和當年伏羲創八卦證道後一樣，神農不知道怎麼找到合適的繼承人，也就是找到第三人皇。神農想到伏羲說過，當年伏羲也是根據尹國的指示找到他的，所以他也找到尹國，希望尹國能指點他怎麼找到第三人皇。
尹國听完神農的來意之後，眼神突然一亮，然後陷入沉思。尹國從神農證道中領悟因果斬尸之法後，一直思考著如何去消除背負在身上的巫妖大因果，如今人族入住洪荒，巫妖兩族全都隱匿起來了，想要消除巫妖兩族的大因果，就要去洪荒大地上去尋找巫妖兩族的蹤跡，而現在尹國不可能離開人族，他現在最主要的任務是幫助人皇教化人族，從而消除人族和他之間的因果。
既然不能離開人族，尹國本來打算等自己和人族因果了解後再去尋找巫妖兩族消除因果。如今听到神農的請教，一下子想到了第三人皇時期發生的一件大事，這件大事和巫族有著緊密的關系。
尹國腦中馬上算計的這件大事，終于想到了既幫助人皇又幫助巫族的辦法，尹國頓時充滿了信心，只要事情和他算計的一樣的話，他定能斬出一尸！成為準聖！
尹國想完這一切後，抬起頭看著神農說道︰「共主，為何你知道我能指點你找到第三人皇？」神農在跟尹國說明來意後，就發現尹國陷入了沉思，還以為尹國是在想第三人皇之事，見到尹國的問話，連忙說道︰「當年伏羲天皇陛下跟我說過他是在聖師你的指點下找到我的，如今我已經證道，我相信聖師你一定能指點我找到第三人皇！」
尹國當然會指點，想了想說道︰「既然如此我也指點你一字，能不能找到就看你的了。」神農連忙問道︰「何字？」尹國閉上眼楮說道︰「熊！」說完後，就再無動靜。神農這麼多年來請教過尹國很多問題，知道尹國的性格，都是只指點一下，就不再說話，于是也不見怪，起身向尹國躬身行禮後就離去了。
神農回到住處連忙命人到人族中打听與熊有關的人或物，這樣的人和物太多了，但是過了很久神農依舊沒有找到令他滿意的對象。直到有一天，有人來報︰在陳都西方千里之處有一個部落，名叫有熊氏！其部落領袖，名叫公孫軒轅，從小聰慧，而且拜師闡教首徒廣成仙師為師，長大後憑借著自己的武勇和智慧帶領著有熊部落，不斷發張壯大，如今已是那片地域部落聯盟中數一數二的大部落，公孫軒轅在部落聯盟中擁有著極高的威望。
神農听說後，心中一動，以前流歷洪荒時，神農也遇到過許多仙人的幫助，從這些仙人口中知道闡教乃是玉清聖人元始天尊所創，而闡教十二金仙更是名揚洪荒，廣成子就是十二金仙之首。廣成仙師既然收公孫軒轅為徒，其人必有不凡之處，而且部落名字中有個熊字，神農隱約覺得這個公孫軒轅可能就是第三人皇。
于是神農派人仔細打听公孫軒轅的事跡，沒過多久就有了詳細消息︰公孫軒轅出生就不平凡，其母附寶曾見一道電光環繞著北斗樞星，後那顆樞星就掉落了下來，附寶有感而身孕，懷胎一年生下公孫軒轅，出生那天廣成子恰好路過，听說了附寶奇異懷孕之事，親自看了看公孫軒轅，然後說此子日後必當不同凡響，遂收了公孫軒轅為徒。
公孫軒轅出生十多天便能開口說話，少年時便顯現聰明的一面，並且跟著廣成子學習仙法，修煉速度極快。十幾歲時就在部落樹立極高的威望，並成為了部落的領袖，然後短短數年時間，就帶著有熊部落發展成為了部落聯盟中數一數二的大部落。
神農听完後越發覺得公孫軒轅就是第三人皇，決定親自去見見這個公孫軒轅。神農著《神農本草經》證道在洪荒世界鬧得沸沸揚揚，當他出現在有熊部落時，整個部落頓時熱鬧起來，公孫軒轅連忙帶著部落人民拜見神農。
神農一見到公孫軒轅，便上下打量他，濃眉大眼，一臉浩然正氣，年齡不大就已經顯得相當穩重成熟，公孫軒轅給神農的第一印象非常不錯，特別是公孫軒轅全身透露出的那股皇者風範，神農看了暗自點頭稱贊不已。
除了公孫軒轅外還有一人引起了神農的高度關注，乃是一位道骨仙風的老道士，神農證道後，其眼力大增，立刻感覺到這位老道士的不凡，很快就想到此人是誰，必是公孫軒轅的師傅，闡教十二金仙之首的廣成子。
神農向廣成子躬身行了一禮，神農現在的身份何等尊貴，業已證道，隨時都能成就人皇道果，廣成子哪敢受此大禮，連忙躬身回禮。神農也略微知道其中道理，沒有再理會廣成子，今天來的主要目的是公孫軒轅。
上前親自扶起公孫軒轅，說道︰「听聞軒轅首領乃是人族賢能之人，今日是專門前來和軒轅首領探討問題的。」公孫軒轅听完後，想到伏羲當年拜訪神農的事跡以及老師廣成子說過自己可能是第三人皇的話，心中頓時明白過來，神農這次來估計是來考驗自己的。
果然隨後幾天神農跟軒轅談論了許多如何教化人族的問題，軒轅毫無保留說出了自己的想法，神農從中看到了軒轅的才智，對軒轅很滿意，廣成子也暗中向神農講訴了軒轅從小的不凡之處，神農越發肯定了公孫軒轅為第三人皇的想法。神農與公孫軒轅商討幾天後，神農便邀請公孫軒轅和他返回陳都，幫助神農一起教化人族。公孫軒轅從小有著極大的抱負，對神農的邀請欣然接受，帶著家人跟著神農回到了陳都。
回到陳都後，神農便學著伏羲那樣，慢慢放權給軒轅，可是軒轅的聰慧大大超出了神農的預測，只是短短一年的時間，軒轅便完全掌握了人族共主應做之事，並且在人族高層樹立絕對的威信，軒轅之名也慢慢在人族之中流傳。
神農非常滿意，命人安排禪位事宜，並像伏羲那樣帶著軒轅來到尹國的茅屋，希望尹國能在以後多指點軒轅。軒轅對于尹國這位人族聖師非常好奇的，不管是從人族的傳聞還是老師廣成子那里都知道尹國是位洪荒高人。特別是廣成子曾告訴他，人族聖師尹國即使廣成子老師玉清聖人元始天尊都無法算出其來歷，而且是鴻鈞道祖說的幫助人皇教化人族的天命之人，六位聖人都對他另眼相看，並吩咐門下弟子不要輕易招惹人族聖師。
當軒轅見到尹國後，頓時覺得聞名不如一見，尹國的容貌在是太年輕了，根本不像是個洪荒高人，不過這不是主要的，主要的是尹國不經意間流露出來的氣質，是那麼的飄渺，那麼的玄奧，整個人給人一種朦朧神秘的感覺，即使見慣了廣成子的軒轅，在面對尹國是依舊看之不透。
听完神農的來意後，尹國看了看軒轅笑了笑說道︰「以後有什麼事，我會親自來找你的，你就不用來找我了。」神農和軒轅一听很疑惑，神農問道︰「聖師這是何意？」尹國說道︰「軒轅跟伏羲和你不同，當年伏羲拜太清聖人為師，我指點伏羲教化人族，太清聖人乃是聖人之尊，不會為這點小事遷怒于我，而且太清聖人也沒有這麼多時間幫助伏羲，我指點伏羲，太清聖人還樂的清閑。神農你沒有師傅，我指點你更不會受到誰的遷怒，軒轅你不同，拜了廣成子為師，你師傅乃是洪荒名人，若是我經常指點你教化人族，你師傅會怎麼想，所以遇到什麼困難，可先問你師傅，若依舊解決不了，我這才會出面指點你。」
神農和軒轅听完頓時明白過來，軒轅向尹國拜謝道︰「多謝尹國聖師。」尹國點點頭，接著和神農軒轅商議了禪位大典之事，表示和伏羲禪位時一樣，依舊由他宣讀禪位祭文。
半個月後，禪位大典依舊在陳都中心處的禪位祭台舉行。有了上次伏羲禪位的例子，這次神農禪位之事，在準備階段就傳遍了整個人族。禪位大典那天，陳都雲集了眾多人族，連一些修道之人和仙人也趕了過來。
和伏羲禪位時一樣，參加大典的人都圍著祭台跪拜，只有神農、尹國、軒轅三人登上了祭台。這次祭台上擺放的牌位不只有鴻鈞道祖和六位聖人，最後還加了一個伏羲天皇的牌位。
依舊先是尹國宣讀禪位祭文，接著神農向祭台上的八位人族中最高的神明宣布了自己禪位于軒轅，最後軒轅同樣向祭台上的八位人族中最高的神明表示自己願意繼承人族共主之職。
隨後整個洪荒蒼穹奏起仙音，降下五彩祥雲，一輛駕馭著九條金龍的輦車，緩緩來到祭台之上。上面站著兩人，分別是伏羲天皇陛下和三教首徒玄都師。
玄都師來到神農面前，神農連忙跪下，玄都師朗聲說道︰「尊鴻鈞道祖，六位聖人之意，人族共主神農氏，歷經艱險，為解人族疾苦，親嘗百草，立本草經，教化萬民，今功德圓滿，成就人皇道果，為人族三皇之第二地皇，同伏羲天皇陛下共居于三十三天外火雲洞，永受人族萬世香火信奉。」其聲依舊傳遍整個洪荒。
說完後，玄都師扶起神農，然後退到一邊說道︰「請神農地皇陛下登輦！」神農緩步走向了金龍輦車，當登上輦車和伏羲並立時，上天降下大團七彩功德霞光，這次沒有分成兩塊，全部都沒入了神農體內。
就和伏羲當年一樣，神農接受上天賜予的功德之力後，疑惑不解的看著尹國，因為尹國依舊沒有半點功德霞光。神農張嘴想說點什麼的時候，一旁伏羲阻止了他，神農看向伏羲，伏羲雖然也很疑惑但是想到當年尹國傳音給他的話，低聲對神農說道︰「尹國聖師在我禪位的時候就說過，要我不要疑惑，以後會知道的。」
神農听完伏羲的話，再次看了看下方的尹國，見到尹國沖他微笑點頭，知道伏羲沒有騙他，于是放下了心中的疑惑。這時玄都師亦登上了金龍輦車，向伏羲和神農請示後，駕馭這金龍輦車飛向了天際。