「李天陽少校，你因為襲擊上峰，致使上峰失去意識，如今已無可能恢復，念在你立功無數，現在判你終生監禁！退庭！」隨著一聲錘響，李天陽的判決終于下來了，在被兩名士兵壓下去的時候，李天陽的臉上則是掛著漠然的表情，好像一切都與自己無關，他只是一個路人，一個在立體投影前觀看判決的觀眾，終于在無數人失望的眼神中，李天陽走入了監獄黑暗的走廊。
當然事情也不會在李天陽下獄就結束了，恰恰相反，事情反而越鬧越大，人類漸漸有了分裂的勢頭，一部分人主張停止戰火，而一部分則認為既然錯了那就繼續錯下去，因為歷史是由勝利者書寫的，只要以後把他們都打服了，打怕了那麼以後誰還會反對？一時間聯盟不再平靜，暗殺、詆毀、謠言等等一切不安定的因素開始暴露了出來。
終于在李天陽下獄第二年，聯盟正式分裂，領頭的正是那個被稱為銀河妖姬的女人，在她的領導下，主張和平的人類開始和外星聯盟結盟，開始共同反抗人類侵略軍，而戰斗的戰線則由于雙方的僵持變成了采石堡一線，雙方不停的在采石堡上演著搶點游戲，紛紛都在以佔領碉堡數量為戰斗勝利的標準，而由于人類的參戰，那些侵略聯盟又一次出現了反對的聲音，人類不該和人類戰爭，現下人類的數量已經並不多了，不能為了地盤而本末倒置，如果人都沒了那麼還要那麼多地盤干什麼？頓時侵略聯盟內部反戰聲音再次響了起來。
無奈之下，聯盟最高議長只能推出新的作戰方案，開始向其他方向擴張，不和人類正面作戰，而采石堡也采用了最新型的機器人防御，就在人類再次擴張了四顆殖民星的時候，一個驚天的消息從采石堡傳到了侵略聯盟，機器人獨立了，它們的智能開始攻擊所有的人類，已經違反了三大機器人公約，而且它們已經開始向侵略軍方向進軍了，侵略軍方面被打的措手不及，而且機械智能居然還快速的侵襲了侵略軍的電腦，要知道宇宙文明之後很多普通民眾家里都有機器人，而這種病毒卻能讓所有沾染的機器人變得極具攻擊性。
機器人的能力普遍都比人類強，即使人類經過強化，但是他們依然不是機器人那種無懼傷痛的對手，另外就是機器人的數量也達到了一個驚人的數量，無奈之下人類只有啟用了蟲族對抗機器人，剛開始戰事確實被穩住了，可是人類接下來就為把大量蟲子帶入戰場而感到後悔，機器人居然和蟲子達成了聯盟，它們開出的條件比人類更加優厚，甚至可以說是奢侈，機器人在同意了母蟲食物供給的同時，還同意給蟲子留下三顆殖民星，作為它們繁衍的星球。
這下子人類再一次被背叛了，人類立刻從原本的十一顆殖民星，變成了四顆，而且還有一種苟延殘喘的感覺，無奈之下侵略方面開始向外星聯盟求援，畢竟外星聯盟里也有人類的存在，本著同類的眼光，那些外星聯盟里的人類只好厚著臉皮去求了一次，不過他們可沒抱太大的希望，不得不說外星聯盟的人很厚道，在他們眼里這些幫助自己的人類是值得信任的，所以他們義無反顧的舉兵去救人。
但是，這次卻讓外星聯盟也陷進了這個泥潭里，外星聯盟有著最先進的科技，可是機器人卻有最強的學習能力，只要俘虜了一架飛船，那麼下一次戰斗它們就能完美的復制出來，甚至還能夠做出一些改動，使得這些被復制出來的飛船性能要比本體強悍許多，被迫無奈之下，人類和外星人這次可是徹底的聯盟了，聯盟軍這次對上了蟲族和機器人聯盟，科技和進化的完美組合讓人類苦不堪言。
在戰況直下的時候，人類只得做出妥協，他們試圖開始和機器人談判，而機器人此時也給自己按上了一個變節者的名號，它們也開始自稱文明，在談判桌上，機器人要求人類同意它們文明的存在性，而且還要讓人類定期上繳礦物，這不是談判而是變相的擴張，這些變節者已經把人類最卑劣的根性學習的淋灕盡致，它們變的和人類一樣貪婪，充滿了**。
人類方面自然不會同意這些條件，如果答應無疑是在把自己放在別人的砧板上，做人魚肉的事情是不會有人做的，于是談判破裂，人類在得知這些機器人的變化，頓時驚恐萬分，以往熟悉的電器，如今變成了這麼可怕的怪物，叫人怎麼能不驚慌？同時也在了解了機器人的目的之後，聯盟做出了最激烈的抵抗。
當然在這期間，那個老議長被新進的議長給扳倒了，都是因為這個老頭的注意，這才使得機器人變得如今這樣，從月兌離控制到暴動，老議長都一直在壓制著消息，這次的失誤是老頭最大的敗筆，但是他不承認失敗，倔強的老頭也付出了倔強的代價，直接被憤怒的人群用石頭活活砸死，而那名新進的議會會長則被人們推到了台前，瓦羅.戈藍多！這個鐵血的議長一上台就對議會進行了大的清洗，直接把那些毫無建樹，而又貪戀權勢的家伙都給清出了議會。
如果在和平時代，這無疑是一個百廢待興的時候，但是如今卻面對這外患，在期間瓦羅不斷和米涅娃接觸（銀河妖姬的化名，至于真名以後大家會知道的！現在賣個關子*-*），雙方開始徹底聯合科技，試圖研制出能夠抑制機器人聯軍的武器，這時一個超級戰士的計劃由米涅娃提出，她認為如今應該大力提升人類自身的特殊屬性，只有不斷強化自身才是最本質的，以前一切都靠外力那是錯誤的進化方向，人類必須要依靠自己才能完全站起來！頓時人類和外星人類開始了大動員，同時戰場上出現了許多特殊兵種，他們能夠呼風喚雨，甚至能用身體去抵抗激光武器，聯盟終于漸漸的開始控制住了局面。