「現在已經是非避難不可的時間了啊！我偷偷看過我爸爸的資料了。」幾個少年站在天台上說著。
突然，正對著他們的臉的山脈移動了起來。
「應該是這個時間沒錯的……」相田劍介一邊看著手表一邊說道。
「可是怎麼不快點出來啊？」藤次鈴原問道「……」
突然，教學樓斜對面的山脈動了起來。
「山在動……」藤次鈴原說道。
「是evangelion啊！」相田劍介激動地說道。
深紫色的機器人和黃色的機器人漸漸從山脈里傳送出來了。
「好帥哦！」少年們說道「加油啊！evangelion！」
夕陽正在慢慢的墜下。
二子山
「敵方鑽頭突破第17裝甲板，距到達本部時間3小時55分。」
「陽電子炮系統調試完畢，可以射擊了！」
「四國和九州的通電作業完成。」
「各冷卻系統請開始進行調試。」
現在的二子山，仿佛成為了一個巨大的建築工地，事實上，這些所做的工事，全部都是為了能夠用陽電子炮一擊滅殺掉第五使徒。
「這可是精密機器，請小心一點。」赤木律子對拿著槍管的零號機說道。
初號機和零號機正在搬運著一個又一個的陽電子炮的零件，等到搬完了之後，他們下了eva，和赤木律子及葛城美里一起。
「不過，這種非野戰用的武器真的會有用嗎？」碇真嗣問道「怎麼說也沒有經過實戰用測試吧……」
「沒辦法，這是臨時趕出來的嘛。」赤木律子說道。
「沒問題麼？」碇真嗣有點心虛，畢竟是沒有經歷過實戰用測試的武器，要是使用的時候臨時炸膛了怎麼辦？如果根本射不出去怎麼辦？
「理論上沒問題。」赤木律子回答道「但是槍身及加速器能否撐得住這個問題，不打打看是不知道的。再怎麼說，以這麼大的功率試射，是以前從未嘗試過的。」
「……也就是說，有可能會爆炸吧。」碇真嗣說道「巨大的電流如果撐不住的話，會產生巨大的爆炸吧。」
「正是如此。」赤木律子說道「不過安心吧，你們還有eva可以抵抗電流，不會死的。」
「……」碇真嗣沉默了，他知道，如果真的炸膛了的話，有生命危險的並不是他，而是現在在二子山上的這些人。
「現在發布本次作戰各擔當任務。」葛城美里背對著碇真嗣，看著身下的「建築工地」說道︰「真嗣。」
「是……」碇真嗣回應道。
「由你來駕駛初號機射擊。」葛城美里說道「麗以零號機來防御。」
「是。」綾波麗回答。
「這是因為真嗣君與初號機的同步率較高的緣故。」赤木律子說道。「本次作戰，需要最高精度的操作。由于陽電子受到地球的自傳磁場，重力的影響……是不會呈一條直線前進的，不要忘了修正這些誤差。一定要正確的貫穿核心一點。」
「怎麼可能……我連練習都沒做過啊……況且，誤差數據也沒有得到吧。」碇真嗣說道。
「大丈夫，你只要按照電腦指示的去做就行了。等目標進入中心時按下按鈕就行了。」赤木律子的舌頭舌忝了舌忝嘴唇「其他的事情電腦會幫你做的，還有，在發射過一次之後，因為要再冷卻，再填裝陽電子，到能夠再次發射需要花些時間。」
「那如果沒打中，而敵人反擊過來呢？」碇真嗣問道。
「現在不要想多余的事情，只要想著如何擊破就好了。」赤木律子眼楮偏向了另外一邊。
「……真是大危機啊……」碇真嗣說道。
「我……我只需要保護初號機就行了吧。」綾波麗說道。
「沒錯。」赤木律子回答。
「了解了。」
「時間快到了，去換上駕駛服吧。」葛城美里用這一句話結束了會議。
「是……」綾波麗和碇真嗣同時回答。
僅僅隔著一層白布，碇真嗣和綾波麗無言的換著衣服。
碇真嗣比較快，畢竟是男孩子，就算他將自己的衣服整整齊齊的疊起來，他花的時間還沒有綾波麗多。
按下按鈕，駕駛服排出氣流，收縮起來。
「或許這次會死吧。」碇真嗣說道。
「為什麼要這麼說？」綾波麗問道。
沉默。
短暫的沉默過後，綾波麗斷言道「你是不會死的。」
碇真嗣仿佛是察覺到了什麼，隔著白布緊緊地盯著綾波麗。
「因為我會保護你。」
作戰開始
「綾波你為什麼要加上eva？」碇真嗣問道。
「因為牽絆。」綾波麗回答。
「牽絆？」碇真嗣有幾分不解。
「對，牽絆。」綾波麗說道「因為我要保護這個世界。」
「因為我的父親？」碇真嗣說道。
「不，是因為大家。」
「真堅強啊。」
「因為我除了牽絆之外一無所有。」
「一無所有？」
沒有回答碇真嗣這個問句，綾波麗站了起來。
「時間到了，該出發了。」
「イプよスヘ。」
碇真嗣呆住了，月光映照在綾波麗白色的駕駛服上，白的刺眼，綾波麗就仿佛身上帶著輝光的女神一樣那麼的耀眼。
「現在進入0點0分0秒。」
「作戰開始！」
「真嗣君，全日本的能源就交給你了。」葛城美里說道「發射出去吧！帶著我們的願望和執念……」
「是……」仿佛也知道了現在的身上的擔子有多麼重似地，碇真嗣斬釘截鐵的回答，
「第一次接續開始！」葛城美里下令到。
「第1到803管區開始充電！」
「電壓上升中，正在往過壓區域通過。」
「全冷卻系統出力開至最大！」
「溫度安定！沒有問題。」
「陽電子注入，狀況安定。」
「第二次接續。」
「所有加速器開始運轉。」
「強制聚集器，啟動！」
「所有電力送往二子山臨時變電所。」
「第三次接續，沒有問題。」
「最初安全裝置解除！」葛城美里知道，這是暴風雨之前的寧靜。
「腳架升起！」
「這樣就好！真嗣君！將全日本的能量，將全日本人民的執念一起發射出去吧！」葛城美里大聲吼道。
初號機內
「地球自轉及重力誤差修正+0.0009，電壓距離臨界點還有0.2。」
「第七次最後接續！」
「全能源輸入致陽電子炮！」
「目標產生高能源反應！」
「什麼?!」
「リヨ⑦ヴэレ⑦初號機！行わネエ！！！」
陽電子炮平安的射出了第一發子彈，碇真嗣應該慶幸沒有炸膛，不過，第五使徒也同時射出了光束攻擊。
兩道光束似乎就要正面對上了，有可能是因為光束之間的物理反應吧，兩道光束產生了怪異的軌道，但是依然向著之前規定的目標前進著。
「失誤了？！」兩束光芒都沒有擊中想要擊中的敵人，但是第五使徒的鑽頭已經進入了地下都市。
「敵人鑽頭侵入地下都市！」
「第二發！快一點！」
就算碇真嗣不斷地想要初號機更快的填裝上子彈，但是，固定需要的時間依然沒辦法修改。
「引線交換，再填充開始！」
「冷卻槍身開始！」
「目標再次產生高能量反應！」
「糟糕了！」
巨大的光束再一次襲來，碇真嗣操縱的初號機僵住了。
零號機拿著盾牌，擋住了這次襲擊。
碇真嗣被震撼了，那個瞬間，不管是恐懼也好，憤怒也好，全部都迸裂出來，成為了碇真嗣的力量。
漸漸地，盾牌被消融了。
「綾波！」
「盾牌正在被消融中！」
「還沒有好嗎？！」
「還需要十秒鐘！」
綾波的盾牌接近崩潰的邊緣。
「待サゆゲ！！！！」
「什麼？！」
「……？！」
使徒停止了攻擊，碇真嗣也被震撼住了。
「不知道戰斗的空虛的愚蠢之使徒啊。戰斗只是用來救助自己所愛之人的。這種擁有為了勝利而舍棄自身勇氣的人……人們稱之為英雄。」
「勝利者下一刻就失敗，失敗者下一刻就勝利，而統御這一切的男人……人們稱之為英雄王！」
黃金色的身影出現了。
就仿佛是天上的太陽一般的耀眼，碇真嗣覺得似乎現在漆黑的日本仿佛被光芒照耀著一般。
「……？！」
使徒發出強大的聲波。
「你不配知道我的名字！」
「他在和使徒對話！」赤木律子立刻反應了過來。「別管他，碇真嗣，快射擊！」
「不行啊……他還在那里呢！」碇真嗣這麼說道。
使徒的光束攻擊再一次襲來，這一次仿佛是被弄得惱羞成怒了，光束的威力和上一次想必簡直就搞了數個等級。
「gate－of－babylon！」
虛空之中，仿佛出現了不可見的屏障，防御住了這一次的攻擊。
「我就是吉爾伽美什！最古的英雄王，听見我名字的少年啊！不要再遲疑了！」吉爾伽美什大聲吼道「我曾經被你們稱之為榮格?g?弗洛伊德，而現在，我拋棄這虛假的名字，向你伸出援手！」
「攻擊吧！而我也將響應你的攻擊的！」吉爾伽美什拿出了乖離劍。
陽電子炮再度開炮，而吉爾伽美什的ea也發了出來。
ea先擊中了第五使徒的at力場，打開了一個空洞，而陽電子炮的光束正對著那空洞，因此全力直擊到了第五使徒。
「……！」
第五使徒倒下了。
結束的幕間
「女神無傷。」
「第五使徒被干死了啊……」
「明日香也快來了啊……」
「劇情漸漸要進入**了呢。」
「負數的穿越者們也將對抗吉爾伽美什了。」
「人物卡請快點制作吧，不然的話，就又只能原創敵方的穿越者了呢。」