于孝天御下極嚴，要求麾下官兵，每到一地，不得擅自擾民，除了要求有錢大戶拿錢出來助餉勞軍之外，對于普通百姓，基本上可以說是秋毫無犯，相反到了一個地方之後，往往還會拿出一些錢糧，對當地遭受災荒或者匪患而受害的百姓給予一定的賑濟，對當地一些為禍民間的地痞流氓進行嚴厲打擊。
如此幾年下來之後，以前老百姓只要听聞官軍到來，十里八村的老百姓立即就會轟然而散，逃入山中躲藏起來，可是現如今只要听說是于孝天麾下的官軍到來，老百姓已經不跑了，非但不跑了，而且還往往會扶老攜幼的跑到路邊歡迎他們，甚至于還不惜取出他們極為有限儲存的吃的東西，哪怕是拿出一個雞蛋，也要表示表示他們的心意。
這讓福建不少地方的官吏，看到這樣的情景都為之側目，想不通于孝天身為被招安的賊首，怎麼能如此善于掌兵控軍，將麾下兵馬教的如此听話，居然能把他麾下所控的官兵，整治的如此听話。
其實這也難怪，以前一些官軍說白了就是一些軍將的農奴，這些當兵的閑時務農，要給軍將種地交糧，常年拿不到一點軍餉養家糊口，難免會對軍將們心懷怨氣，往往一旦到了用兵的時候，軍將要用這些當兵的為他出力或者賣命，可是又擔心當兵的心懷不滿不給他們賣力，于是便寬縱這些手下官兵，去搶，去偷，去勒逼百姓，變相的讓當兵的撈一點甜頭。
而且對于這些偷來搶來勒逼來的錢財，他們自己可以拿大頭中飽私囊，也可以多少提振一下士氣，讓這些當兵的不至于上陣對敵的時候，因為心中怨氣，哄堂大散甚至臨陣倒戈，如此一來大明官軍如果軍紀好的話，那就真見鬼了。
但是于孝天控兵，卻沒有他們的弊病，但凡歸在于孝天手下的官軍，于孝天往往第一時間便先將那些老軍將們全部架空，然後對官兵進行篩選，留下老實以及身體強健的士兵，將那些兵油子以及老弱殘兵裁撤，招募新丁補充兵員。
對于這些兵將，于孝天令他們全部月兌產，專司練兵，從農奴一般的身份轉職為職業軍人，雖然官府時不時的欠餉，可是于孝天卻從來不拖欠這些當兵的糧餉，每個月定時足額發放給他們，使之可以有錢養家，不至于因為沒錢養活家人，迫不得已之下當兵的同時還要想方設法的搞點副業。
而且于孝天自掏腰包，但凡戰時手下官兵出現傷亡，傷者給予救治，殘疾者給予妥善安置，戰亡者便給予其家人高額撫恤。
這麼一來，官兵也是人，當然知道誰對他們好，自然對于孝天歸心，願意令行禁止，跟著于孝天好好干，因為每個月可以拿到足額的餉錢，立功還能受賞，在保障了他們衣食無憂之後，違紀則會給予嚴懲，如此一來，誰還願意輕易犯戒！
經過于孝天這麼一番整治之後，想要他手下軍紀敗壞都難，這些當兵的把他當成天一般看待，對其可謂是忠心耿耿，誰都知道他們現在能過上這樣的好日子，乃是于孝天所賜，要不然的話他們照樣還跟以前一樣，過著天天被軍將欺壓暗無天日的日子。
所以但凡一支軍隊，只要劃歸于孝天掌控之後，很快便會被于孝天整治的面貌煥然一新，變得軍紀嚴明。
一支軍隊只要軍紀嚴明，將士敢于用命，就算是不怎麼充足的訓練，他們照樣還能爆發出相當強悍的戰斗力，更何況他們轉職為職業軍人之後，每天可以吃的飽飽的，然後天天要進行充分的訓練，就算是大部分官軍並未像于孝天嫡系那樣換裝全新的武器，依舊使用以前的舊兵器，但是戰斗力比起以往，還是成百倍的提高。
在天啟三年初的時候，就曾經出現過這麼一件事，一支剛剛被于孝天收編的雜牌軍，之前因為剿匪不利，被一伙山賊打的大潰，可是當他們剛被于孝天收編，不到三個月的時間，同樣還是這支兵馬，只是換上了于孝天的嫡系手下軍官率領，兵力甚至還不足以往三分之一，在一個地方遇上了同樣一伙悍匪。
這伙悍匪得知對面那支官兵，乃是之前被他們打的落花流水的那支官兵，頓時高興的屁顛屁顛的，呼啦啦便沖了上去將這支官軍包圍了起來，本以為肯定還像上一次那樣，能把他們一舉擊潰，打的他們再一次落花流水。
但是這貨悍匪萬沒有想到，同樣還是那支軍隊，而且這次兵力這麼少的情況下，一個個卻像是吃了chun藥一般，居然各個死戰不退，在軍官的率領下，高呼酣戰，大股悍匪久攻不下，反倒是被他們最終打的大敗而逃，還被他們如同跗骨之蛆一般的狂追了三天，直至全部將這伙悍匪全部剿滅。
這伙悍匪的頭子至死都想不通，到底發生了什麼事情，居然能把這伙官軍，短短數月之間，變的如此能打。
也只有海狼的人，才知道這是為什麼，同樣一個人，當得到了應得到的待遇之後，心中沒有了不平，前途沒有了擔憂，戰場上自然而然也就少了很多顧慮，當然願意用命，一個敢于用命的人，和一個恨透了當官的、胸中充滿了不平的人相比，能發揮出的戰斗力，豈止是相差一層兩層。
故此于孝天掌控的官軍，這才能在福建縱橫來去，所向披靡，可是同樣那些非于孝天所轄的官兵，卻往往戰斗力虛弱，士氣低落，雖然不敢說他們逢戰必敗，可是卻很難和于孝天麾下的兵馬相比。
一些軍將對此很想不通，為啥把兵一交給于孝天，這幫爛兵馬上就能變得生龍活虎，成為一幫悍兵，可是在他們手里，卻各個都如同癩皮狗一般，一副扶不上牆的德行。
有人後來發現，但凡是一些官兵，只要交到于孝天手中，往往都能定時足額的拿到糧餉，當兵的從來不會挨餓，不會欠餉，于是便心懷怨氣，覺得上峰不公，憑啥都是官軍，于孝天的手下就不欠餉，可是卻要欠他們的餉。
這幫軍將于是紛紛找上峰囂鬧，這麼一鬧之後，才知道，其實人家于孝天那邊，並沒有像他們想的那樣，都拿到了足額的糧餉，而是于孝天自掏腰包，在給手下的人發餉，于是這幫貨頓時一個個烏龜大縮脖，都憋氣不吭了。
這幫人想想也是，就算是官府及時足額的給他們撥發糧餉，除去期間被過手的那些官吏克扣飄沒的一部分錢糧之外，到了他們手里面，大部分還要被他們自己扣下來中飽私囊，這麼下來，真正能發到當兵的手中的糧餉，早已十不存一，也難怪當兵的一到于孝天手下，就各個變得生龍活虎。
這麼一來，這幫福建的軍將，自然而然也沒屁可放了，只能揣著一肚子的不高興，只能打掉牙朝肚子里面咽，誰讓于孝天財大氣粗，肯做這樣的傻事，居然願意自掏腰包來給官兵發餉，而他們這幫人，非但不會這麼做，相反靠的卻是壓榨手下當兵的，要喝兵血才能中飽私囊，他們手下要是陣前願意跟他們賣命的話，那就真是頭讓驢踢了，既然這件事怪不得上峰不公，那麼他們自然也不敢再鬧什麼了。
倒是那些沒有能歸到于孝天手下的官兵，一個個在听聞這些事情之後，人比人氣死人，都越發不高興了，更加不願意在他們軍將手下效力，一個個都巴望著，有朝一日也能被劃歸于孝天手下干活。
如此下來，福建的官軍可以說是更加兩極分化，但凡是于孝天所轄的官兵，幾乎無不斗志昂揚，軍紀森嚴，敢于用命。
而那些非于孝天所轄的官軍，則各個滿月復牢騷，士氣衰落，逢戰必逃、遇戰必敗，甚至還出現了大面積的逃兵，許多當兵的，寧可冒著被逮回去殺頭的風險，棄了他們的兵戶的身份，暗中結伙逃往于孝天那邊，就算是不當兵，把他們弄到台灣島去種地，他們也不願意再給以前的軍將干活了。
到了天啟四年的時候，福建整個軍隊系統之中，幾乎可以說是僅剩下了于孝天所控的官軍還有一戰之力，其余的那些軍將所控的官軍，缺員情況已經達到了令人發指的程度，往往一個千總，手下最多只剩下二三百官兵就算是不錯了，雖然他們可以吃更多的空餉，可是卻已經徹底失去了作戰的能力，成為了紙面上的軍隊。
天氣越來越熱，眼瞅著進入到了崇禎四年七月間，于孝天身穿一件裁剪極為簡單的麻質對襟短衫，坐在書房之中，手搖著一個大蒲扇，扇著涼，面前擺著一碗放了冰塊的酸梅湯，一邊處理手頭上的公務，一邊忽然間開口對坐在對面的林易陽問道︰
「對了，林先生，我年初安排你做的事情現如今那邊有什麼反饋沒有？」
對了，敢問一下弟兄們，誰手里還有月票沒有？有的話別浪費了！呵呵！另外特別鳴謝cryosun兄弟的打賞！
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