晚上，毛利偵探事務所，柯南還在看偵探電影，被小蘭發現，大肆批評一番，因為已經很晚了。看完電影里槍擊的片段，柯南恍然大悟，「原來如此，千鈞的判斷對了一半。剩下的疑點，也就可以解開了。我們全都上了那個真正凶手的當了。沒想到這個案子中還有曲折。不過，要證明這點，目前的證據還不夠。」
千鈞宅，千鈞在跟靜楊、小雅、直子討論這個案子，「所以我認為凶手一開始就是沖著高田議員去的，被波及到是石本。」小雅直接否決，「不可能的。為什麼凶手不在開始照明的時候就開槍呢？」直子也道，「對啊，沒必要等走到石本社長身邊時才開槍吧。」靜楊也道，「就算是巧合，未免也太巧了，恰好石本剛好被人恐嚇。」千鈞道，「這點我也想不通。的確，在高田行動過程中，開槍的機會很多。對方是神槍手，如果是我的話，我會在高田開始行動不久後就開槍，因為會場的人比較多，高田越走到後面，開槍射殺高田的機會就越少。」三女一致認為，毛利小五郎的推斷是正確的，是高田遭了池魚之災。
第二天，山本綜合醫院，毛利還在房間呼呼大睡，電話一直在響。石本誠二忍無可忍，將毛利叫醒。毛利尷尬，「真是對不起，我怎麼會睡著了。」小五郎跑過去，接起電話。來電話的是目暮警官，「大事不好了，毛利老弟。」原來，平岡志郎死了。
千鈞大驚，「千葉警官，怎麼會這樣，他死在什麼地方？」千葉道，「在一棟廢棄的大樓里，那好像是他藏身的地方。這個，高木警官推斷他不小心沒有踩好，自己墜樓梯身亡了。」千鈞怒道，「胡說八道！平岡是有名的職業殺手，又不是三歲小孩，怎麼可能自己失足從樓梯滾下來呢？」千葉道，「說得也是，佐藤警官也是這麼認為，覺得平岡的死太蹊蹺了。據判斷，平岡是頭部受重傷死亡的。」千鈞道，「可惡！搞不好平岡是被人給滅口的。」
毛利問道，「平岡的死是意外嗎？」目暮道，「這些還不知道。我正要帶高木和佐藤去案發現場。有進一步消息，我再聯絡你。」千鈞也趕到了案發現場，見到了死者平岡志郎，他腰上還插著一把手槍。警察已經將那棟大樓徹底封鎖了，進行詳細取證。根據鑒識的取證，證實了擊中高田議員的子彈，的確是從這把槍里射出來的。換句話說，凶器就是平岡腰上的手槍。
柯南從房間走出來，小蘭正在接電話，毛利說在確保石本社長安全之前，他都不會回家來住。隨後，千鈞也打來了電話，小蘭疑惑，上前接起來。千鈞道，「柯南在不在？讓他接電話。」小蘭怒道，「那些殺人案件什麼的，你不要老是找柯南。」千鈞頭疼，「小蘭，我腦子不好使。新一又不在，我只是找柯南出出主意。你也知道，柯南聰明得很……」柯南急忙搶過電話，詢問案情。千鈞就將平岡志郎之死的事情講了一遍。柯南大驚，「會不會是被殺？」千鈞道，「我也這麼認為。可是警視廳那幫糊涂蟲，傾向于是意外。他們說什麼平岡在藏身的大樓沒有踩好樓梯就撞頭死了，真是笑死人了！」
柯南立即判斷出這絕不是意外，「如果的推斷沒錯的話，這又是一宗殺人案件。那個凶手，因為平岡知道這個秘密，才被他滅口的。因石本社長引發這一連串案件，乍看上去簡單，但其中隱藏著一個天大的秘密。最關鍵的是要找到證據。我們都被那個凶手蒙騙了。我一定會從這個復雜糾纏的謎團中，找出事實的真相。」小蘭疑惑，「柯南，你剛才在跟千鈞說什麼？」柯南手忙腳亂將電話掛斷，「哈哈哈，我是在模仿新一哥哥的說話口氣。」小蘭這才釋然，「真是的，你怎麼老是喜歡玩這種偵探游戲。」
隨後，開車來到毛利偵探事務所，千鈞帶著柯南趕到石本精機公司。二人進來時，看見毛利和目暮經過前台，乘上電梯向上面去，大概是要去拜訪石本誠二。千鈞與服務台的前台小姐搭訕，知道頂樓處就是社長室。千鈞正準備帶柯南上去時，新倉常章卻從旁邊的電梯里面出來，手里提著個箱子。千鈞詫異，「他不是高田議員的秘書嗎？來這里做什麼？」
社長室，目暮出示了柯南讓兔女郎拍下的照片，指著照片上的墨鏡男子，「這就是平岡志郎，你們有什麼恩怨嗎？」石本誠二卻說根本不認識這個人，目暮語氣嚴厲，「你最近接到恐嚇信，你的性命可以說是危在旦夕。再說，從你肩膀上掠過的子彈，可是擊中了高田議員，他還因此身亡。」毛利也勸道，「這可是一件嚴重的謀殺案。」石本知道問題的嚴重性，將手里的煙頭掐滅，「老實說……」幸子急忙勸阻，石本嘆氣，「沒關系的，幸子。我想沒有再隱瞞下去的必要了。」
石本承認，他的確受到了平岡志郎的威脅。平岡不知道用什麼方法搞到了石本公司的內部賬本，里面的內容如果公開，公司會有大麻煩。平岡恐嚇，「到時候你肯定會被逮捕入獄的，你公司的信譽也會蕩然無存。」石本怒道，「就算這樣，你也不能開口要10億啊！」平岡冷笑，「這個價格很便宜。你賺了那麼多了，石本先生！」由于平岡要價實在太高，石本就拒絕了平岡的要求，而且態度很堅決。石本知道平岡可能鋌而走險，搞出大事來，就請了毛利小五郎來保護自己，「沒想到因為我的關系，卻害得高田議員無辜身亡。新倉秘書剛才來還跟我談了一下。」
據石本講，新倉說不要讓高田議員就此白白死去，說服了石本向警方說明真相。這時，柯南打開門偷偷向里面觀看，被幸子發現了。毛利大怒，「你怎麼會跑到這里來的？」柯南急忙將包拿過來，「是小蘭姐姐讓我將你換洗的衣服送過來。」千鈞走進來，「是我開車送柯南過來的。」毛利不喜，「你們真是多事。」目暮已經問清了，石本社長的確在偷稅，內部賬本就是關鍵，「請你跟我們去警局走一趟吧，也能保證你的安全。」石本頭上冒汗，只好答應。
毛利大驚，「這麼一來，那我就不是……」幸子道，「你還是幫上忙的，真的非常感謝你。」小五郎大為沮喪，自己的使命結束了，自然不能再找借口接近幸子。目暮將石本帶走了，幸子陪同出去。毛利嘆氣，「我還真夠倒霉的，沒想到這件案子，這麼快就解決了。」柯南提示，「如果說運氣不好，平岡志郎的運氣還真夠差的。他的目標明明是石本先生，卻打中了別人。最後又從樓梯上掉下來摔死了。運氣真的差到了極點。」
毛利听完，也覺得有些蹊蹺，「運氣未免太差了吧？這件案子也太離奇了。難道說這個平岡還有共犯？」千鈞道，「也許他看到平岡失敗後，就將平岡給滅口了。」小五郎一驚，「這麼說，這人還有可能會對石本先生下手。」毛利大喊幸子的名字，連滾帶爬追了出去，「這件案子還沒結束呢！」柯南滿臉黑線，「大叔……」千鈞好笑，「算了，美色當前，大叔是根本指望不上了。」柯南問道，「你這次怎麼沒有過去獻殷勤？」千鈞道，「幸子小姐雖然漂亮，卻不是我喜歡的類型。說起來，大叔還是喜歡英理阿姨那種類型啊！」柯南笑道，「他們會結婚生下小蘭，也不是巧合。」
毛利跑到外面，與一個男子迎面相撞。毛利道歉，「真不好意思，你不要緊吧？」男子搖頭，沒有跟毛利對話。小五郎不要意思，「我有急事先走了。」男子向社長室走來，柯南和千鈞還在里面搜查。千鈞一下子就听到腳步聲，「柯南，有人來了。」千鈞本來想出去看看，柯南搖頭，示意藏起來。柯南藏到了櫥櫃里面，千鈞閃身貓腰躲到櫃子下面。男子在辦公桌前翻找東西，柯南和千鈞都認出來，是之前跟幸子偷偷見面的男子。男子找到一樣東西，露出奸笑。由于位置的關系，千鈞沒看清是什麼東西，不過柯南看到了。隨後，男子立即離開了。
確認男子離開後，柯南和千鈞出來。柯南道，「那個男子，與幸子小姐有什麼關系？」千鈞道，「這還用說，肯定有一腿。他拿走了什麼東西？」柯南道，「是個像遙控器的東西……難道說是這樣……」隨後，二人離開公司，趕往平岡陳尸的廢棄大樓，千鈞早已跟千葉說好了。千葉將那些警員暫時支開，讓千鈞帶著柯南進入現場。平岡的尸體已經不在了，不過警方的尸體圖標都已經標示好了。
柯南道，「如果平岡自己都沒注意到，他只是被真凶雇來設計成凶手的話……」千鈞道，「就算注意到也一樣，他本來就是專門干恐嚇勒索勾當的。」柯南道，「他很有可能藏著足以作證的憑據。」二人找了一下，什麼也沒發現。千鈞道，「如果有線索，警方肯定早找到了。」柯南卻發現牆角有個奇怪的洞。千鈞拔出七夕劍，將洞口撬開，從里面取出一樣東西，遞給柯南，「好像是個玩具馬達，真奇怪！」柯南大喜，「果然，這些做壞事的家伙都喜歡留一手。」
毛利偵探事務所，小蘭在打掃房間。小五郎還在自怨自艾，「幸子小姐……」千鈞和柯南推門進來，小蘭抱怨，「千鈞，你又帶柯南去哪里了？」千鈞道，「出去看了一下警察檔案，你知道，這小子好奇的很……」小蘭皺眉，「真是的，哪有小孩子沒事總去看偵緝檔案的。」千鈞只好打哈哈，柯南問道，「毛利叔叔，你不用保護石本先生了嗎？」毛利沮喪，「他已經拜托警方了，不需要我了。真希望能早點跟幸子小姐拉近距離啊！」三人頭上都汗，千鈞苦笑，「拜托，你只會想這種事情啊，大叔！」柯南也譏諷，「現在是努力找凶手的時候！」
目暮警官忽然推門進來，說有件事情要跟毛利確認一下。小蘭端上咖啡，目暮道謝。千鈞問道，「是什麼事情，目暮警官？」目暮問毛利，「你昨晚是親自送石本去的山本綜合醫院吧？在那之後，他的秘書田中幸子小姐，待在醫院里面有多久呢？」毛利回憶，石本去里面病房休息後，他和幸子一邊喝可樂，一邊閑聊。然後目暮警官打電話過來，再之後，小五郎就迷迷糊糊地睡著了。後來再醒來的時候，就是目暮警官早上打電話的時候了。當時是石本社長將毛利叫醒的，那時幸子早已不在醫院了。
目暮道，「這麼說來，你是不知道幸子小姐到底什麼時候離開醫院的？」小五郎肯定這點。千鈞問道，「大叔，你是在床上睡的，還是……」毛利尷尬，「我坐在沙發上睡著了。」千鈞道，「大叔你沒有喝酒，卻在沙發上睡過頭……幸子小姐，只怕在可樂里給你下了安眠藥。」柯南認可這個推理，毛利頭上冒汗，「目暮警官，難道幸子小姐……」目暮點頭，「這麼看來，幸子小姐有充分的時間殺害平岡志郎。」毛利跳起來，「胡說八道！幸子小姐那麼漂亮，怎麼可能會殺害平岡呢？」柯南好笑，「這個理由還真是理直氣壯啊！」