然而，面對混亂，敵人的抵抗能力依然超乎想象，顯然這里的防備力量很強，必定是重要的所在。里面，琴酒已經下令，「非戰斗的醫療人員馬上轉移，準備啟動備用電源！告訴外面的警衛人員，使用紅外線夜視裝備，不要大意，對方是龍魂使者！」伏特加也心有余悸，「沒錯，只有龍魂使者使用那把帶血光的劍。」警衛們的呼救聲此起彼伏，龍魂使者的推進速度超乎了想象，很多人只看到血光一閃，就失去了意識。
備用電源啟動，整個實驗基地亂成一團，非戰斗研究人員手忙腳亂地清理物品，準備打包撤離。琴酒知道這里已經暴露，讓手下督促這些人馬上轉移，物品全部銷毀。成群的烏鴉在空中鳴叫，預示著死亡的到來。很多人不明白為什麼組織那麼多戰斗人員卻擋不住一個敵人。火光、雷鳴、電流、土石、鋼鐵物體不斷在戰斗區域閃現，許多人慘叫著丟了性命。還有許多被莫名的黑暗吞噬，爆炸不斷發生，千鈞動用了破壞力極大的流星爆炸力量。沖出煙塵後，千鈞從地下潛入進來，繼續進攻。
組織的戰斗人員，漸漸從慌亂中恢復過來，開始動用威力巨大的槍械進行反擊。可是千鈞的速度太快，又是晚上，很多人連殘影都沒有看到就丟掉了性命。一些人一起向前投擲手雷，希望能炸死龍魂使者。爆炸過後，龍魂使者從後面出現了，瀝血劍劃過，這些人一起尸首分離。槍聲火光爆炸聲不斷傳來，組織的剩余人員正在拼命阻擋龍魂使者的推進。實驗人員已經撤離了大半，剩下的來不及離開，全部被關閉在地下室，伏特加按動了爆炸鈕，將那里全部摧毀了。
組織的特戰小隊出動了，他們是專門負責對付超級戰士的。千鈞剛剛闖入前面的建築中，馬上察覺到前面的敵人發出強大的氣息。一個高個子怪人猛撲過來，迅如猛虎，千鈞飛腳出擊，將其踢飛。情人槍響，怪人斃命。千鈞就地滾出去，對面已經投擲過來許多手雷。千鈞也不示弱，向對面扔出了許多高爆手雷。爆炸接連響起，整個建築都在劇烈的晃動中。千鈞從爆炸中月兌身出來，要不是生命原力和磁場保護，剛才也非常危險。對面沖過來幾條高大的獵犬，千鈞準確射擊，將陸續接近的獵犬快速擊斃。
一條經過特訓的紅色獵犬從側面猛撲過來，千鈞身體在空中回旋，瀝血劍劃過，獵犬被劍光粉碎。後面的馴犬人員大驚失色，這些獵犬都是改造後的猛犬，就算是特種兵也很難應付，沒想到被龍魂使者輕易消減了。千鈞發動了光束攻擊，射出的光柱穿透了牆壁，擊斃了躲藏在後面的馴犬人員。隨後，有個強大的敵人出現，那人速度也非常快，而且力量很強。千鈞猜測此人就是這里警衛人員的頭目。雙方高速移動，互相對射，都沒有擊中對方。頭目從側面繞過來，射出套索纏住了千鈞的腳。千鈞也動了，這次使用了金系力量，建築里面的鋼筋類金屬夾雜巨石碎屑飛出去，一舉將頭目砸成了肉泥。千鈞確認這個區域沒有宮野志保後，繼續向前推進。
前來迎戰的人員注意到了，「龍魂使者似乎在找什麼東西。」千鈞好奇一件事情，那就是黑衣組織到底在研究什麼，真的是長生不老藥嗎，還是類似生化危機里的藥品？可是抓到的一些戰斗人員也不知道具體在做什麼研究，顯然組織的保密工作非常到位。千鈞在前進過程，遭到了各種各樣的伏擊。但那些戰斗人員發現，龍魂使者每次都能提早發現，或者躲開伏擊。負責指揮的黑衣人很震驚，「天化組織的超級戰士，怎麼會這麼厲害？」還沒等他明白，千鈞已經殺到，紅光殺過，鮮血四濺。一個黑衣女子從建築後突然出現，準備開槍。千鈞的槍先響了，正中女子頭部，一槍斃命。
琴酒知道不妙，「馬上將交戰處的區域全部引爆。」伏特加大驚，「可是那里還有我們的戰斗人員。」琴酒冷笑，「與其被龍魂使者殺死，不如讓他們跟龍魂使者同歸于盡。」伏特加同意，立即下令。巨大的爆炸聲響起，將整片樓房全部炸毀，燃起了熊熊烈火。千鈞費了好大力氣才月兌困而出，繼續向前推進。等到千鈞殺到琴酒所在的中心區域時，這里早就人去樓空，顯然他們已經逃走了。千鈞知道不好，馬上以風之力量起飛離開。果然，這里隨後發生了巨大的爆炸。爆炸過後，地面上一片狼藉，千鈞盡力搜索了一遍，沒有找到宮野志保，只好選擇撤退。
這晚的戰斗，持續了大約1個小時，黑暗組織的基地被徹底摧毀，人員死傷無數。早就有遠處的居民報警，警視廳的人馬接到消息後匆忙趕來。可是由于是新年期間，交通繁忙，大大延誤了時間。在千鈞離開半個小時後，山本一夫率領秘密調查局的人，趕到了現場。秘密調查局的人非常吃驚，「這里發生了戰爭！」
山本一夫大為惱火，「到底是哪個組織破壞了我的計劃？」原來山本也查到了這個據點，正準備3天後秘密圍捕，沒想到千鈞提前行動，反而讓琴酒等人逃過了一劫。山本不是善男信女，馬上下令提前啟動「捕貓」計劃，全力追殺黑暗組織的人。不過這次現場依然留下了不少線索，足夠讓山本追查。隨後的追捕戰斗，破壞了黑暗組織大量據點，許多地方在那天夜里燃起大火，組織的不少非戰斗人員被迫放棄。
黑衣組織損失巨大，最要命的是，組織的天才科學家宮野志保失蹤了。上面的boss給琴酒下了死命令，「活要見人，死要見尸。」琴酒也非常頭疼，之前他把拒絕合作的雪莉銬在一個房間鐵柱上。龍魂使者來襲時，到處都一片混亂，撤退時才發現雪莉莫名其妙地失蹤了。琴酒並不認為雪莉被龍魂使者帶走了，因為那時龍魂使者還沒有殺到這片區域。琴酒猜測，可能趁著混亂，雪莉用什麼方法月兌離了手銬，趁機逃走了。
第二天，千鈞回到住處時，筋疲力盡，幾乎將所有的力量都消耗殆盡，尤其是生命力量。千鈞終于意識到了，「人力終有窮盡。一個人能力再強，也很難對抗一個龐大的組織。」晚上的時候，千鈞來到梅琴的住處，梅琴喝了很多酒，有些神志不清了，「千鈞，來陪我喝一杯！」千鈞還是第一次看到她這麼傷心，「姐姐，你喝多了。」梅琴搖頭，「沒有啊！我是不是很沒用？爸爸媽媽死後，我跟妹妹相依為命，現在妹妹也沒了，我還被人利用，被人欺騙感情，什麼都做不了……」
千鈞將她扶住，「為什麼你這麼講？你妹妹應該還活著……」梅琴露出苦澀笑容，指了指報紙，「那麼多地區在一個晚上起火，還發生槍戰。我雖然離開了組織，還是知道那應該就是他們的秘密據點。我的妹妹就在那些地方工作……組織的作風我很明白，如果來不及撤退，他們肯定會殺死那些非戰斗人員滅口的。」在宮野明美心里，妹妹是她活著的唯一羈絆，現在這個羈絆可能已經不存在了，「我也沒必要繼續活著……我想爸爸媽媽，也想志保……對不起，千鈞，我可能幫不了你了……」千鈞大驚，「好姐姐，你不要這麼講。你要不在了，我會很傷心的。」
明美淒然笑道，「為什麼？因為你失去了一個可以利用的工具嗎？」千鈞怒道，「你把我看成什麼人了！你應該知道我不是那種人。」明美知道失言，「對不起……」千鈞將明美抱住，「我喜歡你，明美姐姐！一直都是！」明美想推開他，但是沒有力氣了，「小壞蛋，大，快放開我！不要亂來……」千鈞卻一直抱著她沒有松開，直到明美完全冷靜下來。千鈞輕輕將明美抱到床上，明美大羞，不敢直視千鈞的眼楮，如同落入惡狼手里的小紅帽一樣。千鈞再也忍不住了，趁著明美酒後失意，撲了上去，與明美激烈地熱吻。明美半推半就掙扎了一會兒，二人的衣服都落在床頭，綠色的晶石項鏈也落在枕邊。天空的星辰依然在閃爍，很快，明美發出嬌美的申吟聲和輕叫聲。這正是，「肌骨細勻紅玉軟，臉波微送春心。嬌羞不肯入鸞衾，蘭膏光里兩情深。」
第二天天亮後，千鈞的全身充滿了力量，耗費的生命原力已經全部恢復了。昨晚上，他和宮野明美瘋狂地交纏，足足要了三次，將戰斗後的戾氣都發泄出來。千鈞有些悔意，多少有些愧疚，又有些滿足，他一直希望能跟明美更進一步，這次如願以償。明美依然在沉睡中，玉體蜷伏在千鈞懷里，肌膚如雪，上面還有歡愉後的痕跡。千鈞忍不住輕輕撫模明美的**，明美漸漸醒過來，抓住千鈞的手，「好癢，不要再亂模了。」千鈞有些窘迫，「對不起，明美姐姐。」這正是，「海日輕紅通似臉，小窗明麗新晴。滿懷著甚是真情。不知春睡美，為愛曉寒輕。說似吳山樓萬疊，雪銷未盡宮城。湖邊柳色漸啼鶯。才听朝馬動，一巷賣花聲。」
明美勉強坐起來，身體還有些不適，昨晚上她是第一次，「大，我早就知道你沒安好心，就不知道憐香惜玉，晚上一個勁地要……」千鈞有些尷尬，「好姐姐，我實在太喜歡你了……」明美沒好氣地示意，「把衣服給我……項鏈也拿來……」千鈞急忙將衣服遞過來，幫明美將衣服穿好，自然少不了一些手足之欲。昨晚上的事情，明美也早就有了心理準備，她本來就打算這次讓千鈞得逞的。在明美心里，她需要一份新的羈絆，能夠讓自己活下去的羈絆。千鈞喜歡她，她是知道的，其實她也蠻喜歡千鈞的，只是礙于志保的情分，這一年來，二人一直保持著曖昧關系。直到昨晚上，二人終于突破了界限，有了實質性的關系。
「一笑千金，越樣情深。曾共結合歡羅帶，終願效比翼紋禽。許多時，靈利惺惺，驀地昏沈。自從官不容針，直至而今。你共人女邊著子，爭知我門里挑心。記攜手，小院回廊，月影花陰。」洗浴完後，二人吃過早飯，偎依在一起，說起一些私密的事情。男女之間一旦有了這層關系，自然變得更加親密了。雖然有心理準備，但听到自己不是千鈞的第一個女人，明美依然醋意大發，故意找借口將千鈞指使的團團亂轉。不過，在某些方面，日本的風氣比較開放，像明美這樣的年齡才有第一次是非常少見的，所以明美倒也沒有十分生氣。千鈞自然曲意逢迎，伏低做小，哄明美開心。明美初嘗j果，情意正濃，也沒有太為難他。作為回報，千鈞也告訴了明美一個天大的秘密，那就是柯南的真正身份。明美萬分吃驚，「怪不得柯南那麼聰明，竟然是……這種藥物就是我妹妹開發出來的，真是天意啊！」
隨後的新年假期里，千鈞天天晚上跟梅琴膩在一起，二人正處于濃情蜜意時分自然如膠似漆，而千鈞的其他女友都不在。他們並不知道，就在他們開始正式在一起的那個晚上，一個茶色頭發的小女孩掙扎著來到了工藤宅的前面，當夜下著大雨，女孩暈倒在地上。阿笠博士打著傘經過，發現了女孩，就將她抱了回去。