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一個大約十五歲的男孩看著貨架上的口袋妖怪游戲，搖了搖頭，嘆口氣，這些自己都已經玩過了，而且還玩了好幾遍，熟得不能再熟了。
既然沒有新的，只能空手而歸了，還是回家慢慢等最新版的到來吧，這樣想著，男孩便準備走出這家店。
「你等一下，看樣子你很喜歡神奇寶貝啊。」這時店長突然把男孩叫住。
「嗯，喜歡。」男孩淡淡的應了一聲。
「果然如此。」店長神秘的一笑，「看你如此喜歡，我免費送你一套好了。此版本全世界僅有這一套。」
「哦？」店長的這句話挑起了男孩的興趣。
「那天有一個人來我們店里，離開的時候，從他的身上掉出了這部游戲，我也試著和其他的廠家聯系，不過據說沒有出版這個……」店長說著，然後小心翼翼的拿出了一個箱子，打開後，映入眼簾的是一個游戲，上面寫著「口袋妖怪之神秘島」
口袋妖怪之神秘島？確實沒有玩過，果然是最新版本的口袋妖怪游戲。男孩這樣想著。
「給你，拿走吧，總覺得你和它很有緣。」店長說道。
「多謝。」男孩淡淡的說道，頭也不回地走出這家店。
「唉，現在的孩子真是……」店長無奈的搖了搖頭。
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「怎麼這麼晚才回來？你去哪了？」男孩一到家，就遭到了母親的質問，而男孩給予的回答是理都不理，直接回到了自己的房間，狠狠地把門關上。
屋內，男孩握緊雙拳，緊咬著牙，他的背影看起來充滿了悲哀與寂寞。
此男孩的名字叫做陳羽，原本是一個活潑開朗的陽光男孩，有著幸福的家庭，很受父母的疼愛。然而有一次，在陳羽生r 那天，他的哥哥陳澤為了給他準備生r 禮物，卻意外的遇到車禍不幸喪命，為此，全家把錯都怪在了陳羽的身上，從此，陳羽便從一開始的活潑開朗的男孩變成了現在的冷酷無情。
重新整理好心情，陳羽坐到電腦前，打開了剛剛得到的游戲。打開後，便出現口袋妖怪之神秘島這樣的界面。
一開始。選擇x ng別，陳羽自然選擇了男，然後，角s 不是一開始出現在家中，而是出現在一座島上。
在這座島上，可以自己創造一些火山，雪山，湖泊什麼的。不過這些要隨著神奇寶貝的種類和角s 的級別才能創造。然後可以在島上放養神奇寶貝，這些神奇寶貝自然要去旅行收服，游戲設定可以隨意去任意一個地區，關東地區，橘子群島，成都地區，豐緣地區，神奧地區和合眾地區，應有盡有。
角s 在正式冒險之前，可以從島上的隱藏之處選出一只神奇寶貝作為搭檔，然後再去將要旅行地區的博士處領取初始神奇寶貝。
「呵呵，有意思。」陳羽呢喃了一句，然後就正式開始冒險了。
「請為你的神秘島取個名字吧。「就在這時，游戲界面上出現了這樣一句話。
「誒，不是叫做神秘島嗎？」陳羽有些疑惑，不過也沒有多想，「既然這樣，就叫‘月光島’好了。」
陳羽簡直是玩口袋妖怪的天才，用了不到一個晚上的時間，陳羽就稱霸了所有的地區，抓遍了所有的神奇寶貝，當然也包括阿爾宙斯等神獸。
「就剩下最後一步了，只要打敗你，我就真正的稱霸了。」陳羽說道。
陳羽口中的「你」是誰他也不知道，是一個神秘的人物，在游戲設定里此人物在神奇寶貝聯盟中是最強的，要比各地區的四天王和冠軍都有強很多，而角s 只有在打敗所有地區的四天王和冠軍之後，才有資格挑戰他，而陳羽現在已經打敗所有的天王和冠軍了，所以有資格挑戰最後的那個神秘人物。
馬上就要見到神秘人的真面目了，陳羽不禁有些興奮，然而在此時。「啪」的一下，電腦突然自動關機了。陳羽當場愣住，怎麼也沒有想到偏偏在此時……停電了……更重要的是之前玩的，他還沒有存檔……
陳羽愣了許久，最終忍住y 要爆發的怒氣，什麼都不說，直接倒在床上，很快的就睡著了。
不知過了多久，似乎感到有一股冷意襲來，陳羽睜開了雙眼，看到的卻不是和往常一樣的天花板，而是藍s 的天空，白s 的雲朵。
「這是怎麼回事？！」陳羽一下子站了起來，卻感到地面在晃動，險些跌倒，「地震？不對……」
陳羽看向周圍，這才發現自己是在一艘豪華游輪的甲板上，似乎又感覺到了什麼不對，立刻跑到甲板邊上，果然，映在海水里自己的影子是一個完全不同的形象，黑s 的頭發，淡紫s 的眼瞳，在加上這小小的僅有五歲模樣的身體，另外脖子上還掛著一顆神奇寶貝球。
「等等，神奇寶貝球？！」陳羽立刻從脖子上將那顆神奇寶貝球從脖子上拿了下來，仔細地看了又看，果然是神奇寶貝球，也就是說，他穿越了，而且還是穿越到了夢寐以求的神奇寶貝世界。
「在這個世界的我生活的怎麼樣呢？」陳羽不禁說道，畢竟之前的家給了他太多的y n影，快速的瀏覽了大腦里的記憶，原來今世的自己……
「不知道在這顆球里面的是什麼神奇寶貝？」陳羽靜靜的凝視著手中的神奇寶貝球，根據這個身體的記憶，這顆神奇寶貝球從來沒有打開過，可是陳羽可以輕易的感覺到神奇寶貝球里有一個生命，可是為什麼卻不為人知呢？
「轟」就在這時，一陣巨大的爆炸聲響起，海面上激起了無數的浪花，陳羽順著聲音的方向看去，發現有幾艘船似乎正在圍攻一只神奇寶貝。那只神奇寶貝，陳羽認得，正是美夢神奇寶貝克雷s 利亞，而圍攻克雷s 利亞的幾艘船，他們分為兩方，其中一方有個明顯的標志「R」，而另外一方則是「P」。
「是火箭隊和神奇寶貝聯盟。」陳羽咬了咬牙，
「是火箭隊要抓神奇寶貝，而神奇寶貝聯盟在阻止嗎？」
觀察了一會，陳羽那淡紫s 的眼眸變得有些深沉，情況似乎並不是他想的那樣，神奇寶貝聯盟看起來是在保護克雷s 利亞，而實際上卻是和火箭隊一樣，明面上是在阻止火箭隊，暗地里則是在攻擊克雷s 利亞。
「不可原諒，人類總是那樣的自私，為了自己的私y 而去傷害其他的生命。」陳羽抓緊護欄，滿臉寫著不甘心，「難道我什麼都做不了嗎？」
「對了……」陳羽突然想起了什麼，猛的看向了手中的神奇寶貝球，「雖然不知道你是什麼神奇寶貝，但是，我相信你，如今只有你可以借給我力量了，拜托你，去救救那只克雷s 利亞吧，去吧，神奇寶貝球。」說完，陳羽扔出了手中的神奇寶貝球……