朝倉義景見自己的聯盟倡議手段完全不奏效也不召集，一計不成再生一計又想起調略高島郡內的國人反叛，或許是朝倉家的強勢早已深入畿內武士的心中，朝倉義景的使者三言兩語就把許多高島郡的武士給說動，除去郡內的高島七頭始終曖昧不明之外，其他的各路國人還頗有一些人听信朝倉家的蠱惑。♀
眼看高島郡內生出幾分動蕩不穩的架勢，朝倉義景就寫信給自己的小舅子淺井長政，鼓動他趁著這個機會順勢發動對六角家的入侵戰，只要能把六角義賢這個草包給揉扁搓圓，整個近江就再也沒有能夠抵抗畿內三國同盟的力量。
這個要求恰好正中淺井長政的下懷，他早就盯上六角家這塊肥肉眼饞許久，尤其是去年六角義賢這個草包竟然罕見的沒有慫，在洛中合戰里死磕三好義賢打的是昏天黑地山河變色，最後自己折損八千余眾還搭進去幾個家老可謂是元氣大傷。
可臨到了只撈到一個象征意義的四位下作為鼓勵獎賞，還有五千貫文永樂錢作為對忠勇死去武士的補償，六角家譜代眾早已對強情公方的行為怨氣沖天，可他們不能對幕府公方發火，那就只有六角義賢這個倒霉的家督要中槍。
正值六角家內動蕩人心混亂的時機，淺井長政就生出要趁你病要你命的想法，于是和朝倉家一拍即合立刻召集淺井家的國人眾商議出兵事宜，北近江的國人眾也是很清楚六角家內部的紛爭矛盾。幾乎沒花多少時間就敲定出陣的事宜，但是在出兵之前卻收三好家傳遞的情報。
三好長慶身為三國同盟的發起者以及實際上的盟主。同樣表示支持女婿淺井長政出兵盡快打下六角家，他給予的支持就是派出五千軍勢越過澱川在山城國東部駐扎，佯裝作出威脅六角家左翼的樣子，吸引六角義賢的主力不能完全轉向北部淺井家的真正壓力，同時三好長慶又委派松永久秀為自己女婿的攻略燒上一把火，這把火就是調略。
永祿三年五月初，在松永久秀的從旁協助下很輕易的寢返愛智郡肥田城城主高野瀨秀隆，此君的父親高野瀨賴定為六角氏履歷功勛並英勇戰死。卻沒有得到應得的封賞，因而高野瀨秀隆始終對六角家抱有不滿。
這種不滿隨著日積月累逐漸發酵，尤其當他看到幾個昔日的舊友同僚不是高升就是委派重任就更加不平衡，在松永久秀的使者居中幾番調略就輕易的說服他反水，至于反叛以後能否得到他所需要的封賞之類的問題從來沒想過，許多時候人是沖動的也是盲目的，高野瀨秀隆就是個沖動而盲目的武士。
他宣布反水投靠淺井家以後引發巨大的影響。六角義賢收到這個消息的時候出離的憤怒了，他覺得六角家對此君也算挺好的，雖然沒有知行增封但地處琵琶湖東側土地肥沃物產豐富，這可是近江甲賀郡里多少武士盼不來的好地方。
更何況肥田城又承擔著拱衛觀音寺城的重任，可以說只要六角家的家督不腦袋不清醒就絕對不會動他們這一族，在六角義賢眼里高野瀨秀隆是最不可能出問題的一環。♀比其家里的幾個難纏的譜代家老絕對算的上人畜無害的代名詞。
可就是這麼個「乖寶寶」卻突然對自己齜牙咧嘴，甚至不惜投靠越發不听話的淺井家配下，這讓六角義賢感到十分的憤怒和羞辱，覺得這幾十年的真心對待全都喂狗了，于是他二話不說率領一萬五千軍勢對肥田城展開進攻。同時將情報傳遞給坐鎮阪本的山本時幸，希望他看住山城國邊境的三好軍勢的五千余釘子。
高野瀨秀隆一邊籠城固守一邊向淺井家呼救。但是淺井長政並沒有作出立刻出陣的選擇而是集結軍勢在小谷城內待機，他這麼做也是考慮到戰國時代的攻城的兩種極端，要麼是幾天破城要麼就是長期攻而不克，擔心自己貿然出陣還沒到地方就發現肥田城被攻破，不如等一等看情況再做調整，順便還能消耗六角家的銳氣。
六角家那邊的行動卻十分迅速，六角義賢統領一萬五千軍勢迅速肥田城包圍，位于愛知郡的肥田城距離位于蒲生郡的觀音寺城實在太近，六角軍只用一天就來到肥田城外大舉圍困，六角義賢先是象征性的派出使者勸降，待勸降不成就大舉圍困。
不過他的圍困還是十分巧妙的，可以看的出六角義賢是個心思縝密的家督，他很清楚對于六角家來說目前的形式不允許長期在外圍困肥田城，于是就下令就地征發普請役在肥田城的周圍修築一道堤壩，將肥田城南北兩側的愛知川和宇曾川的河水水引入堤壩內，打算用水攻困死六角家的叛逆高野瀨秀隆。
愛知郡又名愛智郡，書寫方法的不同經常出現通假字之一，比如加賀兩字就是通假字，京都城東側的鴨川既可以叫加茂川也可以叫賀茂川，所以愛知郡也叫愛智郡，同理還有愛知川和愛智川也是一個道理。
他的計策確實取得不凡的成效，愛知川和宇曾川恰好環抱著兩川之間的肥田城，兩條河川就有現成的堤壩可以使用，一萬普請役只是耗時一個月就勉強修起高一間多高的堤壩，以這到堤壩為依托掘開河壩發動水攻立刻就對肥田城造成毀滅性的打擊。
肥田城大半被浸泡在水塘里，只有二丸及以上憑借著修建城砦時的高度勉強擺月兌大水的侵襲，面對如此巨大的損失已經把高野瀨秀隆逼到絕路上，越是如此就越發不願意投降認輸，因為他知道此刻投降只有死路一條。
事實證明他的堅持是有用的，時值六月正是雨水最豐沛的季節。一場巨大的暴風雨席卷畿內引發近江地區的河川暴漲，傾盆大雨連下十幾天讓愛知川和宇曾川也隨之引發洪災泛濫。本就不堅固的河堤迅速被洪水沖出決口，反過來把堤壩外的六角軍淹成落湯雞。
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