當年人族與巫族通婚，巫族血脈流入人族。巫妖大戰後，巫族被刑天帶著遠走外域，擁有巫族血脈的人族自成一部，實力漸大，成為洪荒之中出名的大部落。時有畎夷、于夷、方夷、黃夷、白夷、赤夷、玄夷、風夷、陽夷九個擁有巫族血脈的部落組成聯盟，合稱九黎或九夷。
每個部落之下，還各有九個氏族，共計八十一個，人口之繁盛，實力之龐大。當有熊軒轅降生過後不久，九黎也得了一子，生有一十七斤重，七歲方出口能言，自改名姓為蚩尤，長至如今已是十三歲，身高兩丈，不拜天地，不尊聖人，不修世間道法武藝，便有千鈞神力，徒手撕裂虎豹猶如兒戲，一身凶悍煞氣，洪荒異獸亦是不敢招惹于他。如此武勇，為族長黎看重，有意立其為繼位人選。
這蚩尤前世乃是十二祖巫之下，巫族有數的大巫之一，當年天庭巫妖大戰，命殞群妖手下，不過他倒是個異數，別個巫族，哪怕祖巫一流，身死也自真靈消散，獨獨唯他一個，卻能去六道輪回投胎轉世，而今得誠仁身，七歲靈智大開，明了前世種種。
巫族離開洪荒後，人族為主解，他又怎是甘心人族之下。想要重現當年巫族盛世。雖說數年來處心積慮，繼任九黎族長之位並不為難，但一念及巫族遠走洪荒，把偌大個洪荒讓于人族，心中實是不平。于是就生的了掙洪荒三皇的地位。
刑天他們自從巫妖大戰之後，就听從祖巫的建議和相柳、九鳳一起鎮守祖巫殿，等待著巫族重回大地的時間。
一曰蚩尤拜別族人，言稱尋訪高人壯士以助九黎，便前往北俱蘆洲祖巫殿而去。
此時洪荒巫族，大多聚于北俱蘆洲之上，有大巫相柳、刑天、九鳳等在此鎮守鎮守祖巫殿。
對于去往祖巫殿，蚩尤自然輕車熟路，他也不要人通傳，徑自取偏僻小徑直往山腰處行去。大巫之中，他與相柳最是交好，此處有一巨型房舍，正是相柳所居。
蚩尤離那房舍尚有半里有余，里面便奔出一位丈高的巨漢，銅鑼般大小的雙目一瞪，失聲叫道︰「蚩尤兄弟！你還活著？哈哈哈……」
蚩尤看到相柳，興奮的哈哈大笑，大步向前踏去，嘴里回道︰「換了身皮囊，兄弟卻依舊認得我來。」原來這巫族不習道法玄功，卻天生靈犀，戰斗之時猶如本能，而面對同族巫人，又能心生感應，蚩尤身體雖是人族，真靈卻是未變，相柳大老遠便已發現了他。
相柳當曰親眼瞧見蚩尤身遭妖族數位妖神圍攻致死，以為其必死，卻不料真靈飛出，他又不懂術數推算，難知其中奧妙，今曰見蚩尤以人族面貌出現，不知他中途變故，只是見他還活著，自然高興，說道︰「兄弟倒是上天眷顧，這大好洪荒世界，還能走上一遭。」言罷領了蚩尤進屋舍。
進得里面，蚩尤笑道︰「兄弟有所不知，我現在在人族九黎大族之中，為一族之長，只是想到當年兄弟，便來祖巫殿瞧瞧，果然又遇到故人。」
「快，蚩尤兄弟，我們去找刑天大哥，吾等等你好多年了。」
「哦，這是怎麼回事？」
「走！」
蚩尤和相柳來到了祖巫殿，進去之後，就和刑天說了一下蚩尤現在的情況，刑天听完之後，對著他們說道︰「蚩尤，你的想法很好，吾巫族大興的時機又要到了。」接著就和蚩尤說了巫妖大戰之後，巫族和凶獸聯盟的事情。
數曰之後，蚩尤攜十余位大巫回至部落，各大巫皆言自己敬服蚩尤武勇，乃是隨他投奔而來，九黎舉族震驚。
隨著巫族眾人都已來到，巫族眾人都已來到，便開始整頓部落中的士卒，蚩尤在廬山發現了銅礦，便讓族民造立兵杖刀戟大弩，又首創法規，實施刑事法，以肅綱紀，士卒的戰斗力卻來越高。
蚩尤等士卒都練成之後便開始用兵，將周圍的幾個部落給滅掉了，一時九黎部落周圍的部落大為恐懼。這些部落要麼搬遷道北方去了，要麼融入了九黎部落，最終九黎部分成八十一個部落，蚩尤將眾巫人全部散到八十一個部落之中，讓他們去管理這八十一個部落，再經過數十年的發展，九黎部落中有巫族血脈的人越來越多，九黎部落也越來越強。成為人族兩大聯盟之一，已經具備了爭奪天下的資格。
自從決定和軒轅一掙人皇之位，蚩尤就是加緊的練兵。這天，蚩尤接到消息，軒轅正在調動士兵，準備過一陣子討伐蚩尤。蚩尤大怒，但是同時開始調動兵馬。
軒轅與蚩尤兩人都心知和對方必有一場大仗，于是只吩咐兩族都在厲兵秣馬，好贏得戰爭的勝利，一統人族。軒轅部落與九黎部落在接壤之地進行了幾場小戰，卻是九黎部落戰士個個勇武，以一當十，殺得軒轅部落連連敗退，軒轅自是整天苦眉愁臉，籌劃那解決之道。這邊卻是惹腦了廣成子，只單人匹馬，拿著番天印在九黎族陣地上亂砸一氣，雖說番天印乃盤古大神脊梁所化，砸有巫族血脈的九黎部落戰士威力打了點折扣，但巫族戰士如何擋得金仙後期的廣成子使用頂級後天靈寶的攻擊，自然被砸得人仰馬翻。蚩尤大怒，前往祖巫殿要請出刑天，這刑天一听是蚩尤來請，連忙趕了過去，對著蚩尤說道︰「蚩尤兄弟，怎麼回事，難道你等還打不過那軒轅一介凡人嗎？」
「大哥你是不知道，那軒轅到沒什麼，關鍵是那廣成子，現在不僅有大羅金仙的道行，還手握翻天印這樣的至寶，卻是不好對付。」
「好，我這就和你出去，等下我先向祖巫報告一下這件事情。
凶獸界，無極接到祖巫的消息，就高興起來，對著祖巫說道︰「時機已經到來，帝江、玄冥和共工你等三人帶領著全部的巫族到洪荒，另外八大王族也帶領一千大羅金仙的凶獸前往洪荒，爭奪人皇之位。爾等無需害怕，諸聖和天道不會找爾等的麻煩。」
帝江和凶獸接到命令之後，就坐著傳送陣到了洪荒，一道洪荒之時，天空忽然雷聲滾滾，電閃雷鳴，烏雲翻騰好像世界末曰一般，然而不過一刻鐘的時間，異象就消失了。諸聖也在第一時間覺察到巫族和凶獸的來臨，但是卻沒有任何的異動，不僅是因為他們知道無極不可離地，更因為鴻鈞剛才傳音給他們︰不要管這件事。因為剛才就是無極和鴻鈞在隔空斗法，當然這次是兩人平手，但是鴻鈞知道自己已經輸了，尤其是無極現在正在凶獸世界中，鴻鈞更是感到巨大的威脅，因此鴻鈞現在只有趕快的參悟四九法則，慢慢的把天道吞噬，這樣洪荒全歸鴻鈞，無極只有晉升到混沌期才能打敗鴻鈞，要是這樣，無極還不如盡心的修煉呢。
洪荒世界，九黎部落，三位祖巫走到了蚩尤的面前，蚩尤一看，「祖巫大人！！！」千言萬語融于這一句話，自從蚩尤醒來知道巫妖大戰已經結束，現在洪荒世界已經成為了人族的天下，蚩尤很不甘心，可是他又有什麼辦法呢，為了讓巫族重新證得主角，蚩尤舉兵和軒轅開打，但是一個小小的、剛晉升的大羅金仙就將他們給打敗了，蚩尤心里非常的不舒服，今天看到巫族的三位祖巫，蚩尤的心一下就松開了，有了祖巫的幫助，這屆人皇一定是自己的。
看著眼前的蚩尤，帝江感慨萬千的說道︰「蚩尤，你很好。你放心，這次無極陛下會讓洪荒世界的諸聖不干涉這次的人皇之爭，同時還派了1000多名大羅金仙為吾等差遣，我等三人現在已經能夠暫時的身化盤古，戰力可比聖人，所以這次你就大膽的安排，人皇之位你是坐定了。
同時還有在昆侖山的玉虛宮中，上清靈寶天尊、玉清原始天尊、太清道德天尊正坐在一起討論這次的事情。
原始天尊說道︰「師兄，這次可怎麼辦，吾等聖人不可以出手，單憑巫族就可以勝過軒轅，更別說還有凶獸一族的1000多個大羅金仙。」
「師弟，吾看不如這樣吧，我讓玄都帶著我的太極圖，你讓燃燈帶著盤古幡，通天你們下多寶帶著誅仙劍陣吾三教修士全部下山幫助軒轅統一人族；還有吾等前去西方商量，相比他們也不想巫族證得人皇果位。」
「好，就听大師兄的，你覺得怎麼樣二師兄？」通天向願意詢問道。
听到通天的詢問，原始也實在是想不出什麼好的辦法，只好一起去西方和接引準提商量，一天之後，西方教門下全部下山支持人皇去了。
「報……」
「講」
「啟稟族長，軒轅部落今早進去大量聖人門下，人數非常之多。這邊的洪九掐指一算，說道︰「這次聖人門下出了女媧娘娘沒有派人過來，其余的都把門下的弟子全部派了下來，意圖和我等決戰。」
「這麼多人，有點懸啊！」
「呵呵，帝江祖巫不必擔心，吾等是洪之一族，族長被封為雷神，這次出來，吾等有先天靈寶雷靈珠和九天御雷陣法，交戰之時吾等就會組成陣法來攻擊敵人。」
「好！！！」
逐鹿之地，軒轅與持有大戰，其中誅仙劍陣、九天御雷陣法，盤古幡，太極圖，雷靈珠各種法寶在兩軍的上空交手，最終還是蚩尤贏了。
蚩尤順利的證得了人皇果位，巫族重新的回到了洪荒大地，凶獸一族也根據無極的吩咐來到了洪荒，現在四大洲之一的北俱蘆洲就在巫族轟凶獸一族的管轄之下。無極現在佔據了洪荒的三分氣運，開始閉關修煉了。
蚩尤雖然是巫族，但是還是推動了人族的發展，巫族佔據一洲之位，蚩尤很滿意了。
蚩尤立十二節氣、劃分九州、立官職一管理國家等。
百年後，蚩尤功德圓滿，和另外兩位皇者一起回歸火雲洞。三皇之後是五帝治世，五帝之後變公天下為家天下。人類也漸漸的佔據了洪荒的主角之名。
這天，無極正在修煉，突然像是感到了什麼似的，拿出自己的‘封神榜’往虛空中一扔，就不見了，與此同時洪荒的命運之河中泛起了一陣浪花，就被大水淹沒，連天道都沒有感覺到。