當碇真嗣再次清醒過來的時候，他的身體已經完全復原了。
原先根本無法動彈的身體重新恢復了活力，而且感覺似乎變得更加的強壯了。
初號機也已經完全修復，而且在沒有連接電纜的情況下仍然可以自由的活動。
然後，低下頭的碇真嗣看到了，整個地下室中，鋪在地面之上的一層鮮紅的血液，還有在血液之上漂浮著的碎肉……
「初號機，dummyplug行動模式，最終指令，吃掉人造天使！」父親最後一刻下的命令再次在耳邊響起，碇真嗣只感覺頭腦一陣暈眩，極度的惡心感充斥了全身。碇真嗣猛一翻身就這樣趴在駕駛艙中吐了起來。
當肚子里的食物都吐干淨了之後，碇真嗣開始吐起了黃水，到最後甚至連吐了好幾口鮮血，然後重重的撲倒在了駕駛艙中。
「真嗣，听我說冬月耕造沉重的話音響起，碇真嗣沒有起身，雙手護著頭渾身輕微顫抖著，喉頭滾動間發出了一陣陣若有若無的嘶吼。
「當渡把c計劃的最後一步告訴我的時候，我一度以為渡瘋了，但是直到現在我才發現，原來他的選擇，是真正的，令人覺得欽佩的選擇冬月耕造淌著小腿深的血液走到了初號機身旁，仰頭看著初號機那冰冷的面龐接著說道︰「我和渡一起也很多年了，從曾經那個令我感覺反感的男人到現在這個令我欽佩敬畏的渡，這中間，發生了許許多多的事情，令人遺憾的是，其中大部分都只會讓人感到悲傷
「當渡把這最後一步告訴我的時候，他的笑容，讓我感覺似曾相識。現在我想起來，那個笑容，只在兩個人面前顯露過。一個是唯，你的母親；而另一個，就是你，真嗣，只不過那個時候你還在襁褓之中
「不要覺得有所愧疚，真嗣，你要清楚的知道，這是你的父親，碇源渡做出的選擇，他犧牲了自己，成就了你與初號機。真嗣，振作起來，不要辜負了你父親的期望！」
「父親的……期望？」碇真嗣雙眼無聲的喃喃自語，腦海中浮現的一幅一幅畫面卻都是曾經那個冷漠的男人。
「麗，真希波，還有美里，律子……大家都沒事，麗和真希波是被渚薰救下來的，然後和美里他們一起被安排到了nerv的安全室，現在，能夠繼續戰斗的只剩下你了，真嗣，記住我接下來的話，這，是你父親讓我轉告給你的……」
「碇真嗣，拼命努力去成為一個配得上六分儀源渡和碇唯的兒子這個身份的男人吧，不要讓我們失望！」
這一刻，碇真嗣仿佛看到了他的父親和母親站在他的面前，母親微笑著看著自己，笑容是那麼的溫暖；父親還是冷冰冰的，他說的話也像是在頒布命令一般，但是不知道為什麼，碇真嗣發現，自己的內心，很安詳。
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地下都市，nrev總部。
沃瑟化身的類eva從空洞中緩緩飄下，轉頭四顧，整個地下空間都是靜悄悄的沒有半點聲音。
由于大半的電力系統被破壞，所以楊清逸看不到地下都市平時那亮如白晝的場景。此時這里略有些昏暗，看起來充滿了末世的悲涼。
nerv總部就在沃瑟身前不遠處，楊清逸朝那邊看去，正好發現一個紫色的身影從總部那破爛的大門中緩步走出。
初號機，碇真嗣！
初號機從總部中走出，穩穩的站在了沃瑟的對面。楊清逸看著此刻煥然一新初號機，嘴角微微翹起，「亞當，莉莉絲，初號機，真是美妙的組合
身為天使的楊清逸，自然感覺到了在初號機中那強烈的亞當與莉莉絲的氣息，這只能說明，亞當和莉莉絲都被初號機給吃了。
不過這些並不能引起楊清逸的重視，真正讓楊清逸側目的，還是此刻前方那紫色身影中所流露出的強勢與自信，碇真嗣，這個少年似乎有了巨大的改變！
‘喲，真嗣同學，你好。’楊清逸朝碇真嗣傳去了心靈通訊，突然在腦海響起的聲音讓滿臉鄭重的碇真嗣嚇了一跳。
「是誰，誰在說話……」碇真嗣轉頭四顧，最後把視線投到了對面那個與四號機極為相似的eva上。
‘是我在和你說話，不過看起來你還不怎麼會使用自己的心靈立場。’楊清逸笑道，‘你應該是見過我的，我是第七天使，伊斯拉菲爾，第十天使沃瑟的eva形態的駕駛員。’
「是你！你害了明日香，還指使力天使差點殺了綾波她們！」雖然驚訝于使徒形態的巨大變化，但是這都不妨礙碇真嗣對于這幾個使徒的巨大的憤怒。
‘明日香可不是我害的，是霞吃了它，至于綾波她們，到最後不也沒死嗎？’楊清逸的心靈立場可以感覺到在nerv總部地下近千米還有一個巨大的空間，而在那其中，還有許多的幸存者，綾波麗等人就在其中。
‘不論如何，現在，既然是你站在我的面前，那麼，毫無疑問莉莉絲與亞當都已經成了初號機的養分了，這一點，我也能感覺得到。碇真嗣，來吧，這將是決定這個世界的最後一戰了，如果你贏了，人類便可以繼續繁衍生息；若你輸了，那麼就讓人類這個惹人厭的族群徹底消失吧！’
「雖然我听不懂你在說什麼，但是不論如何，我一定會打敗你們，保護大家的！」碇真嗣的神情前所未有的堅定，初號機擺開架勢，緊緊的盯著手持著朗基奴斯之槍的沃瑟。
‘那麼，最後一戰，開始吧！’
沃瑟身後血猩羽翼一翻，十二支齊出直奔初號機而去；然而一道血紅色的心靈立場突然浮現，完全擋下了血猩羽翼的攻勢，初號機微一躬身，隨後猛然發力頂著心靈立場直朝沃瑟沖去。
‘噹！’血紅色的心靈立場與沃瑟七彩色的心靈立場毫無花哨重重的撞在了一起，道道電光閃動，七彩色的心靈立場竟然被血紅色心靈立場侵蝕了一大部分，剩下薄薄的一層也在片刻後被血紅色心靈立場擊破！
「集合了亞當與莉莉絲的之後，進步也太大了！」楊清逸心中微微一驚，朗基奴斯之槍飛速舉在身側擋住了初號機凌厲的鞭腿，但是那巨大的力量也推得沃瑟往旁邊連踏了三四步。
眼見初號機小佔上風，碇真嗣對于初號機的力量頓時滿懷信心，初號機大跨步沖到沃瑟身旁，乘著對方未穩之際雙手握攏一記勢大力沉的重拳緊跟而上。
楊清逸冷哼一聲，在他的控制之下沃瑟干脆順勢躺倒在了地上，朗基奴斯之槍劃過一道半圓直擊初號機的腳踝。
‘砰！’前一刻還自信滿滿的碇真嗣下一刻便吃了苦頭，腳踝上劇烈的痛楚傳來，緊接著初號機的雙腳便被沃瑟緊緊抓住，隨後沃瑟猛然起身，直接將初號機掀翻在地。
初號機轟然墜地，碇真嗣腦袋微微一愣，緊接著便發現那把血紅色的雙叉長槍狠狠的朝自己駕駛艙這邊刺了過來；碇真嗣急忙打開了初號機的心靈立場，然而那堅硬無匹的血紅色立場卻被長槍如裁紙般輕易刺穿，閃爍著冷光的槍尖沒有絲毫停頓繼續往駕駛艙重重落下。
如果被朗基奴斯之槍貫穿駕駛艙的話，死亡幾乎是注定的結局，危急時刻，碇真嗣下意識的一招手，初號機胸前突然亮起一陣紅光，一把一模一樣的朗基奴斯之槍出現在了初號機胸前在千鈞一發間擋住了沃瑟這必殺的一擊。
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