神農傳下《神農本草》，為天下黎民治療疾病，又有麥、稻、谷子、高粱給廣大黎民充饑，神農的地位一時快趕上天下共主伏羲了。
伏羲都听到了，于是他決定自己親自去看看，來到了有姜部落，只見部落里有水的低處種著稻子，無水的高坡上種著麥子，又有粟、蕎、薔間或期間，到處一派綠油油的景象。
農夫在地里耕作，小孩在壟里玩耍。「阡陌交通，雞犬相聞。」說的就是如此。伏羲見到到處一片繁華的景象，非常高興，心中隱隱有讓賢的想法。
神農听說天下共主伏羲來了，連忙率人前來迎接。
伏羲見神農身材魁梧，皮膚黝黑，卻也是一表人才，心中更暗暗歡喜，于是便問了神農幾個關于種植莊稼的問題，神農自然是對答如流。伏羲又問了神農幾個關于管理洪荒眾部落的問題，發現神農也能推陳出新，提出許多好的見解。
伏羲嘆道︰「神農果真為大賢啊！」越想就越有讓位的想法。伏羲再問下去，越問越驚訝，他只發現神農還對行兵布陣有研究，他最厲害的還是治病。伏羲又是大贊神農。
神農卻謙虛道︰「共主謬贊了，神農愧不敢當，我這身本事卻是人族聖父所賜。」
伏羲一听，連忙感嘆一聲︰「聖父原來早就有安排。」心中更是將神農視為第一人選。
于是，伏羲便邀請神農前去陳都，神農見是共主邀請，如何不從！辭別家人，找個助手接管了自己的事物，與伏羲一起去了。到陳都，神農輔佐伏羲，處理政務井井有條，一些困難的事情也很好的解決了。
杜子騰一日在天機山忽然醒來，恰指一算，嘆道︰「伏羲也該歸位了。」
如此同時，天地六聖皆有感應。
女媧更是欣喜，自己的兄長就要歸位了。
杜子騰一道南明離火遁趕往人族，人族伏羲神農見人族聖父，帶領人族拜見，杜子騰點點頭道︰「伏羲，你為人皇，今日該是功德圓滿之時。早點讓位于神農，回三十三天外火雲洞去修養吧！」
杜子騰說完，一道清氣彈入伏羲體中，長嘆一聲︰「如今人皇功德圓滿，人皇歸位！」一聲長嘆，清氣引動伏羲體內的人皇印記。人皇印記散發著功德氣息引發天道感應，天道頓時降下一道大功德。功德一入伏羲體內，只見一道功德圓環出現在伏羲身後，伏羲前世記憶也同時恢復。
伏羲一成人皇之身，天地六聖皆來恭賀。
女媧行了一禮，道︰「恭喜兄長證得人皇之身。」
伏羲看看杜子騰，又看看女媧，回想起自己在人族經歷的種種磨難以及與自己一同共苦難奠下人族，心中一嘆，道︰「從今往後，妖族沒有伏羲，只有人族伏羲。」
伏羲一說完，只見天空飛來一龍鑾，由九條九爪金龍拉著，伏羲在上龍鑾之前，當著眾人的面，將人皇之位讓給神農。
人皇之位一讓給神農，那人皇印記也一同出現在神農身體里。
神農接手伏羲，更是將人族打理的井井有條，他教民種五谷後，並不單單靠天而收，還教民打井汲水，對農作物進行灌溉。同時，他還發明了陶器，解決了人類的生活用具——器皿和陶盆、陶罐等。
農業的出現，人類的勞動果實已有剩余，這時，神農氏設立集市，讓大家把吃不完，用不了的食物和東西，每天中午拿到集市上去交換，從而出現了原始的商品交易。還治麻為布，使民著衣裳。更削木為弓，以威天下。
神農之教曰︰「丈夫丁壯而不耕，天下有受其饑者，婦人當年而不織天下有受其寒者，故身自耕妻親蠶以為天下先。」
神農管理部落，治理天下很有方法。他不望其報，不貪天下之財，而天下共富之。智貴于人，天下共尊之。他以德以義，不賞而民勤，不罰而邪正，不忿爭而財足，無制令而民從，威厲而不殺，法省而不煩，人民無不敬戴。
之後因為糧食吃不完，腐爛在倉庫中，神農又經過觀察叫人養起牛、羊、馬、豬、狗、雞六種牲口和家禽來，統稱六畜。自此人族可以不用打獵也有肉吃了。
五谷六畜的出現，標志著人類文明了一個嶄新的農業發展階段。這時候，人類的勞動果實已有剩余。
人族飛速的發展，與此同時，巫妖大戰，祖巫隕盡，但是殘存下來的大巫帶領巫族也在洪荒邊緣發展著。
其中九黎遺族有一大巫名叫蚩尤。
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