此時邊境的戰斗已經爆發，還好部隊準備充分。李峰利用超時空傳送儀將大部分防御武器的設備傳送到了防線周圍，而大量工程機器人對各種設備進行組裝。
一條由光凌塔，法國巨炮和磁暴線圈以及大量圍牆組成的防線，被部署在了漫長的國境線上。這些武器的電力則完全依靠大量磁能反應爐和部分核能反應堆供應。異形雖然數量龐大不過大部分都是沒有融合武器的水貨。在這種堅固的防御陣地面佔不到絲毫便宜。對方在進行了幾次試探性進攻後暫時停止了活動。
不過這樣反而有利于太空中的重炮進行精準的毀滅性打擊。為了盡可能多的消滅這些生物，李峰甚至決定將主炮調低了能量級別加入到了炮擊當中。來自太空中的怒火一直在持續著，在無路可逃的情況下逼得這些怪物只能拼命的撞擊著前方堅固的防線。不過那只是加快了自身的毀滅速度。而防守這條防線的機械兵團也在防御武器的配合下，進行著大面積屠殺。不過李峰並不知道，這些只不過是對方試探的炮灰部隊而已，真正的殺招還在後面。
當聯軍主力趕到防線時，戰斗已經結束了。準確的說是防線已經被徹底毀滅了，戰場上滿地都是異形支離破碎的尸體和各種武器的殘骸。在最後時刻李峰不得不命令超載所有電力設施引爆核電站，這才毀滅了即將突破防線的異形軍團。自己也沒有想到對方居然還在附近隱藏了一支全部融合了武器的部隊。雖然數量不足100萬，可是戰力相當彪悍。里面居然還有大量裝備了激光武器的異形，甚至有的異形激光的強度超過了光凌坦克威力。
黑鷹戰機雖然及時趕到，不過這些怪物之中能夠對空的也不在少數。各種口徑的機關炮，防空飛彈向雨點一樣打上來。甚至一部分異形進化出了無法干擾的跟蹤飛彈，800多架黑鷹戰機就這麼在密集的打擊下，瞬間護盾就被突破了。接下來就像被煙燻的蜜蜂一樣 里啪啦的從天空中掉下來。最終在這種情況下不得已才使用了同歸于盡的打法。這才將這些鬼東西全都搞死，不過這樣一來此地的守軍也大部分玩完了。
不過在這場戰斗之後，聯軍在接下來的戰斗中，再也沒有遇到大規模的異形群。雖然時不時能踫到幾個，不過對部隊也沒什麼威脅了。而全球解放軍在失去領袖後，也迅速走向崩潰。只有極個別的宗教狂人還在繼續抵抗，但是大局已定，對方只是在螳臂當車而已。很快聯軍就控制了大半個非洲，除了南部地區還有全球解放軍的抵抗外，幾乎完全控制了北部地區和中部地區。李峰也完全搞不清楚異形母體到底要干什麼？它的目的難道就是派手下來作死的不成？更嚴重的是現在已經發現能夠同時使用兩種武器的異形，對方的進化融合速度明顯正在加快。要是在這麼搞下去，要想干掉對方恐怕就要付出更大的代價才行！
而愛因斯坦經過對這些生物殘骸的研究，也無法看透對方的進化規律。不過卻發現這種生物似乎在不斷的優化自身。每一次的標本都和上次有許多不同之處。雖然變化十分細微，不過長此下去也不是一件好事！每一次變化只能說明對方比以前更難纏了。
此時的聯軍主力已經推進到了南非邊境，而這里是叛逃的生化將軍崔可斯博士所控制的地盤，不過此時對方被打的已經毫無還手之力了。但是這家伙手里的生化病毒科可不是開玩笑的。而且有情報表明最近崔可斯這個變態不知道怎麼搞出來的一種特殊藥劑居然可以控制異形！而對方正在對被捕捉到的異形原體進行實驗改造。一旦成功那可就麻煩大了！
而對方的研究中心建在了一座廢棄的金需內，但是位置實在是太深。想要靠太空武器將其擊毀恐怕對地表的破壞相當嚴重。不過即使能夠摧毀，李峰也不會那麼干。因為對方情報中提到那種藥劑居然可以讓異形變得听話，這對李峰是一種多麼大的誘惑啊！李峰甚至懷疑全球解放軍的那個領袖之所以能夠控制異形幫助自己，恐怕和這藥劑有著莫大的聯系。不過李峰也只猜對了一半，合作是異形母體主動和對方聯系的，而這種病毒則是對方為自己準備的後手。為了防止以後雙方翻臉而秘密搞出來的。只不過在分裂時被崔可斯博士的部隊逃跑時順便搶走了，而城外的秘密研究中心也被對方炸成了碎片。
而藥劑的來歷，恐怕就要從對方意外獲得了異形母體成長後褪下的那層外殼說起。這東西對于異形母體來說毫無價值還佔地方，本來打算讓分裂出來的異形們吃掉。不過被趕來的全球解放軍領袖意外發現。當時提出用100萬人作為食物來進行交換的。只能說異形的智力還是進化的不過關，居然沒有發現這麼明顯的陰謀。動物還是沒有人類奸詐狡猾，反而是一個只知道吃的單純大吃貨！所有決定都圍繞在怎們吃飽吃好來進行的{還有其它原因}。
對方本來要這東西的目的也只不過是要更充分的了解這種生物，以後佔領世界後更容易對付它們。只不過在研究中卻意外的發現了殼體上面附著的少量組織殘留，從中居然?p>
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不過搶到藥劑的崔可斯博士現在也開始郁悶了起來，本來以為搶到了這東西憑自己在化學武器上的成就能夠很輕松的搞定問題，沒想到直到聯軍打到家門口也無法完全合成成功。自己費盡心機抓到的那幾萬異形反倒成了累贅。這些生物一天要吃的東西都快趕上自己部隊一個月吃的量了。還好這些生物都不挑食什麼都吃，可是就算喂石頭和沙子什麼的也要派人去拉啊！看管它們也要派人手不是。現在戰況越來越激烈哪有那麼多閑人干這個啊！這東西合成實在是太困難了，恐怕美國也搞不定。
此時他自己並不知道，自己的秘密研究所已經被人惦記上了。聯軍為此組織了一支特戰部隊，其中包括華國的黑蓮花，5名精英偵察兵，美國的貝頓上校和5名特種狙擊手，此外堡壘方面的約翰•普雷斯頓所率領的5人特戰小隊也參加了這次行動。
為了保證這次任務的成功，李峰派出飛機向該地區投放了大量電磁脈沖炸彈。完全破壞了該地區地面上所有電子通信設備，而機降作戰進行的十分順利。在5架阿帕奇武裝直升機的火力掩護下，華國的米171武裝直升機和美軍的黑鷹直升機迅速完成了機降，而堡壘的特戰分隊則通過登陸艙進行空降到達了指定位置。雙方會合後，迅速摧毀了基地外圍的所有防御部隊。
特別是堡壘的特戰分隊，依靠著過人的身手和先進的武器。將一支意外趕來的裝甲部隊完全炸了碎片。強大的金屬風暴重機槍輕易的撕碎了對方天蠍坦克的裝甲，將其打了個稀巴爛。至于那些防護更差的沖鋒車，戰斗摩托車，戰斗巴士什麼的更是被粒子步槍和槍榴彈炸成了廢鐵。而自身強大的單兵作戰系統的護盾輕易的抵消了對方所有火力的打擊，這支只有5人的小分隊在不到10分鐘的時間就將對方200多人的機械化部隊變成了一堆零件。
美國和華國參加這次行動的人也開始重新審視這些可怕的人形戰斗機器。特別是對方身手實在是快的太離譜了，戰斗中幾乎很少被對方武器擊中。這也主要得益于在瑪格飛船搜到的幾件5級文明戰斗服的強大輔助能力。黑蓮花十分輕松的用電腦破譯了基地的大門，解除了內部的所有防御系統。不過從發現的資料來看里面至少有一支200多人的精英防御部隊而不是情報中說的80人。而這支部隊的指揮官卻是令兩國聞之色變的賈曼卡爾。一名全球解放軍十分可怕的傳奇狙擊手，他的恐怖在于科技什麼精準的射殺各種載具的成員，只要你有一絲一毫的弱點他都能輕松抓住，死在他手里的沒有1000也有800了。即使信心爆棚的貝頓上校也開始謹慎起來，雖然自己很厲害可是對于阻擊手還是有著天生的恐懼感。本來都在考慮是否應該放棄任務時，才想起了拆坦克那群變態般的存在，于是又重拾了信心。
三方各留下1人看守出口外，其余14人則進入基地內部。根據基地外黑蓮花的指示，很快就在錯綜復雜的地下隧道內找到了研究室的位置。不過卻在路上遇到趕來的基地防御人員，剛開始還好些憑借這身為精銳的實力完全壓著對方打。可是隨著敵人增援的不斷增加小隊的彈藥也消耗的越來越多。現在除了那些人形戰爭機器還在戰斗以外，小隊其他成員大部分陣亡。而美軍那頭更是除了貝頓上校以外，所有阻擊手都被對方狙殺。雖然對方也在激烈的交火中付出了將近70多人的代價，不過很明顯對方還有上百人的部隊可供消耗，而聯軍的小隊現在已經不足8人。除了貝頓上校還能戰斗外，就只剩下3名華國偵察兵了，而其中一名華國偵察兵也身受重傷眼看就要咽氣了。
貝頓看著形勢急轉直下心中也十分焦急，不過從進來以後就玩失蹤的堡壘特戰隊隊長，卻突然出現在敵人背後。手中兩把手槍使用的出神入化，包圍自己的敵人居然被他奇跡般的槍法瞬間撂倒，居然只用了30幾秒就把50多個敵人都給干掉了。不過干掉槍法精準的賈曼卡爾倒是花了不少時間，一代傳奇人物就這樣死在了這里。不過大家剛松懈的神經此時又因為基地的自毀程序突然啟動再次緊繃了起來。
所有隊員背著戰友的尸體開始往外狂奔，一路上看到了許多頭部中彈的尸體，有基地防御人員的也有研究人員的，甚至還看到了幾只異形的尸體，不過均是一槍斃命。難怪逃跑的時候沒有發現一個活人，原來都被那名變態的隊長給干掉了。
當大家終于逃出基地後，巨大的爆炸徹底摧毀了整座需井。甚至出口處塌陷了10多米。任務雖然算不上成功，沒有舀到那種特殊的病毒，不過卻摧毀了整座研究基地也不算失敗。很快美國和華國的參戰人員就被本國趕來的直升機接走。而堡壘方面的人員也返回了登陸艙附近，被超時空傳送儀傳送了回來。當然沒人知道藥劑其實就在他們手中。
之後南非的戰斗就變得毫無懸念，在強大的三方聯軍面前。最終全球解放軍被徹底殲滅，雖然最後他進行了垂死掙扎，釋放了所有異形。甚至動用了生化風暴飛彈對聯軍進行了攻擊。不過導彈還沒等升空就被美軍的粒子炮和華國的核彈徹底摧毀了，最終而崔克斯博士也被聯軍活捉。正被送往國際海牙法庭審判，如果不出意外的話，絞刑是一定的了。
不過偏偏這個時候，進攻索馬里的部隊卻遭到了一支神秘部隊的重創。原來是科賽德王子的眼鏡蛇軍團和部分莊斯將軍的毒蠍團在此站穩了腳跟重組了全球解放軍的勢力。而他的部隊居然得到了一支數百萬的融合異形軍團的支持。而李峰通過各種偵測手段驚訝的發現，異形母體很有可能就在索馬里的摩加迪沙！
一場新的較量即將展開！
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