他嘗完一山花草，又到另一山去嘗，還是用木桿搭架的辦法，攀登上去。一直嘗了七七四十九天，踏遍了這里的山山嶺嶺。他嘗出了三百六十五種草藥，為天下百姓治病。哪怕是有毒的草藥他也會親自嘗一嘗，然後觀察自己的水晶肚，根據來親自治療，他把治療的方法寫了下來。
神農嘗完百草，為黎民百姓找到了醫病的草藥，來到回生寨，準備下山回去。他放眼一望，遍山搭的木架不見了。原來，那些搭架的木桿，落地生根，淋雨吐芽，年深月久，竟然長成了一片茫茫林海。神農正在為難，突然天空飛來一群白鶴，把他和護身的幾位臣民，接了下去。
往回走時一日被一群毒蛇圍住。毒蛇一起向烈山氏氏撲去，有的纏腰，有的纏腿，有的纏脖子，想致烈山氏氏于死地。烈山氏寡不敵眾，終被咬傷倒地，血流不止，渾身發腫。這時嫦娥與後羿來到了神農的面前，施展法力趕走了毒物，拿出一枚丹藥救了神農，神農感激涕零，高聲向師傅道謝，哪知，一張口，仙丹落地，立刻生根發芽長出一棵青草，草頂上長出一顆紅珠。神農氏仔細一看，與仙丹完全一樣，放入口中一嘗，身上的余痛全消，便高興地自言自語︰「有治毒蛇咬傷的藥方了！」于是，給這味草藥取名「頭頂一顆珠」。後來，藥物學家給它命名為「延齡草」。
神農回到陳都後，開始專心書寫《神農本草經》。可他的兩個女兒，卻相繼出事了。有兩個女兒，大女兒叫瑤姬，小女兒叫女娃。她們一直和父親一起幸福地生活著。有一天，女娃駕著一只小船去東海游玩。突然大海變的波濤洶涌，白浪把她的小船打翻。女娃因為太小沒有經驗，來不急施法術自救，就被海浪無情的吞噬了。
她的姐姐瑤姬在一旁看到，急忙趕往東海邊搶救。但，大海茫茫，哪有妹妹女娃的蹤影？女娃雖然溺水，她的哀怨、不平的靈魂化作一只花腦袋，白嘴殼，紅色爪子的鳥，棲息在西方的發鳩山森林里，因為經常發著「精衛、精衛」的鳴叫，人們就管這種鳥叫精衛或精衛鳥。棲息在西方發鳩山上的森林里，然後開始它一天的工作，餃取一顆小石塊，或是一段寸余長的樹枝，從發鳩山飛往東海，把石塊和樹枝投入當年溺水的海面上，發誓要把東海填平。就這樣日復一日，年復一年，精衛鳥一直在填平著東海。這樣年復一年，日復一日的堅持著，一定要把東海填平。大海奔騰咆哮著，一條金龍飛來嘲笑它說︰「小鳥呀，你就是干上一百萬年，也休想把大海填平！」精衛在高空中答復金龍︰「哪怕是干上一千萬年，一萬萬年，我也要把大海給填平！」
原來這條金龍乃是東海龍王三太子，兩人曾經有過這麼一段過節。一次三太子跑到陸地上來游玩。走累了，就想騎馬，看到一旁的玩耍的幾個小孩。三太子將讓他們給自己當馬騎。而剛好路過的女娃，看到一個大孩子把小孩子當馬騎。小孩都累爬下了，大孩子還不肯罷休，就憤怒了。喜歡打抱不平的精衛走過去，指著大孩子的腦門怒斥道「你這個人太不知羞恥，欺負小孩子算什麼本事，有力氣，去打虎打熊，人們會說你是英雄。」
大孩子見精衛是個小姑娘，生得單薄文弱，根本不把她放在眼里。他從小孩背上跳下來，走到精衛面前說「我是東海龍王的兒子，你是什麼人？竟敢來管我！」精衛說「東龍王的兒子有什麼了不起，我還是炎帝的女兒呢，以後你少到陸地上撒野，小心我把你掛到樹上曬干。」
龍王三太子說「我先讓你知道知道我的厲害，往後少管小爺的閑事。」說著動手就打。精衛從小跟著父親上山打獵，手腳十分靈活，力氣也不小，見對方蠻橫無禮，並不示弱，閃身躲開對方的拳頭，飛起一腿，將龍王的兒子踢個嘴啃泥。龍王的兒子站起來，不肯服輸，揮拳又打，被精衛當胸一拳，打個昂面朝天。龍王三太子見打不過精衛，只好灰溜溜地返回大海。
而就在不久後的一天，精衛到東海中坐著小船游玩，正玩得十分開心，剛巧讓東海龍王的三太子發現了。他游過來，對精衛說「哪天在陸地上讓你撿了便宜，今天你跑到我家門前，趕快認個錯，不然我興風作浪淹死你。」精衛倔強地說「我沒錯，認什麼錯。」龍王的兒子見精衛倔強，根本沒有服輸的意思，立即攪動海水，掀起狂風惡浪，精衛來不及掙扎，就被淹死。
神農听說了女娃的事情後，淚流滿面，卻是毫無辦法。而瑤姬親眼目睹自己的妹妹被海浪淹死，也是自責不已。回來後，就一病不起，臥倒在床。來勢洶洶的病魔很快就將她擊倒在地。從此，她就只能躺在病榻上了，顯得非常憔悴。漸漸地，瑤姬已經病得站不起來了。
溪流邊，沒有了瑤姬梳妝的身影，溪流仿佛在嗚咽著；微風里，沒有了瑤姬靈動的身姿，微風仿佛也在呼喚著。漸漸地，瑤姬已經病得站不起來了。神農心急如焚，但卻束手無策︰自己雖是醫藥之神，但藥能醫病，卻不能讓人起死回生。
不久，瑤姬就死了，被安葬在巫山上。瑤姬是神農之女，有大氣運庇佑。就像精衛落水身死而化精衛鳥一樣，她的香魂飄到姑瑤山化作芬芳的瑤草。瑤草花敕黃，葉子雙生，果實似菟絲子。女子若服食了瑤草果，便會變得明艷美麗，惹人喜歡。這瑤草在姑瑤山吸收日月精華，千年後慢慢的修煉成了人形，就是人們一直以來所說的巫山神女——瑤姬。
神農的兩個女兒都要死了，雖然悲傷難過。但為了人族早日不再受到病痛的折磨，還是毅然決然的繼續書寫藥典。三年後終于完成了這部醫學著作《神農本草經》，天際間，功德金光飛落而下，落在了神農的身上。瞬間神農的修為就超越了準聖，達到了聖皇之位。
而在陳都感應到天降功德，便知自己的徒弟功德圓滿的嫦娥，也欣慰的笑了笑。就在她和後羿要回歸蓬萊島的時候，有接到簡雲的傳音。來到了人族的一個名叫白水的地方，來收她的第二個徒弟，此人名喚倉頡。
在此那個時候，人們結繩記事，即大事打一大結，小事打一小結，相連的事打一連環結。後又發展到用刀子在木竹上刻以符號作為記事。隨著歷史的發展，文明漸進，事情繁雜，名物繁多，用結和刻木的方法，遠不能適應需要，這就有創造文字的迫切要求。
嫦娥收下倉頡後，便讓他去神農手下當官。那時，當官的可並不會顯得威風，和平常人一樣，只是分工不同。神農分派他專門管理圈里牲口的數目、屯里食物的多少。倉頡這人挺聰明，做事又盡力盡心，很快熟悉了所管的牲口和食物，心里都有了譜，難得出差錯。可慢慢的，牲口、食物的儲藏在逐漸增加、變化，光憑腦袋記不住了。當時又沒有文字，更沒有紙和筆。怎麼辦呢？倉頡犯難了。
倉頡整日整夜地想辦法，先是在繩子上打結，用各種不同顏色的繩子，表示各種不同的牲口、食物，用繩子打的結代表每個數目。但時間一長久，就不奏效了。這增加的數目在繩子上打個結很便當，而減少數目時，在繩子上解個結就麻煩了。倉頡又想到了在繩子上打圈圈，在圈子里掛上各式各樣的貝殼，來代替他所管的東西。增加了就添一個貝殼，減少了就去掉一個貝殼。這法子挺管用，一連用了好幾年。
神農見倉頡這樣能干，有心栽培他成為下任人皇。于是叫他管的事情也是愈來愈多，年年祭祀的次數，回回狩獵的分配，部落人丁的增減，也統統叫倉頡管。倉頡又犯愁了，憑著添繩子、掛貝殼已不抵事了。怎麼才能不出差錯呢？
可是，他苦思冥想，想了很長時間也沒造出字來。說來湊巧，有一天，倉頡正在思索之時，只見天上飛來一只鳳凰，嘴里叼著的一件東西掉了下來，正好掉在倉頡面前，倉頡拾起來，看到上面有一個蹄印，可倉頡辨認不出是什麼野獸的蹄印，就問正巧走來的一個獵人。獵人看了看說︰「這是貔貅的蹄印，與別的獸類的蹄印不一樣，別的野獸的蹄印，我一看也知道。」倉頡听了獵人的話很受啟發。他想，萬事萬物都有自己的特征，如能抓住事物的特征，畫出圖象，大家都能認識，這不就是字嗎?從此，倉頡便注意仔細觀察各種事物的特征，譬如日、月、星、雲、山、河、湖、海，以及各種飛禽走獸、應用器物，並按其特征，畫出圖形，造出許多象形字來。想通之後，倉頡高興的手舞足蹈。
而不遠處的一座山峰上，出現一只鳳凰和一名獵人。鳳凰化作嫦娥，獵人化作後羿的模樣。嫦娥看著手舞足蹈的倉頡，笑著感嘆道「真是笨死了，我怎麼就收了這麼個徒弟啊！一點都不讓我省心，真是太不孝了。」後羿把嫦娥攬在懷里，刮了刮嫦娥秀美的鼻子。贊同的說道「的確，跟神農比，確實是比差遠了。」