「賢者之石呢！」剛剛清醒的貝羅就大喊大叫起來。李維費了好一會兒的功夫才把激動的貝羅重新按回地上躺好。艾利手里拿著一顆紅se的菱形石頭在貝羅眼前晃了晃，說︰「在這里，不用擔心。」貝羅看了一眼那發出血紅se光芒的石頭，然後再次爆發，身體掙扎著要站起來，「你騙我！這不是賢者之石！」然後貝羅就不動了，疑惑的看著自己的雙手，「我的魔法呢？」
「什麼魔法？」李維放棄了，坐在一邊。
「我剛使用了一個雷暴術，我的雷暴呢？」一邊說著一邊對著微笑的艾利揮手，只是揮動間的手上沒有半點魔法的影子。
「我的魔力呢？我怎麼感覺不到我的魔力了？」貝羅的神情變得恐懼起來。「火之jing靈，顯現出你原本的姿態！水中的……」貝羅像失心瘋一樣大聲的喊著各種魔法咒語。
「你能不能安靜點！」李維抬腳照著貝羅的**就是一腳。
貝羅一個前沖，沒有穩住直接跪在地上。他安靜了片刻，然後又行動起來。貝羅用細長的手指在地上飛快的畫起來，從最初的魔法回路到魔法陣以及最外圈的演算式。瞎忙了好一會後，貝羅放棄了，呆呆的坐在地上一言不發。
艾利看不下去了，他走到貝羅面前，把賢者之石放在貝羅的手中說，「你再試試。」
貝羅呆呆的盯著手里的石頭，模索著，又看看艾利，思考了片刻，然後抬手吐出了兩個字︰「火球。」然後一個巨大的炙熱的像太陽一般的燃燒著的火焰巨球就在半空中出現。灼熱的高溫讓周圍的光線產生了扭曲，相隔幾米的樹木以肉眼可見的速度干枯然後燃燒起來。除了施法者貝羅，李維和艾利都分別使用了魔法和煉金裝備來抵抗這恐怖的高溫。
好在貝羅並沒有打算長時間的維持這個禁術版的火球術。火球消失，而貝羅就像全身失去力量一樣癱軟下來，他低著頭，但的眼楮中卻散發著jing光，「原來是這樣！原來是這樣的！」看來聰明的貝羅已經發現了賢者之石的秘密。
「艾利！」貝羅勉強的轉頭，問，「這是真的賢者之石嗎？還是只是又一個煉金術師的玩具？」
艾利舉起右手，手掌與耳朵平齊，這是對神發誓的手勢，「我，艾利•懷思特，以我的靈魂發誓，這就是賢者之石！」
「好好好！」貝羅連續說了三個好，然後他緩慢的站起，面向艾利和李維，拿著賢者之石對準面前的兩個人。「你可沒想過要把賢者之石從我手上拿走吧？」
這個貝羅！李維在經過了昨天貝羅的突然的攻擊後，對這個奇葩魔法師的人品已經不做任何期待了，但李維也沒有擺出防御或者要躲閃的姿勢，他只是依舊懶散的坐在地上，背靠著自己jing心尋找的靠背，其實只是這偏僻樹林中一塊長的比較規則的石頭而已。李維早就在貝羅昏睡的一天里，同意加入艾利的隊伍了，接下按照計劃說服貝羅加入的事情，還是交給導致這一切的艾利去解決好了。
「聰明的大魔法師貝羅啊，我想您也一定知道，只要這賢者之石還是一塊石頭，那它就永遠不會屬于你。」艾利不慌不忙的對著貝羅說，「而且你還記得希爾城中我最後練成的兩個布袋嗎？那里裝著由我和李維身體信息煉成的兩個身體，最後可都是在你的魔法下死去的。于是在教會的眼中，你現在正是殺死了偷走賢者之石的我——艾利和李維的人，並且拿走了賢者之石，不用我再解釋你也一定知道教會會派出什麼樣的人來追捕你吧。」艾利絲毫沒有給貝羅說話的機會，「那麼，如果我能給你的是賢者之石里面的東西，而不是一個隨時可能被搶走的石頭，你願意加入我們嗎？」
一天前，貝羅第一次使用了賢者之石後，直接昏死過去。艾利只對李維說了句「李維，加入我，我給你目標！」之後，李維就心甘情願的帶著貝羅和艾利在太陽完全淹沒在大地下的時候離開了希爾城。在逐漸遠離希爾城往北方前進的路上，艾利向李維解說了自己的目的和賢者之石的真相。
最早的關于賢者之石的記載是在最早的神教教堂里的壁畫上。佔據壁畫七成身披七彩衣的神捂著胸口面露悲傷，角落里一個只有腰間圍著褐se獸皮的人舉著一顆紅se的石頭對著神。壁畫下有經文，神說︰「義人才有資格擁有之物被罪人玷污，世界將成地獄。」之後的壁畫上原本手拿紅se石頭的人把石頭放入一個盒子，然後跪在祭壇前懺悔，下方的經文是，悔過的該隱成為賢者。賢者之石的名字由此而來，而壁畫中的故事就是關于賢者之石最著名的傳說，人類先祖之一的該隱使用賢者之石中強大的力量讓神都受了傷。由此之後的研究和傳說都無意識的加深了賢者之石擁有強大力量的說法。隨著魔法文明的興盛，賢者之石就被外界形容成擁有無限魔力的神奇結晶。事實上在教會的研究中，賢者之石一直被認為是禁忌之石，因為在神教的聖典中有非常明確的記載，「義人偷食了智慧果，神剝奪其義人之身，將其趕出伊甸園，其為吾所有人類之祖先。」
根據兩個關于‘義人’的記載，賢者之石是曾經人類先祖擁有的東西，只是後來被剝奪了，所以神教曾擁有賢者之石的千年中，一直沒有人試圖使用賢者之石，是因為他們認為以現在人類的身份使用賢者之石是對神的褻瀆。這種情況持續到了另一塊傳說中的石頭出現——藍se的聖石。關于聖石的記載最出名的是在一本煉金術師的ri常筆記上。
「莫瑞林老師對著亡妻哭泣，他蒼老的身軀佝僂著，悲傷的低語，‘為什麼人會衰老，人會死亡？為什麼人不能像神那樣擁有不可思議的力量？我想要那種創造生命的力量！我的艾玲娜！如果我能擁有神的力量！你就不會離我而去了！’在悲傷的老師說這些的時候，教堂被藍se的光包裹著，人們四處張望著，尋找藍se的光源，卻只發現了教堂頂端象征神之眼的藍se寶石正散發著溫暖的光輝。或許神也被莫瑞林老師的悲傷感動了吧。」
在這段筆記標注的ri期上，歷史上的第一個魔法誕生了，那是一個現在看來不過算是中級魔法的冰凍術，筆記中的莫瑞林在不想愛人離去的情緒下無意識的冰凍住了他所愛之人的棺木。所以傳說中，煉金術師向聖石許願，這才有了魔法師的出現。
神教在知道這件奇怪的事情後就收回了被瓖嵌在那間教堂頂端的藍se石頭，于是在毫無準備的情況下，兩塊石頭融合了。第一個踫觸融合後的石頭的人是當時神教的一位傳教士，融合後的石頭消失在了他的身體中，他留下一句話後就消失了。在他消失的一個月中，整個世界都在震動，原本散落的大陸相互撞擊著連接在一起，河流被阻斷，山峰被移平，大量的生物在驟變的氣候和環境下死亡，包括人類。當這一切平息後世界就變成了我們現在看到的這個樣子。
在那之後的人類復興期，魔法作為新出現的事物迅速崛起。神教的學者們也終于通過那個消失了的傳教士留下的話中知道了真相，那位直接導致世界變成現在這個樣子的傳教士在離開神教的時候說︰「從今天開始，我就是這天地間唯一的義人。」
就在一百多年前，這位義人回到了神教，帶回了大量的筆記和資料，然後死去了。死前的他對當時的教皇說，「在找到生命樹前，不可融合義人之石。」為了保證這一點，他自己強行分裂了身體中的義人之石，紅se石頭留在了神教，藍se的石頭被拋出，消失在大陸的某處。
從那以後，神教就在研究萬全的重新融合義人之石的方法。根據那位已經死去的義人的筆記，他在自己活著的一千多年里無時無刻不在躲避著神的追捕，始終沒有找到生命之樹的他明白自己一定會被被神抹殺，所以他選擇了放棄，把機會留給其他人，于是他回到神教。隨著煉金術在生體練成上的發展，教會看到了比尋找生命樹更有希望的方法，于是神教聯合煉金術協會開始不死身體的研究，神教又共享了一部分義人對聖石的研究拉著魔法協會加入進來。于是這三個大陸上最大的非政權組織聯手開始了義人計劃。
艾利作為著名的生體練成專家也加入這個計劃，但是艾利並不希望義人再次出現在這個世界上，所以艾利偷走了賢者之石，開始了毀掉賢者之石的行動。李維並不認為義人有什麼危險的，上一次的義人出現雖然導致了大陸格局的改變，但也因為這樣的原因，魔法才能有飛速的發展。如果這一次義人出現，說不定大陸上就會有新的東西強大起來，這不一定是壞事。
艾利贊同李維保持樂觀的心態，但是他仍然堅持自己的目標。
「聖典上記載神創造了萬物，最後神覺得需要一個像自己一樣的生命來管理萬物，于是神照著自己創造了一個新的生命，也就是說神創造了另一個神，為了不讓新出生的神做自己不想它做的事情，神分離了新神的永恆的生命和學習的能力分別化作生命樹和智慧樹。神做完這一切後稱這個創造出來的生命為義人，就是完全的人的意思，直到人吃掉了智慧果，重新獲得了學習的能力，離神只差永恆的生命。神在義人剛剛獲得智慧還沒有發現永恆的生命的時候就剝落了人的義人之體並把人流放到永遠踫不到生命樹的地方。李維，用用你那智慧吧，神並不是什麼大方的人物，終歸我們這個世界史他創造的，毀滅對他來說也不是什麼難事！」
「有道理。」李維表示同意艾利的想法，接著問，「賢者之石和聖石的到底是干什麼的？」;