程毅看著眼前的有些眼熟的黑人大漢，問道︰「你是……」
那人走了進來坐在程毅的身邊，自我介紹道︰「我叫墨菲斯，你好，程毅！」
「你……你知道我的名字？」听到墨菲斯叫出自己的名字，程毅詫異的問道。
「我還知道很多，特別是對于現實我知道的遠比你要多！不過這些問題以後你也會慢慢了解！怎麼樣？你現在可以走動嗎？」墨菲斯說道。
程毅點了點頭，說道︰「是的！當然，沒問題！」
「恩！跟我來！現在你自己可以去看看現實了！」墨菲斯站起身來說道。在墨菲斯的帶領下走出了房間。
「這是我的船，尼布甲尼撒號，是艘氣墊船。不過現在出了些故障暫時不能行動了！」墨菲斯便解釋道。
听著墨菲斯的介紹程毅腦海中頓時就顯現出在黑客帝國第一部中關于尼布甲尼撒號的介紹，在黑客帝國中錫安的每艘船的名字都有特別的含義。比如尼布甲尼撒號，是用巴比倫的智慧之神的名字命名的。在聖經中尼布甲尼撒是巴比倫的國王，曾近找人解夢，在黑客帝國中墨菲斯等人就是坐著尼布甲尼撒號去找尋先知闡釋什麼是現實。
不一會兩人便來到了尼布甲尼撒號的主控室。
「這里是核心地帶，我們就是通過這里黑進母體！」墨菲斯解釋道。
和電影中一樣，這里完全沒有船應該有的樣子。與其說是船不如說是間工廠，只不過在中間有著一台結構復雜的「電腦」。主控室一個黑人小伙坐在電腦前，身旁是站著兩個白人一男一女。
墨菲斯向程毅介紹道︰「這位是林克，我們的接線員！至于他們倆是尼奧和崔尼蒂！」
「他就是尼奧，救世主！和電影中一樣帥啊！至于崔尼蒂，額！好吧！可能是東西方的審美觀不同吧，真沒看出來他那里吸引人！」程毅心里對兩人評價道。
程毅對眾人點了點頭，說道︰「你們好，我叫程毅！」
「林克！錫安出生的人類，和你有些區別！很高興見到你！」林克笑著說道。
尼奧也主動的走上前問道︰「你好，我是尼奧！和你一樣都是母體中的人類！」而崔尼蒂只是冷冷的對程毅點了點頭。
這時墨菲斯走了過來，對程毅說道︰「毅！我現在必須告訴你我們的處境！錫安危在旦夕，所有的一切都超出了我們的判斷，包括你的出現！」
「恩！？不好意思，我听的有點蒙，你能在詳細的解釋一下嗎？」程毅問道。因為在程毅的印象中在第三部尼布甲尼撒號應該已經被摧毀了，而且尼奧也被困在了一個車站之中。但是現在尼奧還站在記得面前，尼布甲尼撒號也沒有被摧毀！
林克在一旁解釋道︰「總是你和我們現在的處境都非常危險就對了，原本接回尼奧和崔尼蒂後我們準備返航，但是這時你就出現了！」
「你是第一個能獨自月兌離母體的人類，我能感到你的特殊，我想你應該對我們有所幫助，所以就臨時改變主意把你接到了船上！」墨菲斯說道。
听到這程毅算是知道怎麼一回事了，現在這段場景應該出現在黑客帝國2的片尾，也就是說是在尼奧見過設計師救了崔尼蒂後自己才出現的。
「好吧！我承認我還是听不懂你們在說什麼，不過如果我能夠幫到你們什麼我一定會盡全力的，那怕死也不怕，畢竟無論在母體還是現實我都沒有任何親人了！」程毅說道。
「很好！」墨菲斯微笑的點了點頭，然後說道︰「現實中還是有人類的，我們都是你的族人，如果我們還能活著就一定會帶你去錫安！我們人類最後的家園！」
程毅笑了笑，說道︰「我想一定會的！」
就在這時，崔尼蒂突然說道︰「墨菲斯，下一步我們該怎辦？」
林克在一旁說道︰「按照墨菲斯說的，現在戰爭應該結束了！但是……」
「但是顯然不是這麼一回事？」尼奧接著說道。
墨菲斯走動著，說道︰「我不明白！一切都應該有定規！救世主一旦到達代碼之源，戰爭就應該結束！」
尼奧顯得很沉重，開口說道︰「24小時之內就會結束！」
「什麼？」眾人詫異的看著尼奧。
尼奧接著說道︰「如果24小時內我們不采取措施，錫安就會遭到毀滅！」
「什麼？」林克立刻站了起來，詫異的看著尼奧。
崔尼蒂也問道︰「你怎麼知道？」
墨菲斯看著尼奧，堅決的說道︰「不可能，預言……」
「可那不是真的，墨菲斯！」尼奧立刻反駁道︰「預言是謊言，救世主不能終結任何事！」
尼奧這話一出口眾人都呆了，而一向沉穩的墨菲斯也顯得有些無助。程毅在一旁看著知道自己應該說幾句了。
「那個，各位！不好意思，打斷一下！我雖然是個新人，但是從你們的談話中，我听出了一些端倪！我能說幾句嗎？」程毅小心翼翼的問道。眾人都看著程毅，尤其是崔尼蒂冷冷的眼神看的他有些發毛。
稍許，墨菲斯的情緒也穩定了，開口說道︰「可以！」
「或許我是小看了現在人類所面臨的的處境。而且從尼奧的話里得知似乎一切都已無法挽回，但是我卻不認同你的話，很抱歉尼奧！我知道作為一個新人我不應該這樣說！」程毅歉意的對尼奧說道。
尼奧笑了笑，說道︰「沒關系！你繼續說！」
程毅又接著說道︰「在母體中，我的一切都被束縛著，甚至有時候連思想都被禁錮，但是我依舊逃了出來！我不喜歡被控制的感覺，我想擁有自由的呼吸，為了這些我可以不顧一切，或許對于我們人類來說那些機器可以輕易撕碎我們，但是面對身處現實世界的我，他們休想在控制我的思想！我不知道什麼預言？不明白什麼人說的什麼話？我也不想知道不想明白，我只想有個人告訴我，敵人是誰？我就會拼盡全力去干掉他，我們的祖先生活的這片世界就由我們這群後人來保護！」
「好！你說的對！毅！」林克激動的站了起來，說道︰「沒錯，錫安是我們的家，那里生活在我們的親人！我才不管什麼語言，我一定會保護好我的家！」
墨菲斯、尼奧和崔尼蒂雖然沒有說話，但是他們看待程毅的眼神卻發生了改變……
墨菲斯走到程毅身前看著他，然後對林克說道︰「林克！我們有許多事情要做，現在毅可以先去學習一些東西！我想你可以幫助他！」
「當然，我非常樂意！雖然我們的船不能動了，但是其他的功能還可以照常工作！」林克走了過來，然後對程毅說道︰「毅！來吧！我帶你去見識點好玩的東西！」
程毅當然知道林克最終所謂好玩的東西是指黑客帝國中特有的學習方式，通過磁盤中編寫的不同程序把相對于的知識直接傳送到人類的大腦中。程毅早就想試試了，因為教學系統中也有著類似的功能，程毅很想知道兩者有什麼不同。
兩人來到電腦前，而墨菲斯、尼奧和崔尼蒂則去了另一個房間。
「好吧！毅！你可能沒有嘗試過這種新鮮的玩意，不過你千萬不用擔心！首先你先躺下！」林克指著身邊的椅子說道。
程毅躺了上去，問道︰「這樣就行了嗎？」
「哦！不不！還沒開始呢！」林克說道，然後他拿出一疊的磁盤不停的挑揀著，嘴里說道︰「不得不說，你和尼奧兩人運氣都不錯，按說你們應該先學習船上的內容，但是很顯然目前的狀況你們更應該學習保護自己！好的，先來點這個！」
林克說完便把磁盤放了進去，這時電腦出現了學習的內容——詠春拳！