和忠亲王分别后，吴青又投入到繁忙的工作中。资善堂和国子监都要授课，常朝也恢复正常了，书肆和庄园方面也需要时常看顾指点。而到了夜深人静的时候，吴青总会不自觉地想起忠亲王，想起那天他来告别的场景。
谁知，没过几日，从幽州发来了急报，说运河沿线爆发天花疫情，劳工患疫而死者不可计数，且有向南扩散的趋势。
皇帝紧急召开廷议，商议如何控制疫情。经过众臣合议，太医局将派良医赶赴疫区检视，根据病症配药赐与疫民，药费由朝廷无偿拨付。在疫区各级军队派驻“住泊医官”，并在各郡县设立官办药局，防止疫情泛滥。
吴青全程参与了这次廷议，听到这样的处理方案，深觉仅以这样的措施恐怕难以控制天花疫情的蔓延。想到忠亲王就在疫区，吴青心忧不已，忙越众而出，向皇帝请缨欲前往幽州治疫。
皇帝看了眼吴青，忙摆手道：“不是朕信不过吴卿的能力，只是这天花疫症异常凶险，吴卿身为女子，身娇体弱，万一沾染上天花，会危及性命的，这可不是开玩笑的！”
吴青忙回道：“回禀陛下，微臣早在进宫前就已接种‘牛痘’，今生不会沾染上天花，陛下无需替微臣担心。如今幽州疫情严重，正是臣等为陛下分忧的时候，微臣虽身为女子，也不愿落于人后。”
皇帝听吴青说到牛痘，疑惑的问道：“接种‘牛痘’，这是怎么一回事？”
吴青回道：“回禀陛下，去岁微臣曾进献过两本医书，一本是《时疫论》，一本是《急救方》。其中《时疫论》一书是由微臣收集民间及海外制疫之法总结而成，其中就有记载用‘牛痘法’预防天花。此法微臣已亲身试过，确实有效。此外，书中还记载了怎样控制疫情的方法，十分详尽周全。对于时疫微臣做过很多了解，派微臣去控制疫情，是最合适的人选。”
皇帝点点头，说道：“朕想起来了，吴卿确有献过此书。当时朕还专门传召了太医局任博士点评此书。朕记得任博士给出的评语是‘全书过半皆为荒诞之言，若要推行至全国怕是不妥’，所以朕便打消了让国子监书库印制此书的念头。今日吴卿提起此书，朕倒是想问一问，你说的方法确实可行吗？”。
吴青回道：“不敢欺瞒圣上，微臣愿以项上人头担保，《时疫论》一书虽然有很多惊世骇俗的防治疫情之法，但却并非无稽之谈。今次幽州天花时疫，微臣可以用事实来证明微臣并非枉言。微臣再此恳请陛下能允准微臣前往疫区。”
这时，吏部尚书却出列向皇帝提出反对意见，他说道：“启奏陛下，救疫一事非同小可，若举措不当，死者恐逾万众。吴学士年纪轻，不知其中的厉害深浅，为了立功不顾疫情紧急，只一味争强显胜，实属不该，还请陛下明察。”
皇帝沉吟片刻道：“朕知吴卿绝非贪功冒进之辈，章爱卿怕是过虑了。吴卿忧国奉公，其情可嘉。朕就任命吴卿你为治疫使，前往幽州主持救疫。”
吴青听到皇帝准了自己的请求，心中一喜，忙领旨谢恩。
章尚书见吴青获准，心有不甘，向皇帝陈情道：“启禀陛下，吴学士不通岐黄之术，恐难当此大任，还请陛下派请太医局专研痘疹的太医前往疫区检视配药，以免耽误了疫情。”
皇帝抚须顿首道：“章爱卿此话有理，朕便将太医局痘疹科的所有医博士派往幽州，协助吴卿治疫。”
吴卿忙跪下领旨，接着又目光灼然，字字铿锵地向皇帝说道：“微臣斗胆，向圣上再请一旨。微臣资浅齿少，恐难服众，恳请圣上予臣专断之权，以便主持救疫。”
此话一出，众臣皆惊，皇帝亦骇然，半晌才说道：“吴卿可知此事责任重大，你若要专断之权，就需承担一应后果。时疫猖獗胜于猛虎，实非一己之力可以阻扼，吴卿当量力而为。”
吴青忙叩首说道：“微臣定当竭尽心力，全力以赴，还望陛下能应允微臣的请求！”
皇帝见吴青成竹在胸，不似一时逞强，遂点点头说道：“吴卿胆识过人，朕便准你便宜行事，见机专断，幽州各级官员及军队全部听命于吴卿调度。京中所派医官亦任由吴卿差遣。”
由于事态紧急，不容耽搁，吴青一下朝就向三殿下借来果儿和巧儿，又向周大监借了魏云。回到家简单收拾了一下行李就领着一行人连夜赶往幽州。
在路上，吴青又派遣骑兵先行一步，传达她的指令。
第一条：命疫区各郡县安排僻静的庄园或寺庙道观充作安济坊，作为染疫者隔离之所。
第二条：在城门和各要道，严格排查所有出入者有无出疹或发热的病患，有疑者需强行单独隔离于空邸，满十六日排除身患天花的可能方可释放。
第三条：城内以坊为单位，城外以里为单位，普查有无病患。已出痘者为熟身，未出痘者为生身，疑似或正在出痘的为疫身。熟身除却老弱，全部征调为义工，或负责收殓掩埋无主尸体，或安排照顾安济坊染疫的病患。生身严禁外出，各自以家宅作为避痘所。而疫身需尽快集中到安济坊隔离，所有接触过疫身的家属四邻需在空宅单独隔离观察。
第四条：运河工地由当地医官检视，排查疫身。
一路上，吴青一行马不停蹄，日夜兼程，终于在第五日赶至疫情最严重的涿县。忠亲王和幽州刺史亲自来迎，吴青也不多言，直接询问灾情。忠亲王眉头紧锁，回道：“据我所知，仅涿县已经确诊的染疫病患已经过千，且每日还在增长。现在我们还没有找到可以控制疫情的方子，情势十分危机。”
吴青问道：“忠王殿下，不知我先前传达过来的指令是否已经执行了？”
幽州刺史忙回道：“已然吩咐下去了。”
吴青说道：“这些举措十分重要，还请刺史大人能加以重视。另外，天花已防为主，这次我带来的牛痘法还需找到接种源才行。”转头吴青又对魏云说道：“魏大哥，你是见过得了牛痘的病牛，这样，你带着他们去寻找一下，看附近一带是否有患了牛痘的病牛。一旦找到，立刻带过来为生身接种。”
魏云答应了一声，忙领着一群官兵离去。
忠亲王看魏云离去，忙向吴青问道：“吴学士，不知道本王可以做些什么？”
吴青说道：“忠王殿下应该还没有得过天花，对天花并不免疫。这天花疫情异常凶猛，不分男女老少，官民贵贱。殿下责任重大，不可以身犯险，所以还请殿下千万不要靠近患有痘疹的病人，以免感染。现在军队也有感染疫情的危险，而军中人员密集，传染速度极快，殿下当务之急就是严防疫情蔓延至军营。若军队染上疫病，恐会影响边关安全，此事也是一等一大事，还需殿下亲自坐阵。”
忠亲王忙又说道：“现在疫情紧急，我怎可因为自己的安危躲在军营逃灾避难，这委实说不过去……”
吴青双目圆睁，斥道：“殿下糊涂，防治疫情绝非凭靠勇气，而要讲究方式方法。我已说过，天花无药可治，只能以防为主。好在军队尚无病例，殿下若守好了军营门户，也算是为控制疫情做出了贡献。其他的事情我自然会来处置，殿下无须担心！”
接着吴青又取出皇帝颁下的旨意向忠亲王和刺史宣读了一遍，说道：“从现在开始，幽州所有官兵都要听从我的调遣。忠亲王，还请您立刻回军营坐阵，每日遣医官和医技排查军中将士，严防天花。刺史大人，您安排一位熟知情况的医官领我和各位京中来的医博士去各处视察一番，我们好商量对策。”
幽州刺史听完，忙吩咐身旁的随从去叫人。而忠亲王见吴青态度强硬，说的话也在理，便不得不拱手告辞。