人类科技飞速发展，早在二十三世纪，便已经进入太空时代，然而，太空中恶劣的环境以及层出不穷的强大生物，却令人类束手束脚。
二十六世纪，生物智脑问世，联邦启动智脑战士的秘密实验，然而，一连数百年，均以失败告终。
二十九世纪，随着基因智脑的出现，智脑战士终于成为可能。
基因智脑，以基因为存储原件，以光子为运算单位，拥有超高速计算能力，最大的特点，是能够不断分裂增长，植入智脑战士体内之后，可以将其基因逐步改变，在这个过程中，智脑战士的实力会不断提高，直到全身基因被改造完毕，智脑战士才算进化成成熟体，此时的他们，拥有极强的力量。
智脑战士最厉害之处，还是他们强悍的适应能力，这让人类星球移民的计划得以实行。
智脑战士最大的缺点，则是基因智脑与人类战士的融合成功率不高，这导致他无法普及到整个人类，只有少数杰出的战士才能融合成功。
2999年，跨入新千年前的最后一年，联邦第一批智脑战士培养成功。
寂静的太空中，星光永恒，但夜色，却笼罩整个宇宙。
一艘飞船，以三分之二的光速，穿梭于夜幕下的宇宙中。
α－神农星号探索飞船，联邦政府直属飞船，探索未知星球专用飞船，长三十米，可容纳四名探险员，不过，此时α－神农星号上，仅有一名乘客。
莫休，成熟体智脑战士，是联邦战士中，第一个达到成熟体，也是目前实力最强的智脑战士，曾多次执行绝密任务。
三个月前，因为一项秘密实验的失败，α星系神农星自转方向发生三十度偏转，导致此星球上所有三千名研究人员丧生。
此次，莫休的任务，就是进入α－神农星，探查失败的原因，更重要的是查看α－神农星的状态，以决定是否放弃α－神农星。
此时，飞船已进入α－神农星的大气层。
“警告！警告！发现不知名能量波动，能量庞大，建议立即启动空间跳跃！”
莫休一惊，这是基因智脑的警报，从未出过差错，因此，他毫不犹豫的下了命令。
“启动空间跳跃！”
然而，下一刻，庞大的能量自α－神农星上喷涌而出，将飞船淹没。