云城，原本是罗云建立的一个人类和感染体共存的巨大城市，甚至，通过各种方式，几乎成为现世的一个传说中的都市。可是，在一起丧尸的围攻下，城市的人死伤惨重，最终不得不撤离这里。不过，在离开的时候，云城的人都始终记得那句话，我们还会回来的。现在，就是他们实现这个心愿的时候了。
在离开云城一段时间后，发生了许多事，甚至让罗云自身都陷入危机之中。不过，云城依然再一次壮大起来，无论背后隐藏着多少秘密，它的实力比起从前，几乎是强大了几十倍。拥有一商城为主的指挥型城市，下属完全接受其统治的，还有几十个大小村落和十多个人类幸存者基地，甚至还有一处正在修建的大型城市。
在上一次救援三十万人的基地，和近百万丧尸战斗之后，时间很快就过去了一个多月，中间虽然还有不少小规模的战斗，大多都是云城为了巩固统治区域，展开的清剿作战，清剿的目标主要是那些未受控制的野生丧尸群，还有侵犯云城所属的黑暗军团部队，当然，其中也包括一些敢于袭击云城所属的人类幸存者。按照云城公开的声明，几个被消灭的人类幸存者基地，都是以抢劫商队，夺取其他幸存者物资的强盗团伙基地，所以，云城为了维持统治区的秩序，不得不对这些人类中的败类份子进行清剿，来保障更多幸存者的安全。
此外，就是云城的军事扩张行动。储藏在各地的武器弹药，在救世军混编部队的行动下，一点一点的被聚集起来，然后召集更多的勇敢的士兵，训练新的作战部队。对于越来越广阔的领土，原有的部队显然不足以完全控制。何况，还有那个不断袭扰人类的黑暗军团存在，救世军就必须进一步的增强实力。
这里，让潘兴等获救的人类基地领导感到可惜的是，那些被黑暗军团围困的五千人物资收集部队，似乎来不及等到救世军的救援，就被黑暗军团完全消灭了，而且，连可以找到的尸骨都没能留下多少，五千人的人类战士，这个损失，对于现世的人们来说，也是非常巨大的。
当然，五千人是不是真的被黑暗军团消灭，仅仅是更具现场搜索的情况，猜测出来的结果而已。实际上，五千人的人类战士，在被包围，并击败之后，还有三千多人幸存了下来，而且大部分在武力威胁下，不得不加入黑暗军团，成为那些戴着面具的特殊成员。在很长的一段时间里，这些臣服于黑暗军团的人类，不得不指挥着感染体对同样的人类发动攻击，而他们操纵感染体进攻的方式就如同和恶魔签订了契约，并化身成恶魔的仆人袭击人类，最终，这些被迫服从黑暗军团的面具战士，被人们称作黑暗契约者。同时，云城那种同样是人类和感染体达成契约，并接受控制的人类，则被称作契约者。如同光明和黑暗的对立存在一样，只是……
完全由感染体和少量人类战士组成的黑暗军团，避开了救世军的主力，转向其它地区发动袭击，进一步让已经饱受丧尸和变异生物摧残的人类幸存者们遭到沉重的打击。新的高智慧丧尸，有预谋的战术进攻，让人类幸存者基地每天都沉浸在水深火热之中，那些远离云城和救世军的地方，对于希望救世军出兵支援的呼声越来越高，这些结果都按照寄生体临汾公主的计划，不断的发展着。
在另一方面，陨石产生的特殊感染体，也在快速的进化变异，虽然，最初的统治者小宇最终被罗云消灭，可是在一段时间之后，新的统治者在特殊感染体中产生。这些被陨石影响的特殊感染体，和普通的感染体有着完全不同的本质，无论是感染体中的领导者也好，罗云这样的特殊人类也好，甚至于寄生体临汾公主这样的千年丧尸，都无法控制它们，甚至无法建立更直接的联系。可是说，这些被陨石影响的特殊感染体，就像是在人类和感染体之后，又一次出现的新的可怕生物，而这种生物则是由感染体被影响后产生的，就如同最初人类被病毒感染成为感染体一样。它们不但袭击人类，甚至袭击感染体，因为它们的食物范围，甚至扩大到连丧尸和变异生物都可以吞食。
对于这种不受控制，并且可以把感染体当作食物的怪物，临汾公主当然无法容忍它们的存在，这也是临汾公主突然放弃征服更多人类，而想要先对付这些特殊感染体的原因之一。
可以说，在长达一年多的变化之后，现世的生物，渐渐的被分成三大类，一种是对病毒产生免疫，没有受到太大影响的普通生物，比如正常人类，虽然有些变异，却依然和从前一样可以食用的动物和植物。第二种就是丧尸群和变异生物，还有出现变异，甚至可以吞噬生物的植物，它们被统一称作感染体。而第三种，则是被存在于世界各地的奇怪陨石所影响的，由普通感染体产声的特殊感染体。这三类，基本就是现世依然存在的生物构成的主要部分。当然，还有许多更加特殊的进化和变异，当那些都是少数，毕竟病毒寄生体带来的进化和变异，永远都会出现无法预料的结果。
好在，虽然这些特殊感染体进化的相当快，但是毕竟才经过了短短的几个月，依然停留在为了生存而生存的本能上。由于云城留下大量的食物，还有能够快速繁殖和生长的变异猪和变异兔子，使得数量并不算太多的特殊感染体在满足生存需求的基础上，并没有向其它地方扩张。
要想夺回云城，首先要做的就是把这些特殊感染体消灭掉，然后破坏陨石，或者把陨石再次封闭起来。但是，这数万丧尸的能力却异常强大，而云城这边，为了避免更多的丧尸被陨石影响，反过来攻击自己人，只能派遣以人类战士为主的部队。
何成，在并入云城之后，继续担任有进化者组成的部队的指挥官，不过，现在的进化者部队，被改称为特种部队。由于他之前的优秀表现，甚至连临汾公主都对这个人类有深刻的印象，所以在伤好之后，立刻被提拔上来，负责协助管理所有加入军队的进化者，也就是说，新成立的特种部队的总指挥。
这一次，来自各地被召集起来的进化者，人数已经超过三千，而且都是经过挑选，其能力适合作战的进化者。比如，基础能力强化型的，拥有比普通人更强的力量，体力，速度等等，特殊能力型的，比如简单的控制感染体，心灵感应等等。这些进化者和普通的人类战士混编，组成一支特种部队，专门用于对应无法派遣感染体参与的战斗。虽然说，特种部队的成立，主要是为了夺回云城，不过考虑到将来可能会遇到更多这样的环境，所以即便不是为了夺回云城，特种部队也有成立的必要。
而此刻，何成的老搭档黄楚，正带领着一支侦查小队，潜伏在云城的周围，收集着城内特殊感染体的信息。侦查队伍里，除了拥有精锐的战士外，还有一些特殊能力型的进化者，可以和丧尸建立意识联系，获取更多的信息情报。
不过，这些特殊的进化者，似乎并不能和更高级的特殊感染体建立意识联系，仅仅是获得外围的一些最底层的特殊感染体情况。不过，虽然得到的情报不多，还是被他们发现了一件事情，那就是，整个云城的特殊感染体，似乎已经打算开始一次对外攻击的行动了，似乎新产生的统治者，突然打算扩大它们的生存领域，增加同伴的数量。而最让黄楚他们感到惊讶的是，特殊感染体的攻击目标，居然是被感染体占据的另一个人类沿海基地。
这些情报被传回指挥中心的时候，林维安吃惊的发现，那个沿海能力基地，居然就是从前云城的老对手，丧尸倒霉熊围攻的人类基地。根据李军他们带来的情报，沿海人类基地似乎已经被攻破，里面的幸存者好像都撤离了，据说是从海上撤离的，至于具体去了什么地方，却没有人知道。所以，现在沿海基地里，完全是感染体占据着，而这些感染体的统治者，则是丧尸倒霉熊。很长一段时间没有遇到这个老对手，估计它的实力应该更进一步了。
得知这个情况之后，林维安不得不考虑针对这个新变化做出战术改变，比如，是否暂停进攻云城，让特殊感染体和感染体之间自相残杀，等到最后，他们再趁机袭击两败俱伤的敌人。
“我觉得这个办法最好，可以最大程度的将少我们的牺牲。”潘兴看着地图说：“而且，如果那些占据云城的特殊感染体主动出击的话，云城那边的敌人力量就会大幅度减少，也是我们夺回云城的最好机会。不过，唯一要考虑的就是，这种特殊感染体和普通感染体之间的实力，究竟有多少差距，而且，情报说特殊感染体本身就是由感染体转变而来，万一那些……嗯，叫做丧尸倒霉熊带领的丧尸群被轻易打败征服的话，只怕我们真正要对付的敌人特殊感染体，反而会大幅度的增加实力。所以，我们是不是有必要在关键的时候，稍微协助一下这个丧尸倒霉熊的丧尸群。”
林维安思考了一下说：“我看这个建议不错，根据我们获得的资料，这个被城主叫做倒霉熊的丧尸，似乎和城主之间有着很特别的感情……嗯，甚至我们派往沿海基地的一支观察队，在基地被攻破前，逃离基地的时候还被它抓住。可是它在知道是云城的队伍之后，居然放过了没有受伤的三名战士……也许，我们可以尝试和这个特别的丧尸领导者联系一下。”
“不过和丧尸群联系的话，我们要派什么人去比较合适？”虽然有人这么问，不过大家的目光都看向丧尸小林，似乎和丧尸中的领导者联系的话，作为云城所有感染体的实际控制者，丧尸小林是最合适的人选。可是，目前丧尸小林还有很多更重要的工作，无法轻易离开商城。
这时，丧尸小林用越来越顺畅的人类语言说：“还有其他人选……我的部下小吴非常合适这个任务，他现在正在训练带领我们新成立的狼骑兵。这次夺取云城的战斗，可能用不上他们，不如让他和狼骑兵去和倒霉熊联系，顺便协助作战。”
一阵商议之后，大家通过了这个计划，然后各自散开去执行自己的任务。会议之后，不知不觉中，大家都在心里有了一些奇怪的感觉，人类似乎从最初的和感染体完全对立的战斗中，出现了一些新的转变，从控制，到现在的试图合作……似乎，人类和感染体之间的敌对状态，正在随着时间一点一点的改变着，不在是从前那种单纯的为了生存而残杀，在感染体的智慧越来越高之后，开始渐渐的出现有目的的对抗……