“吴孙权太元元年八月朔，大风，江海涌溢（疑为海啸），平地水深八尺，拔高陵树二千株，石碑蹉动，吴城两门飞落。……明年，权薨。”（《晋书-志-第十九》）这段史料记载的意思为，凡帝王之死都是有预兆的。这年十一月，孙权祭祀南郊，回来后得了中风病。
太元二年（252年）正月，孙权封孙和为南阳王，遣之长沙。二月，改年号为神凤，实行大赦。
潘皇后性情刚戾，孙权染病后，潘后派人向中书令孙弘询问西汉吕后行使皇帝权力之事。潘后左右之人不堪忍受她的虐待，乘她昏睡之机，把她勒死，又宣称她是暴病而死。
晚年的孙权“多嫌忌，果于杀戮”，日益骄奢，宠信吕壹，丞相顾雍无故被杀，大将军陆逊忧愤而卒。且赋役繁重，刑罚残酷，人民经常起义反抗。在立太子方面，孙权也犯了很大的错误（接班人没选好）。这为后来吴国的政变埋下了祸根。使本已凸显的内部矛盾更加复杂化，其身后的吴国最终沦落为党争剧烈、暴政盛行的黑暗王朝。
神凤元年(252年），也就是“疑为海啸”的第二年，孙权病情危重，召诸葛恪、孙弘、滕胤以及将军吕据、侍中孙峻等人入卧室内，嘱托后事。四月，孙权——雄踞江东的杰出政治家病死于建业宫中，享年71岁，在位24年。加谥号为大皇帝。葬于南京中山门外钟山之南的小山上，这是南京地区最早的六朝陵墓。孙权因避祖父孙钟名讳，而将钟山改名蒋山，孙权陵因葬在蒋山而称作蒋陵。是山遂名孙陵岗，又称吴王坟。庙号太祖。谥曰大皇帝。
之后孙权的夫人步氏、后妻潘氏及太子孙登也移葬这里，即今之梅花山。孙权墓是南京地区最早的古代帝王陵墓，但并不豪华，陵前无神道，墓上无建筑。以后，明朝开国皇帝朱元璋、太子朱标也葬于孙陵岗附近的山上，后人在山上种植了大量的梅花，俗称梅花山。目前植梅面积410亩，品种230个，总株数达13000余株，规模堪居全国之首。
为纪念孙权，有关部门在梅花山东麓新建了一座孙权故事园。园中心是一尊高大的孙权石像，高5.1米，石像西南侧，有一座扇形孙权故事画廊，嵌有12幅孙权故事浮雕石刻，生动再现了东吴大帝纵横驰骋的一生。
近年来，有关部门利用现代精密磁测技术，对整个梅花山进行了全面的调查勘探，结果发现，在“博爱阁”南侧附近有巨大地下构筑物，呈“甲”字形状分布，且墓道之门可能向西。专家们初步推测，这一构筑物极有可能与孙权陵墓有关。
相比楚威王熊商在金陵置邑来说，孙权开创了在南京建都的先河，还修建了如此金碧辉煌、规模宏大的东吴宫城，对后来其他王朝在南京建都立国产生了十分重要的影响。
《妃嫔传》选录：
①吴主权谢夫人，会稽山阴人也。孙权元配，没有生子，抚育了孙权妾生的儿子孙登。父亲谢煚是汉朝尚书郎、徐县县令。权母吴夫人为孙权聘谢氏为妻，谢夫人很得孙权宠爱。后孙权娶姑母孙女徐氏，要谢夫人屈居徐氏之下，谢夫人不肯，渐失孙权欢心，抑郁而死。孙登卒年33岁。
谢夫人去世10年后，其弟谢承被任为五官署郎中，后升为长沙郡东部都尉（职位次于将军的武官）、武陵郡太守（州郡最高行政长官），撰写《后汉书》100多卷。
②吴主权徐夫人，孙权的表侄女儿，虽然是位二婚，但是仍然使谢夫人失宠。当初，徐夫人本已嫁了同郡的陆尚，岂料陆尚早死，孙权就把她娶过来，她抚育孙登，使之当上太子，群臣看到这种情况，就建议孙权立她为后，由于徐夫人爱吃醋，所以孙权未同意，后来又将她废了。
③吴主权步夫人，淮阴美女，与丞相骘同族。孙权夫人之中最漂亮的一个，她最大的优点是不爱吃醋，不但不与其他夫人争宠，反而经常给老公介绍靓妞，孙权也因此最宠爱她。步夫人生有鲁班和鲁育两位公主。长曰鲁班，字大虎；少曰鲁育，字小虎。孙权追封其为皇后。葬于蒋陵（今南京紫金山麓）。
④吴主权王夫人，琅邪人也。黄武年间选入官中，生孙和，得宠程度仅次于步氏。步氏去世后，孙和被立为太子，孙权欲立王夫人为后，步氏长女孙鲁班素来憎恨王夫人，就不断在孙权面前诋毁她。孙权卧病，孙鲁班又说王夫人面露悦色，孙权大怒，对王夫人痛加斥责，王夫人无从辩白，在忧惧中去世。孙和子孙皓被立为帝，追尊王夫人为大懿皇后。封三弟皆列侯。
⑤吴主权潘夫人，会稽勾章人。父亲是一名官吏，因犯了法被处死。潘氏和妹妹被一起送进了官府的织布作坊。一次，孙权看到了潘氏，喜欢上了她，便将她召入后宫。潘夫人受到孙权的宠幸后，有了身孕。一天，潘夫人梦见有人将一龙头交给了自己，她把龙头接了过来，不久便生下了孙亮。
潘皇后虽然妩媚动人，性格中却充满野心。想方设法要把袁夫人置于死地。当孙权病重时，竟向孙弘询问西汉吕后行使皇帝权力之事。孙权的病势越来越重，潘皇后竟然喜形于色，恨不得孙权能马上死掉。
一天，潘皇后在寝宫昏睡，她平日虐待宫女，宫女们生怕她当了女皇之后会更加残酷地对待她们，于是趁机用布帛将她缢杀，又宣称她是暴病而死。之后，孙权杀了所有侍候潘夫人的侍妾。不久，孙权病逝，潘皇后与他一同葬于蒋陵。
（以上《吴书五-妃嫔传第五》有载）
⑥吴主权王夫人，南阳人也，以选入宫，嘉禾中得幸，生孙休。及和为太子，和母贵重，诸姬有宠者，皆出居外。孙休即位，遣使追尊曰敬怀皇后，改葬敬陵。
⑦袁夫人，袁术的女儿。这位夫人可以说是最自知之明的一位，没有子嗣。步夫人得病去世，孙权打算立袁氏为皇后。袁氏以自己没有儿子的理由推辞了。
⑧仲姬夫人，生孙奋为齐王，出居武昌。
⑨此外，孙权还有一位赵夫人，河南人，据说是丞相赵连之妹。她善于绘画，笔触构思巧妙无双。据说她能够绘制表现全国“江湖九州山岳之势”的地图，还能在手指间用彩丝织成云龙虬凤图案的锦，大的超过一尺，小的只有一寸，宫中号为“机绝”。又于方帛之上绣作五岩列国地形，号为“咸绝”。又以胶续丝作轻幔，号为“丝绝”。后来有贪宠求媚的人诬陷赵夫人总爱在国君面前炫耀自己。赵夫人因而被废黜，失去了以前的宠幸。但是她超绝的技艺仍被载录在史书上。后来吴国灭亡的时候，不知她流落到了什么地方。
（5）后人评价。
——刘备：孙车骑（汉代将军的名号）长上短下，其难为下，吾不可以再见之（《山阳公载记》）。孙权的长像是上身长，腿短。据相书记载，这样的人是难以做别人的手下的，也就是一定要自己雄霸一方，所以刘备认为要赶快离开他。于是星夜跑掉了。
——曹操：生子当如孙仲谋，刘景升儿子若豚犬耳（《三国志-吴书-吴主传》）。
——诸葛亮：孙权据有江东，已历三世，国险而民附，贤能为之用。今议者咸以权利在鼎足，不能并力，且志望以满，无上岸之情，推此，皆似是而非也。何者？其智力不侔，故限江自保；权之不能越江，犹魏贼之不能渡汉，非力有馀而利不取也（《三国志-蜀书-诸葛亮传》）。
——孙策：举江东之众，决机于两陈之间，与天下争衡，卿不如我；举贤任能，各尽其心，以保江东，我不如卿（《三国志-吴书-孙策传》）。
——周瑜：将军以神武雄才，兼仗父兄之烈，割据江东，地方数千里，兵精足用，英雄乐业（《三国志-吴书-周瑜传》）。
——鲁肃：①将军神武命世。②孙讨虏聪明仁惠，敬贤礼士，江表英豪咸归附之（《三国志-吴书-鲁肃传》）。
——苏轼：《江城子-密州出猎》“老夫聊发少年狂，左牵黄，右擎苍。锦帽貂裘，千骑卷平冈。为报倾城随太守，亲射虎，看孙郎。酒酣胸胆尚开张，鬓微霜，又何妨？持节云中、何日遣冯唐？会挽雕弓如满月，西北望，射天狼。”孙权勇而有谋，此不可以声势恐喝取也（《魏武帝论》）。
——胡三省：当方面者，当如吕岱；委人以方面者，当如孙权（《资治通鉴注》）。
——罗贯中：紫髯碧眼号英雄，能使臣僚肯尽忠。二十四年兴大业，龙盘虎踞在江东（《三国演义》）。
——辛弃疾（宋朝词人）：“千古江山，英雄无觅，孙仲谋处。舞榭歌台，风流总被、雨打风吹去。斜阳草树，寻常巷陌，人道寄奴曾住。想当年，金戈铁马，气吞万里如虎。”（《永遇乐-京口北固亭怀古》）“何处望神州？满眼风光北固楼。千古兴亡多少事？悠悠，不尽长江滚滚流。年少万兜鍪，坐短江南战未休。天下英雄谁敌手？曹、刘。生子当如孙仲谋。”（《南乡子-登京口北固亭有怀》）
——**：说到孙权，他是个能干的人。天下英雄谁敌手，曹刘，当今惜无孙仲谋（《**读古书实录》）。
——陈寿（《三国志》作者）：“孙权屈身忍辱，任才尚计，有勾践之奇，英人之杰矣。故能自擅江表，成鼎峙之业。然性多嫌忌，果于杀戮，暨臻末年，弥以滋甚。至于谗说殄行，胤嗣废毙，岂所谓赐厥孙谋以燕冀于者哉？其后叶陵迟，遂致覆国，未必不由此也。”道出了，东吴政权最终亡国的根本原因。
孙皓为了活命，只好采纳中书令胡仲的建议，分别派使者向王浑、王濬、司马伷奉上书信请求投降。这一天，王濬的8万士兵，乘着相连百里的战船，擂鼓呐喊进入石头城。孙皓仿效刘禅的做法，备亡国之礼，素车白马，肉袒面缚（两手反绑），衔璧牵羊，大夫衰服，士舆榇（把棺材装在车上），率领太子孙瑾等21人到王濬营门。