林冲回山后得知此事，自是将穆弘一顿训斥，幸而相斗双方穆弘和史进都未损伤，这才将穆弘一顿责罚后，就此揭过此事。
不过，这事虽然没有酿下祸患，但却为林冲敲响警钟。梁山诸位兄弟，在山下之时，多是无法无天，甚至杀人放火如家常便饭的莽汉，如果不定下规矩，今后难免要生事端。
想及于此，林冲决定对山上众位兄弟的职务进行划分，并且将梁山正规人马做一番整改。于是，林冲着人将吴用和朱武请来，三人一番商议之后，定下章程。
其后，林冲将山上众位兄弟召集到聚义厅，宣读了章程。
算上从少华山新投的两千余名喽啰中挑选出来的一千一百二十名青壮，如今，梁山共有兵士五千三百六十九人，其中时迁带走了十九名传令兵进东京监视童贯，石秀带走了十人进行地形勘察及绘制地图工作，李俊带走了三百名兵士进行海战训练，山上剩余兵士五千零四十人。
这次整改，便是将这五千余名兵士细分为步兵，骑兵，炮兵及水兵。其中步兵三千人，取名七杀，由鲁智深负责，李逵、晁盖、刘唐为其副手；骑兵一千二百人，取名贪狼，由栾廷玉负责，牛行、陈达、杨春为其副手；炮兵三百人，取名破军，由凌振负责，凌动为其副手；水兵五百人，取名海豹，由阮小二负责，阮小五、阮小七、童威、童猛为其副手。
此外，任命吴用为水泊山庄左军师，朱武为右军师，王伦依旧负责山庄杂务，朱贵和李立负责梁山美酒在北方的输送和销售事宜，杜迁和宋万负责梁山美酒到南方周家的输送事宜。至于，未在山上的时迁、石秀、李俊及张横张顺两兄弟则暂时负责其任务，待任务完成后再做安排。
最后，林冲宣布从五千余名兵士中挑选三十到一百名兵士，成立一支特殊军队，取名虎魄，由武松负责，穆弘和史进为其副手。
章程宣读完毕后，众人对林冲安排自无异议。
于是，林冲提出特种兵挑选标准，命众位兄弟从五千余名士兵中一一挑选。如此，众人共挑选出了两百人，接着林冲亲自出马，又将这两百人一一筛选，最终筛选出四十人作为虎魄的第一批训练成员，至于其最终能否成为虎魄正式成员，要看最后的考核结果。
选出这四十人后，林冲开始着手军队建制，其中步兵、骑兵已经大致成形，只需稍加变动便可，炮兵和水兵则是新建，需要重新筛选。炮兵筛选林冲交由凌氏兄弟全权负责，水兵筛选林冲也只是稍提了些建议，便交由阮氏兄弟及童氏兄弟负责。
而林冲自己则开始着手虎魄特种兵的训练。在挑选虎魄成员之时，林冲首重性格，其次才看资质和身手，身手可以训练但性格却难以改变，作为一名特种兵，必须具有冷静、果敢、不惧艰难的品质，因此，在这五千多兵士中，林冲只挑选出了四十人，可谓百中取一。
林冲将二十二世纪的那一套特种兵训练方式，根据当前实际情况加以改变，便成了虎魄的训练方式。此外，林冲专门为虎魄设计三棱军刺作为武器，另传授擒拿格斗，军刺搏杀术、飞刀之术以及隐匿暗杀之术。
虎魄不会正面对敌，专行暗杀以及奇袭，因而其成员将个个被训练成出类拔萃的高手，尤其擅长中段距离，特别是十步以内一击制敌。
在水泊山庄进行军队编制以及特种兵训练的同时，山下荒地拓田的工作也没有停滞下来。吴用、朱武及王伦在林冲的安排下，组织梁山别园劳力以及林家村灾民，对梁山水泊到独龙冈之间的荒地进行了轰轰烈烈的拓荒行动。
如此，一个月后，吴用等人拓田三千顷，将梁山水泊与独龙冈之间的大部分荒地开拓为田地，
得到消息后，林冲命人将封存的十万贯‘生辰纲’取出，并将之运到林家庄，召集灾民后，林冲道：“诸位乡亲，如今洪水已退，诸位若要返乡，林某提供盘缠，每人两贯，若留在此地，每人可分田地五亩，一应种子耕具俱由林某提供。”
此言一出，灾民顿时跪倒一片。
“大善人呐！”
“再生父母呀！”
“林大善人，我们愿意留下！”
……
……
一阵纷乱之后，林冲着吴用等人为返乡的灾民分发盘缠，如此，大约有五千人选择了返乡。
接下来，林冲将留下的三万五千余灾民，按照每十户为一保，设保长；每五十户为一大保，设大保长；每十大保（也就是五百户）为都保，设保正及副保正的方式对灾民进行了划分。如此，这三万五千多人，八千余户，便被分成了十六都保。
至于保长、大保长及保正副保正的人选则由灾民中德高望重者担任。如此，这些灾民也就成为了林家庄正式庄户，并且得到了官府认可，张县令亲自命人前来林家庄编排户籍。
将林家庄庄户划分完后，林冲命吴用等人带领各都保保正及副保正分配田地，其后，命这些保正及副保正将分配到各都保的田地逐级分配到各个庄户。
如此分配完毕后，拓荒出来的田地尚余一千两百顷，自然被林冲作为军屯田由梁山兵士统一耕种。
却说，这日林冲正在训练虎魄兵，忽然得到一个消息，不禁大喜。原来，前些日子，林冲便派了探子前去二龙山一探究竟，看那‘青面兽’杨志在被夺取了生辰纲后，是否按照命运的步伐抢了二龙山落草？毕竟少了鲁智深，杨志是否落草二龙山便是未知之数。而这探子上了二龙山一番打探之后，得知二龙山头领正是‘青面兽’杨志，连忙回来报知林冲。
林冲当即将正在与虎魄兵一同训练的武松叫来，道：“武松兄弟，你先将手头的训练交予穆弘和史进，随我下山一趟。”
武松自是欣然领命。
这些日子武松跟着虎魄兵一同训练，虽然吃了不少苦头，但是心中却十分甜蜜，一来是潘金莲对他百般照顾，让武松沉浸在柔情蜜意的温柔乡中；二来则是他大哥武大郎武植，在洪水退后，被林冲派人从清河县接来，兄弟两年未见，如今相见自然喜从心生。