朱元璋建军的思想是军队朱家化和文官治军。全国的军事力量以卫所为基本单位，每卫所数千人，每所数百人，分驻地方。一有兵事，则由兵部派出总兵官去指挥都指挥使和卫所兵作战，作战完毕则交出军权。这样，都指挥使、都督府和总兵，都无法全面控制，有指挥权的平时不和军队在一起也无固定的下属，军权牢牢掌握在皇帝的手中，此所谓“将不专兵，兵不私将”。
朱元璋吸收前朝军将拥兵自重的教训，搞得这一套分权制度可谓用心良苦，确实明朝在大部分时间没有多少将领能拥兵叛乱，但带来的后果是运转效率低下，指挥不参与军队的训练和管理，在那样的冷兵器时代必然严重影响军队的战斗力。
强制的军事屯田，世代不得月兑籍，军饷微薄，战时做炮灰，平时做苦力，逃亡则采取连坐，强制亲戚家人相代。朱元璋曾经得意的说：“养兵百万，不费人民一粒米”，照他的俭朴，这话还有一定的道理，但到了后来的皇帝，对人民还是一样的横征暴敛，不过是把该正常支出的军费换为自己的享乐费用，代价是军人的困苦罢了。这种又要马儿跑，又要马儿不吃草的做法，到了明中后期就显露出来，首先是军队训练荒废，战斗力严重下降。
其次，社会风气严重不正常，军事由文官统领，武官为跑腿而已民，一个社会把军人轻贱到如此程度，遇有战乱，能指望他们保家卫国吗？
清君在灯下翻看着《练兵纪实》，原来国家军队战斗力直线下滑的原因，戚老前辈尽已备述。但统治阶级也只是临时抱佛脚，一旦风浪过去，就又是不思进取，都想做一个老好人，关起门来做神仙，每日饮酒作乐罢了。
是夜，惊天动地的喊杀声将人们从睡梦中惊醒，耳畔又听到了隆隆的炮声，那响声是从秦淮河传来的，店老板道：“一定是官军与倭寇打起来了！”
清君道：“妹子，你在此处陪伴楚楚姑娘，我们要去支援军兵！”
君惜也想去，清君又说：“小妹，你在此地用处也很大，万一有些游兵散勇来伤害百姓，你也可以帮助他们。抗击倭寇不是说每一个人都要上前方的！”
君惜不再固执，几人骑上快马向秦淮河奔去，那嘶杀声音越来越近，远处的夜空被火光照得通明，双方打得都很凶，尤其是倭寇个个手执双刀，如虎入狼群一般，更加上王十目率领的一些汉奸败类对官兵也构成了很大的威胁，这些人都非常熟悉明军的作战方法，使得明军极其不利，虽然在数量上远远超过了倭寇，但在气势上远远不及这些倭寇，总兵陈大成将军也亲自督战，但明军逐渐有败退之象。
清君等纷纷跳上敌船，挥动兵器，如入无人之境地，顿时击落无数倭寇，那些倭寇的头子双剑小泉，赶忙派人开弓射箭，那些箭如飞蝗一般向清君等人飞来，清君和不败、不可道、烟波渔隐左手各执一个倭寇，右手不断将箭打落水中，那挡箭的倭寇都快被射成马蜂窝了，陈大成见有四位大侠如此英勇助战，也指挥军士奋不顾身的向前，士气大增，杀得倭寇且战且退。
陈大成命令道：“再多发射些神火飞鸦，不要让倭伤了几位壮士的性命！”