第073集就任国主
到织田家攻打武田家的意图武田胜赖决定先下侵占据三和远江两国的织田家盟友德川家，来打破目前的僵局。
武田胜赖为武田信玄与其侧室~访赖重的女儿~访御料人所生，为武田信玄的四男。由于信玄的妹妹武田~~和~访赖重的儿子寅王丸夭折，永禄五年(1562)，胜赖进入高远城改姓~访氏继承~访家，名为~访四郎胜赖。永禄八年(1565)，娶织田信长的养女远山氏（苗木城主远山勘太郎的女儿，信长的侄女）为妻，永禄十年(1567)111月，生下嫡子信胜后远山氏死于难产。永禄十年1C月，信玄幽禁中的长子武田义信自杀死于东光寺，因次子海野信亲为盲人，三子早逝，而后面的儿子们又都已过继他人，信玄这个时候发现，继承顺位最高的，竟然是外样穴山信君。于是信玄想出一个折衷办法，就是把家督让给孙代。这个时候有两个人选，一个是胜赖之子信胜，另一个则是穴山信君之子胜千代，又因信玄本意就是不想让家督让给外姓，所以信玄马上认信胜为养子(就是立嫡)，在信胜成年之前胜赖得为“阵代”，因此胜赖得于在信玄死后继位。15653月，胜赖离开高远城回到甲府，复名为武田四郎胜赖，其后追随信玄进攻骏河、相模各地屡立战功，成为军中勇将。
1566年信玄病逝，后继信胜年仅7岁，胜赖遂继承当主之位。信玄遗命三年内不发丧，不随意征战。家康，谦信等探知信玄死讯，做多方试探。九月家康夺回长筱城奥平信昌为城主，并许配女儿龟姬以示器重。为了报复，胜赖进攻东美浓诸城，并占领远江要冲高天神城。武田家势力一度超过信玄时代是胜赖刚刚自用，一味信任近臣迹部胜资和长坂长闲，也因此与信玄时代稳重的宿老不断有所冲突，家内不稳，埋下了失败的种子。在江户时代的通说中，武田胜赖是有蛮勇之人，作战时常常亲陷战阵，让自己的周边不断成为战场，但胜赖毕竟只是个猛将不是像他父亲一样的名将。
武田胜赖也一直有上洛一争天下的野心，首先在1570下织田家的明智城，并于15711出阵攻击织田信长的盟友德川家奥平信昌据守的长筱城。其实三方原之战后武田家即陷入于织田、德川和北条这些强大势力所组成的“武田包围网”之中，处境十分尴尬。而武田家和织田家的实力也在严重分化：织田家的经济基础是商业，而武田家的经济基础是农业和矿业；商业的增长是资金的积累，而农业的增长是要靠领土的增加上信玄时代引以为豪的甲州金山的储量不断减少，武田家如果不对外扩张的话，也只有等着慢慢被织田和德川蚕食。胜赖并不是那种愿意坐以待毙的君主，唯一的出路就是先吞并当时实力最弱的德川家的三河、远江地区，然后再寻找机会和织田信长一较高下。胜赖特意选择了梅雨季节出兵，就是为了限制织田家铁炮的使用这个决定需要付出代价：武田家的军队主要是由农耕兵组成，而当时正处于农繁期，武田家的募兵工作受到很大的影响，只招募到15000人（三方原时信玄共出动450人）；织田家已经实行了兵农分离，军队由农民家中的二子、三子组成的佣兵为主体经常进行训练，其动员力和作战力自然不是武田家可比上长岛一向众被镇压后，此时没有后顾之忧的信长调兵遣将已不象三方原时捉襟见肘了。
5月1赖领军从甲府出发。5月30日，在医王寺山设立本阵月15日，攻打吉田城后向长筱城进军。6月16日，攻城开始。6月19日，武田军包围长筱城，攻打野牛门。6月20日，攻打长筱城西隅。6月211日，攻落长筱城瓢郭，信昌和500士兵坚守不降。6月22日，再次攻打野牛门，至此一切都在胜赖的掌握之中。6月27日，信长亲率与德川家康的联合援军35000人在设乐原布阵，胜赖在得到消息后留下3C00人继续攻打长筱城，自己带领其余军队回医王寺山本阵。6月28日，胜赖本阵移至设乐原的神丘，想在织田、德川联军立足未稳时给予致命打击。与此同时，织田、德川联军迅速在阵的两侧设起防马栅，酒井忠次率人奇袭队向鸢巢山进发。6月29日5时，武田胜赖鲁莽冲动不听老臣劝告，决定出击进行决战，然而等待他们的是织田家的新武器支国友铁炮，武田精锐骑马军团死伤达七千人几乎全军覆没，胜赖逃归信浓，而武田家老臣名将大部份都抱定战死决心，山县昌景、内藤昌丰、马场信房、土屋昌次、真田信纲与真田昌辉等大将战死，武田家受到极大的打击。
为了在长筱之大败后稳住阵脚，武田胜赖命令家中仅存的两位宿老之一秋山信友，抵挡织田家接下来的东美浓攻略。1572月，长大会战刚结束不到一个月，织田信忠率领三万大军开始围攻岩村城。但是既然是被称为蓬莱三大山城之一的坚固山城，加上信友之前的修缮、补强，岩村成为了一个几乎无法攻落的超级要塞。
信友挖掘了由岩村直通田（信友过去的领地）的密道，通过这条密道，可以获得武器与粮食的补充。
在岩村城大量挖掘水井，这样就可以避免敌人断水。
加强了防御工事，同时善~|用天险防御。
在信友的策略之下，信忠简直被衬得是一无是处：一开始，他打算强行攻城，但是由於岩村是个易守难攻的要塞，两天下来，只是造成己方士兵的大量损伤、以及敌方士气的快速上升。之忠派出大量的弓箭手，从後山向城内发箭。但是由於地势的关系，箭根本射不进城里头，还被士兵嘲笑成真是个大白痴。发觉力攻无益忠在第四天开始改打长期作战牌，同时还握到了一张王牌：被捕的岩村城士兵中，有人透露出有一条密道的存在。知道有密道的存在後，大喜若狂的信忠立刻派人把密道堵了起来，岩村就这样开始了地狱般的笼城战。在被包围了五个月後，十一月十七日，信长亲自抵达了岩村城。仔细观察过地势，信长当然知道：力攻无用。因此他派出使者，对信友提出了招降通告：
这座城是姑大人所在地城以我也不忍心见这座城为刀兵所伤。只要投降。城主以下均可保全性命。
由於密道已经遭到堵塞。城士兵受了伤不能得到医治、肚子饿了也没东西吃；加上胜赖在长一战就已经元气大伤。就算他前来支援。怎可能打得过织田家地三万大军？而且最致命地一点是：十一月已经是冬天了。此时就算胜赖想来也绝对通不过信浓国境地深深积雪。知
不可能撑到援军赶到。信友终於决定开城投降。关有史学家认为：信友地举动相当於卖主求荣。但是在下个人觉得这实在是满慷他人之慨地话。每天面对著一堆受伤哀嚎地士兵、看著大家饿得面有菜色。信友要承担地心理负担不可谓不重。更何况当时城中还有不少无战斗力地老弱妇孺。就算是要「好好地打一场」堆老弱妇孺不就成了牺牲品？而且信长说过：这是姑母大人所在地城。只要投降。城主以下皆可保全性命。对信友而言。投降是无法救活自己地。城主以下。城主本人地安全可就不一定了。但是只要投降家就不用这样饿肚子受寒。最。信友终於在十一月二十一日派遣使者式开城投降。当信友前往织田家阵营地时候。织田军便在城下贴了这样地公告：想回家地人就出来集合们送你们一起回去。
结果当这群又饿又累、正以为已经重获新生地人们向自家走去地时候。却遭到织田军地前後夹击长公记描述：这些人不是拔刀战斗却被杀死。就是被活活烧死。而看看死亡者地名单。几乎全部都是远山一族地人。信友与近臣大岛森之助、作光寺左近进两人一起被抓到岐阜。处以极刑中地极刑——逆刑。关於主仆三人地下场。还有一个说法是在岩村当地三人共打死。但是信长公记里地记载是押解到岐阜才处死。
至於信长地姑母夫人。信长并没有因为他是自己地姑母而原谅他。关於夫人之死。有两种传闻
其一是信长正在与重臣开会。商讨如何处理信友等人地时候。外头来了一位穿著鲜小袖和服地女性求见信长。侍卫拦住他地时候。女子只是掏出一个小小地茶器。说只要把这个交给信长、信长就会见他。侍卫把茶器交给了信长之後。信长脸色发青地冲出营帐。一刀把这个女人斩死。然苦涩地说了句：这女人就是我地姑母。
第二个说法比较有说服力：夫人在被抓一起被送到岐阜，跟丈夫一起被处以逆刑。而一直到死，夫人仍是诅咒之声不断，他怨恨将自己作为战略工具、见死不救——如果信长当初援救岩村，夫人就不会开城投降，甚至还残忍无情的处死自己的侄儿。据说夫人临死前哭叫著说了这样的一段话：像这种残忍而没有情理的事情（指自己被处逆刑一事），就算我原谅信长，上天也不会原谅他！你们看好！因果是循环不停的，总有一天他一定会到最痛苦的死法啊！（以来的历史发展来看，夫人的诅咒果然是很准确的应验了）
对信友而言，这战斗是他能作的最後一件事情。只要他能多撑一天，胜赖就能多争取到一天重建武田。或许跟三年才活活累死的高|虎纲比起来，信友的一切努力并没有留下太大的涟漪；但是跟那些为了求自己的死所、战死于长的其他宿老而言，或许信友的所作所为，还比他们更为胜赖著想得多了也说不一定。
长筱之战后武田家急速弱，织田信长考虑到长子织田信忠海需要一段时间的成长，领地也需要恢复元气以命令织田信忠据守岩村城，勤练士卒，两国开始陷入僵持阶段。
此后武田赖致力于国力的恢复。1577，娶北条氏政的妹妹为妻与北条结成同盟。但天正六年(1578)上杉谦信急死，上杉家发生“御馆之乱”，谦信的外甥上杉景胜和北条家来的养子上杉景虎争夺继承权，氏政请胜赖出兵相救自己的弟弟景虎；而景胜则以黄金一万两、割让一部分土地、娶胜赖的妹妹为妻建立姻亲等条件与胜赖结为同盟，胜赖决定支持景胜，景虎兵败自杀，景胜获胜使甲相同盟解体。天正八年(1580)德川军经过三个月激战，夺回高天神城。为防备信长、德川、北条的进攻，武田胜赖令兄弟仁科盛信移居高远城。天正九年(1580)12月自己移居新筑的新府城胜赖以筑新府城为名向领地内新征赋税，却导致武田家凝聚力尽失，人心浮动，不少老臣最后也叛离了武田胜赖；天正十年(1582)11月，信长策反了胜赖的妹婿木曾城的大将木曾义昌，打开了信浓甲府的门户田胜赖为讨伐木曾义昌而再度举兵，2月1日胜赖率军2万从甲府出发平叛，12日信长集中大军命长子织田信忠自歧阜城出兵。211日骏府的穴山梅雪被德川家寝返，家康向甲斐进发。武田军在鸟居峡被木曾义昌击败，随后松尾城的小笠原信领反叛，胜赖节节败退到新府只剩下千余人。
29日在信领引导下信忠军围了高远城，途中几乎没有遇到什么抵抗，信忠宣布解除与武田松的婚约并要仁科盛信投降，却无反应，3月2日破城甲斐国内骚动。武田胜赖拒绝真田氏的邀请，3月3日放弃新府投奔小山田信茂的岩殿城田德川军紧紧追赶。不料最后信茂也降信长，胜赖一行转往上野下相继逃散，11日众叛亲离的武田胜赖于天目山田野与妻子及嫡男武田信胜等人一起自杀身亡享年三十七岁，名族甲斐武田氏嫡系到此灭亡。
武田胜赖并不是一个庸才，甚至说算的上一个有战略眼光的军事家，但是由于其家族内部的不团结、经济落后国力匮乏、还有一个无比伟大的父亲，面对日益强大的织田氏，没落是不可避免的。如果把武田家衰亡的过错放在他身上是不公的，应该正确的认识这个被埋没的名将。
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攻灭朝仓、武后，织田信长终于完全消灭了参加包围网的所有大名。这时，他开始秋后算账，找曾经支持过包围网的毛利和波多野、一色等家的麻烦。毛利家国力雄厚，一时还不便动手，所以织田信长决定先拿丹波国的波多野家开刀。波多野家虽然表面上已经臣从于织田家，但一直维持着很大的独立自主权，听到织田家准备攻打丹波国后，立即开始准备抗敌。
波多野氏为藤原秀乡的后，平安时代自关东举族迁居丹波，逐渐成为丹波国的有力国人。波多野秀长在“应仁之乱”中加入细川胜元东军，在京都、近江等地屡立战功，深得胜元的喜爱。“应仁之乱”平息后波多野秀长被胜元之子政元（“半将军”）任命为丹波守护，波多野家正式登上了历史舞台。
秀长之子植通是波多野家的中兴英主。1515年植通主持修建了日本战国时代十大坚城之一的八上城作为居城，向世人宣示了波多野家人力、物力和财力之丰厚。1525年植通趁细川家“内粉”、近畿大乱之际驱逐了细川家安在丹波的钉子——丹波守护代内藤国贞，从而独霸丹波一国，使得波多野家转化为战国大名（波多野家的勃兴是战国时代屈指可数的几个守护驱逐守护代的例子之一）。
但是，植通之子晴通却是一个暗弱昏庸之辈。在1555年三好长庆流放细川晴元并以闪电般的速度席卷近畿的时候，晴通居然打着“复兴细川家”的旗号与三好家开战（植通若是地下有知，非得找他儿子索命不可）—结果自然是被三好长庆和松永久秀虐得哭爹叫娘，最后只得向三好家臣服。
晴通之子秀治勇谋兼备，颇有植通之风。1564年三好长庆病死，三好家立即分裂为三好义贤、三好长治、松永久秀和“三好三人众”四派畿再度大乱。秀治趁机发兵攻灭了丹波国内的全部亲三好势力，再一次独霸丹波一国。
1565年织田信长“上洛”成功，波多野秀治被迫像织田家屈服。然1569年将军足利义昭发动了“信长包围网”，波多野秀治高估了“包围网”的力量决意背叛信长。但是信长经过六年的苦战打破了“包围网”，并流放了足利义昭，波多野家遂成为了织田军猛攻的主要目标。
1575年，织田信长令明智光秀全权负责攻略丹波。波多野秀治利用丹波多山的地形与织田军进行笼城战和游击战，使得明智光秀的侵攻进展缓慢。后织田信长又抽调近畿的丹羽长秀和池田恒兴两部配合明智光秀的行动，亦收效甚微。信长大怒，乃对光秀下了限期一年的“最后通光秀十分恐慌，除了加强攻势之外，又向播磨的羽柴秀吉求援。1576年明智、羽柴、丹羽和池田四部兵马五万余人开始强攻丹波诸城，波多野秀治决意收缩兵力，集中防守八上城——只有赤井城城主赤井直正（“丹波之赤鬼”）拒绝弃城，最后在羽柴秀吉部十倍以上的兵力的强攻下战败，直正亦死于秀吉麾下胁坂安治之手。八上城坚固无比，织田军数次强攻均未得手；于是只得采用羽柴秀吉的“断粮战法”—围而不攻。一年半之后城中粮尽治与其弟秀尚被迫出降。后信长在安土城接见了他们并许诺“安堵”，但是最终却又违约杀死了他们。昙花一现的波多野家就此灭亡。
史载秀治、秀尚兄弟之所以投降，除了城中粮尽之外，还在于得到了重要的人质——明智光秀的叔母。但是织田信长最终还是违约杀死了秀治、秀尚兄弟，愤怒的波多野家家臣便也将光秀的叔母杀死。这也成为日后光秀发动“本能寺之变”的原因之一。
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“主公，恭喜您被封为丹波国的国主！”终于平定丹波一国后织田信长任命明智光秀为丹波国主，并命协助细川藤孝征讨丹后国的一色家。
绣中半兵卫似乎很高兴，来向明智光秀道贺。
“唉，为了平波，却让光春的母亲惨死又怎么高兴得起来？”明智光秀叹道。
“如论如何，主公你总算又国之地。丹波有人口0万以动员上万兵力，有这上万大军们就有了很大的回旋余地…”绣中半兵卫似乎意有所指。
“此事不要再提。就因为怀疑我有二，织田信长才故意违约杀死了波多野秀治与其弟秀尚这是在向我示威。可见，织田信长已经对我戒备之心极重，这种情况下，我们只能夹起尾巴来做人…”明智光秀现在与竹中半兵卫交谈时，对织田信长已经直呼其名，可见，因为织田信长背信弃义造成其叔母的死亡，他的愤怒和不满其实已经达到了极点。
“唉。这样下去，迟早会被织田信长追访甚至处死的。”绣中半兵卫郁闷地说。
“不要担心。我们暂且默默地耐，等待时机的成熟再说…”明智光秀现在似乎成熟了许多。
“嗯。那么，我们接下来讨论一下征讨一色家的士气吧。一色家十分弱小，通过征讨一色家，正好可以整编和训练我们刚收编的丹波兵。如果一切顺利的话，我们甚至还可以抓到不少一色家的降兵，如果我估计得没错的话，通过征讨一色，我们的部队数量可以从现在的一万人增加到人左右。”竹中半兵卫深知有兵就是草头王的道理，还是先发展军力最重要。
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丹后一色家是室幕府四职之一的名门。
一色氏出自于足利泰氏的五男公深在三河国吉良庄一色地方居住，以地名为苗字改称为一色氏，而足利氏与三河国吉良庄发生联系，是从承久之乱后泰氏的父亲义氏补任三河守护开始的。
公深之子范氏跟随足利尊氏逃亡九州之后，准备上洛的尊氏将范氏置于博多，任命为九州的统辖者为最初的镇西管领。范氏作为最初的镇西管领一直与南朝方的势力交战，很好地守卫了九州，而镰仓幕府以来九州的守护一直受到少贰氏、大友氏、岛津氏等的反乱。
直到后来南朝方的怀良亲王进入九州，并受到菊池氏的拥立使得当地的一色氏的立场变得相当困难，结果文和4年（1355）怀良亲王正式进入博多，而一色氏一族逃往长门国，后来又上洛去了。
当时上洛的一色氏是范氏之子范光，范光后来于贞治5年（1366）补任若狭国守护，不久又获得了本贯地三河国的守护职。范光将若狭国蜂起的国民一~镇压，很好地巩固了守护领国体制。后来，范光之子诠范镇压了山名氏发动的明德之乱而因功获得了丹后守护的任职，并且由于在军事方面很多的攻击为了三代将军足利义满政权期中的重要任务，并成为了幕府的四职之一。
诠范的孙子义贯起初也在幕府担任参与幕政的重臣，但后来由于与将军足利义教对立，而导致在幕府的地位有所下降。后来在大和参与镇压越智氏的叛乱的时候，被奉义教之命的武田信荣谋杀，使一色氏的支配力量大大削弱。后来色氏在丹后、三河的领地分别遭受了细川氏和武田氏的夺取，实际只支配了丹后一国。应仁之乱时的一色氏加入了山名方的西军，而与之对立的细川、武田两氏则加入了东军。
义贯之子义直于明应7年（1）在普甲山战死，后来一色氏数次与若狭的武田氏发生战争，义贯之子义春也战死了。义春的后继者是义有，明应1（15011）武田元信担任了丹后守护入了丹后国内，并安置了守护代延永春信。由于延永氏与丹后的国人石川氏发生对立，再加上武田氏的入侵丹后，导致了丹后国内极度混乱的状况。
永禄元年（1558），义幸之子义道继任了丹后的国主当时虽然武田氏拥有守护职，实质上丹后的支配权在一色氏的手中。义道庇护了与织田信长对立失败而逃来的将军足利义昭果导致与信长的对决。天正6年，接受信长命令的细川藤孝攻略丹后宫津的八幡山布阵，义道积极地进行防战使藤孝退回丹波，请求明智光秀的援军。同
道的家臣和被官被怀柔而使得义道被逐渐孤立起来，藤孝与光秀军攻击义道的居城八田城，义道被击破，退往中山城的昭田氏，由于昭田氏的反叛，结果义道最终自害。
义道败死之后，子义定聚集残党逃亡丹后国与谢郡弓木城。天正8年，藤孝军攻入与谢郡，攻打弓木城，后来在明智光秀的斡旋之下将藤孝的女儿嫁给义定，达成了和睦。此后丹后国置于细川氏的支配下，天正9年，义定谋叛的计谋泄露，被诱至细川氏的馆中谋杀。义定之后，叔父义清继任了当主，与细川氏交战，天正1遭到细川氏的进攻，激战的结果，义清在下宫津的海岸战死，一色氏至此灭亡。
另一方面，与义贯同一祖先的一色氏，义贯的弟弟持范于嘉吉元年担任若狭的守护职，后来被武田信贤夺取，经过数代传至藤长时，出仕了足利义昭，后来先后出仕织田信长、丰臣秀吉，被任命为丹后宫津城的城主。
藤长在关原合战时加入了石田三成一方，遭到细川忠兴的进攻而被杀。藤长之子范胜与儿子范规一起跟随了家康而保存了家名，到范规的孙子一代时子孙断绝，所领被没收。
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细川藤孝号幽斋、玄旨，通称兵部大辅，精通和歌的儒将，曾著《百人一首抄》，并传下家集《众妙集》。父亲是三渊晴员，他作为细川元常的养子继承细川家，服侍将军足利义辉。义辉被杀后，拥立足利义昭为将军，但最终与其决裂而服从信长，受封丹后田边城。
细川藤孝，幼名吉幕府官员三渊晴员的次男，母亲则是著名学者清原宣贤之女，妻子则是与父亲三渊晴员同为幕臣的沼田光兼之女，其出身与幕府有著千丝万缕的关系。晴员本是管领细川家中细川元有之子来入继母家三渊氏担任养子，在天文九年时晴员奉将军足利义晴的命令让年仅七岁的万吉入继本家，成为亲伯父和泉守护胜龙寺城主细川元常的养子。之於天文十五年元服时拜新任将军足利义辉的本名义藤之藤字改名细川藤孝。
天文十八年，因为三好家迫而逃往南近江受六角氏庇荫的足利义辉与管领细川晴元反攻京都，年方十六的细川藤孝做为将军家的部将也领兵参战，但是仍不敌三好长庆，旋即战败。最是在六角氏当主六角定赖斡旋下终促成义辉跟三好氏的和睦，回到京都的义辉正式举办继承将军位置的仪式，细川藤孝也因此叙任从五位兵部大辅的官位。
出身足利府名门细川家的藤孝也在这段时间向三条西实枝学习和歌、茶道并成为歌道二条流的正统继承人，乃当时唯一拥有古今传授资格的传承者。在京都藤孝除了以文化人闻名外，因为时处乱世肩负一家兴旺重责的藤孝更勤修武艺，藤孝与文人孱弱之形象相左地在武艺一道上也有著不俗的成就，不仅向冢原卜传学习香取神道流的剑术，还从武田信富练习弓马之道并得到了波波伯部贞弘的弓术印可。
永禄八年，松永久秀及三三人众联手突袭足利义辉居住的府邸，义辉力战而死。松永久秀拥立义辉的堂弟足利义荣继任为室第十四代将军，但真正应该拥有将军继承权是当时在兴福寺出家的义辉亲弟觉庆，松永久秀等人本想顺便一起对他下毒手但苦於兴福寺拥有极为强大的僧兵武装力量，使他们无法得逞。
虽然觉庆一时间并无生命之忧动却仍受松永久秀等的严密监视，始终忠於幕府的细川藤孝与同僚一色藤长等人於当年七月二十八日冒险将觉庆从兴福寺救出并藏匿於南近江六角氏家臣甲贺和田惟政家中，觉庆也在永禄八年二月还俗改名义秋，之後六角义贤之子义治决意和三好三人众一同进军近江阪本，情势危急的义秋只好逃亡段时间里藤孝一直投奔至若狭守护武田家又转至金崎投靠越前强豪朝仓义景。
不料此时的景正因嫡子之死而意志消沉并无拥义秋上洛的心情，藤孝和义秋便通过和信长有姻亲关系时正在朝仓家仕官的明智光秀接近并投靠了已控制尾张、美浓两国的织田信长。而义秋也在此时改名义昭，永禄十一年义昭在细川藤孝的陪伴下由越前一乘谷出发到达阜，居住於立政寺。原本认为上洛之战必定十分艰辛的义昭等人未料到个月信长便浩浩荡荡地率领大军发动直捣黄龙式的攻击，一路直攻上京都赶走三好三人众等而已与三好三人众反目的松永久秀以及三好义继则先後投降了信长，信长快速且俐落的动作令细川藤孝大感佩服。
在义昭成功当上第十五代军後，细川藤孝随织田军转战大和、摄津，因战功担任回封旧领山城胜龙寺，并同时被任命为幕府奉行众担当各项政事的推动。织田信长在永禄十三年提出的「五条条书」和在元龟三年向义昭提出“异见十七”对将军的权威严重伤害，双方的对立日益表面化，以足利义昭的家臣身分仕於信长，可说是同时臣事二君的细川藤孝为了安抚两边相对的不满情绪而来回奔走、居中调解，如此亲近信长的行为使义昭对细川藤孝渐生心，认为藤孝已投靠信长，于是对信长不满的足利义昭暗中与武田信玄、本愿寺显如、朝仓义景、浅井长政、比山延历寺、三好三人众等反信长势力组成「信长包围网」，这时的藤孝果断地离开多年服侍的义昭，转而投靠拥有远见和才干的织田信长。此，细川藤孝便以织田家武将的身份转战畿内，活跃於对本愿寺、纪伊的战场上，後於天正元年细川藤孝积功获得加封山城长冈的领地，改姓长冈，之後更以此为根据攻下淀城。
天正五年，藤孝与织田信忠、羽柴秀吉一同攻陷叛将松永久秀的大和信贵山城，嫡子忠兴也随明智光秀攻入大和片冈城，翌年在信长的促合下让藤孝之子细川忠兴与明智光秀结亲，迎娶光秀之女玉子。然後将细川藤孝、忠兴父子一同被编入明智光秀属下，负责进攻丹波、丹。丹的一色义道曾一度率兵将之击退，细川藤孝遂一面向明智光秀求援，一面暗中收买义道身边的家臣沼田勘解由，於翌年再次攻击一色义道的居城八田城，义道败走至中山城，最後因家臣沼田勘解由的背叛而自杀。由於这样的功劳细川藤孝被信长任命为丹後一国十二万石之主，之後藤孝开始努力经营丹後国田边城。
通过协助细川藤孝攻打丹后，明智光秀果然收编到不少降兵，总兵力达到了13000人。不但如此，通过这将近一年的实战，将士们获得了宝贵的作战经验，开始有了一定的战斗力。