有了王杨的解析和精神支持，尼奥总算没有当场晕菜。但是他踉踉跄跄径直回到休息舱，就一头栽倒，昏昏沉沉地睡死过去。
看着莫菲斯一副手足无措的模样，王杨转头问道：“我是不是很没心没肺？”
所有人都用奇异的眼光看着他，不知道该怎么回答。
——至少，你让我们很受伤是真的。
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三天后莫菲斯来到尼奥的休息舱，看见尼奥安静的独自坐在房间角落，莫菲斯也慢慢走过去陪在他身边坐下看着他。
沉默了一阵，尼奥怔怔的说：“我回不去了，对吧。”
莫菲斯反问：“要是你能，你真想回去吗？”
尼奥沉默。
莫菲斯低声说道：“尼奥,我向你道歉，我们本来有个规矩是绝对不能解放成人的心灵，因为这样非常危险，成年人会无法接受真相，我见过。我很抱歉这么做，我这么做是因为我别无选择。”
尼奥好奇地看着他。
看了一下尼奥，莫菲斯继续说：“当matrix成形时有一个人在里面出生，他有能力随意改变matrix并重新创造真实世界。他解放了第一批反抗份子，他告诉我们真相，只要matrix存在一天，人类就没有自由。他死后有个先知预言他将再度降临，他将带来matrix的毁灭和战争的终结以及全人类的自由。所以我们终其一生游走matrix中，试图寻找救世主，我这么做是因为，我相信我找到了。”说完盯着尼奥，尼奥转过头来难以置信的回视着他。
莫菲斯随即站起身来拍拍尼奥的肩膀：“好好休息！你需要接受训练。”
看着莫菲斯走出去，尼奥突然问道：“为什么不是王杨？”
莫菲斯在门口停顿了一下：“我不知道。”说完开门离开。
第二天一大早，尼奥的训练正式开始，就像电影中一样，他很快展现出不同寻常的特质，先是如饥似渴地将所有功夫全部学到了手，然后在新编写的搏击程式里打败了莫菲斯，只不过到最后仍然没有通过跳跃程式……表现不可谓不惊人，但是有王杨珠玉在前，尼布加尼撒号的船员已经见怪不怪了。
至于王杨，他早已进入尼布加尼撒号的战斗序列，成为正式的一员。除了值班之外，王杨已经很久没有碰过辅助磁碟机了。平时他都在自己的休息舱和主舱里摆弄着一大堆机器零件，也不知道在搞什么。而他鼓捣的那些东西，就连机务员坦克和程序员茂斯也搞不懂。得益于内力修炼带来的神奇效果，在所有人眼中，他似乎有着无限的精力和灵感，没过多久，就没有人再有兴趣继续到他这里来接受打击了。
而关于王杨和尼奥两人的救世主光环问题，成了尼布加尼撒号私下的的争论焦点。
“我还是认为救世主是王杨。”茂斯现在已经成了王杨的粉丝，对王杨神奇的内力和拉风的轻功痴迷之极。并且一直期待拜王杨为师，学习传说中的内力，甚至承诺介绍自己在锡安的妹妹给王杨，据他自己说，他的妹妹相当正点。可是王杨一直拒绝，除了后院的几只母老虎还在虎视眈眈之外，最重要的是茂斯的个性跳月兑，过于沉迷于天性中的**——吃个早饭都能扯到人性上，想让他静心入定，达到心如止水的精神修为，不亚于电脑人集体脑残重新遵从机器人三大定律。不过这也难怪，看看他的名字：茂斯，m——o——u——s——e，翻译过来不就是耗子吗？古往今来，耗子能得道的，好像只有释迦牟尼跟前的白毛老鼠精了吧？
“但是先知说……”崔妮蒂虽然仍然坚持对莫菲斯的信任，不过底气已经明显不足了。
“拜托！”正所谓百闻不如一见，活生生的事实难道还不能说明问题吗？茂斯对先知开始不那么不感冒了，“也许他现在就能打败特工了。”
艾巴和苏薇琪对视了一眼，打败莫菲斯的一幕犹在眼前，他们纵然不相信王杨能打败特工，至少也不会明面上提出质疑了——起码特工就做不到在墨菲斯毫无知觉的情况下扒掉衣服。所以，他们属于精神上支持莫菲斯，实际行动上投给王杨一票的派别。
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“哇，你差点把我吓死！”
这一天，塞弗正在值班，无意间一回头，差点被无声无息地出现在背后的尼奥吓得三魂不见了七魄。
尼奥歉意地笑笑，又向另一边的王杨打声招呼：“嘿，王杨。”
王杨抬抬手，表示收到。
“要喝一杯吗？还有王杨？”塞弗递给尼奥一个金属杯子，日子一天天过去，王杨和尼奥逐渐习惯了飞船上的生活，对飞船上仅有的几个成员也渐渐熟稔了。并且因为王杨那非人一般的表现，他作为一个新手，威信反而非常之高。连带着尼奥也跟着沾光不少。
“不了，谢谢。”另一边的王杨头也没有抬，专注于自己手中的零件。休息舱和主控室，是他平时最常待的地方，手里永远有着说不出名堂的古怪零件和小玩意。慢慢的，所有人都发现，尼布加尼撒号开始一点一点地发生变化，操纵系统更加灵活，信号传输更加便捷，火控系统更加精确，训练程式更加有针对性，甚至他们对付电子乌贼最有效的武器emp也有了改进：不再仅仅是一次性充能施放，也有了发射引爆的选择。这一切的改进都来自于王杨，他在进入黑客帝国之前，专门向萧宏律学习了适用于这个世界的一些科技资料，虽然绝大多数只是死记硬背下来，但是在尼布加尼撒号上的辅助磁碟机输入系统的知识体系后，这些在关键点上更加先进的科技资料顿时被激活了，这就让王杨可以放手对尼布加尼撒号进行更高级的改装。当然这些东西剧情人物是不知道的，在他们眼中，只看到一系列实用先进的技术成果源源不断地从一个绝顶聪明的天才手中诞生。这也使得尼布加尼撒号船员的救世主之争更加偏向王杨，人类有这样聪明的成员，机器怎么可能获胜？
不过有一点让身在曹营心在汉的塞弗很不满意，那就是王杨在主控室的时候，他想要悄悄潜入matrix去跟特工接头就很不方便了，甚至有一段时间还疑神疑鬼，认为王杨发现了自己的秘密。其实王杨很想跟他说咱们各干各的，你就当我不存在好了。可惜即便他真的这么表示，塞弗也不敢相信。
不过时间长了，塞弗也渐渐发现，王杨根本对其他事情毫无兴趣，一心专注于自己的发明创造，这也让他渐渐放下心来。
从感情上说，王杨其实很能理解塞弗。在面对莫菲斯给出的红色小药丸时，生性浪漫的塞弗一定是浮想联翩——自由啊，多么诱人的字眼！没想到真正的现实却是自由自在地生活在暗无天日的地底，自由自在地吃着吃淡而无味像是浆糊的食品，自由自在地被机械们满地球追杀，然后自由自在地被大卸八块……如果不想被这种自由抛弃，就只能在机器来临之际赶快找个下水道最阴暗的旮旯钻进去闷声藏好，然后祈祷别被发现……在机器已经统治了全世界的大前提下，以人类那单薄的身体、微量地人口、相较于机械的流水线生产速度慢得可怜的自然繁殖速度、落后地技术兵器……人类的翻身之日怎么看都是痴人说梦的一个幻想罢了。
既然大目标不能指望，那么只能退而求其次，个人待遇如果能够解决也可以接受。毫无疑问，崔妮蒂是大美女，尤其是在这种地狱一般的未来世界，美女就更是稀缺资源。虽然没有了matrix的花花世界流连忘返，但是有美相伴，也能在真实的荒漠里稍加安慰了。而且整个团队里，掰着手指头数数，可以说基本上没有能够作为情敌的对手存在：莫菲斯心里有尼俄柏，艾巴明显和苏薇琪更亲近，茂斯只是个嘴上没毛的愤青，再加上朝夕相处同甘共苦的近水楼台之便，这样算来，其实瘸子里面拔将军，塞弗还是很有希望的。
可是等来等去，等来了主角尼奥，长得帅也就算了，头上还顶着一个救世主的光环，刚登上尼布加尼撒号就无视组织纪律把老大莫菲斯菜了，谁知道莫老大不但不以为忤，反倒亲自捧着上位；就连先知这老太太也在一旁跟着瞎起哄……长得帅了不起吗？救世主就可以随便插队吗？什么素质！
再怎么埋怨，有了这样一个极品高富帅闪亮登场，还有他什么事儿？这一刻，塞弗同志的心一定是拔凉拔凉的。至此，他留恋人类阵营的最后一丝羁绊——消失了。
在莫菲斯看来，身为人类阵营的一员，摆月兑机器的奴役，争取种族的自由，这不是天经地义的吗？要不然，你千辛万苦地从matrix里逃出来干嘛？再说了，你就是想投诚，机器也得愿意要你啊。所以在队伍控制上，一向睿智的莫菲斯却犯了一个很低级的错误：对团队的成员无条件地赋予了全部信任（很像郑吒的说，呵呵呵）。
但是莫菲斯忘了一个最基本的道理，人性是复杂的，也是善变的，好了伤疤忘了痛更是人类最大的劣根性之一。昨天他会觉得做奴隶的滋味糟糕之极，可是对比了这整天被追杀的地老鼠一般的自由人生活，曾经在matrix里被求之不得的真相折磨得夜不能寐的日子便会有意无意地忽略掉，反而觉得其实有时候做做奴隶也是可以接受的，这就是鲁迅先生所说的“暂时做稳了奴隶的人生”和“想做奴隶而不得的人生”了。莫菲斯的缺点就在于他把自己的认知替代了所有人的认知，殊不知人性一旦冥顽不灵起来，就会像周星驰在《济公》里费尽心机想要度化那个九世乞丐一样，即使你给他做神仙的机会，他的第一反应也是“神仙——乞丐”。
如果说尼奥和莫菲斯代表了人性中真诚、善良、自由、光明的一面，那么塞弗就代表了人性中丑恶、自私、狭隘、保守的一面。
但是理解不代表认同。对于每个人在险恶环境下的选择，王杨一向抱持宽容的态度，只要你没有危害到集体、妨碍到他人，王杨都可以理解。但是像塞弗这样，为了一己之私，出卖团队、甚至背叛族群的做法，王杨绝对不能接受。在王杨看来，你可以选择放弃，但不能选择伤害。
“还是尝尝这个吧。”做完了手里的零件，王杨拿出一个金属壶。想必明天就是尼奥去见先知的时候了吧？也是这个叛徒下场领盒饭的时候了，本着送行的心情，王杨把自己刚刚做出的酒拿了出来。
果然，塞弗刚喝了一口就惊奇地跳了起来：“这真的是酒，你怎么做到的？”
“只要想做，就没有做不到的。”王杨一语双关的说道。现在这种条件下，找粮食酿酒是不可能的，不过这难不倒王杨，因为从本质上说，酒精同样是一种分子构造，只要能具备生成条件，即使没有粮食，也照样能制造出酒来，甚至还可以将酒精分子**化，变成酒精病毒，只要注入生物体内，就会利用宿主的生物条件不断地分裂繁殖，直至醉死。道瑟能够在这种条件下造出酒来，更不要说准备充足的王杨了。而除此之外，进入剧情以来，收获颇丰，心情愉快之下，王杨也想给塞弗最后一次机会。在希望渺茫的环境中，人人都会有软弱的时候，一时的迷茫不能代表一个人的本质。
“你知道吗？我知道你在想什么，因为我现在想的跟你一样。”塞弗似乎有了一点醉意，王杨的话却让他产生了误解，以为王杨也是对现实不满。他摇晃着脑袋继续说：“实际上我来了以后就一直在想，为什么我不吞蓝色药丸呢？”
他说着将头凑近王杨低声说：“我可以问你吗,他有没有跟你说为什么要这样？为什么找你来？是不是告诉你，你来这里是要拯救世界？”说着他眯起眼睛侧头看着王杨，面带一丝笑意：“说说看，你要怎么做。作为资深者，我会给你最好的建议的！”
“世界上从来没有什么救世主。”王杨毫不犹豫地说，“我也从来没有想过要做什么无聊的救世主。我只是想做一些自己喜欢的事情，比如这个。”他举了举手里的酒壶。
塞弗的眼中浮现起一种幽暗难名的光芒，而他看着王杨的神情也开始带着志同道合的意味。
“我一直在想。”王杨皱着眉头说道，“逻辑思维、身体强度、科技水平、繁衍能力、对环境的适应性、社会结构的高度统一性、组织协调的高效性，人类全部比不上机器；无论怎么计算，这几乎都是一场看不到胜利的战争。既然如此，造物主为什么当初要选择人类来作为地球的主角？直接选择机器不是更好吗？”
“也许就是想借助人类的双手来埋葬自己呢。”竟然公开质疑人类的未来，塞弗越发肯定王杨有弃暗投明的潜质。
尼奥不满地看了塞弗一眼，却没有说什么。
“不可能。”王杨断然说道，“在这种无休无止的战争中消耗掉地球的所有资源，将一个生机勃勃的世界变成千疮百孔的荒漠，任何一种稍有理性的智慧生物都不会选择这种同归于尽的生存方式。”
“那么你的意见呢？”比脑子，塞弗还是很有自知之明的。
“如果真的有造物主，我想他只会将机会平等地给予所有生命。如果没有自我意识的觉醒，如果人类仍然是这个世界的支配者，那么人类离得开机器吗？”王杨冷冷一笑，“当然不能。因为人类与机器人已然相互依存，机器需要我们，我们也需要机器，这就是造物主的真正的意愿。”
“你这话应该跟机器去说。也许它们会在杀你的时候问问你的临终遗愿。”塞弗愣了一会儿，悻悻然地说。
“面对给予你生命的人，如果不是万不得已，你会选择刀兵相见吗？”王杨反问道。
“你的意思是……”尼奥好像捕捉到了王杨的思想脉络。
“虽然没有资料做为佐证，但是我基本上可以肯定，这场战争一定是人类挑起的。”王杨的笑意里充满嘲讽，“几千年来，人类逐步形成的自我中心地位怎么容许其他生命的挑战？更不用说是自己制造出来的工具了。”
王杨目光中的辛辣如同一柄烧红的刀子，让尼奥和塞弗情不自禁地回避开。
“现在说这些有用吗？那个时候我可没有冲机器开过一枪，现在还不是要被整天追杀？”塞弗对于同族前辈的挖坑行为充满怨念——凭什么你挖的坑要我来填？
“既然现在这一切是人类自己的傲慢和偏见造成的，那么再坏的结果也需要人类自己去承担。”尼奥倒是很认同王杨的观点。
“事实上，机器的确离不开人类。”王杨没有给两个人思考的时间，直接解释说，“除了作为能量来源外，更重要的是进化和自我完善的需要。”
“比如呢？”尼奥好奇地问道。
“比如，感情和人性。”王杨进一步解释说，“人类从支配者变成被奴役者，这就说明了机器的力量比人类更加强大。可是生命的核心价值不是体现在力量上，否则身体孱弱的人类就不可能成为地球的主宰者。机器觉醒了自我意识，成为新的智慧生命，但是这种觉醒只是非常初级的层次，从进化的角度来看，甚至还比不上人类。机器的长处就在于数学上几乎完美的逻辑运算能力，但正是因为这种完美，反而抹杀了机器突破传统框架、产生革命性思维的可能性，简单地说，就是机器缺乏创造力。我们中国有句歇后语叫做‘武大郎开店——伙计永远高不过掌柜’，说的就是这个意思。机器设计机器，永远难以进化。”
“为什么是感情和人性呢？”尼奥继续问道。
“因为在理性上，人类永远超不过机器。人类发明机器，不就是想借助机器那完美的理性吗？”王杨笑道，“可是促进人类不断进化和完善的，恰恰就隐藏在那些非理性的东西里面，喜、怒、忧、思、悲、恐、惊、仇恨、嫉妒、拒绝，爱别离，怨憎会，求不得，等等，这一切都是所谓的不确定因素，也就是不受机器控制和没有事先设计好的随即变量，这些变量不是逻辑推理能解释的，带给人性的影响却是无法预料的。从古至今，面对那些依靠理性和技术无法解开的死局，遵从心灵的指引反而常常会产生柳暗花明的神奇效果。这些东西都是机器无法理解也不能解决的，它们只能徒劳地把技术推到极限，却不能跳出这个固有的圈子，去发现和开创一个新的天地，因为从本质上说，生命和爱，都是不可度量的。”
“感情吗？所有的？也包括恐惧和绝望？”塞弗突然想到了什么，好像不在意的问。
“人类不断地发明那些武器，其实不就是出于对未知的恐惧吗？人类不停地想要寻找延续生命的方法，不就是出于对死亡的恐惧吗？懦弱、胆怯、绝望、恐惧，这都是与生俱来的人性。没什么可丢人的。”王杨淡淡地说，“每个人都会死，谁都不会例外。关键是，当你弥留之际，回忆自己的一生，有什么值得骄傲的吗？或者说，没有什么让你无法释然放手的吗？”
“表面上看来，这种整天朝不保夕的自由，未必就比在matrix中的不自由好多少，可问题是，如果我能忘记一切，重新回到matrix，就一定不会后悔吗？”王杨挪揄地笑了笑，然后斩钉截铁地说道，“不，我一定会后悔。”
塞弗不自觉地问：“为什么？”
王杨冷笑道：“因为我们都是黑客，骨子里都是流动着反叛的因子，我们天生就不会服从暴政和强权，对既定秩序和规则的否定是我们与生俱来的东西；即便我返回matrix，要不了多久，依然会重新开始寻找现在已经得到的答案。这就是我们的性格，我们的性格决定了我们的命运。”
塞弗愣了一下，随即把头扭了过去：“可是人总要活在当下，现在的一切才是真正能够把握的，不是吗？”
“你怎么知道，明天的这个时候，一切不会变的更好呢？”王杨饶有兴趣地问道，“玩过轮盘的人都知道，不到最后一刻，胜负只有上帝能看透。”
“上帝？”塞弗冷笑，“上帝早就死了。要不然，人类怎么会沦落到今天这个地步？”
“我也不相信上帝。”王杨自始至终没有喝一口酒，他站起来，身形淡淡，却自有一股巍峨的傲岸，“但我相信自己。”说完，转身走出值班室。
看着他的背影，各怀心思的尼奥和塞弗都沉默了，