魔导学部；全名为时空管理局魔导科学研究部。
是时空管理局最为重要的战略部门之一。主要负责；研究新型魔法，新型魔导器，培养魔导士，培养各类科学家，研究新式科学技术，同时也担任管理局的技术顾问团等角色
魔导学部位于米德切尔德首都的米德国立魔导大学内（此大学为米德魔导士的圣地，米德最高学府）。
部门内成员同时在大学担当教授，准教授，教授助手等教师工作。管理局中央技术研究局是后来才出现的，原本为地面本部的‘三贤者’建立起来作为魔导学部的对抗部门，不过底蕴方面实在是无法和历史悠久实力雄厚的魔导学部相比，所以一直没有什么出彩之处。
魔导学部为管理局重要部门，教师都拥有军职。
学部长拥有固定的中将军衔（必要时可能会更高）。根据实力和贡献的不同，教授的军职可能是少将也可能是中将。准教授统一固定为准将（有能力升到少将已经可以直接被提升为教授了）教授助手以及教授助手以下职位的军衔视情况不定，最低为二等尉官，最高可到一校。毕竟已经是和平时期，所以军衔都普遍降低。在新历初期，魔导学部最为辉煌的时期更是拥有1名荣誉元帅（阵亡后特别晋升）3名上将，10名中将，13名少将，准将24名（这部分主要是教授助手），校官不计数。不过在混乱时期结束后，多数人阵亡，剩下少部分随着时间流逝陆续退役，至今还留下来的只有数人，不过也是风烛残年即将退役。
魔导学部分为里和表。
‘里’部分
‘里’部分主要从事研究新型魔法，新型魔导器，军用科技的研究以及培养魔导士。
混乱时期结束后，学部的评估开始逐渐严格；担当教授除学识丰富外，魔导士等级必须在S级以上。准教授则必须达到AAA级以上。
同时，魔导学部‘里’部分内教授与准教授的数量是有限的。在教授与准教授满员的情况下，视情况可以增加席位。教授与准教授的人数一共有27位（死徒27祖？笑！），教授与准教授是1比2的比例，也就是说教授一共9名，准教授18名。当然也有准教授实力达到S级，不过因为各种原因暂时无法晋升教授的情况。
27席位统称为教授联议会
魔导学部的总负责人直接向管理局三提督负责。
当然‘里’部分的成员既然担当了教职员的身份，自然也要负担起教授学生的职责，所以教授的职位并不是纯粹掩饰用的身份，所有人必须每年有至少3个月，也就是一学期的时间在米德国立魔导大学内授课。
魔导学部拥有培养魔导士的责任，但是与教导队之间并无从属关系，这是为了防止魔导学部握有管理局绝大部分战力。魔导学部主要培养魔导士理论知识以及魔法应用技巧。当然‘里’部分27席位的教授们自己的亲传弟子不算在内。27席位的教授亲传弟子数量受到严格的控制，但是这个规定可以说是多余的。
其实几乎所有教授的亲传弟子都只有寥寥数人或者甚至只有1人。主要原因是27席里的人骨子里将自己看作是学者多于战斗的魔导士，大家都醉心于研究，与其说是在为自己培养弟子不如说是培养有助于自己研究的助手更为合适。
这也导致了，学部内大多数的教授助手是由这些教授和准教授的弟子担任，卡米尤也曾经是其中的一员,事故之前不久27席位已经开始讨论卡米尤晋升准教授的议案并且获得绝大多数教授的支持,只差正式表决。（当然，卡米尤以后还是回到学部的）
同样因为魔导学部也继承了大学的通病，晋升全靠教授联议会内部表决，‘空降部队’是很难在学部立足的。
如果魔导学部的‘里’成员全部集齐的话，魔导学部才是管理局拥有最大战力的部门。不过因为教授晋升太过苛刻，除了在管理局建立的新历最初的时期外，数量再也没有满员过，但也始终保持在6位以上。也只有魔导学部是管理局唯一合法拥有复数位S级魔导士并且不会被限定的部门吧！
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‘表’部分
魔导学部也拥有很多学识上的天才，却无法成为魔导士或者魔导士等级过低的人才，这些人被授予荣誉教授，拥有一尉到一校等不同待遇却不领军职（有意愿者可以申请军职），大多这类型人才只服务于米德国立魔导大学。只有少部分特殊或者极为优秀的人才进入魔导学部。
‘表’部分主要从事民生科技与少量的魔导、军事科技的研究，大学内的主要授课老师由‘表’担当。
同时，魔导学部虽然位于地面本部的范围，不过却直属总局，地面本部对它只有建议权和申请协助权。可以说，魔导学部算是总局在地面本部钉的一颗钉子。（震慑？）
对于魔导学部如此的不正常规定，可以理解为时空管理总局最后的隐藏战力吧！（地面本部的高层模模糊糊知道一些，不过无法弄明白内部的实际情况）
PS，在魔法少女原著中，一支部队不能拥有复数位S级魔导士，超过的话必须被能力限定，六科就是这样。
在原著中，S级魔导士都是相当稀有的，更别说SS级了。在奈叶SS中，地面本部的总司令盖兹中将曾今说过，地面部队没有SS级的人物。疾风都只能算是总局借调给地面本部的。
管理局次元总局中，S级以上的人数也不多，奈叶S+级的实力被称为ACE中的ACE。这固然是奈叶战斗技巧的强悍，不过一力降十会，面对SS级实力的人，奈叶拼着命可能会创造奇迹吧！毕竟她是原著主角。
再PS；魔导学部会为‘里’中的27为教授、准教授授予荣誉称号，这个称号同时也被全管理局境内的官方承认。雷斯林·马哲理被授予的是大贤者的最高荣誉称号。
称号也有对外颁发，当然外界能够获得这类称号的人很稀少。（主要人才都被‘里’挖走了。）
由于魔导学部和米德国立魔导大学关系太深，所以外界的人将两个部门画上了等号，不过只有内部的人员才明白其中的天差地别。
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