经过一番苦战，白骨舰队和机甲斗士终于将面前这只经过级进化的变异祖玛完灭。然而作为进攻主力的两名机甲斗士此时都已受到了严重的损伤。继续深入，后面还会冒出什么意想不到的事情，谁都无法预料。
花季美果断地命令白骨舰队的全部作战小组立即返回铁楼进行修正。就在舰队刚刚撤回号基地的同时，一道来自阿萨总部的调遣命令也传到了这里。
这道军令是由军战部最高指挥官刑东签的。其主要内容是调集所有在外作战的低空舰队迅返回阿萨总部，似乎有什么紧急情况要低空舰队去完成。但使大家感到疑惑的是，命令中还指出协同低空舰队一起作战的圣徒门斗士要留守原地。以帮助各地的铁楼完成通讯系统的建设。
无论是低空舰队的飞行员还是圣徒门的斗士对军战部下的这道军令都有着或多或少的疑虑。清除地球表面的变异祖玛是阿萨总部制定的近三年的作战目标，也是如今阿萨军团的核心任务。也正是因为如此，圣徒门的斗士们才融入了阿萨军团的部队当中。但在短期目标还未完成的情况下，阿萨总部却一改初衷再次将低空舰队与圣徒门组织分离，这使很多人都感到不能理解。即使是此时的新家园基地出现了什么变故，急需低空舰队回援，那么也没有必要非将斗士们留下。更何况在地面上的变异祖玛还未清除干净便急着重建通讯系统，也的确让人感到重蹈当年失败的覆辙。
就在大家心存疑虑之时，另一封面向全球基地的通告再次传到了号基地。此封通告仍然是由阿萨军战部颁布的。其大概内容描述了新家园基地在最近一段时间的一项振奋人心的壮举。在地球失去卫星通讯的一百多年后，经过新家园基地科研人员的努力，三颗足以覆盖全球的通讯卫星在昨日成功地进入了地球同步轨道。同时附件上的信息中还强调：各地的铁楼要加紧通讯系统的建设，尽快完成与通讯卫星的信号连接，从而恢复全球的通讯系统。
这个好消息对于基地的人们来说无疑起到了很大的鼓舞作用。中断了一百多年的通讯系统终于可以再次恢复，这对全世界人民来说都是一件值得庆幸的事。而且这个后传到号基地的通告也稳定了阿萨军团的军心。大家也不再对刚刚接到的那封调转军令再存质疑了。所有的战士与斗士都认为军战部的此道调令必有其深刻的用意。
可就在花季美刚要率领白骨舰队起程之际，另一道由军备部签的军令再次传到了号基地。
虽然军备部与军战部同属阿萨总部的核心机构，但由军备部直接向低空舰队出军政命令这还是头一回。到底军备部有没有权限直接调遣作战军团大家不得而知，但由军备部最高长官徐雪娇亲自签的这道命令却使圣徒门的斗士们情绪高涨。
这第二道由军备部下直接面向阿萨军团的调令中明确了在低空舰队返航时必须带上协同作战的圣徒门斗士。并且在调令中还夹带了两条面相圣徒门斗士的通知。
在第一条通知中军备部向圣徒门斗士们宣告，新的一批机甲斗士已经投入配备当中。但由于其数量有限，所以其配备原则定位先到先得。而另一项通告则是由圣徒门馆长杜特安布的，其主要内容是圣徒门指挥权的转让。
杜特安在通知中明确阐述了圣徒门近些年来的作战部署，其核心还是与阿萨军团的融合与统一。并且杜特安还在通知中指出，为了更好地达到圣徒门与阿萨军团的作战统一性，杜特安将圣徒门的指挥权转让给了军备部最高长官徐雪娇。今后圣徒门旗下的弟子将由军备部统一调动。
对于圣徒门斗士与低空舰队的融合，这是所有人都能理解的。毕竟在阿萨的近期战略部署中，其核心任务的完成也必须要这样做。可圣徒门馆长杜特安为什么要将指挥权转让给军备部而不是军战部，这一点没有一个人能想通。但徐雪娇那具有广告宣传式的招揽，却让很多圣徒门斗士为之吸引。因为大家都见识过机甲斗士的强悍与神奇，谁不想在第一时间也装配上这样的攻击性武器呢？斗士们手中的电光剑的确无法与攻击力强悍的机甲斗士相比拟，因此几乎所有的圣徒门斗士都对机甲斗士的配备跃跃欲试。
但两道相继到来的军令却使花季美陷入了为难之中。立刻返回新家园基地，这一点毋庸置疑。但在白骨舰队返航之时到底要不要带上圣徒门斗士，花季美觉得很难决择。毕竟低空舰队是隶属于军战部的，白骨舰队选择执行由军战部出的调令原本是无可厚非的。但花季美再看看身边那些对配备机甲斗士跃跃欲试的圣徒门斗士，也实在不忍心将他们丢下。毕竟在军备部的通告中指出限量的机甲斗士配备方案是先到先得，如果此时丢下他们也就意味着他们很可能失去配备新一代机甲斗士的机会。可低空舰队并不直接隶属与军备部，因而自己如若执行了军备部的命令算不算违抗军令或是渎职，花季美也无法判断。
就在花季美抉择于两难之间时，莱斯走上前来。莱斯身为圣徒门斗士，自然他的规劝是倾向于后一道军令的。看看门友们那副急不可待的样子，莱斯决定向花季美推波助澜。
“既然两道军令都是出自于阿萨总部，那么我们执行哪一条都是无可厚非的。其实我们也用不着过多的去思虑这两道内容相左的军令其由来的原因，上方的用意可能我们再挖掘也不会吃透其深意。但军备部的命令是后出的，有着前一道命令补充的含义。说不定是总部在决策上有了改变。并且你也不希望那些配有防护罩功能的新一代机甲斗士都配备给别的部队吧？要知道白骨舰队一直是低空舰队中的尖刀，我想你一定不愿意让白骨舰队的配置落后于其他的舰队。”
虽然莱斯的用意谁都看得出来，但莱斯带有鼓动的话语却真的抓住了花季美的神经。自从花季美得知自己成为了白骨舰队的队长后，一个无形的压力便压在了花季美的心头。在田木柯带领白骨舰队的那段日子里，白骨舰队就从未在任何事上落过后。而且田木柯与白骨小分队的神奇事迹还被人们广泛流传，因而白骨舰队真可谓是低空舰队的优秀典范。更何况田木柯是为救自己而牺牲的，花季美又如何能愿意让白骨舰队在自己手里失去光彩？虽不说花季美原本的个性就是争强好胜，单从能否对得起为自己牺牲的田木柯，花季美也断然不会愿意让白骨舰队在自己手中变得黯淡无光。
经过瞬时间的思想徘徊，花季美还是采信了莱斯的说法，调遣所有的舰队成员与协同作战的斗士一起返航。
为了不至于拖累舰队的返航进程，莱斯决定撇下了还在修复的机甲斗士。轻装上阵，与其他斗士们一起登上了低空舰队的战机。因为大家都急于返航，所有人都没有注意到此时花少良的脸色已经变得十分难看。花少良也不愿拖累全队的步伐，因而隐瞒了自己受到重创的病体。强挺着渐变虚弱的身躯，登上了古克的战机。
唯一没有加入到返航队伍当中的便是圣徒门斗士七刀。七刀选择留下也并非是不希望自己也拥有一架威猛的机甲斗士，而是七刀实在无法割舍病榻上的浠孜。
浠孜的心脏移植手术马上就要开始了。在如此危险的手术面前，七刀实在不愿将她独自留下。虽然七刀并非医生，但浑厚的内力也许在什么关键时刻还能起上作用。一想到这些，七刀决定即使失去配置机甲斗士的机会也定要守在浠孜的身边。
在战友们依依握别之后，花季美终于率领白骨舰队全体作战人员起程。七刀告别了战友，一直目送白骨舰队消失在云雾间后，才大步跑向急救中心。
……