庆功喜宴之后，起义军内部就开始大动起来。
首先是整军。起义军重新整编之后，解散了一部分部队。特别是安置了东北部暴动的奴隶，之后仍然留下了四十万的庞大的军队，并且重新部署了军队的布防。陆刚和荷花共领十万人马，紧守着亚和东部的屏障，预防东部亚奥和亚海王国军队的入侵。天龙和兽人巴伦带有十万大军驻守在东北部原来泰勒的老巢；而海杰带领林小年原有的五万人马返回昆合城，和天龙部以及首都合阳城的守护部队在亚和中部构成一个三角形的防护体系。首都合阳城除了开特老师主管的起义军最精锐的五万骑兵和富尔拉的五万部队之外，还有五万矮人部队驻扎。
再就是起义军开始国家政权的建立。起义军大首领——总指挥金波自然是皇帝的必然人选，根本没有争议；林小年也就是必然的皇后人选了。开特老师也就成为宰相的最佳人选了，并且由开特为首建立起亚和王国新王朝的第一套政府班子。开特老师首任主管；朱叶主管财务；沙柳担任大法官主管司法；``````。
林小年不愿多管事情，自己只认领了主管工业的责任。但其他人却不想放过她，不让她偷懒，硬给她按上了个副主管的头衔。并且给富尔拉也按了个副主管的头衔，其实富尔拉已经承担了首都合阳城护卫军的首领，这个副主管的职位，是林小年特意建议的。原本就是想让富尔拉多承担点责任，自己好逃开。这也是最后见实在是无法月兑身，才采取的方法。虽然只能戴上其帽，但还是很不负责的把重任扔给了富尔拉，自己去干自己想干的事情去了。
矮人军团被留在合阳城的决定是林小年一心坚持的，原本金波和开特老师的意见是把矮人军团放至昆合城的。除了保持军力平衡外，还有一个原因就是，昆合城原本就是一个冶金制造的城市。但林小年却坚持要把矮人军团放在合阳，明确地对金波说：“如果矮人军团放在昆合城的话，自己也不在合阳住，改到昆合城去住。”对此金波只好让步，把矮人军团留在了首都。
林小年坚持要把矮人军团留在首都是有目的的，其目的就是要在首都建设起一个大陆最大的兵工厂，或者说是最大的冶炼厂。矮人都是冶炼的好手，有他们的帮助，林小年决心亲自制造出这个世界的第一门火炮。为了研制大炮，林小年甚至于把战神庙里的那个祭品桌都弄回来了，她发现那张桌子竟然是铁铸造成的。按林小年的想法，既然上千年前都能铸造出这样大的一张桌子，相隔了上千年，连一个炮筒都做不出来，那是不符合历史发展的规律的。所以，她集中了能集中的所有的矮人中的大师一起研究。其实，矮人之前已经试制出一个铜制炮筒，但林小年很不满意其火力。林小年很清楚这个世界目前仍然主要是依靠城堡来抵抗敌军进攻的，如果有一门能轰倒城堡的火炮，至少亚和西南的那些贵族们就没有一个敢扎刺的了。
亚和王国本来就是一个满处是山的国家，矿山也是多如牛毛一般，这些日子以来，不停地有煤、矿石不断地从各地运来首都，这些矿石都不值钱，运费也不很多。所以林小年也没有用起义军的资金，只是用自己的钱来研究。当然人却是用的是矮人军团的人。
就在林小年每天在智能电脑中学习，以及和矮人大师们一同熔炼矿石时，金波和开特派来找她的人却不断地前来打扰，这让林小年烦不胜烦。
林小年开始时，是能躲就躲，实在是躲不过去的，才和他们一起来到起义军总部开会。那些大事小事没完没了，让林小年头大得要命，最后干脆和金波耍起女孩脾气来。“这些乱七八糟的破事不要来找我，去找富尔拉解决。我还忙着呢，没空管这些屁事！”
金波和开特拿她也没什么好办法，最后也只好由她去了。但有些重大的问题，金波还是和她暗中交换意见。
有两件大事。第一件就是西北和西南，这两方面的事情。首先是西北边防军，本来早有协议，但却发觉西北大公爵胡齐在暗中发展部队，据情报告知，泰勒的部分散军就跑到西北去了，这事让金波十分担心。再就是西南那些贵族们如何处理的问题。关于这两问题的处理，起义军内部争议很大。以开特老师为主的认为，现在以建国为第一大事，在有些问题上可以先让一步；而起义军的大部分首领却不愿就此让步。
金波只好过来征求林小年的意见。林小年考虑了一个晚上，其实就是和电脑商议了一个晚上之后，给了金波两点建议。第一，对西南贵族来说，他们每人掌握的军队并不多，构不成威胁，只要在解放奴隶的问题上予以坚持，也就是必须解放所有的奴隶，其它的都可以商量；第二，西北不同，奴隶问题似乎不需要过分重视，因为前面已有过协议，而且那儿也没有多少奴隶。关键是必须解决其军队问题，军事方面的事情绝不可以轻易让步的，不行就出动大军。
金波听后觉得有道理，就决定按林小年的意见办理，并准备出动天龙的大军去西北彻底解决边防军的问题。然而，开特老师还是不想动用武力。开特老师和西北大公爵早年就是朋友，所以亲自前往与此谈判。胡齐被迫接受了收编军队的命令，按照双方最后的协议，西北边防军被缩编为起义军队西北军团，只留有十万人马，其余的全部解散。但西北军团仍驻扎在西北地区，并由原来大公爵的将领率领，给养也继续由西北地区负责，只是听从起义军总部的指挥和调遣。
至于西南部的贵族，本来就是一盘散沙，又没有相当的军事实力，只能答应解放奴隶。但山高皇帝远，是真的释放了奴隶，还是阳奉阴违，就说不清了。
第二件大事，就是关于宗教的争议了。起义军神山大胜之后，以宙邦为首的人族神教再一次正式登上亚和王国的历史舞台，迅速在起义军所占领的亚和东北和东南半个王国的地区内建立起自己的地盘。不但接管了原神族神教被战争破坏了的庙宇，而且直接挑战神族神教的权威，把自己的势力范围延伸到亚和西南和西北部分。
人族的神教是宣传人人平等的，在宙邦等人的有意宣传之下，人族神教似乎变成为穷苦大众的保护神。这样便得到大部分穷苦人们的欢迎和接受，特别是在奴隶当中，连起义军内部也有不少人参加了人族神教。而原来在亚和占主要位置的神族神教是得到贵族们支持的，在他们盘踞的亚和西南和西北部自然会加以反击。贵族们在起义军的武力威胁下，自然不敢以武力予以反抗，但在精神上的反抗却绝不会停止。贵族们自己不便出面，便在后面纵容和支持平民中的人出面打头。
神族神教固然是以贵族为支柱，但它的社会基础却就扎根在平民之中，亚和的平民中有很大一批人是神族神教的忠实信徒，在首都合阳城里就有相当多的人。这就是林小年占领合阳城后，并没有立刻消灭神教的原因，就是怕引起混乱。
现在神教中的两个大派在亚和内部吵得是一塌糊涂，如同是天翻地覆了一般，就剩下没有动用武力了。起义军内部也为此形成两大派，一派以霍斯为首的，要求起义军公开出面支持人族神教，并主张出动军队镇压神族神教，如同当年神族神教对其它教派采取的方法一样。而以开特老师为首的却主张不予干涉。金波被吵得头昏脑涨，真不知该如何是好，便找林小年求援。
其实有些问题，不如说关于西北和西南问题的处理，金波自己心里是有主意的，只是为了搞平衡，才故意把林小年的意见放在自己的意见前面。而这次他是真没主意了。宗教问题确实是一个非常复杂麻烦的事情，林小年其实也不懂得如何处理，好在有地球上的经验可以借鉴。林小年和智能电脑商议了两天后，便给金波提出了相应的建议。
首先是思想上必须保持着相对的警惕性。宗教具有精神上的迷惑性，在组织内部能迅速地形成一定的凝聚力。但从人类总体的角度来看，宗教大多具有相当的排外性，越是纯洁性高的排外性就越强，所以从整体和长远的观点来看，并不是好事，这点必须清醒地看到。所以在思想上，特别是在组织的内部尽量还是提倡无神论为主，尤其是高层领导的宗教倾向性越低越好，要严防国家政权被宗教牵着走。
第二，政治上就必须坚持宗教信仰自由。无神论、神教的两大派、圣教，还有精灵信仰的自然母神，矮人信仰的大地之神，兽人的信仰就更多了，总之人们可以自由选择。但只有一点，必须遵守国家制定的法律法规，不管什么人，都只能在法律容许的范围内进行活动。只要违犯法律，就要予以严厉的镇压。
第三，在策略上要采取一些较为柔和的手法，至少在表面上采用公开、公正、公道的手法对待所有的宗教。只要他们不采用极端手段，理论上的争论不但可以由他们去争，甚至可以由起义军政府组织他们公开去辩论，要相信绝多大数的人们是有自己的立场的，越是公开就越能争取多数。
但还是可以采取一些其它的措施，首先是公开提倡无神论；再就是暗中培植人族神教来对抗神族的精神入侵等等。
金波接受了林小年的建议，果然宗教派别之间的冲突很快就被约束在神殿大堂上的唇枪舌剑之间的交锋中了。不管他们吵得是如此地风起云涌、天昏地暗，对社会上的影响却逐渐减弱，很快就没人去过多地议论了。