隔了一周，一切又重新上了轨道，大家都各自忙乎自己的。静杨、直子、小雅又都搬回千钧宅长住，毕竟这里上学方便一些。千钧依然在休息时间修炼剑道，有时会到天文台观星。受千钧的影响，静杨她们三个也都没有放松剑术的修行，连晓月都加大了练习力度。千钧好奇询问，才知道原来千寻在剑术上的进步很快，让晓月感到了很大压力。
某天晚上，将要休息时，小兰打来电话，请千钧明天早上6点开车送毛利小五郎前往高尔夫球练习场。千钧虽然觉得有些奇怪，还是一口答应下来。静杨她们也奇怪，小五郎什么时候玩起高尔夫球了，这一点也不像毛利大叔的作风。千钧猜测大叔一定是为了交际方便才决定学习高尔夫球的，不排除拉风耍帅吸引美女注意的可能。本来静杨她们也想去凑凑热闹，但考虑到6点钟天才刚刚亮，会导致睡眠不足，就不打算再去了。
第二天一大早，千钧开车赶往毛利宅，会合毛利三人组前往胜田高尔夫球练习场。不过，大叔打高尔夫球的本领实在不咋地，挥杆数次居然连球都没有模着，果然是隔行如隔山啊。三人坐在旁边观看，柯南也是一头汗，千钧忍不住道，“我看太勉强了吧，毛利大叔好像不会打高尔夫球啊！”小兰无奈，“爸爸对这些使用运动器材的体育项目最没办法了。”千钧疑惑，“我记得大叔是个棒球高手啊！”小兰苦笑，“妈妈是超级棒球迷，也是棒球高手，当年想尽办法逼着老爸玩命练才成功的……”千钧汗，貌似跟自己目前的处境有些像啊，几个女友都是棒球高手。
千钧好笑道，“既然不会，一开始拒绝不就好了吗？”柯南无奈地解释原因，原来3日前，日卖电视台打来电话，毛利小五郎被冲野洋子推荐参加慈善高尔夫球比赛。大叔本来要拒绝的，但是听到是洋子小姐的极力推荐，而且冲野洋子也会出席这次的慈善比赛，就一改态度，表示愿意参加，“你别看我这个样子，我可是高尔夫球的高手！”然后无耻地哈哈大笑。之所以要早点来，是因为这个时间人少，有优惠折扣，柯南抱怨毛利叔叔拖自己和小兰下水，随后柯南打了个哈欠，显然也是睡眠不足，现在才刚刚6点半。
这时进来4个西装革履的男子，原来是五井电机的员工，一起来打高尔夫。为首的中老年男子是五井集团的商品开发部部长橘英介，身材魁梧，留着八字胡。戴眼镜的中年男子是科长安井稔，圆脸胖胖青年男子是主任大久保达也，青年帅气的男子是职员南智史。橘英介声称今天要打个痛快，安井稔笑着赞成，工作前应该有适当的运动。大久保达也也赞同，“托经理的福，我现在的健康状况好的不得了。”南智史冷笑，“真是这样吗？”看得出来，他们是提前预约好的，都走向准备好的地方。
千钧觉得闲得无聊，就约小兰也去打高尔夫球。小兰有些犹豫，千钧好笑，“咱们就随便玩玩，轮流打就行，毛利大叔什么时候走咱们什么时候结束。”小兰笑着点头，千钧跑到前台，跟漂亮娇媚的老板娘桂子搭讪，申请开一个球区，桂子笑着表示明白。她误以为千钧跟小兰是一对情侣了，还称赞小兰真的非常漂亮。千钧也称赞桂子非常美丽大方，桂子自然非常高兴。
千钧搬了一筐球过来，和小兰二人轮流挥杆打高尔夫，虽然也不怎样，但比大叔好多了。柯南站在旁边气恼，他只有发呆看的份，那个高尔夫球杆比自己的个子都高。另一边，南智史声称肚子疼，安井稔责怪他真扫兴，让他快去洗手间，南智史匆匆离去。大久保从旁边的领球机里面取出大量的高尔夫球，搬过去给经理用。
小五郎徒劳无功地挥舞着球杆，没有几下打到球的。柯南嘲笑“三振，打者出局！球什么时候才会打出去啊？”千钧笑道，“你搞什么，这又不是棒球！”柯南看见五井几个员工的打得相当不错，就跟小兰说去看他们打球，小兰让他不要妨碍到别人。柯南答应一声，跑走了。
安井稔将自己剩下的一些球倒入了经理橘英介的球筐里，柯南模模鼻子，这家伙真会拍马屁。南智史走过来，让柯南站远一些，这里很危险。柯南疑惑，“没关系啊，我站的距离很远啊！”安井稔走过来告诉南智史，经理的远距离球杆维修费要从科室的零用钱里面出，南智史面无表情点头表示知道了。安井稔拿出自己的球杆，将球用力打了出去，柯南暗道比千钧和小兰可强多了，大叔更没法比了。
南智史说道，“你看是不是很危险？”柯南点头，的确很危险，球杆从自己前面挥过去了。柯南看了一会儿，觉得大家都在不停地挥杆，没什么意思，就回到旁边的躺椅上小睡。橘英介打出一记好球，几个属下都大声称赞。安井稔大拍马屁，“经理的手气今天还真顺啊！”大久保也凑取，“星期日的联谊赛上经理一定可以得到优胜了！”橘英介继续打球，安井稔的球已经打完了，坐在椅子上擦汗，南智史急忙递上毛巾。
小五郎也停下来，“那个家伙那么快就打完了啊！”柯南道，“因为那个叔叔打球的速度本来就比较快，而且又把自己的球分了一些给那位经理了。”小五郎冷笑，“拍马屁也太明显了吧！”小五郎换了个长距球杆，做了标准姿势，继续打球。千钧和小兰一边看着毛利的动静，一边心不在焉地轮流打球，顺便说一些学校的事情。
橘英介也要换球杆，大久保急忙将长距球杆递给经理。橘英介挥舞球杆，准备击球，安井稔突然起身离开了。这一边小五郎又没有打中球，大叫“可恶，气死我了！”小兰也看见了，取笑老爸连着20次不中了。千钧也停下来，给小五郎打气，小五郎用力挥动球杆，好像将球打了出去，有撞击声音传来。正在这时，听到剧烈的爆炸声，冲击的气波让小五郎蹲在地上。千钧和小兰这边距离稍远一些，没有事情。柯南也发现爆炸的不是小五郎的球，而是五井员工那边发出来的。
千钧、柯南、小兰、小五郎一起跑过去查看，大久保蹲在地上不动，南智史也惊慌失措，橘英介瘫倒在地上，被炸得面目全非。安井稔也从外面跑回来，闻讯而来的还有戴眼镜的胜田场主和桂子老板娘，胜田是非常正派传统的日本中年男子。安井稔大叫着就要上前查看，千钧急忙将其拉住。毛利蹲在地上检查，摇头，已经没救了。安井稔满头大汗跌坐在地，毛利急忙让小兰报警，让千钧保护好现场。小五郎初步推断是炸弹爆炸事件，柯南根据刺鼻的味道判断是黑色火药。
胜田场主注意到大久保也被炸伤，南智史的手臂也有轻伤。胜田亲自送大久保去里面的医院进行救治，桂子也跟着一起过去。等大久保和南智史都经过初步治疗并包扎好，绑上绷带后，目暮警官也带队赶到，开始向大家询问案情。安井稔将他们的情况介绍给目暮，并且提到他们经常来这里打高尔夫，因为公司就在附近，非常方便。橘英介是最后一次到这里来了，因为下个星期他就要升职了，去纽约做分公司的社长。
鉴识上前报告，证实了的确是黑色火药。根据高尔夫球杆和球的碎片，鉴识初步判断炸弹是被装在高尔夫球中的，再利用球杆打击的瞬间，炸弹会因受到冲击爆炸。目暮警官发现爆炸后的高尔夫球碎片上有十字红线，胜田场主奇怪，他们这里的高尔夫球用的都是一字绿线。毛利推断有交叉红线的高尔夫球就是装了炸弹的记号。目暮警官觉得最大的问题是，这次袭击是针对橘英介个人的行为，还是不分对象的恐怖行动？
南智史认为是针对部长个人的行动，凶手目的是谋杀橘英介，理由是他们三个同事都有谋杀动机。安井稔让南智史不要胡说八道，大久保却认可了南智史的说法。大久保关于新产品的三次创意都被部长霸占以个人名义提上去，南智史的数次建议都被部长无情地否决。安井稔急忙说自己没有动机，大久保拆穿他的谎言。原来安井稔最心爱的年轻女朋友被橘英介给抢走了，安井稔解释是自己跟女友分手了，她才跟部长走的。
千钧冷笑，“原来这个家伙为了讨好上司，将女友打包送人啊！可是这个橘英介都这么大的年纪了，行不行啊？”柯南一脸黑线，小兰啐了千钧一口，对安井稔鄙视万分，这个世上怎么有这么混账的家伙。小五郎立即声称明白了真相，知道了凶手是谁。目暮警官有所怀疑，觉得小五郎这次进度太快了点。
小五郎认为，凶手事先将炸弹球跟所有正常球混在一起，那么最有嫌疑的就是将球从领球机取出再交给橘英介的人。柯南说道自己看到大久保将球放到了经理的筐里，南智史在那时刚好去厕所，安井稔站在自己的位置上。安井稔证实了柯南的话，认定凶手就是大久保达也，今天只有他碰过部长的球筐。
毛利不认这么认为，南智史不在现场肯定没有嫌疑，但是安井稔曾经将自己的球分了一部分给橘英介，所以说他也有可能犯案。安井稔急忙辩解，如果自己的球中有炸弹，岂不是会把自己也炸死？毛利冷笑，说出自己的推理。
安井稔从领球机里取到球后，将装有炸弹的球偷偷放在最后，然后将球大部分倒入自己的球筐，将剩下的装有炸弹的球跟其他少部分球送给部长。然后抢走前面将自己的球提前打完，坐在椅子上休息。当看到部长拿出红色的爆炸球时，就找借口匆匆离去到出口处避难，因为担心爆炸会波及到自己。当时大久保先生还在旁边，也被炸伤，所以不可能是凶手。南智史也同样没有嫌疑。
安井稔辩解自己打球本来就比别人快一些，出去是到柜台订咖啡，因为橘英介打完球后最喜欢喝这里老板娘亲手冲的咖啡，所以每次在部长即将结束的前10分钟去订咖啡。桂子证实了安井的话，因为他们这里用的是咖啡豆，所以需要客人提前打招呼。毛利疑惑，“为什么爆炸时，只有你一个人离开现场？怎么说都未免太巧了一点！”目暮警官明白了，毛利认为凶手就是安井稔，目前来看，他的嫌疑也的确最大。安井稔急忙大声否认，声称凶手绝不是自己。
千钧向目暮警官提议检查一下安井的行李，安井点头同意了。柯南点头，今天毛利叔叔的表现非常出色，千钧的建议也很靠谱，但好像太容易了些。随后，助手警官在安井的行李中搜到了几颗高尔夫球，其中有一个是十字红色炸弹球，就交给了目暮警官。安井大叫怎么可能。小五郎哈哈大笑，“这次铁证如山，这个球应该是备用的吧！是防止部长没有拿到炸弹球而留的备份，你准备的可真齐全啊！”安井稔满头大汗，极力辩解，“不是我，我什么也不知道！”千钧冷笑，“你这话还是留给法官和陪审团说吧，希望他们能相信你！”柯南苦笑，如果让陪审团和法官裁定，凭着这个证据，安井稔的谋杀罪名肯定成立。
小五郎哈哈大笑，“这个案子非常简单嘛，对我名侦探毛利小五郎来说，就像吃早饭那么轻而易举！”柯南还是觉得太容易些，一定还有些疏忽的细节。安井稔还在辩解，“如果我是凶手的话，还等着在这里被抓吗？”目暮警官他们显然不信他的鬼话。柯南向球场走去，发现9号台的球并没有被打出去，千钧走过来说毛利叔叔最后那杆同样没有打中球。柯南觉得奇怪，他当时明明听到了球打在铁柱上的声音。
柯南调查后找到了一颗黑色的球，这才是橘英介打出的最后一球，打在铁柱上的声音也是这个球发出来的。千钧当时离得比较远，没有注意到五井员工球场的详细情况。千钧奇怪，“那爆炸的球又是怎么回事呢？”柯南眼里闪过亮光，原来都是凶手的圈套。目暮警官押着安井正要前往警局，安井还在进行最后的努力，希望目暮警官能够相信自己。
这时，沉睡的毛利小五郎出现了，说出安井稔不是真正的凶手。目暮警官头疼，毛利又给自己来这一手。毛利侦探指出关于爆炸起因的判断是错误的，千钧将那颗黑色的球交给目暮警官，上面还有少许火药味。爆炸的时候，橘英介打出的不是爆炸的球，依然是绿色的普通球。其实，**是装在球杆的头部而不是在球里面，普通球被炸毁了外面的涂料就变成了黑色。现场发现的红色球爆炸碎片，是凶手趁着爆炸时扔在地上的，让警方误认为爆炸的是球。而负责修理球杆的人就最有嫌疑，安井稔提到这次负责修理的人是南智史，“难道凶手是他吗？”
目暮警官询问球杆在哪里修理的，胜田先生说是在自己这里，球场也负责给客人修理球杆，他本来打算换上最流行的碳纤维球杆的，但南智史坚持使用木制球杆。安井解释那个球杆是15年前五井社长送给橘英介部长的，所以部长非常喜欢，坚持使用木制球头。胜田提到前天晚上就将修好球杆交给了南智史，安井奇怪为何南智史今天早上才将球杆交给部长。换句话说，球杆有一天一夜在南智史手上，有很大机会动手脚。
毛利小五郎继续推理，南智史借着肚子疼上厕所的机会，避开了取球的工作。为了让安井掉到陷阱里，故意把爆炸时间设定在安井离开订咖啡的时候。同样，为了让自己摆月兑嫌疑，南智史故意在爆炸时站在爆炸现场附近的位置，在爆炸几秒前下意识地用手护着眼睛并躲在了柱子背后，所以南智史只有右手臂和膝盖外侧受伤，而大久保达也几乎全身都被波及。因为部长马上要离开到纽约去，南智史不得不尽快采取行动，所以采取的手法非常仓促，留下了不少破绽。
南智史见事情败露，爽快地承认了罪行。原来，南智史恼恨自己的建议不被橘英介采纳，才能也得不到赏识，于是就决定自己把经理干掉，嫁祸给只知道阿谀奉承的安井稔科长。目暮警官恼怒，“这么一来，你用炸弹袭击可能会波及到他人的！难道你不在乎吗？如果当时练习场有很多人受伤的话，你该怎么办？”南智史冷笑，“那又怎样？我才管不了那么多呢！”目暮警官大怒，千钧插话，“我想他应该不是那么冷血无情的人，他当时怕炸弹伤到柯南，还特意让柯南离开附近……”柯南也证实了当时的情景，小兰也说，“他说不定也是个心地很好的人，可是不知道怎么走错路了。”
目暮警官点头表示明白了，将南智史带往警局。千钧好笑，“如果人人都像他这样，因为上司不赏识自己就动手杀人的话，天下的上司岂不要死光了？”柯南嘲笑，“是不是因为你现在也是别人的上司才这样说的？”千钧恼怒，“我可是非常重视下属意见的……”柯南戳穿他，“你少来了，你好像平时都不去公司吧！没有藤野先生的话，靠你跟阿笠博士两个不上心的人，藤笠公司早倒闭了！我怀疑你连主要下属的名字都记不全……”千钧被说中痛处，只好赶紧转移话题，“桂子女士的咖啡很好喝，我们去喝咖啡怎么样？当然我请客……”小兰突然发现已经过了8点半，柯南也大叫上学迟到了，千钧月复诽，“大家都经常逃学，迟到一次有那么夸张吗？”
第二个星期日，高尔夫球名人慈善会正式举行，小五郎跟冲野洋子分在一组。小兰、园子、静杨、小雅、直子也都去给毛利小五郎助威加油，柯南和千钧自然也在场边观看。柯南嘲讽大叔竟然敢白痴地答应参加这次的比赛，千钧赞叹洋子越发帅气迷人了。洋子将球打出去，赢得一片喝彩和赞美声，洋子也是非常骄傲，握着拳头欢呼。记者们评价洋子小姐打得很不错，虽然稍微偏了一点。
大家一起欢迎名侦探毛利小五郎来露一手，洋子给毛利加油，大叔露出v字型手势，“包在我身上！”小兰担心万分，“爸爸他没有问题吧？”柯南一头汗，“怎么可能没问题！”千钧道，“我们一起来祈祷大叔这次能打中球吧！”园子她们几个都等着看大叔的笑话，毛利叔叔用力挥杆，这次还真的打中球了，可是球飞出去把摄影机打坏了，所有人都汗。小兰极其尴尬，静杨她们再也忍不住大笑起来，柯南苦笑，“拜托，饶了我吧！”
尾声，南智史用炸弹袭击杀害上司橘英介、炸伤大久保达也并嫁祸给安井稔，被法庭判处7年徒刑。毛利小五郎因破获高尔夫球场爆炸事件，警视厅给以b级奖励。只不过，小五郎在高尔夫球比赛中的乌龙事件，一时被传为趣谈，甚至将破案的推理事件都盖过去了。小五郎抱怨这些八卦记者故意抹黑自己，柯南好笑，你还用得着抹黑吗？