大家都记起来，上田光司冷笑，“中岛，原来真的是你，我还奇怪你的号码怎么变了？”鉴识人员按照千钧的吩咐进行了检查，发现爆炸现场的钥匙上有中岛的指纹。中岛跌坐在地上，满头大汗，“警官，我承认，是我跟死者用号码牌方式进行了交易，钥匙也是我给他的，但是我没有安装炸弹啊！我没有想到要杀他，真的，请你们相信我！”竹下也道，“警官，不管我的事情，都是中岛自己的事情，我什么都不知道的！”目暮警官哼了一声，“你们两个家伙，居然制造恐怖事件！还敢狡辩！”
千钧询问中岛，“你到底卖了什么给那个关西大汉？你认识他吗？”中岛知道抵赖不过，“我只是将满天堂公司所有顶级程序员的名单和每个人的代表程序软件卖给了那个人，我根本就不认识他！我也没有想杀他，我还打算有机会跟他继续合作的……”石川社长气得鼻子都歪了，“八嘎，你怎么可以出卖公司的利益啊？我要向法庭起诉你，让你赔偿我的损失……”
竹下也辩解，“警官，你也听到了，不关我的事情，如果你们非要说我是同伙的话，请拿出证据来！”目暮警官恼怒，“你还在抵赖，跟才你就一直帮着中岛阻挠搜查……可是，千钧，他说的有道理，我们没有证据证明他也是同伙啊！”竹下擦汗，松了口气。千钧冷笑，“目暮警官，请你搜查一下竹下的公事包，我怀疑他那里也有见不得人的东西。对了，要调查一下指纹啊！”
竹下大叫，“我……我拒绝，公民的私有财产神圣不可侵犯……”目暮警官二话不说，马上拿过竹下的公事包，在没有钥匙的情况下，强行将其打开，里面竟然是中岛刚才所说的那些东西，软件光盘跟纸质的程序员名单。中岛疑惑，“原来，你也想卖东西出去啊！”石川社长气得发疯，“你们两个败类，我要告你们出卖公司商业秘密，我要让你们坐牢，倾家荡产！”鉴识人员很快证实了竹下的公事包上有中岛、竹下、存物小姐的指纹，中岛的公事包上只发现了中岛跟存物小姐的指纹。
千钧点头，“那个关西大汉非常谨慎，应该在把东西寄存在柜台时，抹去了自己的指纹。”中岛却很奇怪，“不可能啊，竹下的公事包我没动过啊！我没有装炸弹……”竹下也大叫冤枉，“我的公事包被掉包了，这不是我的……”千钧大怒，“你还不服吗？那我们再来看看你的号码牌99号上是不是也有中岛的指纹！”存物小姐马上找出了99号牌交给鉴识，很快证实了上面有中岛、竹下、存物小姐的指纹。
千钧冷笑，“你不会说你的号码牌也被掉包了吧？只有一个可能，你在帮中岛打掩护！你们两个串通好了，一个带上装炸弹的箱子，一个带上交易的箱子。如果事情顺利，你们就正常交易。万一交易的价钱不符合你们两个的心意，或者出现变故，就让中岛把炸弹箱的牌子交给死者，来个死无对证，毁尸灭迹！”大家都明白了，这两个家伙配合得还真默契啊！
目暮警官觉得要对千钧刮目相看了，“太棒了，千钧！这次也是名推理了，果然学到了工藤的推理技巧！”竹下跌坐在地上，脸色苍白，“怎么会这样？应该不是这样的！”大家都摇头，觉得他这是变相承认罪行了。中岛大呼冤枉，“警官，炸弹不是我准备的，我真的没有……”目暮警官上前给他戴上手铐，中岛明白警方现根本不相信自己了，觉得应该马上想办法推卸罪责，“对了，炸弹是竹下准备的，跟我没关系，我只负责交易，我被他骗了，他才是主谋！”竹下大怒，从地上爬起来，“中岛，你这个混蛋！你不要诬陷我，炸弹不是我准备的，交易的事情我根本不知道！”
看着两人开始狗咬狗，大家都唏嘘无语。千钧鄙视二人，“目暮警官，你把他们两个带回去慢慢审问吧！可以肯定他们两个都不是什么好东西！”目暮警官点头，吩咐手下带他们两个回去。千钧奇怪，“目暮警官，怎么佐藤和高木都没来啊？”目暮咳嗽一声，低声告诉千钧，“我以为是恐怖分子在搞炸弹袭击，就没让他们两个过来，你知道佐藤那丫头冲得太猛，高木又特别冒失，我怕他们乱来会有危险，这次跟我来的人都是比较稳重经验丰富的警官……早知道这样，就让他们一起过来了。”千钧明白了，目暮警官还真是体贴下属啊！
目暮警官正要离开，毛利小五郎突然开口，“等一等，目暮警官！”目暮头疼，“毛利老弟，难道还有问题吗？千钧的推理非常正确，而且还有人证和物证！两个疑犯也没有完全否认！”毛利叹息，“千钧的推理只对了一半，竹下跟中岛的话里，有一半是真话，一半是假话，这些话掺杂在一起，给大家造成了错觉，误以为他们两个是合谋行凶的。”千钧和目暮都汗，一半真话一半假话这好像是数学智力题啊！
千钧不服气，“柯南……毛利大叔，你说说看，我的推理哪里有问题了？我可是有证据的。”目暮警官也疑惑，“毛利老弟，难道凶手不是他们两个吗？”毛利回答，“中岛英明跟死者进行非法交易，是肯定的，中岛先生也没有否认，所以这句话是真的，千钧的推理没有错。但中岛说主谋是竹下，这句话是假的，是为了减轻罪行。竹下裕信说交易的事情他并不知情，这句话也是真的，但他否认炸弹是他准备的，这句话是假的。”大家全绕糊涂了，中岛和竹下却用惊讶的眼神看着毛利侦探。
目暮警官无奈，“毛利老弟，你能不能解释清楚一点？”毛利侦探解释，“其实说简单点，竹下先生跟中岛先生采取的行动没有关联，彼此事先也不知道对方的计划，也就是说他们既不是同伙也不是合谋，所有的一切都是巧合。因为他们都选择了今天行动，也都采取了号码牌交换方式进行犯罪活动，结果事情的复杂变化让他们自己都糊涂了，不知道问题出在哪里！”千钧惊讶，“毛利大叔，你是说他们都是单独行动的？”
“没错，中岛英明是前来跟死者进行交易的，采用了号码牌方式。竹下裕信准备了炸弹，不是用来炸死死者的，而是用来谋杀中岛先生的。所以，竹下先生，你才是安装炸弹的凶手！”目暮警官还是迷糊，“毛利老弟，到底怎么回事？”
“竹下先生在中岛先生的箱子掉在地上打开时，他吓得要死，因为他以为自己安装在公事包的炸弹就要爆炸了。而实际上，安装炸弹的公事包，被中岛先生交换给了死者，死者说钥匙进不去，因为那把钥匙不是那个公事包的。千钧在这一点上的推理是错误的，但千钧对中岛跟死者采取号码牌交易手法上的推理是完全正确的，3位存物小姐的证词也证明了这一点。”
目暮警官点头，“原来如此，那为何钥匙不合呢？”毛利好笑，“当然不合了，因为竹下先生偷偷把自己的号码牌跟中岛先生的号码牌换掉了，应该最开始中岛是99号，竹下98号。结果不知情的中岛先生又拿着98号牌跟死者的124号牌进行了交换，并给了死者自己公事包的钥匙。死者就拿走了装着炸弹的公事包，中岛的钥匙自然打不开竹下的公事包。”中岛奇怪，“怎么可能，他什么时候偷走了我号码牌？”“应该是你打拳击的时候，竹下不是在旁边帮你拿着外套吗？”中岛恍然大悟，“原来如此，的确，竹下手中这个公事包的确是我的，里面的东西也是我的，我还以为竹下也准备相同的东西……”
千钧也明白了，“原来如此，所以竹下这个公事包上有中岛的指纹，因为本来就是中岛的东西。99号码牌上同时有中岛跟竹下的指纹，也就证明了竹下调换了中岛的指纹。如此说来，98号码牌上也应该也有二人的指纹了！”目暮警官马上命令调查，很快证实了98号码牌上的确有中岛跟竹下的指纹。
“插队的事情，也是竹下临时想出来的，因为三个人的号码相连又都是90几号的话，不容易引起存物小姐跟同事的怀疑，所以在最后，存物小姐只注意到了中岛先生的号码牌不对，没有注意到竹下先生的号码牌也发生了变化。”上田跟中岛全看着竹下，“竹下，你太过分了，居然利用我们！”
竹下不服气，“毛利侦探，你这么说有证据吗？”“当然有，目暮警官，爆炸现场发现的钥匙上有中岛先生的指纹，那把钥匙应该可以打开竹下手里的公事包，而竹下手中的钥匙却绝对打不开这个公事包，因为他自己的公事包早就被炸毁了。中岛先生刚才也证实了竹下现在的这个公事包是他的。”
目暮警官马上进行了检验，很快就证实了这一点。千钧明白了，“如此说来，关西大汉是枉死的了，竹下是想炸死中岛的，结果阴错阳差误杀了关西大汉。”毛利侦探肯定，“没错，本来按照竹下的计划，中岛应该在回到自己家后才会打开公事包的，等中岛被炸死后，也没有人会怀疑到竹下的身上，他还可以利用这段时间把一些证据销毁，比如拿在自己手里原本是中岛的公事包。”
目暮警官走过来，“竹下先生，现在人证物证都有了，你还有什么话说吗？对了，你为什么想要杀害中岛先生呢？”竹下叹气，“毛利侦探，我认输了。炸弹的确是我装的，恐吓信也是我伪造的，我本来想杀死中岛，伪造成恐怖分子所为，没想到事情会变成这个样子……我没想要杀害那个无辜的关西人，就像你说的，事情出乎我的意料……”
中岛大怒，“竹下，我平时对你也不错，你为什么想要用这么残忍的办法杀死我？”竹下突然发疯一样冲上来，揪住中岛挥舞拳头猛揍，“就是你中岛！混蛋家伙，死的应该是你才对！是你害死了良美！”中岛发出惨叫，警官甲乙急忙冲上来将竹下拉开。上田说良美是他们大学拳击社的美女经理。原来，和竹下裕信交往多年的良美被中岛英明插足抢走，后来，中岛玩腻良美了后，将良美甩掉，良美悲愤羞愧之下自杀身亡。
目暮警官下令将二人一起带走，毛利侦探拦住，“幸运逃过一劫的中岛先生，我们言归正传吧！跟你进行交易的黑衣男子到底是谁？我觉得你从实招来的好，因为交易失败他们组织的人也死了，就算你进了监狱，还是会找你报复的！我想这一点你应该清楚！你应该实话实说请警方保护你的安全才对！”
中岛变得非常害怕，“我真的什么也不知道！我刚才没有对这个怪侦探撒谎！对了，我们每次暗中交换消息的地点是大黑大厦的cocktail（鸡尾酒）酒吧。”千钧和柯南都大喜，总算有个准确的消息了，二人立即匆匆离去。目暮警官感觉事情有些严重了，“毛利老弟，你醒醒，你刚才说什么组织？”小五郎睁开眼，“怎么了，目暮警官，恐怖分子找到了吗？”目暮警官汗，“喂喂，你搞什么，案件你不是刚才解决了吗？”
说话之际，警官丙过来报告，秘密调查局的山本一夫带人赶过来了。目暮警官站起来，“可恶，这个山本的狗鼻子还真灵啊，我这里刚刚处理完，他就知道了……”山本一夫临时有别的事情，所以来的晚了，不然一开始他就带人过来了。山本一夫赶到后，仔细问明了情况，还让人立即做了死者的素描。山本一夫根据内线消息很快就知道，这个高大黑衣人是黑暗组织的人，代号暂时不明。
山本一夫转身对目暮警官道，“目暮警部，炸弹的事情我不管，这个中岛英明我要立即带走，关于中岛的所有事情尽量保密。”目暮大惊，“等一下，山本！中岛涉及非法交易……”山本一夫冷哼一声，“我当然知道，我就是为这件事情来的，这件事情牵涉到一个非常庞大的地下组织，我想，你应该明白了吧！好了，警部，这件案子的卷宗记得事后给我留一份，下次再见，希望我们合作愉快！”看着秘密调查局的人迅速撤离，目暮警官松了口气，“混蛋，谁希望跟你再见，鬼才跟你合作愉快！”
千钧跟柯南驱车赶往大黑大厦，一路疾驰闯了几个红灯。二人心急火燎地乘电梯而上，刚走入对应的楼层，就发生了大爆炸。无数人被炸死炸飞，好多电梯都被摧毁，千钧和柯南大惊失色，“不好，又来晚了！”一个好心男子不住咳嗽，“你们别过去啊，爆炸是在鸡尾酒吧发生的，那里很危险……”
柯南恼怒，非要过去不可，千钧急忙抱着他混入混乱的人群中。柯南疑惑，千钧指了指下面从楼梯上来的人员，“秘密调查局的人！你不会想让他们发现你的真实身份吧？”秘密调查局的人也从中岛那里知道了这个黑暗组织的据点，就马上赶过来。同样，琴酒和伏特加发现龙舌兰出事，知道这里已经暴露，马上命令情报人员撤离，并将这里彻底炸毁。警方和救护人员、消防队在半个小时后才赶到这里，所有的一切都如同弥漫天际的黑烟一样，整个事件就此尘封于漫天的黑雾中。
对于柯南跟千钧来说，这个事情就到这里了，他们已经无法在追查下去了。秘密调查局将大黑大厦爆炸事件接手过去，一筹莫展的警视厅也松了口气。山本一夫的人马根据掌握的线索，很快追踪到了黑暗组织外围的情报人员，双方发生一系列激战，黑衣组织损失不小，琴酒、伏特加带着剩下的人员转入潜伏状态，东京似乎又恢复了平静。山本一夫虽然没有抓到大鱼，却知道了死鱼的代号是龙舌兰。
尾声，竹下裕信谋杀中岛英明未遂，误杀不知名关西人，炸伤了不少无辜，但他并不是恐怖分子，因此法庭只判处竹下20年徒刑。中岛英明非法交易顶级程序员名单事件，由秘密调查局接手调查，所有的相关消息都被封锁，中岛也被关到秘密调查局的审讯室，不知道何日才能重见天日。毛利小五郎因破获电玩公司爆炸案，警视厅给以b级奖励，目暮警官也因这件爆炸案的功劳官复原职。报纸上都报道的是毛利侦探精彩推理炸弹案件的过程，千钧因为推理失误，报纸上自动将其忽略不计。千钧为此郁闷了好几天，“真是的，我的推理至少对了一半吧！”柯南大笑，“可你找出的根本不是真相，糊涂的华森！”